用于检测胰腺癌的基因标志物、试剂盒及胰腺癌检测方法技术

本发明专利技术涉及用于检测胰腺癌的基因标志物、试剂盒及胰腺癌检测方法。基因标志物包括一个或两个以上以下基因：麦芽糖酶、C型外源凝集素家族4成员C、分选蛋白7、间质同源框2、FAT非典型钙粘蛋白1、黄素包含单氧酶3、囊性纤维化跨膜传导调节蛋白、磷脂磷酸酶相关蛋白3、α白蛋白和胶原蛋白V型α2链；通过高通量测序检测胰腺癌基因标志物中5‑羟甲基胞嘧啶的含量，从而判定胰腺癌是否存在。本发明专利技术检测胰腺癌具有安全无创、DNA来源广泛、准确性高、操作方便、用户体验好优点。本发明专利技术可与其他临床指标相结合，为胰腺癌筛查、诊断、治疗与预后提供更准确的判断。

Gene markers, kits and pancreatic cancer detection methods for detecting pancreatic cancer

The invention relates to a gene marker, a kit and a method for detecting pancreatic cancer for detecting pancreatic cancer. Genetic markers including one or more than two following genes: maltase, C type lectin family 4 member C, sorting protein 7, interstitial homeobox 2, FAT 1, including the atypical cadherin flavin monooxygenase 3, cystic fibrosis transmembrane conductance regulator protein and phospholipid phosphatase associated protein 3 and alpha albumin and collagen type V alpha 2 chain; the content of high-throughput sequencing to detect pancreatic cancer genetic markers in 5 hydroxymethylcytosine, to determine the existence of pancreatic cancer. The invention has the advantages of safety, non-invasive, wide DNA source, high accuracy, convenient operation and good user experience. The present invention can be combined with other clinical indicators to provide more accurate judgment for screening, diagnosis, treatment and prognosis of pancreatic cancer.

【技术实现步骤摘要】
用于检测胰腺癌的基因标志物、试剂盒及胰腺癌检测方法
本专利技术涉及胰腺癌的临床分子诊断的领域。具体地，本专利技术涉及用于检测胰腺癌的基因标志物、试剂盒及胰腺癌检测方法。
技术介绍
胰腺癌（PCA）是一种恶性程度很高，诊断和治疗都很困难的消化道恶性肿瘤，约90%为起源于腺管上皮的导管腺癌。本病发病率男性高于女性，男女之比为1.5～2:1，男性患者远较绝经前的妇女多见，绝经后妇女的发病率与男性相仿。目前胰腺癌的病因尚不十分清楚。其发生与吸烟、饮酒、高脂肪和高蛋白饮食、过量饮用咖啡、环境污染及遗传因素有关；近年来的调查报告发现糖尿病人群中胰腺癌的发病率明显高于普通人群；也有人注意到慢性胰腺炎病人与胰腺癌的发病存在一定关系，发现慢性胰腺炎病人发生胰腺癌的比例明显增。近年来，胰腺癌的发病率明显升高，30年代以来，美、英、日等国PCA发病率增加了2~4倍。上海市PCA在恶性肿瘤中的发病率由1974年的第14位上升到1993年的第8位。PCA发病率增加的速度仅次于胰腺癌，每10年约增加1.5%。虽然，近年来腹部外科的发展日新月异。很多腹部疾患，包括肿瘤在内，其诊断、治疗的水平随着基础医学的进展，影本文档来自技高网...

【技术保护点】
基因标志物用于检测胰腺癌的用途，通过高通量测序检测胰腺癌基因标志物中5‑羟甲基胞嘧啶的含量，从而判定胰腺癌是否存在，所述基因标志物包括一个或两个以上以下基因：麦芽糖酶（SI）、C型外源凝集素家族4成员C（CLEC4C）、分选蛋白7（SNX7）、间质同源框2（MEOX2）、FAT非典型钙粘蛋白1（FAT1）、黄素包含单氧酶3（FMO3）、囊性纤维化跨膜传导调节蛋白（CFTR）、磷脂磷酸酶相关蛋白3（PLPPR3）、α白蛋白（AFM）和胶原蛋白V型α2链（COL5A2）。

【技术特征摘要】
1.基因标志物用于检测胰腺癌的用途，通过高通量测序检测胰腺癌基因标志物中5-羟甲基胞嘧啶的含量，从而判定胰腺癌是否存在，所述基因标志物包括一个或两个以上以下基因：麦芽糖酶（SI）、C型外源凝集素家族4成员C（CLEC4C）、分选蛋白7（SNX7）、间质同源框2（MEOX2）、FAT非典型钙粘蛋白1（FAT1）、黄素包含单氧酶3（FMO3）、囊性纤维化跨膜传导调节蛋白（CFTR）、磷脂磷酸酶相关蛋白3（PLPPR3）、α白蛋白（AFM）和胶原蛋白V型α2链（COL5A2）。2.根据权利要求1所述的用途，其特征在于：所述基因标志物包括SI、CLEC4C、SNX7、MEOX2、FAT1、FMO3、CFTR、PLPPR3、AFM和COL5A2。3.一种用于检测胰腺癌的方法，其特征在于包括以下步骤：a）测定正常样品和受试者样品中权利要求1和2所述的基因标志物的5-羟甲基胞嘧啶的含量；b）用正常样品中所述基因标志物的5-羟甲基胞嘧啶含量作为参照，将受试者样品中对应的基因标志物的5-羟甲基胞嘧啶含量标准化，正常样品和受试者样品中同一基因标志物的5-羟甲基胞嘧啶含量分别为X和Y，则受试者样品中该基因标志物的标准化5-羟甲基胞嘧啶含量为Y/X；c）对步骤b）中经标准化的所述基因标志物的5-羟甲基胞嘧啶含量进行数学关联，并获得评分P；d）根据所述评分P的数值大小得到受试者样品是否患有胰腺癌的检测结果。4.根据权利要求3所述的方法，其特征在于步骤a）包括如下步骤：将来自胰腺癌患者和正常人的样品的DNA片段化；将所述片段化的DNA末端修复并末端补齐；将末端补齐的DNA与测序接头连接，获得连接...

【专利技术属性】
技术研发人员：陆星宇，宋艳群，彭莱，张子谋，
申请(专利权)人：上海易毕恩生物技术有限公司，上海易毕恩基因科技有限公司，
类型：发明
国别省市：上海,31