【技术实现步骤摘要】
用于肺炎致病菌耐药基因快速检测的试剂盒
本专利技术涉及基因芯片技术,尤其涉及用于肺炎致病菌耐药基因快速检测的试剂盒。
技术介绍
近年来,由于空气污染的加剧及公共卫生事件的发生,呼吸道疾病引起越来越多的关注。肺炎是指包括终末气道,肺泡和肺间质等在内的肺实质性炎症,是全球感染性疾病死亡的首要原因[1]。据世界卫生组织(WHO)统计,每年约有350万人死于下呼吸道感染,居所有死亡原因的第三位[2]。在美国,肺炎和流行性感冒位于所有死因的第九位,2010年和2011均有5万多人死于肺炎[3-5],而且该统计没有将肺炎导致的败血症以及死于肺炎并发症的癌症、帕金森等病例纳入肺炎组,所以实际因肺炎死亡的人数比这个数还要高[2]。在我国,每年至少有250万人罹患肺炎,农村多于城市,其中5岁以下儿童肺炎死亡率为184/10万—1223万/10万[6],老年肺炎病死率没有确切的数据,但据黄华瑞报道[7]老年肺炎明显高于其他年龄段。可见,肺炎严重威胁着人类的生命健康。肺炎的致病原有很多,包括细菌、病毒、真菌、寄生虫等,其中最重要最常见的是细菌。众所周知,肺炎按照发病环境可分为社区获得性 ...
【技术保护点】
一种用于肺炎致病菌耐药基因快速检测的试剂盒,其包括基因芯片和用于多重不对称PCR反应的反应体系;所述基因芯片包括对应于肺炎致病菌耐药基因的探针;其中,所述肺炎致病菌耐药基因至少包括金属β内酰胺类耐药基因,所述金属β内酰胺类耐药基因包括NDM1、IMP、VIM中的至少一种;其中,对应于NDM1的探针的序列为:ATGGAAACTGGCGACCAACGGTTTGGCGATCTTTTTTTTTTTT;对应于IMP的探针的序列为:AGATAACGTAGTGGTTTGGTTTTTTTTTTTT;对应于VIM的探针的序列为:TCTAGAAGGACTCTCATCGATTTTTTTTTTTT ...
【技术特征摘要】
2017.09.08 CN 20171080336661.一种用于肺炎致病菌耐药基因快速检测的试剂盒,其包括基因芯片和用于多重不对称PCR反应的反应体系;所述基因芯片包括对应于肺炎致病菌耐药基因的探针;其中,所述肺炎致病菌耐药基因至少包括金属β内酰胺类耐药基因,所述金属β内酰胺类耐药基因包括NDM1、IMP、VIM中的至少一种;其中,对应于NDM1的探针的序列为:ATGGAAACTGGCGACCAACGGTTTGGCGATCTTTTTTTTTTTT;对应于IMP的探针的序列为:AGATAACGTAGTGGTTTGGTTTTTTTTTTTT;对应于VIM的探针的序列为:TCTAGAAGGACTCTCATCGATTTTTTTTTTTT;所述肺炎致病菌耐药基因还包括碳青霉烯类耐药基因,所述碳青霉烯类耐药基因包括OXA2、OXA10、OXA23、OXA48、KPC中的至少一种;其中,对应于OXA2的探针的序列为:TTGCAGGCCACAATCAAGACCAAGATTTTTTTTTTTTT;对应于OXA10的探针的序列为:TCAAATGGGACGGAAAGCCAAGAGCCATGAATTTTTTTTTTTT;对应于OXA23的探针的序列为:GAGAGTAATGGCTACAAAATTTTTTTTTTTTTTT;对应于OXA48的探针的序列为:AGTTTCTGGCTCGACGGTGGTATTCTTTTTTTTTTTT;对应于KPC的探针的序列为:TGACGGCCTTCATGCGCTCTATCGGCGATACTTTTTTTTTTTT;所述肺炎致病菌耐药基因还包括氨基糖苷类耐药基因,所述氨基糖苷类耐药基因包括aac(3)-II、aac(6')-I、ant(2")-I、ant(3")-I中的至少一种;其中,对应于aac(3)-II的探针的序列为:GTGGGTTCGGCCTGCTGAATCAATTTCTGGTTTTTTTTTTTT;对应于aac(6')-I的探针的序列为:AGGTCACCAAGATCCAAACGGACTTTTTTTTTTTT;对应于ant(2")-I的探针的序列为:CACGCAAGCACGATGATATTGATCTGACGTTTTTTTTTTTT;对应于ant(3