用于H5N8禽流感病毒检测的试剂、检测方法及应用技术

技术编号:14497578 阅读:184 留言:0更新日期:2017-01-29 22:59
本申请公开了用于H5N8禽流感病毒检测的试剂、检测方法及应用。本申请用于H5N8禽流感病毒检测的试剂,包括引物对和探针,探针在引物对扩增靶标区域内,引物对上游引物为Seq ID No.1所示序列,下游引物为Seq ID No.2所示序列,探针为Seq ID No.3所示序列或Seq ID No.3所示序列的反向互补序列。本申请的H5N8禽流感病毒检测试剂,对禽流感亚种H5N8具有很强特异性,能够准确灵敏的从众多禽流感病毒中特异性检出H5N8。基于本申请试剂的H5N8禽流感病毒检测方法,耗时短,可很快作出判定结果,对于控制流感流行,减少经济损失,最大限度保护社会人群健康和生命具有很大意义。

【技术实现步骤摘要】

本申请涉及禽流感病毒检测领域,特别是涉及一种用于H5N8禽流感病毒检测的试剂、检测方法及应用
技术介绍
禽流感是禽流行性感冒的简称,它是由甲型流感病毒的一种亚型(也称禽流感病毒)引起的一种急性传染病,也能感染人类,被国际兽疫局定为甲类传染病。人感染后的症状主要表现为高热、咳嗽、流涕、肌痛等,多数伴有严重的肺炎,严重者心、肾等多种脏器衰竭导致死亡,病死率很高,通常人感染禽流感死亡率约为33%。此病可通过消化道、呼吸道、皮肤损伤和眼结膜等多种途径传播。流感病毒属正黏病毒科,由8条单股负链RNA构成基因组。流感病毒根据核心蛋白(NP)及基质(M)的抗原性不同,可分为A、B、C三型,其中致病性最强、在世界上流行最广的是A型流感病毒。A型流感病毒根据表面糖蛋白凝血素(HA)的不同,可以分为15个亚型,H1-H15,根据表面糖蛋白神经氨酸酶(NA)的不同可以分为9个亚型N1-N9,因此理论上共有135种亚型组合。H5N8禽流感病毒是禽流感病毒的一种亚型。流感危害极大,变异极强,宿主范围极广,是传播性极强的传染病和人兽共患病,是WHO、FDA、OIE等国际组织联合倡导全球共同防控的重大疫病。流感病毒有抗原漂移和抗原转变的要求,变异性极大,不断涌现新的病毒,近年来新型病毒出现的频率明显加大。1997年香港首次报道H5N1、H9N2感染人,2004年出现H5N1全球性流行,2013年3月在我国首先出现了H7N9型禽流感,2014年12月20日和2015年1月27新增83起人感染甲型H7N9禽流感病毒。H5N2禽流感在东亚多国──主要在越南、韩国、泰国──严重爆发,并造成越南多名病人丧生,中国河北省保定市首次发生H5N2禽流感疫情。2016年前后,广东肇庆和深圳接连出现H5N6流感病例,深圳2例病例中,一人已经死亡。自2014年8月以来,中国境内广东、湖南等12个省份家禽共发生新型H5N6高致病性禽流感25起,我国周边日本、韩国、俄罗斯也均有H5N6发生流行,新出现的H5N6逐步代替H5N1而成为家禽和人群中的优势流行毒株。2014年开始,H5N8开始在欧洲、亚洲和俄罗斯家禽中大规模流行,由于家禽与人的接触关系密切,H5N8必然会传染给人类。基于时效性和准确性上的优势,实时荧光RT-PCR技术已经在疫病检测的很多项目上逐步取代了一般RT-PCR方法,成为疫病检测领域最常用的分子生物学方法。但是到目前为止,我国目前尚没有比较有效的H5N8禽流感病毒的检测试剂和方法的报道。
技术实现思路
本申请的目的是提供一种用于H5N8禽流感病毒检测的试剂、检测方法及应用。本申请采用了以下技术方案:本申请的一方面公开了一种用于H5N8禽流感病毒检测的试剂,该试剂包括引物对和探针,探针在引物对的扩增靶标区域内,引物对的上游引物为SeqIDNo.1所示序列,引物对的下游引物为SeqIDNo.2所示序列,探针为SeqIDNo.3所示序列或者SeqIDNo.3所示序列的反向互补序列;SeqIDNo.1:5’-CTGCACATAAATACCCAACYCTGTA-3’SeqIDNo.2:5’-TGAGGAATGTTCTTGTTATCCAAATGA-3’SeqIDNo.3:5’-CCACTGTATCCCGACCAATT-3’SeqIDNo.1所示序列中,Y为C或者T碱基。