一种检测人类免疫缺陷病毒的试剂盒制造技术

技术编号:24325496 阅读:82 留言:0更新日期:2020-05-29 17:58
本发明专利技术了公开了一种检测人类免疫缺陷病毒的试剂盒,涉及核酸检测技术领域。本发明专利技术公开的试剂盒包括:引物探针预混液、阳性质控品、阴性质控品和反应预混液。该试剂盒针对人类免疫缺陷病毒设计了特定序列的引物和探针组合,其特异性高,覆盖度好;极大提高了芯片进孔效率,使用热启动Taq酶和UDG酶,有效降低了反应假阳性;能够有效检测DNA终浓度仅为1ng/μL的样本,有效分辨终浓度低至1copy/μL的标准品,灵敏度、准确性和稳定性更高,可以绝对定量,反应时间更快,成本更低。扩大了该试剂盒的使用范围,能够满足临床上超早期筛查的技术需求,还可以广泛应用于临床对于HIV活性的动态监测,以及对于抗病毒药物疗效的评估。

【技术实现步骤摘要】
一种检测人类免疫缺陷病毒的试剂盒
本专利技术涉及核酸检测
,具体涉及一种检测人类免疫缺陷病毒的试剂盒。
技术介绍
人类获得性免疫缺陷综合征(AcquiredImmunodeficiencySyndrome,AIDS),又称艾滋病,是由人类免疫缺陷病毒(HumanImmunodeficiencyVirus,HIV)引起的传染性疾病。1983年,HIV在美国首次被发现。它是一种感染人类免疫系统细胞的慢病毒,属于逆转录病毒的一种,根据其基因型差异分为HIV-1和HIV-2两个大型,各大型包括多种亚型。HIV通过破坏人体的T淋巴细胞,进而阻断细胞免疫和体液免疫过程,导致免疫系统瘫痪,从而致使各种疾病在人体内蔓延,最终导致艾滋病。目前,检测HIV的方法种类较多,主要包括HIV抗体及HIV核酸检测等。其中,HIV抗体检测包括筛查试验和确证试验,筛查试验包括ELISA法、化学发光法或免疫荧光试验等,确证试验常用的方法是免疫印迹法,这种方法简单、快速、成本较低,但灵敏度、精确度不高,且不能定量。特别是低浓度的样本,处于窗口期的新近感染者筛查试验也可呈阴性反应。HIV核酸检测常用方法有反转录PCR(RT-PCR)、分枝DNA信号放大系统(bDNA)和实时荧光定量PCR扩增(realtime-PCR)。核酸检测方法虽然灵敏度相对较高,对疾病进展的监测、抗病毒疗效观察和耐药性监测非常重要。病毒载量测定的临床意义包括预测疾病进程、提供开始抗病毒治疗依据、评估治疗效果、指导治疗方案调整以及HIV感染早期诊断的参考指标。但是该方法定量需要依靠不同浓度的标准品制备标准曲线,极大地提高了检测成本,检测结果是相对定量,无法做到绝对定量。同时,需要操作人员具备一定专业素质,对实验室环境要求也较高。除此之外,对于病毒载量极低的样本,检测会出现假阴性,灵敏度大大地降低。数字PCR(digitalPCR,dPCR)技术是近几年兴起的第三代PCR技术,一般需要将样品稀释到单分子水平,并平均分配到几万至几百万个单元中进行反应,根据每个反应单元中扩增后的荧光信号相对比例和反应单元的体积,通过泊松分布计算出核酸靶分子的浓度。数字PCR技术无需采用内参基因和标准曲线,准确度高、重现性好,可以实现绝对定量分析,极大地提高了检测灵敏度和检出率。目前,比较成熟的数字化PCR平台,主要是伯乐公司的微滴式数字PCR和赛默飞公司的芯片式数字PCR。但是数字PCR仪器操作步骤多且复杂,微滴式数字PCR由于液滴有相对损耗,对于超低含量的目的物检测不准,需要额外的质控体系;芯片式数字PCR的也同样需要多种仪器组合,价格昂贵且操作不便利,无法满足临床便捷使用的需求。现有的检测HIV核酸的试剂盒大多是利用实时荧光定量PCR进行检测的。中国专利CN106498095A公开了一种人类免疫性缺陷病毒2型核酸检测试剂盒,利用实时荧光定量PCR对各浓度梯度的样本进行检测,检测灵敏度为15IU/mL。该试剂盒及其检测方法的灵敏度较低,操作复杂,无法做到绝对定量,不适于检测极低浓度的样本。中国专利CN105018647B公开了一种基于数字PCR精准定量分型检测HPV16-18的试剂盒及其检测方法,基于数字PCR平台,对HPV进行绝对定量检测,可检测出1copy/μL的样本,对于浓度较低的样品,相对于荧光定量PCR,数字PCR方法的检测结果更为精确,且具有良好的分型检测效果。因此,本专利技术提供了一种基于芯片式数字PCR检测人类免疫缺陷病毒的试剂盒。该试剂盒可以对血液、血清、精液、阴道分泌物、唾液等体液样本中HIV-cDNA进行检测,提供绝对定量。操作更加便捷,能够对极低检测目的物进行准确的定性、定量检测,灵敏度更高,数据结果稳定可靠,极大地降低了检测成本。
