与循环肿瘤细胞簇有关的方法以及癌症的治疗技术

本文所描述的是涉及循环肿瘤细胞(CTCs)的存在和/或水平的方法和检测。这些CTC‑Cs代表CTCs的高转移性的亚群。在一些实施方式中，本文所述的方法和检测涉及癌症的治疗。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】相关申请的交叉引用根据35U.S.C.§119(e)，本申请要求2013年10月21日递交的美国临时申请No.61/893,397、2013年11月25日递交的美国临时申请No.61/908,236和2013年12月20日递交的美国临时申请No.61/918,923的权益，以引用的方式将其内容整体并入本文。序列表本申请包含序列表，所述序列表已经以ASCII格式进行了电子提交，并以引用的方式将其整体并入本文。所述ASCII拷贝创建于2014年9月8日，命名为030258-079173-PCT_SL.txt，大小为11,455字节。
本文所述的技术涉及癌症的诊断和治疗。
技术介绍
血源性转移的当前模型基于如下的连续步骤：从原代肿瘤细胞移动入血流中开始；在循环中的生存；肿瘤细胞从血流移动入新的组织中；以及新的肿瘤的建立。循环肿瘤细胞(CTCs)已在大多数的上皮癌中测定到(Yu等，JCB 2011 192：373)，并且它们是理解癌症中的早期传播事件的关键。有趣的是，CTCs的数目大大超过患者中的转移病灶的数目，表明CTCs并不能同等地引起转移。可能是大多数的CTCs在血流中死亡，只有一小部分代表有活力的转移前体。识别CTCs内的转移池具有进一步细化对癌症转移的理解的可能性，并能够使得开发用于转移的人肿瘤的治疗的新药。
技术实现思路
如本文所述，本专利技术人发现循环肿瘤细胞(CTCs)的子集作为CTC簇(CTC-Cs)存在。此外，本专利技术人发现这些CTC-Cs代表CTCs的高转移性的亚群。这些CTC-Cs的标记物以及相应的测定CTC-Cs的存在和/或水平的方法在本文中进行了描述，同时描述了与通过抑制CTC-Cs的生长、生存和/或转移潜能来降低转移有关的方法。在一个方面，本文描述了检测，所述检测包括测量从患有乳腺癌或上皮癌的受试者获得的试样中的循环肿瘤细胞(CTC)簇的水平，如果相对于对照水平，CTC簇的水平增高，则确定受试者具有增高的癌症转移风险。在一些实施方式中，CTC簇的水平通过测量从受试者获得的试样中的CTC簇(CTC-C)标记基因的表达水平而进行测量；其中，CTC-C标记基因是从图9的列表中选择的基因。在一些实施方式中，CTC簇的水平通过测量从受试者获得的试样中的CTC簇(CTC-C)标记基因的表达水平而进行测量；其中，CTC-C标记基因是从表2、表3和/或表4的列表中选择的基因。在一些实施方式中，CTC-C标记基因是斑珠蛋白基因。在一些实施方式中，测量试样的循环肿瘤细胞中的CTC-C标记基因的表达水平。在一些实施方式中，测量从受试者获得的癌细胞中的CTC-C标记基因的表达水平。在一些实施方式中，使用HBCTC-Chip测量CTC簇的水平。在一些实施方式中，受试者是需要治疗癌症的受试者。在一些实施方式中，CTC簇的增高的水平是至少大于对照水平1.5倍的水平。在一些实施方式中，斑珠蛋白基因表达的增高的水平是至少大于对照水平1.5倍的水平。在一个方面，本文描述的是确定受试者是否具有增高的转移风险的方法，所述方法包括测量从患有乳腺癌或上皮癌的受试者获得的试样中的循环肿瘤细胞(CTC)簇的水平，如果相对于对照水平，CTC簇的水平增高，则确定受试者具有增高的癌症转移风险。