The present invention relates to a SNP marker, kit and application related to liver toxicity of antituberculosis drugs based on the CAMTA1 gene. The SNP marker comprises at least the SNP locus CAMTA1 of the rs6696544 gene. The present invention also provides a kit for assessing the risk of hepatotoxicity by antituberculosis drugs for detecting SNP markers related to the hepatotoxicity of antituberculosis drugs. Associated with anti tuberculosis drugs liver toxicity SNP markers and its application provided by the invention can accurately drug hepatotoxicity caused by molecular genetic markers of anti tuberculosis drugs, and molecular marker assisted selection and medication predict individual medication, reduce drug adverse reaction. In the research process of the invention, a large sample is studied, and the sample size is sufficiently representative to ensure the accuracy of the results of the study.
【技术实现步骤摘要】
基于CAMTA1基因的与抗结核药物肝毒性反应相关的SNP标志物、试剂盒及应用
本专利技术涉及单核苷酸多态性(SNP)标志物、试剂盒及应用，特别是涉及与抗结核药物引起的药物肝毒性反应相关的SNP标志物、试剂盒及应用，属于生物基因工程领域。
技术介绍
结核病可谓是传染病中的一个最大灾难——全世界每年会有上百万人因该病致死，是当前导致发展中国家居民(尤其是儿童)死亡的主要疾病之一。药物化疗是当前治疗结核病的主要手段，常用的药物为异烟肼(isoniazid，INH)、利福平(rifampicin，RFP)、吡嗪酰胺(pyrazinamide，PZA)和乙胺丁醇(ethambutol，EMB)。虽然药物化疗对于结核病的临床治疗效果较好，但是在治疗过程中出现的药物不良反应(adversedrugreactions，ADR)，影响了抗结核治疗效果和患者健康。其中，抗结核药物肝毒性反应(anti-tuberculosisdruginducedhepatotoxicity，ATDH)是最严重的常见抗结核ADR。既往研究认为年龄、体重、性别、合并用药、营养状况等因素会影响ATDH的发病。随着遗传领域中药物基因组学的发展，单核苷酸多态性(singlenucleotidepolymorphism，SNP)在揭示个体不同的表型性状、以及对于环境暴露、药物治疗等因素的不同反应的研究中受到人们的重视，有关SNP与ATDH个体差异的关系的研究越来越深入，且多聚焦于N-乙酰转移酶2基因(N-acetyltrangerase2，NAT2)。NAT2是治疗结核病的常用药物异烟肼(isoniaz...
【技术保护点】
一种基于CAMTA1基因的与抗结核药物肝毒性反应相关的SNP标志物，其特征在于，所述的SNP标志物包括CAMTA1基因的SNP位点rs6696544。
【技术特征摘要】
1.一种基于CAMTA1基因的与抗结核药物肝毒性反应相关的SNP标志物，其特征在于，所述的SNP标志物包括CAMTA1基因的SNP位点rs6696544。2.根据权利要求1所述的与抗结核药物肝毒性反应相关的SNP标志物，其特征在于，所述的SNP标志物还包括KCNE3基因的SNP位点rs12272502、BLNK基因的SNP位点rs2290714、PPP2R2B基因的SNP位点rs1031915、FLT3基因的SNP位点rs9319408、VAV2基因的SNP位点rs679106、XO基因的SNP位点rs1429372和IL6基因的SNP位点rs2069852中一个或多个。3.根据权利要求1或2所述的与抗结核药物肝毒性反应相关的SNP标志物，其特征在于，所述的SNP标志物还包括NAT2基因的SNP位点rs4921914、rs10103029、rs7816847、rs1041983、rs1495741中一个或多个。4.根据权利要求1或2所述的与抗结核药物肝毒性反应相关的SNP标志物在抗结核药物肝毒性反应方面非诊断的应用。5.根据权利要求3所述的与抗结核药物肝毒性反应相关的SNP标志物在抗结核药物肝毒性反应方面非诊断的应用。6.一种评估抗结核药物肝毒性反应风险的试剂盒，其特征在于，该试剂盒用于检测与抗结核药物肝毒性反应相关的SNP标志物，所述的SNP标志物包括CAMTA1基因的SNP位点rs6696544。7.根据权利要求6所述的一种评估抗结核药物肝毒性反应风险的试剂盒，其特征在于，所述的试剂盒含有特异于如权利要求6所述的SNP标志物的特异性扩增引物和/或特异于如权利要求6所述的SNP标志物的特异性延伸引物。