")-I的探针的序列为:TCTCCGCGCTGTAGAAGTCACCATTGTTTTTTTTTTTTTT;所述肺炎致病菌耐药基因还包括喹诺酮类耐药基因,喹诺酮类耐药基因包括qnrA、qnrB、qnrS中的至少一种;其中,对应于qnrA的探针的序列为:ATGTACTTCTGCTCGGCTTATATCTCAGGTTTTTTTTTTTTT;对应于qnrB的探针的序列为:GTAGCGCATATATCACGAATACCAATCTAAGCTACGCCTTTTTTTTTTTT;对应于qnrS的探针的序列为:TCGCTGGATAGGAACGAACCTAGCTTTTTTTTTTTT;所述肺炎致病菌耐药基因还包括ESBLs类耐药基因,所述ESBLs类耐药基因包括CTX-M-14、CTX-M-15、SHV、TEM中的至少一种;其中,对应于CTX-M-14的探针的序列为:CAGCCTGTCGAGATCAAGCCTGTTTTTTTTTTTT;对应于CTX-M-15的探针的序列为:AGACTGGGTGTGGCATTGATTATTTTTTTTTTTT;对应于SHV的探针的序列为:CTCCAGCTGTTCGTCACCGGCATTTTTTTTTTTT;对应于TEM的探针的序列为:GTGCTGCCATAACCATGAGTGATAACTTTTTTTTTTTT;所述肺炎致病菌耐药基因还包括头孢菌素类耐药基因,所述头孢菌素类耐药基因为DHA;其中,对应于DHA的探针的序列为:GCTTGATGCGGAATCTTACGGTTTTTTTTTTTT;所述肺炎致病菌耐药基因还包括耐万古霉素类耐药基因,所述耐万古霉素类耐药基因包括vanA、vanB中的至少一种;其中,对应于vanA的探针的序列为:CCGCATTGTACTGAACGAAGTCTTTTTTTTTTTT;对应于vanB的探针的序列为:GCTTACCTACCCTGTCTTTGTGATTTTTTTTTTTT;所述肺炎致病菌耐药基因还包括耐甲氧西林类耐药基因,所述耐甲氧西林类耐药基因为mecA;其中,对应于mecA的探针的序列为:GTAAGCACACCTTCATATGACGTCTATCCTTTTTTTTTTTT;所述肺炎致病菌耐药基因还包括膜孔蛋白类耐药基因,所述膜孔蛋白类耐药基因为oprD2;其中对应于oprD2的探针的序列为:TGTTCCCGCAGACCGCGATTTTTTTTTTTT;其中,所述用于多重不对称PCR反应的反应体系包括:对应于NDM1的正向引物序列NDM1-F为:GCATTAGCCGCTGCATTGAT,反向引物序列NDM1-R为:CGGCATGTCGAGATAGGAAGT;对应于IMP的正向引物序列IMP-F为:CCACGTATGCATCTGAAT,反向引物序列IMP-R:ACTTTGGCCAAGCTTCTA;对应于VIM的正向引物序列VIM-F为:CAGTCTCCACGCACTTTCA,反向引物序列VIM-R为:GCAGCACCAGGATAGAAGA;对应于OXA2的正向引物序列OXA2-F为:CGCTGTTCGTGATGAGTTC,反向引物序列OXA2-R为:GCTGCCTTCTATCCAGTAATC;对应于OXA10的正向引物序列OXA10-F为:TCAATGGTGTCTTCGTGCT,反向引物序列OXA10-R为:CTTACTTCGCCAACTTCTCTG;对应于OXA23的正向引物序列OXA23-F为:CAGTCTATCAGGAACTTGCG,反向引物序列OXA23-R为:CATTGCCCAACCAGTCTT;对应于OXA48的正向引物序列OXA48-F为:TAAGTGGGATGGACAGACG,反向引物序列OXA48-R为:TTGACAATACGCTGGCTG;对应于KPC的正向引物序列KPC-F为:GGCCGCCGTGCAATACAGTGATAA...
【专利技术属性】
技术研发人员:陈良安,马秀清,王升启,刘琪琦,李春笋,梁志欣,杨震,赵微,
申请(专利权)人:中国人民解放军总医院,
类型:发明
国别省市:北京,11
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