在一些实施方式中，CTC簇的水平通过测量从受试者获得的试样中的CTC簇(CTC-C)标记基因的表达水平而进行测量；其中，CTC-C标记基因是从图9的列表中选择的基因。在一些实施方式中，CTC簇的水平通过测量从受试者获得的试样中的CTC簇(CTC-C)标记基因的表达水平而进行测量；其中，CTC-C标记基因是从表2、表3和/或表4的列表中选择的基因。在一些实施方式中，CTC-C标记基因是斑珠蛋白基因。在一些实施方式中，测量试样的循环肿瘤细胞中的CTC-C标记基因的表达水平。在一些实施方式中，测量从受试者获得的癌细胞中的CTC-C标记基因的表达水平。在一些实施方式中，使用HBCTC-Chip测量CTC簇的水平。在一些实施方式中，受试者是需要治疗癌症的受试者。在一些实施方式中，CTC簇的增高的水平是至少大于对照水平1.5倍的水平。在一些实施方式中，斑珠蛋白基因表达的增高的水平是至少大于对照水平1.5倍的水平。在一个方面，本文描述的是降低患有癌症的受试者中的循环肿瘤细胞(CTC)簇的水平的方法，所述方法包括降低CTC-C标记基因的表达水平或活性；其中，CTC-C标记基因是从图9的列表中选择的基因。在一些实施方式中，CTC-C标记基因是从表2、表3和/或表4的列表中选择的基因。在一些实施方式中，降低CTC-C标记基因的表达水平或活性包括给予CTC-C标记基因抑制核酸。在一些实施方式中，抑制核酸是siRNA。在一些实施方式中，CTC-C标记基因是斑珠蛋白基因。在一个方面，本文描述的是治疗癌症转移的方法，所述方法包括降低CTC-C标记基因的表达水平或活性；其中，CTC-C标记基因是从图9的列表中选择的基因。在一些实施方式中，CTC-C标记基因是从表2、表3和/或表4的列表中选择的基因。在一些实施方式中，降低CTC-C标记基因的表达水平或活性包括给予CTC-C标记基因抑制核酸。在一些实施方式中，抑制核酸是siRNA。在一些实施方式中，CTC-C标记基因是斑珠蛋白基因。在一个方面，本文描述的是治疗癌症的方法，所述方法包括：测量从患有乳腺癌或上皮癌的受试者获得的试样中的循环肿瘤细胞(CTC)簇的水平；如果相对于对照水平，CTC簇的水平增高，给予治疗以防止或降低转移；而如果相对于对照水平，CTC簇的水平未增高，则不给予防止或降低转移的治疗。在一些实施方式中，防止或降低转移的治疗选自于由如下所组成的组：如在上述段落中描述的治疗癌症转移的方法；化学疗法；放射疗法；或移除肿瘤。在一些实施方式中，不给予治疗可包括进行监测而不进行治疗介入的临床方法。在一些实施方式中，CTC簇的水平通过测量从受试者获得的试样中的CTC簇(CTC-C)标记基因的表达水平而进行测量；其中，CTC-C标记基因是从图9的列表中选择的基因。在一些实施方式中，CTC簇的水平通过测量从受试者获得的试样中的CTC簇(CTC-C)标记基因的表达水平而进行测量；其中，CTC-C标记基因是从表2、表3和/或表4的列表中选择的基因。在一些实施方式中，CTC-C标记基因是斑珠蛋白基因。在一些实施方式中，测量试样的循环肿瘤细胞中的CTC-C标记基因的表达水平。在一些实施方式中，测量从受试者获得的癌细胞中的CTC-C标记基因的表达水平。在一些实施方式中，使用HBCTC-Chip测量CTC簇的水平。在一些实施方式中，受试者是需要治疗癌症的受试者。在一些实施方式中，CTC簇的增高的水平是至少大于对照水平1.5倍的水平。在一些实施方式中，斑珠蛋白基因表达的增高的水平是至少大于对照水平1.5倍的水平。附图说明图1A-图1B表明乳腺癌患者中的CTC簇的存在与增加的疾病进展相关。图1A描述了示出如下的图，对总共79例患者和265个时间点分析了单一CTCs和CTC簇的存在，79例患者中的54例的CTCs评分为阳性。柱形图显示了仅具有单一CTCs的CTC阳性患者的百分比(灰色)、在一个时间点内具有CTC簇的百分比(白本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种治疗癌症的方法，所述方法包括：测量从患有乳腺癌或上皮癌的受试者获得的试样中的循环肿瘤细胞(CTC)簇的水平；如果相对于对照水平，所述CTC簇的水平增高，则给予治疗以防止或降低转移；以及如果相对于对照水平，所述CTC簇的水平未增高，则不给予防止或降低转移的治疗。