技术实现思路
本专利技术的目的在于提供一种检测人类免疫缺陷病毒的试剂盒,克服了现有技术中存在的问题,能够对极低检测目的物进行准确的定性、定量检测,提高了灵敏度。本专利技术一方面提供了一种检测人类免疫缺陷病毒的试剂盒,所述的试剂盒包括引物探针预混液;所述的引物探针预混液包括HIV-cDNA的引物对、人GAPDH基因的引物对、HIV-cDNA的荧光探针和人GAPDH基因的荧光探针;所述HIV-cDNA的引物对为:上游引物:5’-TTGACTAGCGGAGGCTAGA-3’,如SEQIDNO:1所示;下游引物:5’-CCCTGGCCTTAACCGAAT-3’,如SEQIDNO:2所示;所述人GAPDH基因的引物对为:上游引物:5’-CTAGCTGGCCCGATTTCTCC-3’,如SEQIDNO:3所示;下游引物:5’-CGCCCAATACGACCAAATCAGA-3’,如SEQIDNO:4所示;所述HIV-cDNA的荧光探针的核苷酸序列为:5’-CTGACGCTC+TCGCACCCATCTCTC-3’,如SEQIDNO:5所示;所述人GAPDH基因的荧光探针的核苷酸序列为:5’-TCCGGGTGA+TGCTTTTCCTAGA-3’,如SEQIDNO:6所示;其中“+”表示3’端的碱基为锁核酸修饰碱基。所述的锁核酸的结构式如式(1)所示:优选地,所述HIV-cDNA和/或人GAPDH基因的荧光探针的5’端含有荧光报告基团FAM和/或CY3,3’端含有荧光淬灭基团BHQ-1和/或BHQ-2。进一步优选地,所述的HIV-cDNA的荧光探针的5’端含有荧光报告基团FAM,3’端含有荧光淬灭基团BHQ-1;所述的人GAPDH基因的荧光探针的5’端含有荧光报告基团CY3,3’端含有荧光淬灭基团BHQ-2。优选地,所述的引物探针预混液中用于检测HIV-cDNA的引物对、人GAPDH基因的引物对、HIV-cDNA的荧光探针和人GAPDH基因的荧光探针的浓度比为2:2:1:1。优选地,所述的试剂盒还包括阳性质控品和阴性质控品;所述的阳性质控品是由包含20000copies/μL的HIV-cDNA片段的质粒与等体积的10ng/μL的人正常T淋巴细胞系DNA混合而成;所述的阴性质控品是10ng/μL的人正常T淋巴细胞系DNA。具体地,所述的人正常T淋巴细胞系为H9细胞系。优选地,所述的试剂盒还包括反应预混液,所述的反应预混液包括但不限于:dATP、dCTP、dGTP、dUTP、BSA(牛血清白蛋白)、热启动Taq酶、尿嘧啶-DNA-糖基酶(UDG酶)、ROX、TritonX-100和热稳定焦磷酸酶;进一步优选地,所述的热启动Taq酶和尿嘧啶-DNA-糖基酶的浓度比为0.5-1.5:1。更优选地,热启动Taq酶和尿嘧啶-DNA-糖基酶的浓度比为1:1。进一步优选地,所述的反应预混液包括dATP、dCTP、dGTP、dUTP浓度均为0.4mM,BSA浓度为10μg/μL,ROX浓度为100nM,TritonX-100浓度百分比为0.2%,热稳定焦磷酸酶为0.2U。本专利技术另一本文档来自技高网
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【技术保护点】
1.一种检测人类免疫缺陷病毒的试剂盒,其特征在于,所述的试剂盒包括引物探针预混液;/n所述的引物探针预混液包括HIV-cDNA的引物对、人GAPDH基因的引物对、HIV-cDNA的荧光探针和人GAPDH基因的荧光探针;/n所述HIV-cDNA的引物对为:/n上游引物:5’-TTGACTAGCGGAGGCTAGA-3’;/n下游引物:5’-CCCTGGCCTTAACCGAAT-3’;/n所述人GAPDH基因的引物对为:/n上游引物:5’-CTAGCTGGCCCGATTTCTCC-3’;/n下游引物:5’-CGCCCAATACGACCAAATCAGA-3’;/n所述HIV-cDNA的荧光探针的核苷酸序列为:/n5’-CTGACGCTC+TCGCACCCATCTCTC-3’;/n所述人GAPDH基因的荧光探针的核苷酸序列为:/n5’-TCCGGGTGA+TGCTTTTCCTAGA-3’;/n其中“+”表示3’端的碱基为锁核酸修饰碱基。/n

