检测样本中生物标志物的试剂在制备乳腺癌患者化疗响应评估产品中的应用制造技术

本发明专利技术公开了检测样本中生物标志物的试剂在制备乳腺癌患者化疗响应评估产品中的应用。本申请的第一方面提供检测样本中生物标志物的试剂在制备乳腺癌患者化疗响应评估产品中的应用，生物标志物包含BRD2、PARP8、MTUS1、TRAF1、ADAM11、RAX、DPT、AHSP、CSF3、CITED1、CLCA2、BUB1B、TSPYL5、ABCC3、SCAND1、PTGFR、ASXL1、PTGER4、MAP7D1和MDM4中的若干种。针对乳腺癌患者建立化疗响应的模型，通过获取乳腺癌患者的相关生物标志物的水平，应用该基因模型有效反映受试者的化疗响应，指导医疗方案。指导医疗方案。指导医疗方案。

【技术实现步骤摘要】
检测样本中生物标志物的试剂在制备乳腺癌患者化疗响应评估产品中的应用


[0001]本申请涉及分子诊断
，尤其是涉及检测样本中生物标志物的试剂在制备乳腺癌患者化疗响应评估产品中的应用。

技术介绍

[0002]乳腺癌的治疗手段包括手术治疗、术后的辅助治疗、术前的新辅助治疗等，辅助治疗包括局部治疗(例如辅助放疗)和全身治疗(例如化疗、激素治疗以及靶向治疗)等。由于乳腺癌细胞和其它癌细胞一样都具有侵袭和远端转移的特性，因此，在手术切除后仍有部分患者发生复发转移，需要在术后进行辅助治疗。在辅助治疗手段的具体选择上，转录组多基因检测指标得到了广泛应用，包括70基因检测系统(Mammaprint)、21基因检测系统(Oncotype DX)、50基因检测(PAM50)、乳腺癌指数(BCI)等。以Oncotype DX为例，这一系统能够用来评估乳腺癌患者的复发风险分数，给出0～100的分值。对于淋巴结阴性HR+/HER2
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患者而言，当复发分数<26时表示复发率较低，辅助化疗能够为患者带来的额外益处较少，因而不推荐进行辅助化疗。可见，这类多基因检测系统是通过评估复发风险来确定在术后增加辅助化疗的益处，而并没有相应的模型直接考察患者对于辅助化疗的响应程度，以此评估患者对化疗的敏感性。因此，有必要寻找能够有效评价乳腺癌患者化疗响应的模型。