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】2013.10.21 US 61/893,397;2013.11.25 US 61/908,236;1.一种治疗癌症的方法，所述方法包括：测量从患有乳腺癌或上皮癌的受试者获得的试样中的循环肿瘤细胞(CTC)簇的水平；如果相对于对照水平，所述CTC簇的水平增高，则给予治疗以防止或降低转移；以及如果相对于对照水平，所述CTC簇的水平未增高，则不给予防止或降低转移的治疗。2.一种治疗乳腺癌或上皮癌的方法，所述方法包括：给予治疗以防止或降低受试者中的转移，所述受试者被确定为具有相对于对照水平增高的CTC簇水平。3.如权利要求2所述的方法，其中，所述方法进一步包括在确定具有相对于对照水平未增高的CTC簇水平的受试者中不给予防止或降低转移的治疗。4.如权利要求1-3中任一项所述的方法，其中，所述防止或降低转移的治疗选自与由如下所组成的组：如权利要求14-17中任一项所述的方法；化学疗法；放射疗法；或移除肿瘤。5.如权利要求1-4中任一项所述的方法，其中，不给予治疗可以包括进行监测而不进行治疗介入的临床方法。6.如权利要求1-5中任一项所述的方法，其中，所述CTC簇的水平通过测量从受试者获得的试样中的CTC簇(CTC-C)标记基因的表达水平而进行测量；其中，所述CTC-C标记基因是从表2、表3或表4的列表中选择的基因。7.如权利要求6所述的方法，其中，所述CTC-C标记基因是斑珠蛋白基因。8.如权利要求6-7中任一项所述的方法，其中，测量所述试样的循环肿瘤细胞中的CTC-C标记基因的表达水平。9.如权利要求6-8中任一项所述的方法，其中，测量从受试者获得的癌细胞中的CTC-C标记基因的表达水平。10.如权利要求1-9中任一项所述的方法，其中，使用HBCTC-Chip测量CTC簇的水平。11.如权利要求1-10中任一项所述的方法，其中，所述受试者是需要治疗癌症的受试者。12.如权利要求1-11中任一项所述的方法，其中，CTC簇的增高的水平是至少大于对照水平1.5倍的水平。13.如权利要求1-12中任一项所述的方法，其中，斑珠蛋白基因表达的增高的水平是至少大于对照水平1.5倍的水平。14.一种治疗癌症转移的方法，所述方法包括降低CTC-C标记基因的表达水平或活性；其中，所述CTC-C标记基因是从表2、表3或表4的列表中选择的基因。15.如权利要求14所述的方法，其中，降低CTC-C标记基因的表达水平或活性包括给予CTC-C标记基因抑制核酸。16.如权利要求15所述的方法，其中，所述抑制核酸是siRNA。17.如权利要求14-16中任一项所述的方法，其中，所述CTC-C标记基因是斑珠蛋白基因。18.一种检测，所述检测包括：测量从患有乳腺癌或上皮癌的受试者获得的试样中的循环肿瘤细胞(CTC)簇的水平；如果相对于对照水平，CTC簇的水平增高，则确定所述受试者具有增高的癌症转...

【专利技术属性】
技术研发人员：尼古拉·阿斯托，丹尼尔·阿里·哈伯尔，夏伊阿迈拉·马赫斯瓦兰，
申请(专利权)人：通用医疗公司，
类型：发明
国别省市：美国;US