【技术实现步骤摘要】
基于宏条形码技术的海洋浮游动物多样性的评价方法
本专利技术属于海洋生物多样性研究领域，具体涉及基于宏条形码技术的海洋浮游动物多样性的评价方法。
技术介绍
为加强海洋生态监测和强化海洋生态管理，我国自2003年开始组织建立海洋生态监控区并实施业务化监测，目前已经在我国近岸海域生态脆弱区和敏感区建立了21个生态监控区。海洋生物多样性是生态监控区业务化监测的重要内容，其目的是掌握海洋生物种类和数量的分布及变化趋势，监测对象包括浮游植物、浮游动物、底栖生物和游泳动物等。浮游动物类群具有多样性高的特点，传统基于形态学的显微计数法对鉴定人员的专业技能要求较高，并且不同鉴定人员的结果可比性较差，导致不同年际间的结果也缺乏可比性，这些缺陷导致基于形态学的鉴定方法难以满足业务化监测的需求，因此，急需开发自动化、标准化的浮游动物种类鉴定技术。此外，在海洋浮游动物中，隐存种广泛存在，形态鉴定导致种类多样性被低估。随着高通量测序技术的发展和浮游动物DNA条形码数据库的不断扩充，分子鉴定为浮游动物种类鉴定及多样性的评估提供了机遇，基于高通量测序的宏D...
【技术保护点】
1.一种海洋浮游动物多样性检测方法，其特征在于，包括以下步骤：/nS1、样品宏基因组的DNA提取；/nS2、PCR扩增18S rDNA的V4高变区片段以构建文库；/nS3、高通量测序；/nS4、生信分析；/n所述步骤S2中文库构建所用PCR引物包括正向引物组和反向引物组，所述的正向引物组和反向引物组中不能含有包含相同Index的引物；/n所述的正向引物组由以下引物中的一条或多条组成：/n引物F1：其核苷酸序列为SEQ ID NO:1所示的序列，其中含有Index1：AGTCTAGC；/n引物F2：其核苷酸序列为SEQ ID NO:2所示的序列，其中含有Index2：ACTG...
【技术特征摘要】
1.一种海洋浮游动物多样性检测方法，其特征在于，包括以下步骤：
S1、样品宏基因组的DNA提取；
S2、PCR扩增18SrDNA的V4高变区片段以构建文库；
S3、高通量测序；
S4、生信分析；
所述步骤S2中文库构建所用PCR引物包括正向引物组和反向引物组，所述的正向引物组和反向引物组中不能含有包含相同Index的引物；
所述的正向引物组由以下引物中的一条或多条组成：
引物F1：其核苷酸序列为SEQIDNO:1所示的序列，其中含有Index1：AGTCTAGC；
引物F2：其核苷酸序列为SEQIDNO:2所示的序列，其中含有Index2：ACTGCAGC；
引物F3：其核苷酸序列为SEQIDNO:3所示的序列，其中含有Index3：CTATGCGT；
引物F4：其核苷酸序列为SEQIDNO:4所示的序列，其中含有Index4：CGAATCTG；
引物F5：其核苷酸序列为SEQIDNO:5所示的序列，其中含有Index5：TCAGATCA；
引物F6：其核苷酸序列为SEQIDNO:6所示的序列，其中含有Index6：TCCAGTGC；
引物F7：其核苷酸序列为SEQIDNO:7所示的序列，其中含有Index7：GTCATCGA；
引物F8：其核苷酸序列为SEQIDNO:8所示的序列，其中含有Index8：GACACTTG；
引物F9：其核苷酸序列为SEQIDNO:9所示的序列，其中含有Index9：TCGATCCG；
引物F10：其核苷酸序列为SEQIDNO:10所示的序列，其中含有Index10：AATCGTAG；
所述的反向引物组由以下引物中的一条或多条组成：
引物R1：其核苷酸序列为SEQIDNO:11所示的序列，其中含有所述Index1；
引物R2：其核苷酸序列为SEQIDNO:12所示的序列，其中含有所述Index2；
引物R3：其核苷酸序列为SEQIDNO:13所示的序列，其中含有所述Index3；
引物R4：其核苷酸序列为SEQIDNO:14所示的序列，其中含有所述Index4；
引物R5：其核...
【专利技术属性】
技术研发人员：王睿睿，孙艺，邵魁双，王孝程，林勇，李冬梅，张金勇，李飞，李宏俊，
申请(专利权)人：国家海洋环境监测中心，
类型：发明
国别省市：辽宁;21
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