技术实现思路

[0003]本申请旨在至少解决现有技术中存在的技术问题之一。为此，本申请提出检测样本中生物标志物的试剂在制备乳腺癌患者化疗响应评估产品中的应用。
[0004]本申请的第一方面，提供检测样本中生物标志物的试剂在制备乳腺癌患者化疗响应评估产品中的应用，生物标志物包含：BRD2、PARP8、MTUS1、TRAF1、ADAM11、RAX、DPT、AHSP、CSF3、CITED1、CLCA2、BUB1B、TSPYL5、ABCC3、SCAND1、PTGFR、ASXL1、PTGER4、MAP7D1和MDM4中的至少N个，N任选自1～20的正整数。
[0005]根据本申请实施例的应用，至少具有如下有益效果：
[0006]本申请针对乳腺癌患者人群建立了关于化疗响应的模型，通过检测试剂获取乳腺癌患者的相关生物标志物，基于上述生物标志物建立模型，利用若干个生物标志物所构建的模型能够有效反映受试者对于辅助化疗的响应程度，针对不同的化疗响应程度选择合适的治疗方法，对于化疗响应程度高的患者，反映其对化疗的高敏感性，提振治疗信心；对化疗响应程度较低的人群，在需要辅助治疗的情况下，尽早制定其他的辅助治疗方案，从而构建个性化精准医疗方案。
[0007]其中，BRD2(Bromodomain Containing 2)编码一种转录调节因子，属于BET(溴代结构域和额外末端结构域)蛋白质家族。在有丝分裂过程中，该蛋白与转录复合物和乙酰化染色质结合，并通过其两个溴氧体选择性地结合组蛋白H4的乙酰化赖氨酸
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12残基。
[0008]PARP8(Poly(ADP
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Ribose)Polymerase Family Member 8)是蛋白质聚ADP核糖基
化聚合酶8基因，该基因的编码蛋白启动蛋白质ADP核糖基酶活性，参与蛋白质自动ADP核糖基化和蛋白质单ADP核糖基化，相关通路包括代谢和烟酸代谢。
[0009]MTUS1(Microtubule Associated Scaffold Protein 1)是微管相关支架蛋白1，该基因的编码蛋白含有一个能够与AT2受体相互作用的C端结构域和一个允许二聚的大螺旋区域。该基因的一个转录变体编码一种作为肿瘤抑制因子并参与AT2信号通路的线粒体蛋白。
[0010]TRAF1(TNF Receptor Associated Factor 1)是肿瘤坏死因子受体相关因子1基因，该蛋白和TRAF2形成异二聚体复合物，是TNF
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α介导的MAPK8/JNK和NF
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κB激活所必需的，也与凋亡抑制蛋白(IAPs)相互作用，从而介导来自TNF受体的抗凋亡信号。
[0011]ADAM11(ADAM Metallopeptidase Domain 11)是ADAM金属肽酶结构域11，该基因所编码的蛋白质的家族成员参与多种涉及细胞间和细胞基质相互作用的生物过程，包括受精、肌肉发育和神经发生。此外，该基因是代表人类乳腺癌的候选抑癌基因。
[0012]RAX(Retina And Anterior Neural Fold Homeobox)是视网膜和前神经皱襞同源盒基因，该基因所编码的同源盒包含在眼睛发育中起作用的转录因子，是视网膜细胞命运决定所必需的，并调节干细胞增殖。
[0013]DPT(Dermatopontin)是皮桥蛋白，该基因所编码的细胞外基质蛋白，可能在细胞
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基质相互作用和基质组装中发挥作用。其存在于各种组织中，并且许多酪氨酸残基被硫酸化。此外，皮桥蛋白可能通过与核心蛋白聚糖的相互作用来改变TGF
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β的行为。
[0014]AHSP(Alpha Hemoglobin Stabilizing Protein)是α血红蛋白稳定蛋白基因，该基因编码一个与游离α
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珠蛋白特异结合的分子伴侣，并参与血红蛋白组装。该编码蛋白与α
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珠蛋白结合，直到α
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珠蛋白与β
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珠蛋白形成异二聚体并进一步形成稳定的四聚血红蛋白。
[0015]CSF3(Colony Stimulating Factor 3)是集落刺激因子3基因，该基因编码细胞因子IL
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6超家族的一个成员，编码的细胞因子控制粒细胞的产生、分化和功能。而粒细胞是一种白细胞，是先天免疫反应的一部分。
[0016]CITED1(Cbp/P300 Interacting Transactivator With Glu/Asp Rich Carboxy
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Terminal Domain1)是Cbp/P300与富含Glu/Asp的羧基末端结构域1相互作用的反式激活子基因，该反式激活子与富含Asp/Glu的C端结构域蛋白质家族有关，可能作为转录辅激活因子发挥作用。
[0017]CLCA2(Chloride Channel Accessory 2)是氯化物通道配件2基因，该基因编码钙活化氯化物通道调节剂(CLCR)蛋白质的成员。该家庭的成员调节氯化物的氯化物在血浆膜上。编码蛋白质是自蛋白解压的加工以产生N
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和C
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末端片段。该基因的表达由肿瘤抑制蛋白P53响应DNA损伤而上调。在乳腺癌中，下调该基因的表达，编码蛋白质可以抑制迁移和侵袭，同时促进癌细胞系中的间充质
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上皮转换。
[0018]BUB1B(BUB1 Mitotic Checkpoint Serin本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.检测样本中生物标志物的试剂在制备乳腺癌患者化疗响应评估产品中的应用，其特征在于，所述生物标志物包含BRD2、PARP8、MTUS1、TRAF1、ADAM11、RAX、DPT、AHSP、CSF3、CITED1、CLCA2、BUB1B、TSPYL5、ABCC3、SCAND1、PTGFR、ASXL1、PTGER4、MAP7D1和MDM4中的至少N个，N任选自1～20的正整数。2.根据权利要求1所述的应用，其特征在于，所述试剂检测所述生物标志物的表达水平；优选地，所述表达水平为所述生物标志物的mRNA转录水平。3.根据权利要求1所述的应用，其特征在于，乳腺癌患者的分子分型为HR阳性HER2阴性；优选的，乳腺癌患者的原发肿瘤分期为T1～T2，区域淋巴结分期为N0～N3；优选的，所述区域淋巴结分期为N0。4.根据权利要求1至3任一项所述的应用，其特征在于，所述样本选自血液、组织、粪便、尿液中的至少一种。5.乳腺癌患者化疗响应评估产品，其特征在于，包括检测生物标志物的试剂，所述生物标志物包含：BRD2、PARP8、MTUS1、TRAF1、ADAM11、RAX、DPT、AHSP、CSF3、CITED1、CLCA2、BUB1B、TSPYL5、ABCC3、SCAND1、PTGFR、ASXL1、PTGER4、MAP7D1和MDM4中的至少N个，N任选自1～20的正整数；优选的，所述试剂检测所述生物标志物的表达水平；优选地，所述表达水平为所述生物标志物的mRNA转录水平。6.根据权利要求5所述的试剂盒，其特征在于，乳腺癌患者的分子分型为HR阳性HER2阴性；优选的，所述乳腺癌患者的原发肿瘤分期为T1～T2，区域淋巴结分期为N0～N3。7.计算机可读存储介质，其特征在于，所述计算机可读...

【专利技术属性】
技术研发人员：饶皑炳，
申请(专利权)人：深圳市陆为生物技术有限公司，
类型：发明
国别省市：