针对4G7衍生的嵌合抗原受体的抗体制造技术

本文提供分离抗体，其特异性结合衍生自4G7 scFv的抗CD19嵌合抗原受体(CAR)。还提供制备和使用这些分离抗体的方法。制备和使用这些分离抗体的方法。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】针对4G7衍生的嵌合抗原受体的抗体
[0001]交叉参考
[0002]本申请要求2019年4月19日提交的美国临时申请第62/836,242号的优先权权益，所述美国临时申请的内容以全文引用的方式并入本文中。
[0003]对序列表的引用
[0004]本申请经由EFS
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Web电子申请并包括呈.txt格式的电子提交的序列表。.txt文件含有2020年4月16日创建的名为“AT
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020_02WO_SL_ST25”的序列表，其大小为40,387字节。此.txt文件中所含的序列表为本说明书的一部分并以全文引用的方式并入本文中。


[0005]本公开涉及抗原结合分子，如抗体，其特异性结合于衍生自4G7的嵌合抗原受体(CAR)的scFv部分，所述部分结合于人类CD19；编码所述抗原结合分子的多核苷酸，以及使用所述抗原结合分子制造和治疗患者中的癌症的方法。

技术介绍

[0006]抗独特型抗体是针对免疫抗体产生的抗体的子集。这些抗独特型抗体表明针对免疫抗体的独特型(抗体表面上独特的抗原决定物)的特异性结合。抗独特型抗体一般可以分类成三个不同组：(1)识别不同于免疫抗体上的抗生殖结合位点(ABS)的独特型的抗体；(2)识别ABS内的表位且模拟标称抗原的结构的抗体；以及(3)识别ABS内的表位而无标称抗原的结构类似的抗体(参见例如Pan等人,(1995)《美国实验生物学学会联合会杂志(FASEB J)》9:43
‑
49)。
[0007]检测CAR表达的先前方法(例如，抗鼠类Fab抗体、可溶性人类CD19
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Fc融合蛋白质)可能缺乏特异性，具有批次间可变性，在分析方法(例如，流式细胞术)中产生低强度信号，或难以制备足够数量，这可能低估了CAR表达细胞的真实数目。
[0008]因此，需要稳健试剂来准确检测工程改造T细胞上或在体外分析中的CAR表达。本文提供了解决此和其它需求的方法和组合物。

