本发明专利技术涉及与冠心病相关的多个基因单核苷酸多态性位点组合及其应用，具体涉及包括rs2123536、rs1842896、rs9349379、rs9268402、rs12524865、rs10757274、rs1333042、rs7136259和rs11066280的单核苷酸多态性位点组合，其中，所述rs2123536携带T等位基因、rs1842896携带T等位基因、rs9349379携带G等位基因、rs9268402携带G等位基因、rs12524865携带C等位基因、rs10757274携带G等位基因、rs1333042携带G等位基因、rs7136259携带T等位基因和rs11066280携带A等位基因的个体患冠心病的风险升高1.13到1.36倍，本发明专利技术还涉及针对所述单核苷酸多态性位点及其组合的检测方法以及用于评估人群冠心病患病风险中的应用。
【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及与冠心病相关的多个基因单核苷酸多态性位点组合及其应用，具体涉及包括 rs2123536、rsl842896、rs9349379、rs9268402、rsl2524865、rsl0757274、rsl333042、rs7136259和rsl 1066280的单核苷酸多态性位点组合、针对所述单核苷酸多态性位点及其组合的检测方法以及用于评估人群冠心病患病风险中的应用。
技术介绍
动脉粥样硬化性心脑血管病已成为世界范围关注的主要健康问题。2004年的世界卫生组织(WHO)报告显示，全世界每年心血管疾病以冠心病和脑卒中为主导致的死亡人数达高达1720万，占所有死亡人数的三分之一。预计2020年这一数字将进一步增加50%，高达2500万，心血管疾病是全球人类的“头号杀手”。在中国进行的一项大规模前瞻性研究 也显示，心脏疾病已经成为中国人群的主要死亡原因，分列男、女性死亡原因的第2位和第I位。我国每年新发心肌梗死50万人，随着生活方式的改变以及动脉粥样硬化相关的危险因素持续增加，冠心病与心肌梗死发病也还将呈持续上升趋势。大量的研究资料表明，冠心病是一种复杂疾病，是由多个微效基因与环境因素长期相互作用所致。因此鉴定出与冠心病相关的易感基因或致病基因，在人群中进一步筛选增加疾病风险的易感基因确定易感个体，将有助于冠心病的发病风险预测、新药开发、诊断和个体化治疗。从基础到临床，人们对此进行了大量的研究，并在冠心病的危险因素和冠心病发生的病理生理学方面积累了大量的知识，但是关于冠心病与心肌梗死发生的确切遗传分子机制却知之甚少，对于怎样鉴定遗传易感基因以及鉴定受试者的冠心病遗传易感性，一直缺乏全面系统有效的识别方法。早期识别冠心病高危人群，采取针对性的生活方式干预，是减少冠心病发生，从而遏制医疗费用增长、延长期望寿命的关键。目前，大家普遍认为在个体水平采用模型方法利用个体传统危险因素水平是识别冠心病高危人群的有效方法。危险预测已为疾病预防、政府决策和卫生干预方案效果评价，同时也可以为临床治疗提供可参考的信息。全基因组学技术与流行病学方法的整合为人类复杂疾病或性状的生物学研究带来了全新的视角。个体风险评估是其临床决策的一个重要组成部分，若据此采取更早或更强的干预措施，患者有可能从中受益。目前已发现，冠心病相关的遗传易感性基因座可对冠心病发病风险发挥独立影响，因此应重新评估这些遗传变异在疾病风险预测中的作用。以有效提高疾病风险预测的能力，从而在传统危险因素的基础上进一步加强对疾病风险的认识。
技术实现思路
针对上述问题，本专利技术的一个目的是提供一种多个基因单核苷酸多态性位点组合；本专利技术的另一个目的是提供所述的多个基因单核苷酸多态性位点组合的应用，具体是其在制备用于评估待测个体患冠心病风险的检测装置或模型中的应用；本专利技术的另一个目的是提供一种检测本专利技术的多个基因单核苷酸多态性位点的方法；本专利技术的另一目的是提供一种体外检测冠心病相关基因的方法；本专利技术的另一目的是提供一种检测本专利技术的多个基因单核苷酸多态性位点的试剂在制备用于体外检测冠心病相关基因的制剂、试剂盒或检测装置或模型中的应用；本专利技术的另一目的是提供一种体外检测来自待测个体的样品中多个基因单核苷酸多态性位点的试剂在制备预测待测个体患冠心病的危险性的制剂、试剂盒或检测装置或模型中的应用；本专利技术的另一目的是提供一种体外预测待测个体患冠心病的危险性的方法。