通过二硫化物交联进行体外蛋白质合成的方法技术

技术编号:1753965 阅读:240 留言:0更新日期:2012-04-11 18:40
本发明专利技术的目的是提供一种用重构的蛋白质合成系统简便高效地合成含二硫键的蛋白质的方法。已知具有活性的蛋白质可通过使用含有纯化组分的重构蛋白合成系统合成获得,其中可影响氧化还原状态的酶和底物被除去,并可对二硫化物和硫醇的氧化还原的平衡进行人工调节。这种系统可代替含有多种维持还原状态酶和底物,例如硫氧还蛋白还原酶[EC1.6.4.5]和谷胱甘肽还原酶[EC1.6.4.2]等的细胞提取物或粗组分的、难以调节氧化还原状态的系统。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】
本专利技术涉及通过体外转录/翻译系统进行蛋白质合成的方法。更具体而言,本专利技术涉及通过体外转录/翻译系统高效合成具有分子内或分子间二硫键的蛋白质的方法。
技术介绍
人们试图通过基因重组技术来生产可用作药物或试剂的蛋白质。优选地,考虑到操作的简便性和效率,人们已将诸如大肠杆菌、枯草芽孢杆菌,霉菌和酵母这样的微生物,诸如蚕这样昆虫,诸如牛这样哺乳动物,以及可栽培植物、昆虫和动物细胞,目前已用于基因重组技术中。通过基因重组技术生产蛋白质的方法已被广泛应用。不过,使用这种方法可能导致,譬如目的蛋白的表达水平低、表达无活性的蛋白及形成聚集物这些问题。因此,需要反复进行诸如检查培养条件、生长条件或诱导条件,或试验多种表达系统这样的试误(trial-and-error)过程。已报道许多蛋白甚至在考察这些条件后,也很难被合成。 与此同时,已知一种不使用这些生物或细胞的蛋白质合成方法,其也被称为“无细胞蛋白质合成”。这种无细胞蛋白质合成系统也描述为“体外转录/翻译系统”。通过该系统,用从大肠杆菌、兔网织红细胞、麦胚细胞或其它类似细胞中所制备的提取物或天然成分对模板基因进行转录/翻译,从而合成蛋白质。无细胞蛋白质合成系统的特征在于可克服使用生物或细胞所遇到的限制。这是因为用该系统可合成干扰生物和细胞功能的蛋白质,可通过96孔板或384孔板的形式合成多种蛋白质,并可同时对多种合成条件进行测试。 但已知即使使用这种无细胞蛋白质合成系统,仍有一个问题,即合成的蛋白质形成了凝聚物而不形成为相应的天然结构。其原因可能是具有分子间和/或分子内二硫键的蛋白质的二硫键不能正确交联。有些蛋白质具有分子间和/或分子内二硫键,而有些没有。许多转运并分泌到细胞表面或细胞外环境的蛋白质具有二硫键。而这些蛋白质具有特别重要的应用价值。例如,诸如胰岛素、细胞因子和血细胞生长因子等绝大多数已商品化的蛋白质制品,其组分中都含有具有分子间二硫键的蛋白。 因此,为了高效生产这种具有分子间/分子内二硫键的蛋白质,对无细胞蛋白质合成系统进行了改进。例如,已进行了以下方法向细胞提取物中加入微粒体组分的方法(非专利文献1Biochem.J.254805-810(1988),下文以现有技术1表示);对细胞提取物进行透析的方法,添加氧化型谷胱甘肽和还原型谷胱甘肽的方法,凝胶过滤的方法,调节氧化-还原(redox)电势的方法(非专利文献2FEBS Lett.514290-4(2002);非专利文献3Nature Biotech.1579-84(1997);专利文献1JP Patent Publication(Kokai)No.2003-116590;专利文献2WO 03/072796 A1,下文以现有技术2表示)。 而且已知一种使用了可维持还原态的酶的缺失变异体来形成二硫键的方法(Proc.Natl.Acad.Sci.9613703-13708(1999),下文以现有技术3表示)。通过该方法,目的蛋白可用缺失硫氧还蛋白还原酶和谷胱甘肽还原酶的大肠杆菌进行表达。但通常缺失这种酶的细胞系生长非常缓慢,或者需要特殊的培养条件,这在工业实用性上是很大的障碍。这种方法利用可在大肠杆菌中导致基因重组的系统来表达蛋白。不过如上所述,对生物的直接使用存在多种限制。此外,许多生物除硫氧还蛋白还原酶和谷胱甘肽还原酶外,还含有许多未被鉴定的可控制氧化-还原反应的酶和底物(非专利文献4Nature ReviewMolecular Cell Biology 3836-847(2002))。因此,即使外源蛋白可用这种缺失变异体进行表达,或用以缺失变异体的细胞提取物为无细胞蛋白合成系统来进行蛋白质合成,也很难形成稳定的二硫键。因此,报道了一种用碘乙酰胺处理细胞提取物以灭活这些酶和底物的方法(US 6,548,276 B2,下文以现有技术4表示)。根据该方法,不仅可灭活谷胱甘肽还原酶和氧还蛋白还原酶,而且也可以灭活多种控制细胞内氧化-还原反应的酶和底物。