【技术实现步骤摘要】
SSR和EST-SSR标记在小麦中的应用属于小麦种质资源研究的重要领域。
技术介绍
大多数小麦SSR标记都是基因组专化性的,只在小麦A、B或D基因组含有一个SSR的特定位点扩增,与其它的分子标记相比,信息量高而且利用更方便。所以SSR已替代RFLP进行小麦的遗传作图。
技术实现思路
1、构建遗传学图谱大多数小麦SSR标记都是基因组专化性的,只在小麦A、B或D基因组含有一个SSR的特定位点扩增,与其它的分子标记相比,信息量高而且利用更方便。所以SSR已替代RFLP进行小麦的遗传作图。李卫华等以小麦京771和Pm97034及其173个后代重组自交系(RIL)为作图群体,利用从906对引物筛选出的270对多态性引物对该群体进行分析,共检测到184个多态性标记位点,利用其中的129个标记构建小麦分子的遗传连锁图谱。用Mapmaker3.0和MapdrawV2.1软件将129个SSR位点绘在小麦遗传连锁图上,该图谱覆盖小麦基因组全长2106.2cM,标记间的平均遗传距离为16.32cM。陈海梅等利用普通小麦EST数据库(GenBank/dbEST)中最新的151,695条EST序列进行了微卫星序列筛选,共发现微卫星序列2,038个。根据这些序列设计并合成249个引物对,PCR扩增结果表明,166对可以作为小麦和相关物种新的EST-SSR标记。利用RIL群体将43对EST-SSR位点绘制到遗传图谱11条染色体上。2、遗传多样性的研究在DNA标记中,SSR的普遍存在性、高度变异性和信息量的高多态性,使得它在鉴定小麦遗传多样性的作用,在其应用于小麦研究中的一开始就得到证明。 ...
【技术保护点】
构建遗传学图谱 大多数小麦SSR标记都是基因组专化性的,只在小麦A、B或D基因组含有一个SSR的特定位点扩增,与其它的分子标记相比,信息量高而且利用更方便,所以SSR已替代RFLP进行小麦的遗传作图, 李卫华等以小麦京771和Pm97034及其173个后代重组自交系(RIL)为作图群体,利用从906对引物筛选出的270对多态性引物对该群体进行分析,共检测到184个多态性标记位点,利用其中的129个标记构建小麦分子的遗传连锁图谱,用Mapmaker3.0和Mapdraw V2.1软件将129个SSR位点绘在小麦遗传连锁图上,该图谱覆盖小麦基因组全长2106.2cM,标记间的平均遗传距离为16.32cM, 陈海梅等利用普通小麦EST数据库(GenBank/dbEST)中最新的151,695条EST序列进行了微卫星序列筛选,共发现微卫星序列2,038个,根据这些序列设计并合成249个引物对,PCR扩增结果表明,166对可以作为小麦和相关物种新的EST-SSR标记,利用RIL群体将43对EST-SSR位点绘制到遗传图谱11条染色体上。
【技术特征摘要】
1.构建遗传学图谱大多数小麦SSR标记都是基因组专化性的,只在小麦A、B或D基因组含有一个SSR的特定位点扩增,与其它的分子标记相比,信息量高而且利用更方便,所以SSR已替代RFLP进行小麦的遗传作图,李卫华等以小麦京771和Pm97034及其173个后代重组自交系(RIL)为作图群体,利用从906对引物筛选出的270对多态性引物对该群体进行分析,共检测到184个多态性标记位点,利用其中的129个标记构建小麦分子的遗传连锁图谱,用Mapmaker3.0和Mapdraw V2.1软件将129个SSR位点绘在小麦遗传连锁图上,该图谱覆盖小麦基因组全长2106.2cM,标记间的平均遗传距离为16.32cM,陈海梅等利用普通小麦EST数据库(GenBank/dbEST)中最新的151,695条EST序列进行了微卫星序列筛选,共发现微卫星序列2,038个,根据这些序列设计并合成249个引物对,PCR扩增结果表明,166对可以作为小麦和相关物种新的EST-SSR标记,利用RIL群体将43对EST-SSR位点绘制到遗传图谱11条染色体上。2.遗传多样性的研究在DNA标记中,SSR的普遍存在性、高度变异性和信息量的高多态性,使得它在鉴定小麦遗传多样性的作用,在其应用于小麦研究中的一开始就得到证明,而EST-SSR反映的是生物基因表达的转录部分,所以这两种标记都广泛用于小麦遗传多样性研究和核心种质的构建,傅体华等选用小麦染色体上的60个SSR标记,对来自四川3个不同单位近30年育成的47个普通小麦品种的遗传多样性进行了分析,60个SSR位点中共检测到118个等位变异,每个位点的等位变异范围为1-5个,平均1.08个,品种的遗传相似系数从1980年以来有逐渐升高的趋势。王珊珊等利用SSR标记研究了“矮孟牛”及其衍生品种(系)共计91份小麦材料的遗传多样性。20对SSR引物检测到120个多态性位点,每对引物多态性位点数平均为6.0个,91份小麦材料的遗传距离变幅为0.411-0.961,遗传差异较大,王林海等利用79对SSR引物对河南省审定的46个小麦品种进行了分析。结果表明,79对引物共检测到298个等位变异,每个引物检测到的等位变异数目2-7个,平均3.77个。品种间的遗传距离为0.33-0.84,平均为5.0。聚类分析把这些品种分为6大类和8个亚类。李宏伟等采用35对小麦EST-SSR标记检测了96份小麦材料的遗传多样性,共检测到12...
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