手足口病混合感染中肠道病毒71型的检测方法技术
Detection of enterovirus 71 in mixed infection of hand foot and mouth disease
The invention discloses a method for detecting foot and mouth disease mixed infection of enterovirus 71, this method by extracting virus RNA, using enterovirus universal primers EntAF and A group EntARo RT PCR amplification, then semi nested PCR amplification with primers EntAF and EntARi, according to the intestinal virus A universal primers EV and A71 sequence specific EV A71 EV71AR0 upstream primer and downstream primer EV71ARi, RT PCR products as template was amplified by nested PCR, the 1% agarose gel electrophoresis of PCR products, can be identified. The method of the invention has the advantages of simple operation, fast detection speed, high accuracy, low cost, and the like, and is especially suitable for large-scale epidemiological investigation.
【技术实现步骤摘要】
手足口病混合感染中肠道病毒71型的检测方法
本专利技术属于生物
，具体涉及一种手足口病临床样品中肠道病毒71型的检测方法。
技术介绍
手足口病(Hand-foot-mouthdisease,HFMD)是由多种人类肠道病毒引起的常见传染病,以五岁以下婴幼儿发病为主,以发热和手、足、口腔等部位的皮疹或疱疹为主要特征,多数患者症状轻微预后良好,少数患者可并发呼吸道感染、肺水肿、心肌炎和无菌性脑膜炎等,病情进展快,易发生死亡。HFMD的流行已成为中国和东南亚国家的重大公共卫生问题之一。目前已经明确引起手足口病的病原体有二十多种,主要为小RNA病毒科肠道病毒属的柯萨奇病毒A组16、4、5、7、9、10型,B组2、5、13型、埃可病毒(ECHOviruses)以及人肠道病毒71型（enterovirus71，EV-A71）,其中以EV-A71和柯萨奇A组16型（CoxsackievirusA16，CV-A16）最为常见。多种肠道病毒的共同感染和/或混合感染普遍存在，而多种肠道病毒的共感染和/或混合感染又会加重疾病和/或延长病程。在临床实践中，当手足口病已经被鉴定为某种肠...
【技术保护点】
手足口病混合感染中肠道病毒71型的检测方法，其特征在于，所述方法包括以下步骤：（1）提取病毒RNA，根据肠道病毒VP1的特点设计肠道病毒A组通用引物EntAF（ 5’TNCARGCWGCNGARACNGG 3’）EntARo （5’ ANGGRTTNGTNGMWGTYTGCCA 3’）进行RT‑PCR扩增，然后用引物EntAF和EntARi （5’ GGNGGNACRWACATRTAYTG 3’）进行半巢式PCR扩增，测序并进行NCBI BLAST比对，如果该核苷酸序列与GenBank数据库中肠道病毒参考株核苷酸序列同源性大于75%，即认为是同一血清型，检测出手足口病患者感...
【技术特征摘要】
1.手足口病混合感染中肠道病毒71型的检测方法，其特征在于，所述方法包括以下步骤：（1）提取病毒RNA，根据肠道病毒VP1的特点设计肠道病毒A组通用引物EntAF（5’TNCARGCWGCNGARACNGG3’）EntARo（5’ANGGRTTNGTNGMWGTYTGCCA3’）进行RT-PCR扩增，然后用引物EntAF和EntARi（5’GGNGGNACRWACATRTAYTG3’）进行半巢式PCR扩增，测序并进行NCBIBLAST比对，如果该核苷酸序列与GenBank数据库...
【专利技术属性】
技术研发人员：马绍辉，杨昭庆，赵义林，黄小琴，孙浩，刘洪波，张海浩，
申请(专利权)人：中国医学科学院医学生物学研究所，
类型：发明
国别省市：云南,53
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