一种山羊Sox9基因InDel标记的检测方法及其应用技术

本发明专利技术公开了一种山羊Sox9基因InDel标记的检测方法及其应用。该方法是通过PCR扩增、琼脂糖凝胶电泳鉴定山羊Sox9基因中的一个InDel位点的多态性，根据对InDel位点与山羊生长性状进行的关联性分析，发现该Sox9基因InDel位点的不同基因型与陕北白绒山羊胸围之间存在显著相关，提示所述InDel位点的基因型可作为提高山羊胸围的DNA标记，本发明专利技术的检测方法可以在山羊生长性状的标记辅助选择育种中应用，快速建立优良的山羊遗传资源群体。

A detection method of indel marker of Sox9 gene in goat and its application

【技术实现步骤摘要】
一种山羊Sox9基因InDel标记的检测方法及其应用
本专利技术属于生物技术与家畜育种领域，涉及山羊Sox9基因NC_030826.1:g.58090106_58090109位4-bp插入/缺失多态性(InDel)位点的快速、准确分型检测及其在分子标记辅助选择(MAS)育种中的应用。
技术介绍
近年来随着生物技术的不断发展，人们利用高通量测序、分子标记等先进技术手段，建立起常规育种与分子育种相结合的渠道，使育种工作实现了由经验向科学的根本性转变，大幅度的提高了育种效率。在分子水平上以DNA多态为标记进行遗传分析，识别个体基因差异，从而产生了分子遗传标记，随着畜禽数量性状图谱越来越完善，为畜禽改良提供了有效手段。分子标记辅助选择通过寻找与重要性状紧密连锁的DNA分子标记，加快了育种进程，实现了对目标性状的直接选择，提高了育种效率。在MAS育种技术体系中，寻找重要功能基因、筛查重要基因遗传变异位点，并分析重要功能基因遗传变异位点与生长性能的相关性，是其应用的前提和关键。插入/缺失多态性(insertion/deletion,InDel)是一本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种山羊Sox9基因InDel标记的检测方法，其特征在于：包括以下步骤：/n以待测山羊基因组DNA为模板，利用PCR扩增包含山羊Sox9基因3’UTR区域插入/缺失多态性位点的片段，对扩增产物进行电泳，根据电泳结果鉴定所述插入/缺失多态性位点的基因型。/n

【技术特征摘要】
1.一种山羊Sox9基因InDel标记的检测方法，其特征在于：包括以下步骤：
以待测山羊基因组DNA为模板，利用PCR扩增包含山羊Sox9基因3’UTR区域插入/缺失多态性位点的片段，对扩增产物进行电泳，根据电泳结果鉴定所述插入/缺失多态性位点的基因型。


2.根据权利要求1所述一种山羊Sox9基因InDel标记的检测方法，其特征在于：所述插入/缺失多态性位点选自山羊Sox9基因NC_030826.1:g.58090106_58090109位插入/缺失多态性位点。


3.根据权利要求1所述一种山羊Sox9基因InDel标记的检测方法，其特征在于：所述PCR采用的引物对为：
上游引物：5’-GCGAATCAACAACCACCTTAGG-3’
下游引物：5’-TTCCTCACAAGCCACTGACTTC-3’。


4.根据权利要求1所述一种山羊Sox9基因InDel标记的检测方法，其特征在于：所述PCR采用的反应程序为：95℃预变性5min；94℃变性30s，65℃退火30s，72℃延伸15s，15个循环，每循环后退火温度减1℃；50℃退火30s，72℃延伸15s，35个循环；72℃延伸10min；所述电泳采用质量浓度为3.5％的琼脂糖凝胶。

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【专利技术属性】
技术研发人员：何礼邦，蓝贤勇，毕谊，王若兰，李洁，潘传英，朱海鲸，屈雷，陈宏，
申请(专利权)人：西北农林科技大学，
类型：发明
国别省市：陕西;61