但由于碘乙酰胺以非特异形式修饰硫醇,因此它也可能修饰转录/翻译相关的因子和酶基团、核糖体蛋白及类似物质。从而产生的问题是体外蛋白合成反应的高效性和精确性被破坏。 同时,与已广泛使用的、用生物和细胞通过重组方式来合成蛋白的方法一样,化学合成的肽或通过无细胞蛋白合成系统合成的蛋白质也可用变性剂进行完全变性,然后对其进行再生(非专利文献5Biochemistry 263129-3134(1987),下文以现有技术5表示)。在现有技术5中,由于蛋白质是化学合成的、或即使使用生物体也是以无活性的不可溶形式回收的,因此可生产例如毒素蛋白。当蛋白质再生时,不再使用细胞,试剂和盐可相互自由结合,从而在具有二硫键的蛋白质中正确地引入二硫键。但当使用该方法时也有一些问题,需要不同的步骤来进行蛋白质合成和蛋白质结构再生,而蛋白质结构再生是耗时的步骤(需要几天到一周的时间)。 另外,根据众所周知的测定催化促进和/或异构化二硫键的酶的活性的方法,用作底物的核糖核酸酶A(RNaseA)被还原而变性,RNaseA与某种测定了活性的酶一起再折叠并再生后测定其活性,所获得的核糖核酸酶活性可作为一个指标(非专利文献6Biochem J.1976159377-384)。 专利文献1JP Patent Publication(Kokai)No.2003-116590 A专利文献2WO 03/072796 A1专利文献3US 6,548,276 B2非专利文献1Biochem.J.254805-810(1988)非专利文献2FEBS Lett.514290-294(2002)非专利文献3Nature Biotech.1579-84(1997)非专利文献4Nature Review Molecular Cell Biology 3836-847(2002)非专利文献5Biochemistry 263129-3134(1987)非专利文献6Biochem J.159377-384(1976)
技术实现思路
[蛋白质合成]传统的无细胞蛋白质合成系统在生产具有分子内和/或分子间二硫键的蛋白时具有下列缺点。在现有技术1中,要考虑到必须从胰腺或者其它部位通过匀化和离心的方式来制备微粒体部分;微粒体部分是通过破坏被称作内质网——二硫键最初就是在这里形成的——的细胞器来获得的,这样微粒体部分中形成二硫键的效率要低于内质网;并且形成的二硫键与天然状态会有所差异,因此可能会观察不到蛋白活性——这是个问题。在现有技术2中,无需制备微粒体部分,可通过诸如添加氧化型谷胱甘肽与还原型谷胱甘肽或者透析这样的简单方法来制备细胞提取物。不过,难以制备具有很好重复性的氧化-还原状态从而使得二硫键可以高效交联的反应液。这是因为通常用作无细胞蛋白质合成系统的细胞提取物含有多种类型的处于还原态的酶和底物,包括硫氧还蛋白还原酶[EC 1.6.4.5]和谷胱甘肽还原酶[EC 1.6.4.2](Nature Review Molecular Cell Biology 3836-847(2002))。因此,认为这些酶和底物的功能在调节氧化-还原态时会出现困难,即便经透析或添加谷胱甘肽也如此。当向无细胞蛋白质合成系统中加入诸本文档来自技高网
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【技术保护点】
一种合成具有分子内或分子间二硫键的蛋白质的方法,包括使用包含以下a),b),和c)和/或d)的反应系统:a)至少一个编码目标蛋白的模板核酸;b)包含多种具有特定存在量和纯度的组分的、在加入模板核酸后可合成由模板核酸编码的蛋白 质的蛋白质合成反应基本试剂;c)至少一种具有特定存在量和纯度的、可催化二硫键氧化还原的氧化还原酶;及d)至少一种具有特定存在量和纯度的调节二硫键氧化还原状态的氧化还原试剂。

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】JP 2004-4-30 136520/20041.一种合成具有分子内或分子间二硫键的蛋白质的方法,包括使用包含以下a),b),和c)和/或d)的反应系统a)至少一个编码目标蛋白的模板核酸;b)包含多种具有特定存在量和纯度的组分的、在加入模板核酸后可合成由模板核酸编码的蛋白质的蛋白质合成反应基本试剂;c)至少一种具有特定存在量和纯度的、可催化二硫键氧化还原的氧化还原酶;及d)至少一种具有特定存在量和纯度的调节二硫键氧化还原状态的氧化还原试剂。2.权利要求1所述的合成蛋白质的方法,其中蛋白质合成基本反应试剂包括核糖体、起始因子、延伸因子、终止因子、氨酰-tRNA合成酶、甲硫氨酰tRNA转移酶、tRNAs、氨基酸、核苷三磷酸、10-甲酰基5,6,7,8-四氢叶酸(FD)、盐和水。