SNP标记及其应用制造技术

本发明专利技术公开了SNP标记及其应用。其中，该SNP标记为山羊26号染色体5119569位置的碱基C或T。本发明专利技术的SNP标记与山羊的羊毛卷曲性状紧密相关，能够有效用于山羊的分子标记辅助育种。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及SNP标记及其应用。具体地，本专利技术涉及山羊羊毛卷曲性状相关的SNP 标记，用于检测前述SNP标记的引物对和试剂盒，前述SNP标记、引物对、试剂盒在山羊选育 中的用途，以及检测山羊羊毛卷曲性状的方法。
技术介绍
中国是世界上山羊品种资源最为丰富的国家，根据山羊用途不同可分为绒用、毛 用、裘用、羔皮、肉用和奶用山羊等。而山羊毛一般分为内、外两层。内层由皮肤中的次级毛 囊形成的无髓毛纤维，山羊绒细而柔软，光泽良好，保暖性能强，素有"软黄金"的美称，通常 作为我国重要的出口创汇纺织材料。外层粗毛由初级毛囊生长形成，与绵羊毛相比，弯曲 少。山羊毛主要用于织造地毯、毛毯、各种粗呢料、毛笔、帐篷等。通过对各种羊毛大量加工 的结果进行统计分析，发现羊毛纤维的卷曲度对纤维性能和纱线、织物性能存在着一定的 影响。在地毯织造过程中，采用卷曲毛一般来说可以提高抗压性和手感。但羊毛的卷曲有 时对加工是不利的，特别是过大的卷曲度对精纺加工及其产品不利。毛纤维卷曲度增加会 增加梳毛过程中纤维的断裂和落毛，卷曲度也影响到并合过程中的牵伸力。因而，生产养殖 中需要根据实际需求培育羊毛卷曲度不同（卷毛或直毛）的山羊品种。但是，传统的选择 手段难以取得有效进展。分子标记辅助选择，可以通过影响选择时间、选择强度以及准确性 而极大地提高这类性状的选择效果。 目前应用较广泛的分子遗传标记技术有：限制性片段长度多态分析技术 (RestrictionFragmentLengthPolymorphism，RFLP)、随机引物扩增多态性DNA技术 (RandomAmplifiedPolymorphismDNA，RAPD)、扩增片段长度多态性分析技术（Amplified FragmentLengthPolymorphism，AFLP)、单核苷酸多态性标记（singlenucleotide polymorphism,SNP)等。其中，SNP标记具有遗传稳定、突变率低、便于自动化检测等优点， 因此开发与山羊羊毛卷曲相关的SNP遗传标记将对培育所需羊毛卷曲的山羊新品种（系） 产生重大影响。其中，目前关于山羊羊毛卷曲的遗传标记的研究多基于已在其它品种或物 种中发现的毛发卷曲的候选基因。这些在山羊羊毛卷曲遗传机制研究中发现的羊毛卷曲相 关遗传标记多是初步的结果，并且局限于已有候选基因，利用这些结果，还难以对山羊羊毛 卷曲性状做出较准确的选择。因而，目前，在全基因水平上挖掘与羊毛卷曲性状相关的遗传 标记仍然很有必有。
技术实现思路
本专利技术旨在至少解决现有技术中存在的技术问题之一。为此，本专利技术的一个目的 在于提出一种与山羊羊毛卷曲性状相关，能够有效用于山羊选育的SNP标记。 其中，需要说明的是，SNP(singlenucleotidepolymorphism，SNP，即单核苷酸多 态性）是1996年由美国麻省理工学院的人类基因组研究中心学者Lander提出的一类分子 遗传标记，主要是指基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性。SNP表现 出的多态性仅涉及到单个碱基的变异，表现是有转换、颠换、插入和缺失等。 根据本专利技术的一个方面，本专利技术提供了一种山羊羊毛卷曲性状相关的SNP标记。 根据本专利技术的实施例，所述SNP标记为山羊26号染色体5119569位置的碱基C或T。 