CSRP2在作为评估成人B-ALL患者预后风险标记物中的应用制造技术

技术编号:13768707 阅读:253 留言:0更新日期:2016-09-29 04:10
本发明专利技术公开了CSRP2在作为评估成人B‑ALL患者预后风险标记物中的应用。本发明专利技术所提供的应用具体为用于检测编码CSRP2蛋白的mRNA的检测物在制备用于B系急性淋巴细胞白血病患者预后风险评估的产品或评估B系急性淋巴细胞白血病患者预后风险中的应用。本发明专利技术实验结果证明,CSRP2低表达可能是成人B‑ALL患者OS、EFS和RFS的独立危险因素,可能在B‑ALL的分层诊断和预后评估中发挥重要作用。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于生物医药领域,涉及CSRP2在作为评估成人B-ALL患者预后风险标记物中的应用
技术介绍
B系急性淋巴细胞白血病(acute lymphoblastic leukemia,ALL)是成人最常见的ALL类型,危险分层和治疗方式的进步显著改善了患者的预后,但成人B-ALL复发率高,总体预后仍较差,长期生存仅为30%-40%。目前的危险度分层根据年龄,初诊白细胞计数,染色体核型,中枢神经系统受累以及对初始治疗的反应等将患者分为标危和高危[Burke PW,Douer D.Acute lymphoblastic leukemia in adolescents and young adults.Acta Haematol.2014;132:264–73.]。但值得注意的是,标危患者中仍有部分患者复发,提示目前的危险度分层仍有待精准化,因此新的预后相关分子标记物的发现和验证对于更精确的危险度分层十分必要,且可能提供治疗靶点。半胱氨酸和甘氨酸富集蛋白2(cysteine and glycine rich protein 2,CSRP2)是CSRP2基因家族成员之一,参与调节生长发育和细胞分化,可能在肿瘤发生中有一定作用。已有报道CSRP2在乳腺癌中上调,促进乳腺癌侵袭和转移[Hoffmann C,Mao X,Dieterle M,Moreau F,Al Absi A,Steinmetz A,Oudin A,Berchem G,Janji B,Thomas C.CRP2,a new invadopodia actin bundling factor critically promotes breast cancer cell invasion and metastasis.Oncotarget.2016Mar 22;7(12):13688-705.]。
技术实现思路
本专利技术的一个目的是提供一种CSRP2mRNA的新用途。本专利技术所提供的新用途具体为用于检测编码CSRP2蛋白的mRNA的检测物在如下(A)或(B)中的应用:(A)制备用于B系急性淋巴细胞白血病患者预后风险评估的产品;(B)评估B系急性淋巴细胞白血病患者预后风险。本专利技术还提供了一种用于评估B系急性淋巴细胞白血病患者预后风险的产品,含有用于检测编码CSRP2蛋白的mRNA的检测物。根据需要,所述产品还可包含数据处理装置1;所述数据处理装置1内设模块1;所述模块1具有如下(a1)和(a2)所示的功能:(a1)以由若干名未采取任何治疗措施的B系急性淋巴细胞白血病患者组成的待测群体的离体骨髓为标本,测定每份标本中所述mRNA的表达量,然后按照所述mRNA的表达量由低到高的顺序将所述待测群体进行排列并四等分,将表达量最低的1/4所述待测群体作为CSRP2低表达组,将
其余3/4所述待测群体作为CSRP2高表达组;(a2)按照如下标准确定来自于所述待测群体的待测者的预后风险:来自于所述CSRP2低表达组中的待测者的预后风险高于或候选高于来自于所述CSRP2高表达组中的待测者。在本专利技术中,所述检测物可为任何能够实现对所述mRNA进行定量检测的试剂和/或仪器。具体可选自如下中任一种:用于检测所述mRNA的特异性扩增引物和/或探针。对所述mRNA进行定量检测包括但不限于:设计CSRP2的PCR引物使用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)方法检测CSRP2的mRNA。在本专利技术中,所述检测物具体为由序列表中序列1和序列2所示的两条单链DNA组成的引物对,和/或由序列表中序列3所示的单链探针;所述单链探针的5’端标记有荧光报告基团(如FAM),3’端标记有荧光猝灭基团(如BHQ)。根据需要,所述产品中还可含有用于检测IKZF1基因是否缺失的物质。其中,这里的IKZF1基因缺失具体有如下几种情况:IKZF1基因的编码蛋白缺失第4-7个外显子、缺失第4-8个外显子、缺失第2-7个外显子和缺失第2-8个外显子。所述的IKZF1基因缺失可为如上情况中的任一种。在本专利技术中,所述用于检测IKZF1基因是否缺失的物质具体为实施例1表1中所示的“IKZF1Δ4-7,Δ4-8,Δ2-7和Δ2-8缺失引物和TaqMan探针”。进一步,所述IKZF1基因的GenBank登录号为NC_000007.14的第50303453-50405101位。相应的,所述产品还可包含数据处理装置2;所述数据处理装置2内设模块2;所述模块2具有如下(b1)和(b2)所示的功能:(b1)以由若干名未采取任何治疗措施的B系急性淋巴细胞白血病患者组成的待测群体的离体骨髓为标本,测定每份标本中所述IKZF1基因是否缺失,然后将所述待测群体分为IKZF1基因正常组和IKZF1基因缺失组;之后按照前文所述(a1)再将所述待测群体分为CSRP2低表达组和CSRP2高表达组;(b2)按照如下标准确定来自于所述待测群体的待测者的预后风险:在所述IKZF1基因正常组中,来自于所述CSRP2低表达组中的待测者的预后风险高于或候选高于来自于所述CSRP2高表达组中的待测者;在所述IKZF1基因缺失组中,来自于所述CSRP2低表达组中的待测者的预后风险不高于或候选不高于来自于所述CSRP2高表达组中的待测者。所述“用于检测编码CSRP2蛋白的mRNA的检测物”以及所述数据处理装置1在制备用于B系急性淋巴细胞白血病患者预后风险评估的产品或评估B系急性淋巴细胞白血病患者预后风险中的应用也属于本专利技术的保护范围。所述“用于检测编码CSRP2蛋白的mRNA的检测物”、所述“用于检测IKZF1基因是否缺失的物质”以及所述数据处理装置2在制备用于B系急性淋巴细胞白血病
患者预后风险评估的产品或评估B系急性淋巴细胞白血病患者预后风险中的应用也属于本专利技术的保护范围。在本专利技术中,所述预后风险为经过实施例1中相应治疗后的预后风险。所述预后风险的高低具体可体现为如下指标中的全部或部分:总生存率(OS),无复发生存率(RFS)和无事件生存率(EFS)。若所述总生存率(OS)越低,和/或所述无复发生存率(RFS)越低,和/或所述无事件生存率(EFS)越低,则所述预后风险越高;若所述总生存率(OS)越高,和/或所述无复发生存率(RFS)越高,和/或所述无事件生存率(EFS)越高,则所述预后风险越低。所述产品中还可包含记载有如下内容中的全部或部分的可读性载体:(1)采集待测者与健康对照者的骨髓标本,并测定其中所述mRNA的表达量,若所述待测者的骨髓标本中所述mRNA的表达量显著高于健康对照者的骨髓标本中所述mRNA的表达量,则所述待测者为或候选为B系急性淋巴细胞白血病患者;反之,则所述待测者不为或候选不为B系急性淋巴细胞白血病患者。(2)所述CSRP2低表达组的pre-B-ALL比例显著高于所述CSRP2高表达组。(3)所述CSRP2低表达组的IKZF1缺失阳性率显著低于所述CSRP2高表达组。(4)MLL重排仅出现在所述CSRP2高表达组,而在所述CSRP2低表达组中未出现。(5)单因素分析,所述CSRP2低表达组的所述总生存率(OS)显著低于所述CSRP2高表达组,但是所述CSRP2低表达组的所述无复发生存率(RFS本文档来自技高网
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【技术保护点】
用于检测编码CSRP2蛋白的mRNA的检测物在如下(A)或(B)中的应用:(A)制备用于B系急性淋巴细胞白血病患者预后风险评估的产品;(B)评估B系急性淋巴细胞白血病患者预后风险。