本专利技术的另一目的是提供一种用于评估待测个体患冠心病风险的检测装置，根据基因多态性预测个体冠心病发病风险，能够很好的识别冠心病的高危人群，从而针对性的进行干预，达到延缓和预防冠心病发生的目的。首先，本专利技术提供了一种多个基因单核苷酸多态性位点组合，所述的多个基因单核苷酸多态性位点包括以下位点rs2123536、rsl842896、rs9349379、rs9268402、rsl2524865、rsl0757274、rsl333042、rs7136259 和 rsll066280。上述多态性位点是在大量 实验的基础上得出的。在本专利技术的具体实施方式中，利用Fludigm@EPl tmGENETIC ANALYSISsystem, Taqman MGB探针法对7012例冠心病患者和8579例对照样本进行基因分型实验，对数据进行大量实验研究分析，首次得出上述9个SNP位点(rs2123536、rsl842896、rs9349379、rs9268402、rsl2524865、rsl0757274、rsl333042、rs7136259 和 rsll066280)与冠心病易感性显著相关。在本专利技术的大量实验结果基础上，本专利技术的进一步研究发现，这些SNPs的危险等位基因分别是rs2123536多态性位点为T、rsl842896多态性位点为T、rs9349379多态性位点为G、rs9268402多态性位点为G、rsl2524865多态性位点为C、rsl0757274多态性位点为G、rsl333042多态性位点为G、rs7136259多态性位点为T、rsl 1066280多态性位点为A。携带这些危险等位基因的个体发生冠心病的相对风险是没有携带者的I. 13到I. 36倍。从而，一方面，本专利技术提供一种检测本专利技术的多个单核苷酸多态性位点的方法。可用本领域已知的多种技术在DNA水平、RNA水平检测本专利技术所述的多个单核苷酸多态性位点。例如可以采用直接测序的方法，通过DNA直接测序可以直接揭示对照基因和携带突变基因之间的序列差异，具体可以是传统的使用商业测序试剂盒或自动测序仪对DNA直接进行测序，或是近年来发展的焦磷酸测序(Pyrosequencing)、微测序(SNaPshot)等。焦磷酸测序技术适于对已知的短序列的测序分析，其原理是引物与模板DNA退火后，在DNA聚合酶(DNApolymerase)、ATP 硫酸化酶(ATP sulfurytase)、突光素酶(Iuciferase)和三憐酸腺苷双磷酸酶(Apyrase)4种酶的协同作用下,将引物上每一个dNTP的聚合与一次突光信号的释放偶联起来，通过检测荧光的释放和强度，达到实时测定DNA序列的目的。SnaPshot技术平台是Applied Biosystems,ABI公司推出了专为检测SNP设计的分析软件和试剂盒,可对多个SNP位点同时进行基因分型，也被称为minisequencing，该方法针对不同突变位点设计不同长度的引物SNaPshot反应后,产物通过电泳分离、五色突光检测、Gene mapper分析，可在一次电泳胶内检测多个SNP位点。也可以采用基于杂交的方法,具体包括Taqman探针法,DNA芯片法等。TaqMan SNP基因分型原理利用核酸外切酶对5’特异等位基因染色标记的切除产生持续的检验信号，反应体系包括以基因组DNA或PCR产物为模板；一对PCR引物，以及分别用FAM和VIC标记的2条MGB探针检测SNP的两种类型；在PCR反应终点读取分型数据。DNA芯片技术待测基因经提取后，被切成长短不一的片段，经荧光化学物质标记后，注射到嵌有芯片的载片上，由于DNA和探针杂交的程度与荧光强度相关，因此通过激光扫描，即可根据荧光强弱测出被检测序列的变异。还可以采用基于引物延伸的方法，如基本文档来自技高网...
【技术保护点】
多个基因单核苷酸多态性位点组合，所述的多个基因单核苷酸多态性位点包括以下位点：rs2123536、rs1842896、rs9349379、rs9268402、rs12524865、rs10757274、rs1333042、rs7136259和rs11066280。
【技术特征摘要】
【专利技术属性】
技术研发人员：顾东风，鲁向锋，黄建凤，曹杰，王来元，李宏帆，
申请(专利权)人：中国医学科学院阜外心血管病医院，
类型：发明
国别省市：
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