根据本专利技术的实施例，所述SNP标记位于SEQIDNO: 1所示核苷酸序列的方框标 记处： TACTTGAGGCATAGATTGTAGATAACTTTTTTGAAAAAGTGTTTGCTCCTGTGAGAAAGTTAGACTGTT ATCGTTAAAAATCAAATTCACAGTTGCGGTTCTTCTGTTTATTCAGGTAGAATTCAGGACTACTGAATTTACAAATT GATAACATTATGATTTATCCTTGAGCTGAAGAAATCAGTGATGTGTGAATAAAGGTTGCAAATGCTGATGAAGGCTT GTGTTGGTTATAGATTGAGTCTCAATAAAGTTTGGGTTTCTTTGCTTTCTGTTTTTTCTCCACTGCATTCAACATCA AGGTTTAACAAGGCAGTTTTCTTTTTACTTTTGGGTGGCAGGGCAGTGGTGGCTGGAAAGGGGAAATAAATTCTCAT TCACCTTTAAAATTCACAACCCCATGGACTGCAGCATGCCAAGCCTTCCTGTCCATCACCAACTCCCAGAGATTATG CAGACTCATGTTCATCGAGTTAATGATGCCATCCAGCCACCTCATCgCACCTTTAGCATTCTTCAGATTGGAGTCTT ATTAGACTTACATCTATGAGTGGGCCTTGATCTTGCCTCCTATTCTCTGAGCCACTCAAGACCTCATAAATTAAATT TTAAGTTCACTTGGATCAACAGAAACCCTATAAGTGAACTTACTGTCAGTACTAAACTGTCTAGATCCTTGTTTTCA TTTAGTTTTTGACCTTCATACTTATTTTCTTCTTATCTTCTTGATATGTTTAGGAAAAATTATTAAGATCCTTTCAG TTCAGTCAGT(SEQIDNO：1)〇 根据本专利技术的实施例，该SNP位点的CC、CT基因型个体中直毛个体比重显著高于 TT基因型的直毛个体比重。由此，该SNP位点的CC和CT基因型可以作为判断山羊直卷毛 性状的重要标准。 即专利技术人发现，该SNP位点的CC、CT基因型个体中直毛个体比重极显著高于TT基 因型的直毛个体比重（P= 0.000)。进而，表明该SNP位点的CC和CT基因型可以作为判断 山羊直卷毛性状的重要标准。进而，根据本专利技术的实施例，通过检测山羊的上述SNP，能够有 效地预测其羊毛卷曲性状，具体地，如前所述，该SNP位点的CC、CT基因型个体中直毛个体 比重显著高于TT基因型的直毛个体比重。从而，例如所述SNP标记位点的基因型为CC和 /或CT时，则能够预测待测山羊很大可能为直毛个体。由此，专利技术人确定，本专利技术的SNP标 记与山羊的羊毛卷曲性状紧密相关，能够有效用于山羊的分子标记辅助育种。进而能够根 据实际育种需求对山羊育种材料进行早期选择（例如选择直毛山羊个体），进一步能够有 效提1?育种的效率和准确性，提1?山羊繁殖群体的遗传水平，从而能够准确、1?效地选育出 山羊优良品种。此外，根据本专利技术的一些实施例，利用本专利技术的SNP标记进行山羊分子标记 辅助育种，具有早期筛选、节省时间、成本低廉、准确性高的优点。 根据本专利技术的另一方面，本专利技术还提供了一种用于检测前面所述的本专利技术的一种 SNP标记的引物对。根据本专利技术的实施例，所述引物对包含：具有SEQIDNO:2-3所示的核 苷酸序列，用于检测所述SNP标记。 具体地，引物对的序列如下所示： F：CAAGGTTTAACAAGGCAGTT(SEQIDNO：2) R：CTGTTGATCCAAGTGAACTT(SEQIDNO：3) 根据本专利技术的实施例，利用本专利技术的引物对能够有效地对待测山羊的上述与羊毛 本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种山羊羊毛卷曲性状相关的SNP标记，其特征在于， 所述SNP标记为山羊26号染色体5119569位置的碱基C或T。

【技术特征摘要】

【专利技术属性】
技术研发人员：张清峰，张耕耘，夏秋菊，宋峰峰，苗泽圃，范艺翔，陈庆春，王宇，
申请(专利权)人：深圳华大农业与循环经济科技有限公司，
类型：发明
国别省市：广东;44