需要说明的是,SeqIDNo.1所示序列中Y为简并碱基,其可以为C或者T碱基。本申请中,探针为SeqIDNo.3所示序列或者SeqIDNo.3所示序列的反向互补序列,可以理解,在实时荧光检测中,探针是特异性的结合到双链的其中一条链的,只要PCR扩增的时候,将结合的探针破坏,即可产生荧光信号,因此,可以采用SeqIDNo.3所示序列的探针结合到其中一条链上,也可以采用SeqIDNo.3所示序列的反向互补序列作为探针结合到另一条链上。优选的,探针的5’端标记有HEX荧光基因,3’端标记有BHQ淬灭基团。本申请的另一面公开了本申请的用于H5N8禽流感病毒检测的试剂在H5N8禽流感病毒检测中的应用。本申请的另一面公开了本申请的用于H5N8禽流感病毒检测的试剂在制备H5N8禽流感病毒检测试剂盒或设备中的应用。可以理解,本申请的试剂,实际上就针对H5N8禽流感病毒设计的特异性探针和引物,当然可以用于H5N8禽流感病毒的检测,或者用于H5N8禽流感病毒检测的试剂盒或设备。本申请的另一面公开了一种用于H5N8禽流感病毒检测的试剂盒,该试剂盒中含有本申请的用于H5N8禽流感病毒检测的试剂。本申请的另一面公开了一种用于H5N8禽流感病毒检测的试剂盒,该试剂盒中含有至少一组混合试剂,每组混合试剂由12.5μL2×realtimePCRBuffer、1μL25×enzymemix、终浓度0.4μM/L的引物对和终浓度0.2μM/L的探针组成;引物对的上游引物为SeqIDNo.1所示序列,引物对的下游引物为SeqIDNo.2所示序列,探针为SeqIDNo.3所示序列或者SeqIDNo.3所示序列的反向互补序列。需要说明的是,本申请的试剂实际上是针对H5N8禽流感病毒逆转录实时荧光PCR检测而设计的,为了方便使用,本申请将反应体系中使用的buffer、酶、引物和探针统一配制成混合试剂,每一组混合试剂就是一个反应体系,直接向其中加入RNA样品就可以进行检测,使用简单方便,不仅避免了配制反应体系的繁琐步骤,而且避免了配制反应体系过程造成的污染。本申请的再一面还公开了一种H5N8禽流感病毒的逆转录实时荧光PCR检测方法,包括以下步骤:(1)提取待测样品的基因组RNA;(2)采用权利要求6所述的试剂盒,向所述混合试剂中加入步骤(1)提取的基因组RNA,配制成反应溶液;(3)将步骤(2)配制的反应溶液,在45℃反转录30min、95℃热启动10min,然后进入40个循环:95℃15s、60℃45s,在循环过程中于60℃时采集荧光。优选的,基因组RNA的提取采用RNA提取试剂盒,或者Trizol核酸抽提法。本申请的有益效果在于:本申请的用于H5N8禽流感病毒检测的试剂,对禽流感亚种H5N8具有很强的特异性,能够准确灵敏的从众多禽流感病毒中特异性的检测出H5N8,为新型H5N8禽病毒的检测或监控提供了一种有效的方法和途径。此外,基于本申请的试剂的H5N8禽流感病毒检测方法,其耗时短,可以很快作出结果判定,这对于控制流感的流行,减少经济损失,最大限度的保护全社会人群的健康和生命具有很大的意义。附图说明图1是本申请实施例中H5N8禽流感病毒逆转录实时荧光PCR检测的特异性检测结果;图2是本申请实施例中H5N8禽流感病毒逆转录实时荧光PCR检测的灵敏度检测结果。具体实施方式下面通过具体实施例对本申请作进一步详细说明。以下实施例仅对本申请进行进一步说明,不应理解为对本申请的限制。实施例一、反应体系的建立和优化利用人工合成的H5N8禽流感病毒的病毒质粒作为阳性标准品,其它供试样本则利用商品化RNA提取试剂盒或Trizol核酸抽提试剂的提取方法提取病毒基因组RNA,分装后置-20℃保存备用。其它供试样本包括:H5N8灭活毒株、H5N1、H5N2、H9N2、新城疫病毒、鸡传染性支气管炎病毒、猪流感经典型H1N1毒株、猪流感本文档来自技高网
...
用于H5N8禽流感病毒检测的试剂、检测方法及应用

