AMSH基因突变体及其应用制造技术

技术编号:13463350 阅读:142 留言:0更新日期:2016-08-04 16:33
本发明专利技术公开了AMSH基因突变体及其应用,具体涉及分离的编码AMSH突变体的核酸,分离的多肽,筛选易患腓骨肌萎缩症的生物样品的方法,筛选易患腓骨肌萎缩症的生物样品的系统,以及用于筛选易患腓骨肌萎缩症的生物样品的试剂盒。其中,该分离的编码AMSH突变体的核酸,与SEQ ID NO:1相比,具有c.364A>G突变。通过检测该新突变体在生物样品中是否存在,可以有效地检测生物样品是否易患腓骨肌萎缩症。

【技术实现步骤摘要】
【专利摘要】本专利技术公开了AMSH基因突变体及其应用,具体涉及分离的编码AMSH突变体的核酸,分离的多肽,筛选易患腓骨肌萎缩症的生物样品的方法,筛选易患腓骨肌萎缩症的生物样品的系统,以及用于筛选易患腓骨肌萎缩症的生物样品的试剂盒。其中,该分离的编码AMSH突变体的核酸,与SEQ ID NO:1相比,具有c.364A>G突变。通过检测该新突变体在生物样品中是否存在,可以有效地检测生物样品是否易患腓骨肌萎缩症。【专利说明】AMSH基因突变体及其应用
本专利技术涉及AMSH基因突变体及其应用。具体地,本专利技术涉及分离编码AMSH突变 体的核酸、分离的多肽、筛选易患腓骨肌萎缩症的生物样品的系统、用于筛选易患腓骨肌萎 缩症的生物样品的试剂盒、构建体、重组细胞以及构建药物筛选模型的方法。
技术介绍
腓骨肌萎缩症(Charcot-Marie-Tooth Disease, CMT),又称遗传性运动感觉神经 病(hereditary motor and sensory neuropathy, HMSN)。CMT 是一组最常见的具有高度 临床和遗传异质性的周围神经单基因遗传病,主要影响运动神经元和/或感觉神经元以及 相关的Schwann cells。根据电生理标准,CMT主要分为两类:脱髓鞘型(CMT1)和轴突型 (CMT2)。CMT2又可分为14个亚型(CMT2A-CMT2N)。CMT患病率大概为1/2500,而CMT2A占 所有CMT病人的20-40 %。其中,CMT2A主要表现为远端肢体肌肉无力和/或萎缩,肢体远端 感觉丧失。后期手部出现骨间肌,大、小鱼际肌萎缩、形成猿手畸形、但萎缩一般不超过肘关 节以上,腿部的损伤先从腓肠肌开始,后逐渐扩展至骨间肌,小腿屈肌、最后累及大腿下1/3 肌肉,但其上部完全正常,形成"鹤腿"或倒置的酒瓶样畸形,因足背屈无力常呈马蹄内翻畸 形。本病可影响患者运动功能,难以进行精细的手指活动。严重患者需使用膝-踝-足矫 正器或轮椅。本病预后一般较好,病程进展缓慢,发病后仍能存活数十年。 目前已经发现MFN2、KIF1B基因的突变与CMT2A发病相关,但是仍有许多患者病因 未明,其他基因的突变可能也是导致该疾病的病因。因而,目前对腓骨肌萎缩症尤其是其致 病基因的研究仍有待深入。
技术实现思路
本专利技术旨在至少解决现有技术中存在的技术问题之一。为此,本专利技术的一个目的 在于提出一种能够有效筛选易患腓骨肌萎缩症的生物样品的手段。 本专利技术是基于专利技术人的下列工作完成的: 专利技术人发现,目前的致病基因和致病突变挖掘的研究中,多使用全外显子组测序 法。全外显子组测序是利用特制的DNA序列探针将全基因组中的外显子区域捕获下来,然 后针对每个外显子进行深度测序的技术。利用外显子组测序找出孟德尔遗传病致病基因的 案例很多,比如2009年美国Sarah B Ng等人利用外显子组测序成功定位出mile综合症的 基因 DH0DH (可参见:Ki jima, K.,et al. , Mitochondrial GTPase mitofusin 2mutation in Charcot-Marie-Tooth neuropathy type 2A. Hum Genet, 2005. 116 (1-2): 23-27?,通过参照 将其全文并入本文)。我国Wang等人利用外显子组测序发现了小脑共济失调的新的突变 基因 TGM6(可参见:Zhao,C.,et al.,Charcot-Marie-Tooth disease type 2A caused by mutation in a microtubule motor KIFIBbeta. Cell, 2001. 