用于鉴定样本中失调基因的方法、试剂盒技术

技术编号:34852903 阅读:33 留言:0更新日期:2022-09-08 07:53
本发明专利技术涉及种用于鉴定样本中失调基因的方法,包括以下步骤:获取包含人类细胞的数据集;针对数据集进行数据筛选以得到差异基因;通过数据筛选从差异基因中得到泛癌下的差异基因;通过在线数据库对差异基因进行分析以鉴定失调基因。本发明专利技术还涉及使用该方法的试剂盒。通过执行本发明专利技术的用于鉴定样本中失调基因的方法,可筛选出影响预后的关键因素,从而帮助癌症患者带来更好的预后。助癌症患者带来更好的预后。助癌症患者带来更好的预后。

【技术实现步骤摘要】
用于鉴定样本中失调基因的方法、试剂盒


[0001]本专利技术涉及检测
,尤其涉及用于鉴定样本中失调基因的方法、试剂盒。

技术介绍

[0002]vorinostat的代谢多态性对药物效率和毒性有或多或少的影响,它导致了药物反应的个体差异。以前的临床研究表明,vorinostat在大鼠和狗身上显示出高清除率、短血清半衰期和低口服生物利用度(1.8%至11%)。进一步的调查表明,vorinostat在肾脏中被清除,主要是通过广泛的代谢和高首过效应。但vorinostat在细胞分化、细胞周期停滞、细胞凋亡和肿瘤抑制基因的重新表达方面起着主要作用;SAHA与紫杉醇(PTX)联合使用,与单独使用PTX 相比,对PTX耐药的卵巢细胞系的细胞生长抑制和凋亡细胞的百分比增加更明显。
[0003]然而,对其抗癌机制的研究是多变的,还没有完全探索出来,有必要根据vorinostat治疗后的各种情况,建立一种新的用于鉴定样本中失调基因的方法来解决以上问题。

技术实现思路

[0004]为了实现根据本专利技术的上述目的和其他优点,本专利技术的本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种用于鉴定样本中失调基因的方法,其特征在于,包括以下步骤:获取包含人类细胞的数据集;针对所述数据集进行数据筛选以得到差异基因;通过所述数据筛选从所述差异基因中得到泛癌下的差异基因;通过在线数据库对所述差异基因进行分析以鉴定失调基因。2.如权利要求1所述的用于鉴定样本中失调基因的方法,其特征在于,所述数据集包括从NCBI GEO数据库获得九个基因表达芯片数据集,分别为:GSE22061,GSE43852,GSE49158,GSE60124,GSE64119,GSE69462,GSE70120,GSE72688,GSE77200。3.如权利要求2所述的用于鉴定样本中失调基因的方法,其特征在于,所述九个基因表达芯片数据集共包含十一个不同的处理条件以及七种癌细胞系。4.如权利要求1所述的用于鉴定样本中失调基因的方法,其特征在于,每个所述数据集中实验组、对照组至少进行两次生物重复试验;所述对照组是...

【专利技术属性】
技术研发人员:黄瑞卜凡
申请(专利权)人:中国科学院苏州生物医学工程技术研究所
类型:发明
国别省市:

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