【技术特征摘要】
1.一种检测人类免疫缺陷病毒的试剂盒,其特征在于,所述的试剂盒包括引物探针预混液;
所述的引物探针预混液包括HIV-cDNA的引物对、人GAPDH基因的引物对、HIV-cDNA的荧光探针和人GAPDH基因的荧光探针;
所述HIV-cDNA的引物对为:
上游引物:5’-TTGACTAGCGGAGGCTAGA-3’;
下游引物:5’-CCCTGGCCTTAACCGAAT-3’;
所述人GAPDH基因的引物对为:
上游引物:5’-CTAGCTGGCCCGATTTCTCC-3’;
下游引物:5’-CGCCCAATACGACCAAATCAGA-3’;
所述HIV-cDNA的荧光探针的核苷酸序列为:
5’-CTGACGCTC+TCGCACCCATCTCTC-3’;
所述人GAPDH基因的荧光探针的核苷酸序列为:
5’-TCCGGGTGA+TGCTTTTCCTAGA-3’;
其中“+”表示3’端的碱基为锁核酸修饰碱基。


2.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于,所述HIV-cDNA和/或人GAPDH基因的荧光探针的5’端含有荧光报告基团FAM和/或CY3,3’端含有荧光淬灭基团BHQ-1和/或BHQ-2。


3.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于,所述的HIV-cDNA的荧光探针的5’端含有荧光报告基团FAM,3’端含有荧光淬灭基团BHQ-1;
所述的人GAPDH基因的荧光探针的5’端含有荧光报告基团CY3,3’端含有荧光淬灭基团BHQ-2。


4.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于,所述的引物探针预混液中用于检测HIV-cDNA的引物对、人GAPDH基因的引物对、HIV-cDNA的荧光探针和人GAPDH基因的荧光探针的浓度比为2:2:1:1。


5.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于,所述的试剂盒还包括阳性质控品和阴性质控品;
所述的阳性质控...

【专利技术属性】
技术研发人员:刘一博金鑫浩任鲁风张未来于军
申请(专利权)人:宁波胤瑞生物医学仪器有限责任公司
类型:发明
国别省市:浙江;33

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