一种基于染色体特异探针的炭疽芽胞杆菌鉴定方法技术

本发明专利技术公开了一种基于染色体特异探针的炭疽芽胞杆菌鉴定方法。本发明专利技术提供了一种用于鉴定或者辅助鉴定炭疽芽胞杆菌的探针组，由SEQ ID No.1至SEQ ID No.51所示的51条探针组成。本发明专利技术探针对于未知样品的测序结果(包括二代或三代)进行检测，由于采用多达51条特异探针，只要有任何一条探针检测出来，就可以判定为阳性，检测出来的探针越多，可信度越高，并且这些探针均匀分布在整个染色体上，从而保证了即使测序质量差及覆盖度不高的基因组序列，也可以用这些电子探针进行查询，快速简便高效地鉴定出该样品是否携带有炭疽芽胞杆菌。地鉴定出该样品是否携带有炭疽芽胞杆菌。

【技术实现步骤摘要】
一种基于染色体特异探针的炭疽芽胞杆菌鉴定方法


[0001]本专利技术涉及生物
，特别涉及一种基于染色体特异探针的炭疽芽胞杆菌鉴定方法。

技术介绍

[0002]炭疽是由炭疽芽胞杆菌引起的人兽共患传染病。炭疽芽胞杆菌(Bacillus anthracis，简称炭疽杆菌)是一种重要的烈性病原体与潜在生物战剂。人类通过接触带菌动物或动物制品而感染，根据不同的感染途径分为皮肤炭疽、肺炭疽和肠炭疽三种类型。炭疽芽胞杆菌具有全球流行性、环境耐受性和感染破坏性等特点。面对常有出现并且涉及区域广泛的炭疽疫情，选择快速、准确的炭疽杆菌鉴定方法是至关重要的。
[0003]传统的鉴定方法为培养鉴定法，显然已经无法满足现实需求。蜡样芽胞杆菌、苏云金芽胞杆菌和炭疽杆菌的基因组同源性非常高。研究者认为炭疽芽胞杆菌是在1
‑
2万年前从蜡样芽胞杆菌和苏云金芽胞杆菌进化而来，并在进化过程中获得了pXO1和pXO2两个毒力相关质粒，分别指导合成外毒素和多肽荚膜，使其成为烈性病原菌。质粒上特有的序列被用来当作鉴定靶标使用，在遇到非典型菌株(如质粒丢失的菌株)不能够有效进行鉴别。还有一些染色体上的引物用来区分这两种菌，但菌株数目太少，引物特异性有限。
[0004]测序技术的迅速发展，越来越多菌株获得全基因组序列，但NCBI的炭疽芽胞杆菌基因组数据库中竟然还包含了一些非炭疽芽胞杆菌基因组数据。类炭疽芽胞杆菌的蜡样芽胞杆菌混入炭疽芽胞杆菌基因组数据库容易误导相关人员进行后续分析，一个简单快速高效的区分炭疽芽胞杆菌的方法亟待需要。

