检测靶分子的非侵入性方法技术

本发明专利技术的实施方式涉及用于收集检测、测量和鉴定靶分子的非侵入性方法和组合物。在一些实施方式中，方法和组合物涉及胃肠灌洗液或粪便中的靶分子。

【技术实现步骤摘要】
本申请是申请日为2011年9月12日、申请号为201180074306.6、专利技术名称为“检测靶分子的非侵入性方法”的专利技术专利申请的分案申请。
本专利技术的实施方式涉及用于收集、检测、测量和鉴定靶分子的非侵入性方法和组合物。在一些实施方式中，方法和组合物涉及胃肠灌洗液(GLF)或粪便中的靶分子。参考序列表本申请与电子形式的序列表一起提交。所述序列表以2011年9月7日创建的名为USA_007WO.TXT的文件提供，其大小为约231KB。所述序列表的电子形式的信息以其整体通过引用引入本文。
技术介绍
与胃肠道(GI)和肝胆道以及与胃肠道有关的器官/组织有关的紊乱包括诸如胃癌、食道癌、肝癌、和胰腺癌等癌症。特别地，胰癌(例如，胰腺癌)是胰腺的一种恶性增长，其主要出现在胰管的细胞内。该疾病是第九种最常见的癌症形式，然而在男性与女性癌症死亡的主要原因中，分别位居第四与第五。胰腺癌几乎总是致命的，其中5年存活率低于3％。胰癌最常见的症状包括黄疸、腹痛、以及体重减轻，这些症状连同其它呈现的因素通常本质上是非特异性的。因此，在肿瘤生长的早期诊断胰癌通常是困难的，并且需要广泛的诊断检查，经常偶然在探查术期间发现。超声内镜是一种可用于诊断胰癌的非手术技术的实例。然而，难以可靠地检测小肿瘤以及区分胰癌和局限性胰腺炎。目前绝大多数的胰癌患者在晚期被确诊，即当肿瘤已经扩散到胰腺外从而侵入周围的器官和/或已经广泛转移。Gold等，Crit.Rev.Oncology/Hematology,39:147-54(2001)，以其整体通过引用引入本文。疾病的滞后检测常见于被诊断为通常导致死亡的疾病晚期的大多数患者中；仅有少数患者在疾病的早期被检测到。诊断与胃肠道相关的紊乱和疾病的侵入性技术是不方便的，并将受试者暴露于重大的风险中。因此，需要检测和鉴定来自胃肠道或相关器官/组织的靶分子的非侵入性的方法和组合物。在一些实施方式中，可评价所述靶分子以确定它们是否可用作与特定的特征如疾病、疾病倾向、对治疗方案的阳性响应、或对治疗方案无响应或阴性响应有关的生物标记。此外，来自胃肠道或相关器官/组织的生物标记可用于确定个体是否具有任何上述列举的特定特征。专利技术简述本专利技术的实施方式涉及用于收集、检测、测量和鉴定靶分子的非侵入性方法和组合物。在一些实施方式中，方法和组合物涉及胃肠灌洗液(GLF)或粪便中的靶分子。一些实施方式包括一种用于评价受试者的生理状态的方法，其包括：从所述受试者获得胃肠灌洗液；和检测所述胃肠灌洗液中来源于胃肠系统外部的靶分子。一些实施方式包括一种用于评价受试者的生理状态的方法，其包括：从所述受试者获得粪便样品；和检测所述粪便样品中来源于胃肠系统外部的靶分子。在一些实施方式中，所述胃肠灌洗液通过部分清洗所述受试者的胃肠系统而获得。在一些实施方式中，所述胃肠灌洗液包含粪便物。在一些实施方式中，所述粪便样品包含胃肠灌洗液。在一些实施方式中，所述靶分子包含多肽、抗体、胆汁酸、代谢产物或聚糖。在一些实施方式中，所述靶分子包含生物标记。在一些实施方式中，所述生物标记与疾病、对治疗的阳性响应、对治疗的部分响应、对治疗的阴性响应或对治疗无响应有关。在一些实施方式中，所述靶分子与癌症的存在或癌症倾向有关。在一些实施方式中，所述癌症是胰癌、结肠直肠癌、肝癌或胃癌。在一些实施方式中，所述靶分子来源于附属消化腺。在一些实施方式中，所述附属消化腺是唾液腺、胰腺、胆囊或肝。一些实施方式包括向所述受试者施用灌洗液。在一些实施方式中，口服施用灌洗液。在一些实施方式中，所述灌洗液包含选自由聚乙二醇、硫酸镁、硫酸钠、硫酸钾、柠檬酸镁、抗坏血酸、匹可硫酸钠和比沙可啶组成的组的成分。在一些实施方式中，所述灌洗液选自由GOLYTELY、HALFLYTELY、NULYTELY、SUPREP、FLEET'SPHOSPHO-SODA、柠檬酸镁和它们的通用等效物组成的组。