105(5):587-597.,通过参照将 其全文并入本文)。随着外显子组测序技术的广泛应用和日渐成熟,一批新的致病基因(突 变)被相继发现,极大地推动了相关疾病诊断及治疗的研究进展。 因而,专利技术人针对收集的一个五代CMT2A患者家系,通过外显子组测序、连锁分析 联合Sanger测序验证的方法进行致病突变挖掘和验证,最终确定了腓骨肌萎缩症的一个 新的致病基因--AMSH基因,以及其上的致病突变c. 364A>G突变。 进而,根据本专利技术的第一方面,本专利技术提出了一种分离的编码AMSH突变体的核 酸。根据本专利技术的实施例,所述核酸与SEQ ID N0:1相比,具有c. 364A>G突变,即相对于野 生型AMSH基因,本专利技术的AMSH基因突变体的cDNA序列第364位碱基A突变为G。根据本 专利技术的实施例,专利技术人确定了 AMSH基因的突变体,该突变体与腓骨肌萎缩症的发病密切相 关,从而通过检测该突变体在生物样品中是否存在,可以有效地检测生物样品是否易患腓 骨肌萎缩症。 根据本专利技术的第二方面,本专利技术提出了一种分离的多肽。根据本专利技术的实施例,与 SEQ ID N0:2相比,所述分离的多肽具有P.N122D突变,即该突变是由于c. 364A>G突变而 引起的,具体地,相对于野生型AMSH,本专利技术的分离的多肽(即AMSH突变体)的氨基酸序列 第122位氨基酸天冬酰胺突变为天冬氨酸。通过检测生物样品中是否表达该多肽,可以有 效地检测生物样品是否易患腓骨肌萎缩症。 根据本专利技术的第三方面,本专利技术提出了一种筛选易患腓骨肌萎缩症的生物样品的 系统。根据本专利技术的实施例,该系统包括:核酸提取装置,所述核酸提取装置用于从所述生 物样品提取核酸样本;核酸序列确定装置,所述核酸序列确定装置与所述核酸提取装置相 连,用于对所述核酸样本进行分析,以便确定所述核酸样本的核酸序列;判断装置,所述判 断装置与所述核酸序列确定装置相连,以便基于所述核酸样本的核酸序列或其互补序列, 与SEQ ID N0:1相比,是否具有c.364A>G突变,判断所述生物样品是否易患腓骨肌萎缩症。 利用该系统,能够有效地筛选易患腓骨肌萎缩症的生物样品。 根据本专利技术的第四方面,本专利技术提出了一种用于筛选易患腓骨肌萎缩症的生物样 品的试剂盒。根据本专利技术的实施例,该试剂盒含有:适于检测AMSH基因突变体的试剂,其中 与SEQ ID N0:1相比,该AMSH基因突变体具有c. 364A>G突变。利用根据本专利技术的实施例 的试剂盒,能够有效地筛选易患腓骨肌萎缩症的生物样品。 根据本专利技术的第五方面,本专利技术还提出了一种构建体。根据本专利技术的实施例,该构 建体包含前面所述的分离的编码AMSH突变体的核酸。由此,利用本专利技术的构建体转化受体 细胞获得的重组细胞,能够有效地用于筛选治疗腓骨肌萎缩症的药物。 根据本专利技术的第六方面,本专利技术还提出了一种重组细胞。根据本专利技术的实施例,该 重组细胞是通过前面所述的构建体转化受体细胞而获得的。根据本专利技术的一些实施例,利 用本专利技术的重组细胞,能够有效地筛选治疗腓骨肌萎缩症的药物。 根据本专利技术的第七方面,本专利技术还提出了一种构建药物筛选模型的方法。根据本 专利技术的实施例,该方法包括:使动物的至少一部分细胞表达前面所述的编码AMSH突变体的 核酸。由此,利用本专利技术的药物筛选模型,能够有效地筛选治疗腓骨肌萎缩症的药物。 需要说明的是,本专利技术发现的CMT2A的一个新致病基因AMSH的致病本文档来自技高网
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【技术保护点】
一种分离的编码AMSH突变体的核酸,其特征在于,所述核酸与SEQ ID NO:1相比,具有c.364A>G突变,任选地,所述核酸为DNA。

【技术特征摘要】

【专利技术属性】
技术研发人员:刘少君戴兰兰刘勇谌于蓝陈玉剑张建国阙海萍
申请(专利权)人:深圳华大基因科技有限公司中国人民解放军军事医学科学院基础医学研究所
类型:发明
国别省市:广东;44

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