技术实现思路

[0009]本公开提供了具有特异性高亲和力结合的稳健试剂，以检测包含衍生自抗体克隆4G7(例如，UCART19、ALLO
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501和ALLO
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501A)的scFv部分的抗CD19 CAR。本文所述的抗体可以用于在非临床研究，包含4G7衍生的scFv(例如，UCART19、ALLO
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501和ALLO
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501A)的免疫细胞的制备，作为基于临床流的药代动力学试剂和用于临床免疫原性研究的背景下检测抗CD19 CAR表达的方法。
[0010]在一个方面，本公开提供一种分离抗体，其特异性结合包含衍生自4G7的抗CD19 scFv的分子，并且在一个实施例中，所述抗体是人源化的。在一些实施例中，衍生自4G7的抗CD19 scFv包含与SEQ ID NO:36的氨基酸序列具有至少80％、至少90％、至少95％、至少97％、至少99％或100％序列一致性的氨基酸序列。在一些实施例中，分离抗体不结合于4G7
的构架区。在一些实施例中，分离抗体结合于衍生自4G7的抗CD19 scFv，其中KD不超过100pM、不超过90pM、不超过80pM、不超过70pM、不超过60pM、不超过50pM、不超过40pM、不超过30pM，或不超过20pM，如通过Biacore分析在25℃下确定。在各种实施例中，抗原结合分子选自由以下组成的群组：抗体；scFv；Fab；Fab'；Fv、F(ab')2；dAb；人类抗体；人源化抗体；嵌合抗体；单克隆抗体；多克隆抗体；重组抗体；IgE抗体；IgD抗体；IgM抗体；IgG1抗体；在铰链区中具有至少一个突变的IgG1抗体；IgG2抗体；在铰链区中具有至少一个突变的IgG2抗体；IgG3抗体；在铰链区中具有至少一个突变的IgG3抗体；IgG4抗体；在铰链区中具有至少一个突变的IgG4抗体；包含至少一种非天然存在的氨基酸的抗体，及其任何组合。
[0011]在另外的实施例中，分离抗体包含重链(HC)，并且在具体实施例中，HC包含选自由SEQ ID NO:1
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3组成的群组的重链可变区(VH)序列。在本文所提供的抗体的另外具体实施例中，包含选自由SEQ ID NO:15、21、24和29组成的群组的重链CDR1。在本文所提供的抗体的其它具体实施例中，包含选自由SEQ ID NO:16、22、25、30、31和33组成的群组的重链CDR2。在本文所提供的抗体的另外其它实施例中，包含选自由SEQ ID NO:17、23和26组成的群组的重链CDR3。在又其它实施例中，本文所提供的抗体的重链包含重链CDR1、重链CDR2和重链CDR3，每一CDR包含表1c中所示的氨基酸序列。
[0012]在一些实施例中，抗体包含与本文所提供的抗原结合分子的VH至少约70％、至少约75％、至少约80％、至少约85％、至少约90％、至少约95％、至少约96％、至少约97％、至少约98％、至少约99％或约100％一致的VH氨基酸序列。
[0013]在一些实施例中，本文所提供的分离抗体包含轻链(LC)，并且在各种实施例中，LC包含选自由SEQ ID NO:7
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10组成的群组的轻链可变区(VL)序列。在一些实施例中，本文所提供的抗体的轻链可变区(VL)包含(a)CDR1、(b)CDR2和(c)CDR3中的一个或多个。在另外具体实施例中，本文所提供的抗体的轻链CDR1可以选自由SEQ ID NO:18和27组成的群组。在其它实施例中，本文所提供的抗体的轻链CDR2可以包含SEQ ID NO:19.在又其它实施例中，本文所提供的抗体的轻链CDR3可以选自由SEQ ID NO:20、28和32组成的群组。在又其它实施例中，本文所提供的抗体的轻链包含轻链CDR1、轻链CDR2和轻链CDR3，每一CDR包含表1d中的氨基酸序列。
[0014]在一些实施例中，VL氨基酸序列与本文所提供的抗原结合分子的VL至少约70％、至少约75％、至少约80％、至少约85％、至少约90％、至少约95％、至少约96％、至少约97％、至少约98％、至少约99％或约100％一致。
