一种与心血管疾病相关的SNP分子标记及其应用制造技术

技术编号:22046346 阅读:51 留言:0更新日期:2019-09-07 12:30
本发明专利技术公开了一种与心血管疾病相关的SNP分子标记,属于医学分子生物学领域。所述分子标记选自MTHFR基因rs1801131、rs1801133和Nkx2.5基因rs2277923中的至少一种,其中rs1801131为A或C,rs1801133为C或T,rs2277923为A或G。利用本发明专利技术的分子标记可以进行心血管疾病的辅助诊断,对后续临床治疗具有指导意义。

A SNP Molecular Marker Related to Cardiovascular Diseases and Its Application

【技术实现步骤摘要】
一种与心血管疾病相关的SNP分子标记及其应用
本专利技术属于医学分子生物学领域,具体地,涉及一种与心血管疾病相关的SNP分子标记及其应用。
技术介绍
心血管疾病严重危害人类健康,其病因复杂。研究表明,基因方面的因素导致了心血管疾病易感性的个体差异。现在被大量研究的先天性心脏病(congenitalheartdisease,CHD)相关基因也是导致成年人心血管疾病的基因,它们是心脏发育过程中重要的转录因子,如NKX2.5、TBX5、GATA-4、Irx4、MTHFR等。亚甲基四氢叶酸还原酶(methylenetrahydrofolatereduclase,MTHFR)是同型半胱氨酸(homocysteine,Hcy)代谢关键酶之一。Hcy主要通过促进血管内皮细胞损伤、血管平滑肌细胞增殖、脂质过氧化和血液凝固性增高等机制,诱导动脉粥样硬化的发生。Selhub的研究认为MTHFR基因突变致酶活性下降,使血浆同型半胱氨酸水平升高,是心血管病的独立危险因素。NKX2.5作为转录因子调控网络的起始端,参与了心脏前体细胞的分化、心脏环化、房室分隔、房室流出道和传导系统的形成及成体心脏正常功能的维持,并持续表达于心肌细胞分化的各个阶段,在胚胎、胎儿乃至成体心肌细胞中均保持一定的表达水平。早在1993年,研究者就发现Nkx2.5在成人心脏中表达。而这两种基因多态性位点的突变也被做了大量研究,但针对于成人心血管疾病的研究并不多。
技术实现思路
为了解决上述技术问题,专利技术人针对MTHFR基因与NKX2.5基因的多态位点与心血管疾病的易感性是否存在相关性,以及多态性位点之间是否有联合致病的作用进行试验探讨,出乎意料地发现,MTHFR基因rs1801131、rs1801133和Nkx2.5基因rs2277923位点突变是心血管疾病的风险因素。rs1801133与rs1801131位点、rs1801131与rs2277923位点、rs1801133与rs2277923位点对心血管疾病患病风险存在联合作用,从而完成本专利技术。本专利技术的第一方面提供一种与心血管疾病相关的SNP分子标记,所述分子标记选自所述分子标记选自MTHFR基因rs1801131、rs1801133和Nkx2.5基因rs3729753、rs2277923中的至少一种,其中rs1801131为A或C,rs1801133为C或T,rs2277923为G或A。。MTHFR是同型半胱氨酸(homocysteine,Hcy)代谢关键酶之一。MTHFR基因的突变会导致血浆Hcy水平增高,诱导心血管疾病的发生,Hcy主要通过促进血管内皮细胞损伤、血管平滑肌细胞增殖、脂质过氧化和血液凝固性增高等机制,诱导动脉粥样硬化的发生。在本专利技术中,rs1801131AC基因型或CC基因型患心血管疾病的风险高于rs1801131AA基因型。其中,纯合突变型即CC基因型患心血管疾病的风险最高。在本专利技术中,rs1801133CT基因型或TT基因型患心血管疾病的风险高于rs1801131CC基因型。在本专利技术中,rs2277923GA基因型或AA基因型患心血管疾病的风险高于rs1801131AA基因型。其中,纯合突变型即AA基因型患心血管疾病的风险最高。在本专利技术中,rs1801131AC基因型或CC基因型,并且rs1801133CT基因型或TT基因型患心血管疾病的风险高。进一步地,rs1801131CC基因型,并且rs1801133CT基因型或TT基因型患心血管疾病的风险最高。在本专利技术中,rs1801131AC基因型或CC基因型,并且rs2277923GA基因型或AA基因型患心血管疾病的风险高。进一步地,rs1801131CC基因型,并且rs1801133AA基因型患心血管疾病的风险最高。在本专利技术中,rs1801133CT基因型或TT基因型,并且rs2277923GA基因型或AA基因型患心血管疾病的风险高。进一步地,rs1801131CT基因型或TT基因型,并且rs1801133AA基因型患心血管疾病的风险最高。在本专利技术中,所述心血管疾病选自冠状动脉粥样硬化性心脏病、原发性高血压、冠心病、动脉硬化。本专利技术第二方面提供用于检测本专利技术第一方面所述SNP分子标记的试剂在制备用于预测和诊断心血管疾病的试剂盒中的应用。在本专利技术的一些实施方案中,所述试剂为能够扩增所述SNP分子标记的引物组合。在本专利技术的一些实施方案中,扩增rs1801131的引物组合包括具有SEQIDNO.1所示核苷酸序列的上游引物和具有SEQIDNO.2所示核苷酸序列的下游引物;扩增rs1801133的引物组合包括具有SEQIDNO.3所示核苷酸序列的上游引物和具有SEQIDNO.4所示核苷酸序列的下游引物;扩增rs2277923的引物组合包括具有SEQIDNO.7所示核苷酸序列的上游引物和具有SEQIDNO.8所示核苷酸序列的下游引物。进一步地,利用所述试剂盒检测对象中所述分子标记,当待测对象为rs1801131AC基因型或CC基因型,或者rs1801133CT基因型或TT基因型,或者rs2277923GA基因型或AA基因型,表示患心血管疾病的风险高。在本专利技术的一些优选实施方案中,当待测对象为rs1801131AC基因型或CC基因型,并且rs1801133CT基因型或TT基因型,表示患心血管疾病的风险高。在本专利技术的另一些优选实施方案中,当待测对象为rs1801131AC基因型或CC基因型,并且rs2277923GA基因型或AA基因型,表示患心血管疾病的风险高。在本专利技术的又一些优选实施方案中,当待测对象为rs1801133CT基因型或TT基因型,并且rs2277923GA基因型或AA基因型,表示患心血管疾病的风险高。更进一步地,当待测对象为rs1801131CC基因型,或者rs1801133CT基因型或TT基因型,或者rs2277923AA基因型表示患心血管疾病的风险高。在本专利技术的一些优选实施方案中,当待测对象为rs1801131CC基因型,并且rs1801133CT基因型或TT基因型,表示患心血管疾病的风险高。在本专利技术的另一些优选实施方案中,当待测对象为rs1801131CC基因型,并且rs2277923GA基因型或AA基因型,表示患心血管疾病的风险高。在本专利技术的又一些优选实施方案中,当待测对象为rs1801133CT基因型或TT基因型,并且rs2277923AA基因型,表示患心血管疾病的风险高。本专利技术第三方面提供一种用于预测和诊断心血管疾病的试剂盒,包括用于扩增rs1801131的引物组合:具有SEQIDNO.1所示核苷酸序列的上游引物和具有SEQIDNO.2所示核苷酸序列的下游引物;用于扩增rs1801133的引物组合:具有SEQIDNO.3所示核苷酸序列的上游引物和具有SEQIDNO.4所示核苷酸序列的下游引物;用于扩增rs2277923的引物组合:具有SEQIDNO.7所示核苷酸序列的上游引物和具有SEQIDNO.8所示核苷酸序列的下游引物。本专利技术第四方面提供一种突变的Nkx2.5基因,所述突变的Nkx2.5基因rs2277923位点由G突变为A。本专利技术的有益效果本专利技术的分子标记,对于MTHFRrs1801131位点,携带突变等位基本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种与心血管疾病相关的SNP分子标记,其特征在于,所述分子标记选自

