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借助于X-射线晶体学方法筛选和设计配体技术

技术编号:2600143 阅读:211 留言:0更新日期:2012-04-11 18:40
对于未知是靶生物分子配体的化合物,可应用X-射线晶体学方法筛选它们结合靶生物分子的能力。此方法包括:获得靶生物分子的晶体;将此靶生物分子晶体暴露于一个或多个待测样品;以及获得X-射线晶体衍射图形,以及确定是否形成了配体/受体复合物。可通过存在一个或多个待测样品时共结晶生物分子,或者通过在一个或多个待测样品的溶液中浸泡此生物分子的晶体,而使此靶分子暴露于待测样品。在另一个实施方案中,应用来自配体/受体复合物的结构信息设计配体,此配体结合更紧密,更特异性地结合,具有更好的生物活性,或者具有更安全的分布。本发明专利技术进一步的实施方案,包括借助于这种直接的方法鉴别或设计生物活性部分。在还有一个实施方案中,是通过使此生物分子与一个可降解的配体共结晶,并使此配体降解而形成具有易接近的活性位点的生物分子晶体。(*该技术在2019年保护过期,可自由使用*)

【技术实现步骤摘要】

X-射线晶体学方法可用于鉴别结合靶受体分子的配体,并可用于设计对靶受体具有改进生物活性的配体。专利技术的背景X-射线晶体学方法(晶体学)是一门成熟的技术,它可对晶体中分子显示的图形以三维图象的形式提供最好的描述。科学家已经应用晶体学方法对许多重要的生物学分子分辨了其晶体结构。借助于晶体学方法,可对多种生物分子进行研究,包括但不局限于蛋白质,DNA,RNA和病毒。科学家甚至还报导了在其受体内携带配体的生物分子的晶体结构(一种“配体-受体复合物”)。给定一种靶标生物分子或配体-受体复合物的“图象”,科学家可以找到在此可行使生物活性的空穴或受体。然后科学家可以通过实验或计算对此受体设计出高亲和性的配体(或药物)。计算方法已经被选择地用于筛选对小分子的结合。但是,以前这些设想仅获得了有限的成功。几个问题困扰着通过计算方法对配体的设计。计算方法与其说是基于对结合能量的精确测算,倒不如说是基于估算,并且,在与存在于生物分子内部复杂的相互作用相比较时,是依赖于简单的计算。而且,计算方法还需要实验证实,这种实验常常会暴露出一些对真实靶标不起作用的假阳性模式。此外,基于配体-受体复合物图象的实验本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种用于鉴别靶生物分子配体的方法,包括:a)获得靶生物分子的晶体;b)将此靶生物分子晶体暴露于一个或更多的待测样品,以及c)获得X-射线晶体衍射图形,以便确定是否形成了配体/受体复合物。

【技术特征摘要】
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【专利技术属性】
技术研发人员:VL尼纳伯J格雷尔C阿巴德扎帕特洛DW诺尔贝克
申请(专利权)人:艾博特公司
类型:发明
国别省市:US[美国]

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