肠炎沙门氏菌的链置换恒温扩增(SDA)快速检测试剂盒及其检测方法技术

技术编号:7218278 阅读:336 留言:0更新日期:2012-04-11 18:40
本发明专利技术涉及一种用依赖于链置换扩增技术的肠炎沙门氏菌恒温扩增快速检测试剂盒及其检测方法。该试剂盒内有模板预处理反应液、链置换扩增反应液Ⅰ、Bst?DNA?Polymerase,BsoBI。检测肠炎沙门氏菌的方法包括细菌DNA的提取、模板预处理、SDA链置换恒温扩增、核酸检测。其优点是快速、特异性强、灵敏度高而且成本低。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属生物检测领域,具体涉及恒温扩增快速检测肠炎沙门氏菌的试剂盒及检测方法。
技术介绍
1885年沙门氏等在霍乱流行时分离到猪霍乱沙门氏菌,故定名为沙门氏菌属。 沙门氏菌属有的专对人类致病,有的只对动物致病,也有对人和动物都致病。沙门氏菌病是指由各种类型沙门氏菌所引起的对人类、家畜以及野生禽兽不同形式的总称。感染沙门氏菌的人或带菌者的粪便污染食品,可使人发生食物中毒。据统计在世界各国的种类细菌性食物中毒中,沙门氏菌引起的食物中毒常列榜首,其中肠炎沙门氏菌(Salmonella enteritidis)是重要致病的沙门氏菌之一。我国内陆地区也以沙门氏菌为首位。
技术实现思路
本专利技术的目的是提供一种肠炎沙门氏菌的恒温扩增快速检测试剂盒及其使用方法。本专利技术的另一目的是提供一种肠炎沙门氏菌的快速检测方法,以克服现有技术的不足,从而为食品安全提供科学的依据和指导作用。基于上述原理,本专利技术提供的肠炎沙门氏菌的恒温扩增快速检测试剂盒,包括(1)模板预处理反应液IXNEB buffer 2、1. 0 μ M上游内引物Sl、l. 0 μ M下游内引物S2、3% (V/V) 二甲基亚砜、和ddH20。所述IXNEB buffer 2 为50mM NaClUOmM Tris-HClUOmM MgCl2、ImM 二硫苏糖醇,和 ddH20,pH 7. 9。所述的引物Sl和S2分别如SEQ ID NO :1和2所示。(2)链置换扩增反应液I :3% (V/V) 二甲基亚砜,0. lmg/mL牛血清白蛋白,浓度分别为 0. 2mM dATP、dGTP 和 dTTP 的混合液,1. OmM dCTP α S, IXNEB buffer 2,和 ddH20(3) Bst DNA 聚合酶;(4)限制性内切酶BsoBI。使用上述试剂盒检测肠炎沙门氏菌的方法,包括步骤(1)待检样品或细菌DNA的提取提取DNA,其中提取的DNA 0D26(1/0D28(1在1. 6-2. 0范围内,浓度在IO-IOOng/μ L范围内。(2)模板预处理程序取模板预处理反应液23 μ L,加入待检样品DNA 2 μ L,放入94°C水浴5min后迅速放入59°C的水浴中4 ;然后94°C水浴2 和59°C水浴4 过程反复进行6个以上循环; 产物用作SDA扩增模板。3(3) SDA扩增将上述预处理的25 μ L模板溶液加入24. 2 μ L链置换扩增反应液I 中,95°C水浴加热5min,温度迅速冷却到0°C,然后加入0.4yL Bst DNA聚合酶与0.4yL BsoBI,置于59°C水浴反应Ih。(4)核酸凝胶电泳检测反应结束后,用琼脂糖凝胶电泳检测;电泳板上出现IOObp的核酸扩增条带,说明待检样品为阳性,否则为阴性。本专利技术的试剂盒根据目标菌株的保守基因序列设计引物,保证检测方法的特异性。本专利技术采用改进的链置换扩增技术(SDA)技术,特异性强,具有与PCR检测方法相似灵敏度,但不需要昂贵的PCR仪,只需普通的水浴锅即可,检测方法简单、快速,特别适用于基层医疗机构及食品公司与相关检测部门。附图说明图1 其中,1检测样品2肠炎沙门氏菌阳性对照3 DNA Marker 4阴性对照具体实施例方式SDA(Strand displacement amplification)反应是一种恒温、酶控的体外核酸扩增技术,主要依据限制性内切酶识别并切割半硫代磷酸化DNA的未修饰链以形成一个切口,在具有链置换能力的DNA聚合酶的作用下从切口处聚合延伸并取代下游DNA链。