一些实施方式包括在所述受试者上进行结肠镜检查。在一些实施方式中，所述受试者是哺乳动物。在一些实施方式中，所述受试者是人。一些实施方式包括一种用于鉴定生物标记的方法，其包括：从具有目标病症或生理状态的多个测试受试者获得测试胃肠灌洗液，并从不具有所述病症或生理状态的多个对照受试者获得对照胃肠灌洗液；测定所述测试胃肠灌洗液和对照胃肠灌洗液中至少5种靶分子的水平，和鉴定相对于所述对照胃肠灌洗液中的水平，以显著不同的水平存在于所述测试胃肠灌洗液中的靶分子，从而鉴定生物标记。在一些实施方式中，所述胃肠灌洗液包含粪便物。在一些实施方式中，所述靶分子选自由多肽、胆汁酸、抗体、代谢产物、聚糖及其组合组成的组。一些实施方式包括测定所述测试胃肠灌洗液和对照胃肠灌洗液中至少10种靶分子的水平。一些实施方式包括测定所述测试胃肠灌洗液和对照胃肠灌洗液中至少20种靶分子的水平。一些实施方式包括测定所述测试胃肠灌洗液和对照胃肠灌洗液中至少30种靶分子的水平。一些实施方式包括测定所述测试胃肠灌洗液和对照胃肠灌洗液中至少50种靶分子的水平。一些实施方式包括测定所述测试胃肠灌洗液和对照胃肠灌洗液中至少100种靶分子的水平。在一些实施方式中，所述生物标记与疾病、对治疗的阳性响应、对治疗的部分响应、对治疗的阴性响应或对治疗无响应有关。在一些实施方式中，所述生物标记与癌症的存在或癌症倾向有关。在一些实施方式中，所述癌症是胰癌、肝癌或胃癌。在一些实施方式中，至少一种靶分子来源于附属消化腺。在一些实施方式中，所述附属消化腺是唾液腺、胰腺、胆囊或肝。一些实施方式包括向所述测试受试者和所述对照受试者施用灌洗液。在一些实施方式中，口服施用灌洗液。在一些实施方式中，所述灌洗液包含选自由聚乙二醇、硫酸镁、硫酸钠、硫酸钾、柠檬酸镁、抗坏血酸、匹可硫酸钠和比沙可啶组成的组的成分。在一些实施方式中，所述灌洗液选自由GOLYTELY、HALFLYTELY、NULYTELY、SUPREP、FLEET'SPHOSPHO-SODA、柠檬酸镁和它们的通用等效物组成的组。一些实施方式包括在所述测试受试者和所述对照受试者上进行结肠镜检查。在一些实施方式中，所述测试受试者和对照受试者是哺乳动物。在一些实施方式中，所述测试受试者和对照受试者是人。一些实施方式包括一种用于鉴定生物标记的方法，其包括：从具有目标病症的多个测试受试者获得测试粪便样品，并从多个对照受试者获得对照粪便样品；测定所述测试粪便样品和对照粪便样品中至少5种靶分子的水平，鉴定相对于所述对照粪便样品中的水平，以显著不同的水平存在于所述测试粪便样品中的靶分子，从而鉴定生物标记。在一些实施方式中，所述粪便样品包含胃肠灌洗液。在一些实施方式中，所述靶分子选自由多肽、胆汁酸、抗体、代谢产物、聚糖及其组合组成的组。一些实施方式包括测定所述测试粪便样品和对照粪便样品中至少10种靶分子的水平。一些实施方式包括测定所述粪便样品和对照粪便样品中至少20种靶分子的水平。一些实施方式包括测定所述粪便样品和对照粪便样品中至少30种靶分子的水平。一些实施方式包括测定所述粪便样品和对照粪便样品中至少50种靶分子的水平。一些实施方式包括测定所述粪便样品和对照粪便样品中至少100种靶分子的水平。在一些实施方式中，所述生物标记与疾病、对治疗的本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种用于评价受试者的生理状态的方法，其包括：从所述受试者获得胃肠灌洗液；和检测所述胃肠灌洗液中来源于胃肠系统外部的靶分子。

【技术特征摘要】