【技术保护点】
一种用于H5N8禽流感病毒检测的试剂,其特征在于:所述试剂包括引物对和探针,所述探针在引物对的扩增靶标区域内,所述引物对的上游引物为Seq ID No.1所示序列,所述引物对的下游引物为Seq ID No.2所示序列,所述探针为Seq ID No.3所示序列或者Seq ID No.3所示序列的反向互补序列;Seq ID No.1:5’‑CTGCACATAAATACCCAACYCTGTA‑3’Seq ID No.2:5’‑TGAGGAATGTTCTTGTTATCCAAATGA‑3’Seq ID No.3:5’‑CCACTGTATCCCGACCAATT‑3’Seq ID No.1所示序列中,Y为C或者T碱基。

【技术特征摘要】
1.一种用于H5N8禽流感病毒检测的试剂,其特征在于:所述试剂包括引物对和探针,所述探针在引物对的扩增靶标区域内,所述引物对的上游引物为SeqIDNo.1所示序列,所述引物对的下游引物为SeqIDNo.2所示序列,所述探针为SeqIDNo.3所示序列或者SeqIDNo.3所示序列的反向互补序列;SeqIDNo.1:5’-CTGCACATAAATACCCAACYCTGTA-3’SeqIDNo.2:5’-TGAGGAATGTTCTTGTTATCCAAATGA-3’SeqIDNo.3:5’-CCACTGTATCCCGACCAATT-3’SeqIDNo.1所示序列中,Y为C或者T碱基。2.根据权利要求1所述的用于H5N8禽流感病毒检测的试剂,其特征在于:所述探针的5’端标记有HEX荧光基因,3’端标记有BHQ淬灭基团。3.根据权利要求1或2所述的用于H5N8禽流感病毒检测的试剂在H5N8禽流感病毒检测中的应用。4.根据权利要求1或2所述的用于H5N8禽流感病毒检测的试剂在制备H5N8禽流感病毒检测试剂盒或设备中的应用。5.一种用于H5N8禽流感病毒检测的试剂盒,其特征在于:所述试剂盒中含有权利要求1或2所...

【专利技术属性】
技术研发人员:秦智锋刘建利唐金明曾少灵卢奕良蔡良语廖立珊陈兵马岚孙洁卢体康陶虹郑晓聪林庆燕陈书琨詹爱军兰文升曹琛福王津津
申请(专利权)人:深圳市检验检疫科学研究院深圳出入境检验检疫局动植物检验检疫技术中心清华大学深圳研究生院
类型:发明
国别省市:广东;44

网友询问留言 已有0条评论
  • 还没有人留言评论。发表了对其他浏览者有用的留言会获得科技券。

1