[0015]在实施例中，本文所提供的抗体包含(a)包含SEQ ID NO:1的氨基酸序列的VH；和(b)包含SEQ ID NO:7的氨基酸序列的VL。在另一实施例中，本文所提供的抗体包含(a)包含SEQ ID NO:15的氨基酸序列的VH CDR1；(b)包含SEQ ID NO:16的氨基酸序列的VH CDR2；(c)包含SEQ ID NO:17的氨基酸序列的VH CDR3；(d)包含SEQ ID NO:18的氨基酸序列的VL CDR1；(e)包含SEQ ID NO:19的氨基酸序列的VL CDR2；以及(f)包含SEQ ID NO:20的氨基酸序列的VL CDR3。在另外实施例中，本文所提供的抗体包含(a)包含SEQ ID NO:2的氨基酸序列的VH；和(b)包含SE本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】1.一种分离抗体，其特异性结合包含衍生自4G7的抗CD19 scFv的分子。2.根据权利要求1所述的分离抗体，其中衍生自4G7的所述抗CD19 scFv包含与SEQ ID NO:36的氨基酸序列具有至少80％、至少90％、至少95％、至少97％、至少99％或100％序列一致性的氨基酸序列。3.根据权利要求1或2所述的分离抗体，其中所述分离抗体不结合于4G7的构架区。4.根据权利要求1至3中任一项所述的分离抗体，其中所述分离抗体以不超过100pM、不超过80pM、不超过60pM或不超过50pM的KD结合于衍生自4G7的抗CD19 scFv，如通过Biacore分析在25℃下所测定。5.根据权利要求1至4中任一项所述的分离抗体，其中所述分离抗体包含重链(HC)。6.根据权利要求5所述的分离抗体，其中所述HC包含选自由SEQ ID NO:1
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3组成的群组的重链可变区(VH)序列。7.根据前述权利要求中任一项所述的分离抗体，其包含选自由SEQ ID NO:15、21、24和29组成的群组的重链CDR1。8.根据前述权利要求中任一项所述的分离抗体，其包含选自由SEQ ID NO:16、22、25、30、31和33组成的群组的重链CDR2。9.根据前述权利要求中任一项所述的分离抗体，其包含选自由SEQ ID NO:17、23和26组成的群组的重链CDR3。10.根据前述权利要求中任一项所述的分离抗体，其包含重链，所述重链包含重链CDR1、重链CDR2和重链CDR3，每一CDR包含表1c中所示的氨基酸序列。11.一种分离抗体，其包含与根据权利要求6所述的抗原结合分子的VH至少约70％、至少约75％、至少约80％、至少约85％、至少约90％、至少约95％、至少约96％、至少约97％、至少约98％、至少约99％或约100％一致的VH氨基酸序列。12.根据前述权利要求中任一项所述的分离抗体，其中所述分离抗体包含轻链(LC)。13.根据权利要求12所述的分离抗体，其中所述LC包含选自由SEQ ID NO:7
‑
10组成的群组的轻链可变区(VL)序列。14.根据前述权利要求中任一项所述的分离抗体，其包含轻链，其中所述轻链可变区(VL)包含(a)CDR1、(b)CDR2和(c)CDR3中的一个或多个。15.根据前述权利要求中任一项所述的分离抗体，其包含选自由SEQ ID NO:18和27组成的群组的轻链CDR1。16.根据前述权利要求中任一项所述的分离抗体，其包含SEQ ID NO:19的轻链CDR2。17.根据前述权利要求中任一项所述的分离抗体，其包含选自由SEQ ID NO:20、28和32组成的群组的轻链CDR3。18.根据前述权利要求中任一项所述的分离抗体，其包含轻链，其中所述轻链包含轻链CDR1、轻链CDR2和轻链CDR3，每一CDR包含表1d中的氨基酸序列。19.一种分离抗体，其包含与根据权利要求13所述的抗原结合分子的VL至少约70％、至少约75％、至少约80％、至少约85％、至少约90％、至少约95％、至少约96％、至少约97％、至少约98％、至少约99％或约100％一致的VL氨基酸序列。20.根据前述权利要求中任一项所述的分离抗体，其包含(a)包含SEQ ID NO:1的氨基酸序列的VH；以及
(b)包含SEQ ID NO:7的氨基酸序列的VL。21.根据权利要求20所述的分离抗体，其包含(a)包含SEQ ID NO:15或21的氨基酸序列的VH CDR1；(b)包含SEQ ID NO:16或22的氨基酸序列的VH CDR2；(c)包含SEQ ID NO:17或23的氨基酸序列的VH CDR3；(d)包含SEQ ID NO:18的氨基酸序列的VL CDR1；(e)包含SEQ ID NO:19的氨基酸序列的VL CDR2；以及(f)包含SEQ ID NO:20的氨基酸序列的VL CDR3。22.根据权利要求1至19中任一项所述的分离抗体，其包含(a)包含SEQ ID NO:2的氨基酸序列的VH；以及(b)包含SEQ ID NO:8的氨基酸序列的VL。23.根据权利要求22所述的分离抗体，其包含(a)包含SEQ ID NO:24或29的氨基酸序列的VH CDR1；(b)包含SEQ ID NO:25或30的氨基酸序列的VH CDR2；(c)包含SEQ ID NO:26的氨基酸序列的VH CDR3；(d)包含SEQ ID NO:27的氨基酸序列的VL CDR1；(e)包含SEQ ID NO:19的氨基酸序列的VL CDR2；以及(f)包含SEQ ID NO:28的氨基酸序列的VL CDR3。24.根据权利要求1至19中任一项所述的分离抗体，其包含(a)包含SEQ ID NO:3的氨基酸序列的VH；以及(b)包含SEQ ID NO:9的氨基酸序列的VL。