1.一种用于评价受试者的生理状态的方法，其包括：从所述受试者获得胃肠灌洗液；和检测所述胃肠灌洗液中来源于胃肠系统外部的靶分子。2.一种用于评价受试者的生理状态的方法，其包含：从所述受试者获得粪便样品；和检测所述粪便样品中来源于胃肠系统外部的靶分子。3.权利要求1所述的方法，其中所述胃肠灌洗液通过部分清洗所述受试者的胃肠系统而从所述受试者获得。4.权利要求1所述的方法，其中所述胃肠灌洗液包含粪便物。5.权利要求2所述的方法，其中所述粪便样品包含胃肠灌洗液。6.权利要求1-5中任一项所述的方法，其中所述靶分子包含多肽、抗体、胆汁酸、代谢产物或聚糖。7.权利要求1-6中任一项所述的方法，其中所述靶分子包含生物标记。8.权利要求7所述的方法，其中所述生物标记与疾病、对治疗的阳性响应、对治疗的部分响应、对治疗的阴性响应或对治疗的无响应有关。9.权利要求1-8中任一项所述的方法，其中所述靶分子与癌症的存在或癌症倾向有关。10.权利要求8所述的方法，其中所述癌症是胰癌、结肠直肠癌、肝癌或胃癌。11.权利要求1-10中任一项所述的方法，其中所述靶分子来源于附属消化腺。12.权利要求11所述的方法，其中所述附属消化腺是唾液腺、胰腺、胆囊或肝。13.权利要求1-12中任一项所述的方法，其进一步包括向所述受试者施用灌洗液。14.权利要求13所述的方法，其中所述灌洗液口服施用。15.权利要求13所述的方法，其中所述灌洗液包含选自由聚乙二醇、硫酸镁、硫酸钠、硫酸钾、柠檬酸镁、抗坏血酸、匹可硫酸钠和比沙可啶组成的组的成分。16.权利要求13所述的方法，其中所述灌洗液选自由GOLYTELY、HALFLYTELY、NULYTELY、SUPREP、FLEET'SPHOSPHO-SODA、柠檬酸镁和它们的通用等效物组成的组。17.权利要求1-16中任一项所述的方法，其进一步包括在所述受试者上进行结肠镜检查。18.权利要求1-17中任一项所述的方法，其中所述受试者是哺乳动物。19.权利要求1-18中任一项所述的方法，其中所述受试者是人。20.一种鉴定生物标记的方法，其包括：从具有目标病症或生理状态的多个测试受试者获得测试胃肠灌洗液，并从不具有所述病症或生理状态的多个对照受试者获得对照胃肠灌洗液；测定所述测试胃肠灌洗液和对照胃肠灌洗液中至少5种靶分子的水平，和鉴定相对于所述对照胃肠灌洗液中的水平，以显著不同水平存在于所述测试胃肠灌洗液中的靶分子，从而鉴定生物标记。21.权利要求20所述的方法，其中所述胃肠灌洗液包含粪便物。22.权利要求20-21中任一项所述的方法，其中所述靶分子选自由多肽、胆汁酸、抗体、代谢产物、聚糖及其组合组成的组。23.权利要求20-22中任一项所述的方法，其包括测定所述测试胃肠灌洗液和所述对照胃肠灌洗液中至少10种靶分子的水平。24.权利要求20-22中任一项所述的方法，其包括测定所述测试胃肠灌洗液和所述对照胃肠灌洗液中至少20种靶分子的水平。25.权利要求20-22中任一项所述的方法，其包括测定所述测试胃肠灌洗液和所述对照胃肠灌洗液中至少30种靶分子的水平。26.权利要求20-22中任一项所述的方法，其包括测定所述测试胃肠灌洗液和所述对照胃肠灌洗液中至少50种靶分子的水平。27.权利要求20-22中任一项所述的方法，其包括测定所述测试胃肠灌洗液和所述对照胃肠灌洗液中至少100种靶分子的水平。28.权利要求20-27中任一项所述的方法，其中所述生物标记与疾病、对治疗的阳性响应、对治疗的部分响应、对治疗的阴性响应或对治疗的无响应有关。29.权利要求20-27中任一项所述的方法，其中所述生物标记与癌症的存在或癌症倾向有关。30.权利要求28所述的方法，其中所述癌症是胰癌、肝癌或胃癌。31.权利要求20-30中任一项所述的方法，其中至少一种靶分子来源于附属消化腺。32.权利要求31所述的方法，其中所述附属消化腺是唾液腺、胰腺、胆囊或肝。33.权利要求20-32中任一项所述的方法，其进一步包括向所述测试受试者和对照受试者施用灌洗液。34.权利要求33所述的方法，其中所述灌洗液口服施用。35.权利要求33所述的方法，其中所述灌洗液包含选自由聚乙二醇、硫酸镁、硫酸钠、硫酸钾、...

【专利技术属性】
技术研发人员：L·潘内尔，J·罗克，C·康特拉斯，J·迪帕尔马，
申请(专利权)人：克里蒂科斯有限责任公司，
类型：发明
国别省市：美国;US