一组可视化鉴别神经氨酸酶N6基因有无缺失的引物制造技术

技术编号:17419028 阅读:202 留言:0更新日期:2018-03-07 15:39
本发明专利技术提供了一组可视化鉴别神经氨酸酶N6基因有无缺失的引物,本发明专利技术针对N6基因流行的两种形式(N6完整和N6缺失),根据N6缺失存在33个核苷酸连续缺失(相对于N6完整)来设计特异性的引物,利用本组引物对N6完整株和N6缺失株进行实时荧光定量PCR反应均可有效扩增,但是因缺失区存在33个核苷酸连续缺失导致扩增区域的核苷酸GC含量存在差异,导致实时荧光定量PCR反应后生成的溶解曲线峰值(Tm值)存在特征性差异,通过和实时荧光定量PCR仪器连接的电脑的专用实时荧光定量PCR分析溶解曲线峰值软件,即可对神经氨酸酶N6基因有无缺失进行可视化鉴别。本发明专利技术鉴定方法简单,方便高效、特异性强、准确率高。

A group of primers for the visual identification of the neuraminidase N6 gene

The invention provides a set of visual identification of N6 gene primers neuraminidase missing, two forms of the invention for popular N6 gene (N6 and N6 deletion), according to the N6 deletion of 33 nucleotides deletion (relative to N6 complete) to design specific primers for N6 amplification, effective strain and N6 integrity mutant by quantitative real-time PCR can use this set of primers, but due to lack of area there are 33 nucleotide deletion leads to continuous amplification of nucleotide content of GC regional differences, leading to real-time PCR reaction generated after the dissolution curve peak (Tm) characteristic differences, special connected by real-time fluorescence quantitative PCR and real time fluorescence quantitative PCR instrument computer analysis software can be dissolved peak curve of neuraminidase N6 gene without missing visual identification. The method of identification of the invention is simple, convenient and efficient, strong in specificity and high in accuracy.

【技术实现步骤摘要】
一组可视化鉴别神经氨酸酶N6基因有无缺失的引物
本专利技术属于禽病学检测领域,具体涉及一组可视化鉴别神经氨酸酶N6基因有无缺失的引物。
技术介绍
禽流感病毒(Avianinfluenzavirus,AIV)由8个独立单股负链RNA节段组成,分别为血凝素基因(HA)、神经氨酸酶基因(NA)、基质蛋白基因(M)、核蛋白基因(NP)、非结构蛋白基因(NS)和聚合酶蛋白基因3个(PB2、PB1和PA)。迄今为止,已经分离到毒力各异的AIV毒株,根据其病毒粒子表面的HA和NA抗原性的差异,可分为16个HA亚型和9个NA亚型,不同的HA和NA又可基因重组成亚型各异的流感病毒。鸭被认为是AIVs巨大的基因储存库,其流感病毒由野生水禽到陆生禽类的过程传播中充当着中间媒介的作用,家鸭体内的AIV可以通过基因重排或直接突破种间屏障传播到人和其他禽类,有时可能会造成很高的发病率和死亡率。目前,我国家养水禽范围广、饲养量大,广大农村主要是粗犷式混合养殖为AIVs的传播创造便利条件。前期研究发现,2008年分离鉴定的H6N6分离株(MD/FJ/F1/08)的N6基因其颈部有33个连续核苷酸缺失,但是对同期流行本文档来自技高网...
一组可视化鉴别神经氨酸酶N6基因有无缺失的引物

【技术保护点】
一组可视化鉴别神经氨酸酶N6基因有无缺失的引物,其特征在于:所述引物序列为:上游引物N6‑F1:5’‑ TATGAACATTCCAAACATG‑3’,下游引物N6‑R1:5’‑ ATTATAATGTTAGTGATGTTTGT ‑3’。

【技术特征摘要】
1.一组可视化鉴别神经氨酸酶N6基因有无缺失的引物,其特征在于:所述引物序列为:上游引物N6-F1:5’-TATGAACATTCCAA...

【专利技术属性】
技术研发人员:万春和黄瑜程龙飞傅光华施少华陈红梅傅秋玲刘荣昌
申请(专利权)人:福建省农业科学院畜牧兽医研究所
类型:发明
国别省市:福建,35

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