技术实现思路

[0005]本专利技术的目的是提供一种基于染色体特异探针的炭疽芽胞杆菌鉴定方法。
[0006]第一方面，本专利技术要求保护一种用于鉴定或者辅助鉴定炭疽芽胞杆菌的探针组。
[0007]本专利技术要求保护的用于鉴定或者辅助鉴定炭疽芽胞杆菌的探针组，可由如下组成：
[0008]探针1：SEQ ID No.1所示单链DNA；
[0009]探针2：SEQ ID No.2所示单链DNA；
[0010]探针3：SEQ ID No.3所示单链DNA；
[0011]探针4：SEQ ID No.4所示单链DNA；
[0012]探针5：SEQ ID No.5所示单链DNA；
[0013]探针6：SEQ ID No.6所示单链DNA；
[0014]探针7：SEQ ID No.7所示单链DNA；
[0015]探针8：SEQ ID No.8所示单链DNA；
[0016]探针9：SEQ ID No.9所示单链DNA；
[0017]探针10：SEQ ID No.10所示单链DNA；
[0018]探针11：SEQ ID No.11所示单链DNA；
[0019]探针12：SEQ ID No.12所示单链DNA；
[0020]探针13：SEQ ID No.13所示单链DNA；
[0021]探针14：SEQ ID No.14所示单链DNA；
[0022]探针15：SEQ ID No.15所示单链DNA；
[0023]探针16：SEQ ID No.16所示单链DNA；
[0024]探针17：SEQ ID No.17所示单链DNA；
[0025]探针18：SEQ ID No.18所示单链DNA；
[0026]探针19：SEQ ID No.19所示单链DNA；
[0027]探针20：SEQ ID No.20所示单链DNA；
[0028]探针21：SEQ ID No.21所示单链DNA；
[0029]探针22：SEQ ID No.22所示单链DNA；
[0030]探针23：SEQ ID No.23所示单链DNA；
[0031]探针24：SEQ ID No.24所示单链DNA；
[0032]探针25：SEQ ID No.25所示单链DNA；
[0033]探针26：SEQ ID No.26所示单链DNA；
[0034]探针27：SEQ ID No.27所示单链DNA；
[0035]探针28：SEQ ID No.28所示单链DNA；
[0036]探针29：SEQ ID No.29所示单链DNA；
[0037]探针30：SEQ ID No.30所示单链DNA；
[0038]探针31：SEQ ID No.31所示单链DNA；
[0039]探针32：SEQ ID No.32所示单链DNA；
[0040]探针33：SEQ ID No.33所示单链DNA；
[0041]探针34：SEQ ID No.34所示单链DNA；
[0042]探针35：SEQ ID No.35所示单链DNA；
[0043]探针36：SEQ ID No.36所示单链DNA；
[0044]探针37：SEQ ID No.37所示单链DNA；
[0045]探针38：SEQ ID No.38所示单链DNA；
[0046]探针39：SEQ ID No.39所示单链DNA；
[0047]探针40：SEQ ID No.40所示单链DNA；
[0048]探针41：SEQ ID No.41所示单链DNA；
[0049]探针42：SEQ ID No.42所示单链DNA；
[0050]探针43：SEQ ID No.43所示单链DNA；
[0051]探针44：SEQ ID No.44所示单链DNA；
[0052]探针45：SEQ ID No.45所示单链DNA；
[0053]探针46：SEQ ID No.46所示单链DNA；
[0054]探针47：SEQ ID No.47所示单链DNA；
[0055]探针48：SEQ ID No.48所示单链DNA；
[0056]探针49：SEQ ID No.49所示单链DNA；
[0057]探针50：SEQ ID No.50所示单链DNA；
[0058]探针51：SEQ ID No.51所示单链DNA。
[0059]第二方面，本专利技术要求保护用于鉴定或者辅助鉴定炭疽芽胞杆菌的探针。
[0060]本专利技术要求保护的用于鉴定或者辅助鉴定炭疽芽胞杆菌的探针，可为前文第一方面中的所述探针1至所述探针51中的任意一个。
[0061]第三方面，本专利技术要求保护含有前文第一方面所述探针组或前文第二方面所述探针的试剂盒。
[0062]第四方面，本专利技术要求保护前文第一方面所述探针组或前文第二方面所述探针或前文第三方面所述试剂盒在如下任一中的应用：
[0063]P1、鉴定或辅助鉴定炭疽芽胞杆菌；
[0064]P2、制备用于鉴定或辅助鉴定炭疽芽胞杆菌的产品；
[0065]P3、检测或者辅助检测待测菌株是否为炭疽芽胞杆菌；