【技术特征摘要】
1.用于检测编码CSRP2蛋白的mRNA的检测物在如下(A)或(B)中的应用:(A)制备用于B系急性淋巴细胞白血病患者预后风险评估的产品;(B)评估B系急性淋巴细胞白血病患者预后风险。2.用于评估B系急性淋巴细胞白血病患者预后风险的产品,含有用于检测编码CSRP2蛋白的mRNA的检测物。3.根据权利要求2所述的产品,其特征在于:所述产品还包含数据处理装置1;所述数据处理装置1内设模块1;所述模块1具有如下(a1)和(a2)所示的功能:(a1)以由若干名未采取任何治疗措施的B系急性淋巴细胞白血病患者组成的待测群体的离体骨髓为标本,测定每份标本中所述mRNA的表达量,然后按照所述mRNA的表达量由低到高的顺序将所述待测群体进行排列并四等分,将表达量最低的1/4所述待测群体作为CSRP2低表达组,将其余3/4所述待测群体作为CSRP2高表达组;(a2)按照如下标准确定来自于所述待测群体的待测者的预后风险:来自于所述CSRP2低表达组中的待测者的预后风险高于或候选高于来自于所述CSRP2高表达组中的待测者。4.根据权利要求1-3中任一所述的应用或产品,其特征在于:所述检测物选自如下:用于检测所述mRNA的特异性扩增引物和/或探针。5.根据权利要求4所述的应用或产品,其特征在于:所述检测物为由序列表中序列1和序列2所示的两条单链DNA组成的引物对,和/或由序列表中序列3所示的单链探针。6.根据权利要求5所述的应用或产品,其特征在于:所述单链探针的5’端标记有荧光报告基团,3’端标记有荧光猝灭基团。7.根据权利要求2-6中任一所述的产品,其特征在于:所述产品中还含有用于检测IKZF1基因是否缺失的物质。8.根据权利要求7所述的产品,其特征在于:所述产品还包含数据处理装置2;所述数据处理装置2内设模块...

【专利技术属性】
技术研发人员:阮国瑞刘开彦黄晓军王树娟王卫敏卢文艺冯永怀张加敏姚秋妹周娇
申请(专利权)人:北京大学人民医院
类型:发明
国别省市:北京;11

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