一种基于高通量测序的双歧杆菌快速检测方法及应用技术

本发明专利技术公开了一种基于高通量测序的双歧杆菌快速检测方法及应用，属于分子生物学领域。本发明专利技术以groEL基因为筛选标记，可实现高通量鉴定，批量处理菌株信息，无需分离纯化即可全面鉴定复杂样品中的双歧杆菌组成，并且可以达到亚种水平，分辨率高于16S rRNA。通过基于groEL基因的特异性引物扩展，与传统的16S rRNA方法相比，将双歧杆菌属水平的鉴定周期至少缩短1天时间。本发明专利技术的方法能够100％鉴定双歧杆菌，对种和亚种的鉴定准确率达100％。

A rapid detection method and application of Bifidobacterium based on high throughput sequencing

【技术实现步骤摘要】
一种基于高通量测序的双歧杆菌快速检测方法及应用
本专利技术涉及一种基于高通量测序的双歧杆菌快速检测方法及应用，属于分子生物学

技术介绍
双歧杆菌作为人和其它一些动物肠道内重要的益生菌，备受工业界和学术界专家学者的关注。双歧杆菌不仅能抑制肠道中致病菌的生长进而调节和改善肠道菌群，双歧杆菌还能改善乳糖不耐症、降低血清胆固醇、促进免疫和发挥抗氧化等重要益生作用。大量国内外微生态学研究表明，双歧杆菌还具有抑菌、防癌、营养等多种功效。因此，研究人体以及其它动物肠道内的双歧杆菌显得尤为重要。但是，迄今为止，国际国内尚无统一的可将双歧杆菌菌株准确鉴定至种水平的方法。随着双歧杆菌菌株在益生菌制剂方面越来越广泛的应用，双歧杆菌菌种的鉴定越发显得重要，甚至需要鉴定至种的水平。细菌传统的鉴定方法主要是依据其形态学及生理生化等特性进行的，由于双歧杆菌形态的多变性以及专性厌氧和营养要求的复杂性，采用糖发酵等方法往往无法将性状相近的双歧杆菌菌种区分至种的水平。随着近年来分子生物学的发展，采用分子生物学方法对双歧杆菌进行属、种水平鉴定已有较大进展。目前的双歧杆菌分子生物学检测技术主要可包括三大类：(1)本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种鉴定双歧杆菌的方法，其特征在于，以groEL基因为标记物，以SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示序列为引物，扩增获得标记物基因片段的菌株为双歧杆菌。

【技术特征摘要】
1.一种鉴定双歧杆菌的方法，其特征在于，以groEL基因为标记物，以SEQIDNO.1和SEQIDNO.2所示序列为引物，扩增获得标记物基因片段的菌株为双歧杆菌。2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述标记物基因片段的大小为400～600bp。3.根据权利要求1或2所述的方法，其特征在于，所述扩增是对含有微生物基因组的对象进行扩增。4.根据权利要求3所述的方法，其特征在于，所述对象包括基因组DNA、菌悬液或单菌落。5.根据权利要求3所述的方法，其特征在于，所述扩增是以含待测混合物的基因组DNA为模板进行扩增。6.一种鉴定复杂样品中双歧杆菌亚种组成的方法，其特征在于，所述方法包括：(1)构建双歧杆菌groEL基因标准文库；(2)以SEQIDNO.1和SEQIDNO.2所示序列为引物，对复杂样品基因组中groEL...

【专利技术属性】
技术研发人员：陈卫，陆文伟，胡陆军，翟齐啸，赵建新，张灏，
申请(专利权)人：江南大学，
类型：发明
国别省市：江苏,32