被置换下的单链DNA再与引物结合并由DNA聚合酶延伸成双链DNA。这种“切口一扩增一置换” 不断循环往复达到靶序列高效扩增的目的。基于上述原理,本专利技术提供的肠炎沙门氏菌的恒温扩增快速检测试剂盒,包括(1)模板预处理反应液(所列组分均为在模板预处理反应液中的终浓度)包括 IXNEB buffer 2,1.0μΜ 上游内引物(Si)、1. 0 μ M 下游内引物(S2)、体积比 3% DMSO(二甲基亚砜)、ddH20。所述IXNEB buffer 2 反应缓冲液成分为50mM NaClUOmM Tris-HClUOmM MgCl2UmM Dithiothreitol ( 二硫苏糖醇),ddH20,ρΗ 7. 9。肠炎沙门氏菌引物Sl 5,-CAGCCTGACACCAGACAA- CrCGGG-CATGTCTGAGCACTTC _3,(SEQ IDNO 1)S2 5,-ACCGCATCGAATGCATGT- CrCGGG-TATGCTGGACCAACTG _3,(SEQ IDNO 2)(注其中黑体部分为与肠炎沙门氏菌irwA基因片段匹配的序列)(2)链置换扩增反应液I 体积比3. 0 % DMSO, 0. lmg/mL BSA (牛血清白蛋白),浓度分别为0. 2mM dATP, dGTP和dTTP混合液,1. OmM dCTP α S (购自BIOLOG公司(德国)、 2’ -deoxyeytidine-5' -0-(1-thiotriphosphate)),1XNEB buffer 2,ddH20o(3) Bst DNA Polymerase (链延伸 DNA 聚合酶,购自 NewEnglandBiolabsLTD、 8000U/mL)(4)BsoBI (限制性内切酶 BsoBI,购自 NewEnglandBiolabsLTD、10000U/mL)使用上述试剂盒检测肠炎沙门氏菌的方法,包括步骤(1)待检样品或细菌DNA的提取提取DNA,其中提取的DNA OD260/OD280在1. 6-2. 0范围内,浓度在IO-IOOng/ μ L范围内。(2)模板预处理程序取模板预处理反应液23 μ L,加入待检样品DNA 2 μ L,放入94°C水浴5min后迅速放入59°C的水浴中4 ;然后94°C水浴2 和59°C水浴4 过程反复进行6个以上循环; 产物用作SDA模板。(3) SDA扩增将上述预处理的25 μ L模板溶液加入24. 2 μ L链置换扩增反应液 I中,95°C水浴加热5min,温度迅速冷却到0°C,然后加入0. 4yL Bst DNA Polymerase与 0. 4yL BsoBI,置于59 °C水浴反应Ih。(4)核酸凝胶电泳检测反应结束后,在反应管中加入6XLoading buffer (组分30mM EDTA ;36% (ν/ν) Glycerol ;0. 05% (w/v)Xylene Cyanol FF ;0. 05% (w/v)Bromophenol Blue),自然冷却至室温,用琼脂糖凝胶电泳检测产物,电泳40分钟,电泳成像系统拍照。电泳板上出现IOObp的核酸扩增条带,说明待检样品为阳性,否则为阴性。下列实施例进一步说明本专利技术,但不应当作为本专利技术的限制。实施例(肠炎沙门氏菌的检测)(1)待检样品或细菌DNA的提取提取待检样品核酸,其中提取的样品DNA OD260/OD280在1. 6-2. O范围内,浓度在 IO-IOOng/μ L 范围内。(2)模板预处理程序取模板预处理反应液23 μ L,加入待检样品DNA 2 μ L,放入94°C水浴5min后迅速放入59°C的水本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】

【专利技术属性】
技术研发人员:张京宣彭青魏晓棠李美芹宋涛尼秀媚雷质文李伟涛毕建秀张健
申请(专利权)人:山东出入境检验检疫局检验检疫技术中心
类型:发明
国别省市:

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