3.权利要求1所述的合成蛋白质的方法,其中蛋白质合成反应基本试剂包括核糖体、起始因子、延伸因子、氨酰-tRNA合成酶、甲硫氨酰tRNA转移酶、tRNAs、氨基酸、核苷三磷酸、10-甲酰基5,6,7,8-四氢叶酸(FD)、盐和水。4.权利要求1-3中任一项所述的合成蛋白质的方法,其中氧化还原酶是催化促进和/或异构化蛋白质的二硫键的酶。5.权利要求1-4中任一项所述的合成蛋白质的方法,其中氧化还原酶包括蛋白质二硫键异构酶类(PDIs)或二硫键交换蛋白。6.权利要求5所述的合成蛋白质的方法,其中蛋白质二硫键异构酶的浓度为0到10μM。7.权利要求5或6所述的合成蛋白质的方法,其中二硫键交换蛋白的浓度为0到10μM。8.权利要求1-7中任一项所述的合成蛋白质的方法,其中氧化还原试剂为二硫苏糖醇或氧化型谷胱甘肽。9.权利要求8所述的合成蛋白质的方法,其中氧化型谷胱甘肽的浓度为0到8mM。10.权利要求8或9所述的合成蛋白质的方法,其中二硫苏糖醇的浓度为0到1mM。11.权利要求1-10中任一项所述的合成蛋白质的方法,其中硫氧还蛋白还原酶在反应体系中的浓度不超过100ng/ml。12.权利要求1-11中任一项所述的合成蛋白质的方法,其中谷胱甘肽还原酶在反应体系中的浓度不超过100ng/ml。13.一种检测方法包括在包含以下a),b)和c)和/或d)的反应体系中改变氧化还原酶试剂和氧化还原试剂的浓度;合成包含至少一个肽链的蛋白质,其中所述肽链分子内或分子间通过至少一个二硫键进行交联,其活性可根据这种交联方式进行调节;测定蛋白质的活性;及测定蛋白质活性、氧化还原酶试剂浓度和氧化还原试剂浓度之间的关系a)至少一个编码目标蛋白的模板核酸;b)包含具有特定存在量和纯度的多种组分、在加入模板核酸后可合成由模板核酸编码的蛋白质的蛋白质合成反应基本试剂;c)至少一种具有特定存在量和纯度的可催化氧化还原的氧化还原酶;及d)至少一种具有特定存在量和纯度的调节氧化还原状态的氧化还原试剂。14.权利要求13所述的检测方法,其中蛋白质合成反应基本试剂包括核糖体、起始因子、延伸因子、终止因子、氨酰-tRNA合成酶、甲硫氨酰tRNA转移酶、tRNAs、氨基酸、核苷三磷酸、10-甲酰基5,6,7,8-四氢叶酸(FD)、盐和水。15.权利要求13所述的检测方法,其中蛋白质合成反应基本试剂包括核糖体、起始因子、延伸因子、氨酰-tRNA合成酶、甲硫氨酰tRNA转移酶、tRNAs、氨基酸、核苷三磷酸、10-甲酰基5,6,7,8-四氢叶酸(FD)、盐和水。16.权利要求13-15中任一项所述的检测方法,其中氧化还原酶是催化促进和/或异构化蛋白质的二硫键的酶。17.权利要求13-16中任一项所述的检测方法,其中氧化还原酶包括蛋白质二硫键异构酶类(PDIs)或二硫键交换蛋白。18.权利要求13-17中任一项所述的检测方法,其中氧化还原酶是浓度为0μM到10μM的蛋白质二硫键异构酶类。19.权利要求13-18中任一项所述的检测方法,其中氧化还原酶是浓度为0μM到10μM的二硫键交换蛋白。20.权利要求13-19中任一项所述的检测方法,其中氧化还原试剂为二硫苏糖醇或氧化型谷胱甘肽。21.权利要求20所述的检测方法,其中氧化型谷胱甘肽的浓度为0到8mM。22.权利要求13-21中任一项所述的检测方法,其中硫氧还蛋白还原酶在反应体系中的浓度不超过100ng/ml。23.权利要求13-21中任一项所述的检测方法,其中谷胱甘肽还原酶在反应体系中的浓度不超过100ng/ml。24.一种测定催化促进和/或异构化蛋白质二硫键的酶的活性的方法,包括以下a),b)和c)a)至少一个模板核酸;b)包含多种具有特定的化合物名称、存在量和纯度的组分、在加入模板核酸后可合成由模板核酸编码的蛋白质的蛋白质合成基本反应试剂;c)包含至少一种具有特定的化合物名称、存在量和纯度的组分、可调节氧化还原状态试剂的氧化还原试剂。25.权利要求24中测定活性的方法,其中蛋白质合成反应基本试剂包括核糖体、起始因子、延伸因子、终止因子、氨酰-tRNA合成酶、甲硫氨酰tRNA转移酶、tRNAs、氨基酸、核苷三磷酸、10-甲酰基5,6,7,8-四氢叶酸(FD)、盐和水。26.权利要求24中测定活性的方法,其中蛋白质合成反应基本试剂包括核糖体、起始因子、延伸因子、氨酰-tRNA合成酶、甲硫氨酰tRNA转移酶、tRNAs、氨基酸、核苷三磷酸...

【专利技术属性】
技术研发人员:桑田英文
申请(专利权)人:株式会社后基因组研究所
类型:发明
国别省市:JP[日本]

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