25.根据权利要求24所述的分离抗体，其包含(a)包含SEQ ID NO:24或29的氨基酸序列的VH CDR1；(b)包含SEQ ID NO:31或33的氨基酸序列的VH CDR2；(c)包含SEQ ID NO:26的氨基酸序列的VH CDR3；(d)包含SEQ ID NO:27的氨基酸序列的VL CDR1；(e)包含SEQ ID NO:19的氨基酸序列的VL CDR2；以及(f)包含SEQ ID NO:32的氨基酸序列的VL CDR3。26.根据权利要求1至19中任一项所述的分离抗体，其包含(a)包含SEQ ID NO:1的氨基酸序列的VH；以及(b)包含SEQ ID NO:10的氨基酸序列的VL。27.根据权利要求26所述的分离抗体，其包含(a)包含SEQ ID NO:15或21的氨基酸序列的VH CDR1；(b)包含SEQ ID NO:16或22的氨基酸序列的VH CDR2；(c)包含SEQ ID NO:17或23的氨基酸序列的VH CDR3；(d)包含SEQ ID NO:18的氨基酸序列的VL CDR1；(e)包含SEQ ID NO:19的氨基酸序列的VL CDR2；以及(f)包含SEQ ID NO:20的氨基酸序列的VL CDR3。28.一种分离抗体，其特异性结合包含衍生自4G7的抗CD19 scFv的分子，其中所述分离
抗体包含重链可变结构域和轻链可变结构域，所述重链可变结构域包含VH CDR1、VH CDR2和VH CDR3，所述轻链可变结构域包含VL CDR1、VL CDR2和VL CDR3，其中所述VH CDR1包含选自由SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:24及SEQ ID NO:29组成的群组的氨基酸序列，所述VH CDR2包含选自由SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:25、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:31及SEQ ID NO:33组成的群组的氨基酸序列，并且所述VH CDR3包含选自由SEQ ID NO:17、SEQ ID NO:23及SEQ ID NO:26组成的群组的氨基酸序列，并且其中所述VL CDR1包含选自由SEQ ID NO:18及SEQ ID NO:27组成的群组的氨基酸序列，所述VL CDR2包含SEQ ID NO:19的氨基酸序列，并且所述VL CDR3包含选自由SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:28及SEQ ID NO:32组成的群组的氨基酸序列。29.根据权利要求28所述的分离抗体，其包含(a)包含SEQ ID NO:15或21的氨基酸序列的VH CDR1；(b)包含SEQ ID NO:16或22的氨基酸序列的VH CDR2；(c)包含SEQ ID NO:17或23的氨基酸序列的VH CDR3；(d)包含SEQ ID NO:18的氨基酸序列的VL CDR1；(e)包含SEQ ID NO:19的氨基酸序列的VL CDR2；以及(f)包含SEQ ID NO:20的氨基酸序列的VL CDR3。30.根据权利要求28或29所述的分离抗体，其包含(a)包含SEQ ID NO:1的氨基酸序列的VH；以及(b)包含SEQ ID NO:7的氨基酸序列的VL。31.根据权利要求28所述的分离抗体，其包含(a)包含SEQ ID NO:24或29的氨基酸序列的VH CDR1；(b)包含SEQ ID NO:25或30的氨基酸序列的VH CDR2；(c)包含SEQ ID NO:26的氨基酸序列的VH CDR3；(d)包含SEQ ID NO:27的氨基酸序列的VL CDR1；(e)包含SEQ ID NO:19的氨基酸序列的VL CDR2；以及(f)包含SEQ ID NO:28的氨基酸序列的VL CDR3。32.根据权利要求28或31所述的分离抗体，其包含(a)包含SEQ ID NO:2的氨基酸序列的VH；以及(b)包含SEQ ID NO:8的氨基酸序列的VL。33.根据权利要求28所述的分离抗体，其包含(a)包含SEQ ID NO:24或29的氨基酸序列的VH CDR1；(b)包含SEQ ID NO:31或33的氨基酸序列的VH CDR2；(c)包含SEQ ID NO:26的氨基酸序列的VH CDR3；(d)包含SEQ ID NO:27的氨基酸序列的VL CDR1；(e)包含SEQ ID NO:19的氨基酸序列的VL CDR2；以及(f)包含SEQ ID NO:32的氨基酸序列的VL CDR3。34.根据权利要求28或33所述的分离抗体，其包含(a)包含SEQ ID NO:3的氨基酸序列的VH；以及(b)包含SEQ ID NO:9的氨基酸序列的VL。
35.根据权利要求28所述的分离抗体，其包含(a)包含SEQ ID NO:15或21的氨基酸序列的VH ...

【专利技术属性】
技术研发人员：T，
申请(专利权)人：艾洛基治疗公司，
类型：发明
国别省市：