【技术特征摘要】
1.一种与心血管疾病相关的SNP分子标记,其特征在于,所述分子标记选自MTHFR基因rs1801131、rs1801133和Nkx2.5基因rs2277923中的至少一种,其中rs1801131为A或C,rs1801133为C或T,rs2277923为G或A。2.根据权利要求1所述的SNP分子标记,其特征在于,所述分子标记为MTHFR基因rs1801131和rs1801133,其中rs1801131为A或C,rs1801133为C或T。3.根据权利要求1所述的SNP分子标记,其特征在于,所述分子标记为MTHFR基因rs1801131和Nkx2.5基因rs2277923位点,其中rs1801133为C或T,rs2277923为G或A。4.根据权利要求1所述的SNP分子标记,其特征在于,所述分子标记为MTHFR基因rs1801133位点和Nkx2.5基因rs2277923位点,其中rs1801133为C或T,rs2277923为G或A。5.根据权利要求1-4任一所述的SNP分子标记,其特征在于,所述心血管疾病选自冠状动脉粥样硬化性心脏病、原发性高血压、冠心病、动脉硬化。6.用于检测权利要求1所述SNP分子标记的试剂在制备用于预测和诊断心血管疾病的试剂盒中的应用。7.根据权...

【专利技术属性】
技术研发人员:黄山冯勤颖宋晓钰
申请(专利权)人:贵州省临床检验中心
类型:发明
国别省市:贵州,52

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