8.根据权利要求7所述的一种评估抗结核药物肝毒性反应风险的试剂盒，其特征在于，在所述的含有的特异性扩增引物中：所述的SNP位点rs6696544的特异性扩增引物序列为SEQIDNo.1和SEQIDNo.2。9.根据权利要求8所述的一种评估抗结核药物肝毒性反应风险的试剂盒，其特征在于，在所述的含有的特异性延伸引物中：所述的SNP位点rs6696544的特异性延伸引物序列为SEQIDNo.3。10.根据权利要求8或9所述的一种评估抗结核药物肝毒性反应风险的试剂盒，其特征在于，该试剂盒还用于检测与抗结核药物肝毒性反应相关的KCNE3基因SNP位点rs12272502、BLNK基因SNP位点rs2290714、PPP2R2B基因SNP位点rs1031915、FLT3基因SNP位点rs9319408、VAV2基因SNP位点rs679106、XO基因SNP位点rs1429372和IL6基因SNP位点rs2069852中的一个或多个。11.根据权利要求10所述的一种评估抗结核药物肝毒性反应风险的试剂盒，其特征在于，所述的试剂盒还含有特异于如权利要求10所述的SNP标志物的特异性扩增引物和/或特异于如权利要求10所述的SNP标志物的特异性延伸引物。12.根据权利要求11所述的一种评估抗结核药物肝毒性反应风险的试剂盒，其特征在于，在所述的含有的特异性扩增引物中：所述的SNP位点rs12272502的特异性扩增引物序列为SEQIDNo.4和SEQIDNo.5；所述的SNP位点rs2290714的特异性扩增引物序列为SEQIDNo.7和SEQIDNo.8；所述的SNP位点rs1031915的特异性扩增引物序列为SEQIDNo.10和SEQIDNo.11；所述的SNP位点rs9319408的特异性扩增引物序列为SEQIDNo.13和SEQIDNo.14；所述的SNP位点rs679106的特异性扩增引物序列为SEQIDNo.16和SEQIDNo.17；所述的SNP位点rs1429372的特异性扩增引物序列为SEQIDNo.19和SEQIDNo.20；所述的SNP位点rs2069852的特异性扩增引物序列为SEQIDNo.22和SEQIDNo.23。13.根据权利要求12所述的一种评估抗结核药物肝毒性反应风险的试剂盒，其特征在于，在所述的含有的特异性延伸引物中：所述的SNP位点rs12272502的特异性延伸引物序列为SEQIDNo.6；所述的SNP位点rs2290714的特异性延伸引物序列为SEQIDNo.9；所述的SNP位点rs1031915的特异性延伸引物序列为SEQIDNo.12；所述的SNP位点rs9319408的特异性延伸引物序列为SEQIDNo.15；所述的SNP位点rs679106的特异性延伸引物序列为SEQIDNo.18；所述的SNP位点rs1429372的特异性延伸引物序列为SEQIDNo.21；所述的SNP位点rs2069852的特异性延伸引物序列为SEQIDNo.24。14.根据权利要求13所述的一种评估抗结核药物肝毒性反应风险的试剂盒，其特征在于，该试剂盒还用于检测NAT2基因SNP位点rs4921914、rs10103029、rs7816847、rs1041983、rs1495741中的一个或者多个。15.根据权利要求14所述的一种评估抗结核药物肝毒性反应风险的试剂盒，其特征在于，所述的试剂盒含有特异于如权利要求14所述的SNP标志物的特异性扩增引物和/或特异于如权利要求14所述的SNP标志物的特异性延伸引物。16.根据权利要求15所述的一种评估抗结核药物肝毒性反应风险的试剂盒，其特征在于，在所述的含有的特异性扩增引物中：所述的SNP位点rs4921914的特异性扩增引物序列为SEQIDNo.25和SEQIDNo.26；所述的SNP位点rs10103029的特异性扩增引物序列为SEQIDNo.28和SEQIDNo.29；所述的SNP位点rs7816847的特异性扩增引物序列为SEQIDNo.31和SEQIDNo.32；所述的SNP位点rs1041983的特异性扩增引物序列为SEQIDNo.34和SEQIDNo.35；所述的SNP位点rs1495741的特异性扩增引物序列为SEQIDNo.37和SEQIDNo.38。17.根据权利要求16所述的一种评估抗结核药物肝毒性反应风险的试剂盒，其特征在于，在所述的含有的特异性延伸引物中：所述的SNP位点rs4921914的特异性延伸引物序列为SEQIDNo.27；所述的SNP位点rs10103029的特异性延伸引物序列为SEQIDNo.30；所述的SNP位点rs7816847的特异性延伸引物序列为SEQIDNo.33；所述的SNP位点rs1041983的特异性延伸引物序列为SEQIDNo.36；所述的SNP位点rs1495741的特异性延伸引物序列为SEQIDNo.39。18.根据权利要求17所述的一种评估抗结核药物肝毒性反应风险的试剂盒，其特征在于，该试剂盒用于检测与抗结核药物肝毒性反应相关的CAMTA1基因的SNP位点rs6696544与KCNE3基因SNP位点rs12272502、BLNK基因SNP位点rs2290714、PPP2R2B基因SNP位点rs1031915、VAV2基因SNP位点rs679...
【专利技术属性】
技术研发人员：申阿东，曹诗琴，贺兆辉，王纯刚，晋家骧，
申请(专利权)人：北京光大隆泰科技有限责任公司，
类型：发明
国别省市：北京,11
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