[0066]P4、制备本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.用于鉴定或者辅助鉴定炭疽芽胞杆菌的探针组，由如下组成：探针1：SEQ ID No.1所示单链DNA；探针2：SEQ ID No.2所示单链DNA；探针3：SEQ ID No.3所示单链DNA；探针4：SEQ ID No.4所示单链DNA；探针5：SEQ ID No.5所示单链DNA；探针6：SEQ ID No.6所示单链DNA；探针7：SEQ ID No.7所示单链DNA；探针8：SEQ ID No.8所示单链DNA；探针9：SEQ ID No.9所示单链DNA；探针10：SEQ ID No.10所示单链DNA；探针11：SEQ ID No.11所示单链DNA；探针12：SEQ ID No.12所示单链DNA；探针13：SEQ ID No.13所示单链DNA；探针14：SEQ ID No.14所示单链DNA；探针15：SEQ ID No.15所示单链DNA；探针16：SEQ ID No.16所示单链DNA；探针17：SEQ ID No.17所示单链DNA；探针18：SEQ ID No.18所示单链DNA；探针19：SEQ ID No.19所示单链DNA；探针20：SEQ ID No.20所示单链DNA；探针21：SEQ ID No.21所示单链DNA；探针22：SEQ ID No.22所示单链DNA；探针23：SEQ ID No.23所示单链DNA；探针24：SEQ ID No.24所示单链DNA；探针25：SEQ ID No.25所示单链DNA；探针26：SEQ ID No.26所示单链DNA；探针27：SEQ ID No.27所示单链DNA；探针28：SEQ ID No.28所示单链DNA；探针29：SEQ ID No.29所示单链DNA；探针30：SEQ ID No.30所示单链DNA；探针31：SEQ ID No.31所示单链DNA；探针32：SEQ ID No.32所示单链DNA；探针33：SEQ ID No.33所示单链DNA；探针34：SEQ ID No.34所示单链DNA；探针35：SEQ ID No.35所示单链DNA；探针36：SEQ ID No.36所示单链DNA；探针37：SEQ ID No.37所示单链DNA；探针38：SEQ ID No.38所示单链DNA；
探针39：SEQ ID No.39所示单链DNA；探针40：SEQ ID No.40所示单链DNA；探针41：SEQ ID No.41所示单链DNA；探针42：SEQ ID No.42所示单链DNA；探针43：SEQ ID No.43所示单链DNA；探针44：SEQ ID No.44所示单链DNA；探针45：SEQ ID No.45所示单链DNA；探针46：SEQ ID No.46所示单链DNA；探针47：SEQ ID No.47所示单链DNA；探针48：SEQ ID No.48所示单链DNA；探针49：SEQ ID No.49所示单链DNA；探针50：SEQ ID No.50所示单链DNA；探针51：SEQ ID No.51所示单链DNA。2.用于鉴定或者辅助鉴定炭疽芽胞杆菌的探针，为如下任一：探针1：SEQ ID No.1所示单链DNA；探针2：SEQ ID No.2所示单链DNA；探针3：SEQ ID No.3所示单链DNA；探针4：SEQ ID No.4所示单链DNA；探针5：SEQ ID No.5所示单链DNA；探针6：SEQ ID No.6所示单链DNA；探针7：SEQ ID No.7所示单链DNA；探针8：SEQ ID No.8所示单链DNA；探针9：SEQ ID No.9所示单链DNA；探针10：SEQ ID No.10所示单链DNA；探针11：SEQ ID No.11所示单链DNA；探针12：SEQ ID No.12所示单链DNA；探针13：SEQ ID No.13所示单链DNA；探针14：SEQ ID No.14所示单链DNA；探针15：SEQ ID No.15所示单链DNA；探针16：SEQ ID No.16所示单链DNA；探针17：SEQ ID No.17所示单链DNA；探针18：SEQ ID No.18所示单链DNA；探针19：SEQ ID No.19所示单链DNA；探针20：SEQ ID No.20所示单链DNA；探针21：SEQ ID No.21所示单链DNA；探针22：SEQ ID No.22所示单链DNA；探针23：SEQ ID No.23所示单链DNA；探针24：SEQ ID No.24所示单链DNA；探针25：SEQ ID No.25所示单链DNA；
...

【专利技术属性】
技术研发人员：吕宇飞，刘先凯，王恒樑，王东澍，朱力，潘超，冯尔玲，
申请(专利权)人：中国人民解放军军事科学院军事医学研究院，
类型：发明
国别省市：