一种与小儿先天性心脏病相关的SNP分子标记及其应用制造技术

本发明专利技术公开了一种与小儿先天性心脏病相关的SNP分子标记，属于医学分子生物学领域。所述分子标记选自MTHFR基因rs1801131和rs1801133中的至少一种，其中rs1801131为A或C，rs1801133为C或T。利用本发明专利技术的分子标记可以进行小儿先天性心脏病的辅助诊断，对后续临床治疗具有指导意义。

A SNP Molecular Marker Associated with Congenital Heart Disease in Children and Its Application

【技术实现步骤摘要】
一种与小儿先天性心脏病相关的SNP分子标记及其应用
本专利技术属于医学分子生物学领域，具体地，涉及一种与小儿先天性心脏病相关的SNP分子标记及其应用。
技术介绍
先天性心脏病(congenitalheartdisease，CHD)是心脏、血管在胚胎发育过程中发育障碍所致的心脏、血管形态、结构、功能和代谢上的异常。最新的统计结果显示，存活新生儿中先天性心脏病的发病率为0.07％～1.17％，世界各国报道的发病率无明显差别。根据世界卫生组织的资料，全球每年约有150万儿童出生时患有CHD。我国每年有13万以上的CHD患儿出生，7岁以下儿童中先天性心脏病人数达54万，是造成儿童死亡或伤残的重要原因，并且给社会和家庭带来严重的经济和精神等方面的负担。CHD的病因目前尚未阐明，但多数学者认为，除了少数CHD是单基因突变和染色体畸变所致外，大多数CHD属于多基因遗传病，是由遗传因素和环境因素相互作用造成的，一些先天性心脏病高发家系的研究也证实了这一点。然而，与先天性心脏病相关的基因突变及其类型仍鲜有报道。
技术实现思路
为了解决上述技术问题，专利技术人通过小儿先天性心脏病患者全血检测MTHFR基因的两个多态性位点并检测相关血清学标志物Hcy水平，探讨基因突变与疾病间的相关性。，出乎意料地，MTHFR基因rs1801131、rs1801133位点突变是先天性心脏病的风险因素，从而完成本专利技术。本专利技术的第一方面提供一种与小儿先天性心脏病相关的SNP分子标记，所述分子标记选自MTHFR基因rs1801131和rs1801133中的至少一种，其中rs1801131为A或C，rs1801133为C或T。MTHFR是同型半胱氨酸(homocysteine，Hcy)代谢关键酶之一。MTHFR基因的突变会导致血浆Hcy水平增高，诱导心血管疾病的发生，Hcy主要通过促进血管内皮细胞损伤、血管平滑肌细胞增殖、脂质过氧化和血液凝固性增高等机制，诱导动脉粥样硬化的发生。在本专利技术中，rs1801131AC基因型或CC基因型患小儿先天性心脏病的风险高于rs1801131AA基因型。其中，纯合突变型即CC基因型患小儿先天性心脏病的风险最高。在本专利技术中，rs1801133CT基因型或TT基因型患小儿先天性心脏病的风险高于rs1801131CC基因型。在本专利技术中，rs1801131AC基因型或CC基因型，并且rs1801133CT基因型或TT基因型患小儿先天性心脏病的风险高于其他基因型。其中，rs1801131CC基因型，并且rs1801133CT基因型或TT基因型患小儿先天性心脏病的风险最高。在本专利技术中，所述小儿先天性心脏病选自冠状动脉粥样硬化性心脏病、原发性高血压、冠心病、动脉硬化。本专利技术第二方面提供用于检测本专利技术第一方面所述SNP分子标记的试剂在制备用于预测和诊断小儿先天性心脏病的试剂盒中的应用。在本专利技术的一些实施方案中，所述试剂为能够扩增所述SNP分子标记的引物组合。在本专利技术的一些实施方案中，扩增rs1801131的引物组合包括具有SEQIDNO.1所示核苷酸序列的上游引物和具有SEQIDNO.2所示核苷酸序列的下游引物；扩增rs1801133的引物组合包括具有SEQIDNO.3所示核苷酸序列的上游引物和具有SEQIDNO.4所示核苷酸序列的下游引物。进一步地，利用所述试剂盒检测对象中所述分子标记，当待测对象为rs1801131AC基因型或CC基因型，或者rs1801133CT基因型或TT基因型，表示患小儿先天性心脏病的风险高。在本专利技术的一些优选实施方案中，当待测对象为rs1801131CC基因型，或者rs1801133TT基因型，表示患小儿先天性心脏病的风险高。在本专利技术的一些优选实施方案中，当待测对象为rs1801131CC基因型，并且rs1801133CT基因型或TT基因型，表示患小儿先天性心脏病的风险高。本专利技术第三方面提供一种用于预测和诊断小儿先天性心脏病的试剂盒，包括用于扩增rs1801131的引物组合：具有SEQIDNO.1所示核苷酸序列的上游引物和具有SEQIDNO.2所示核苷酸序列的下游引物；用于扩增rs1801133的引物组合：具有SEQIDNO.3所示核苷酸序列的上游引物和具有SEQIDNO.4所示核苷酸序列的下游引物。本专利技术的第四方面提供一种突变的MTHFR基因，所述突变的MTHFR基因rs1801131由A突变C，和/或rs1801133由C突变为T。本专利技术的有益效果本专利技术的分子标记，对于rs1801131位点，携带突变等位基因C个体的患病风险是野生型等位基因A的3.81倍(95％CI1.79～8.13，P＝0.000)。突变杂合子(AC)和突变纯合子(CC)个体患病的风险升高，AC增加了4.57倍；CC增加了7.48倍。纯合突变(CC)与杂合突变(AC)都可增加小儿先天性心脏病的风险，但纯合子的患病风险更大。对于rs1801131位点，携带突变等位基因T个体的患病风险与野生型等位基因C相比，并未发现差异(P＝0.331)。与野生型(CC)相比，突变杂合子(CT)患病风险增加了2.48倍，突变纯合子(TT)无统计学差异(P＝0.572)。相对于现有技术，本专利技术提供一种全新的用于辅助诊断小儿先天性心脏病患病风险的分子标记，对后续临床治疗具有重要价值。具体实施方式为了使本专利技术所解决的技术问题、技术方案及有益效果更加清楚明白，以下结合实施例，对本专利技术进行进一步详细说明。实施例以下例子在此用于示范本专利技术的优选实施方案。本领域内的技术人员会明白，下述例子中披露的技术代表专利技术人发现的可以用于实施本专利技术的技术，因此可以视为实施本专利技术的优选方案。但是本领域内的技术人员根据本说明书应该明白，这里所公开的特定实施例可以做很多修改，仍然能得到相同的或者类似的结果，而非背离本专利技术的精神或范围。除非另有定义，所有在此使用的技术和科学的术语，和本专利技术所属领域内的技术人员所通常理解的意思相同，在此公开引用及他们引用的材料都将以引用的方式被并入。那些本领域内的技术人员将意识到或者通过常规试验就能了解许多这里所描述的专利技术的特定实施方案的许多等同技术。这些等同将被包含在权利要求书中。实施例11对象与方法1.1对象选择2015年10月至2016年3月在贵州省人民医院就诊并符合小儿先天性心脏病诊断标准的患者49例，作为病例组。选择同时期在本院体检的年龄相仿的正常人群53例，作为对照组。先天性心脏病由彩色多普勒血流显像(colorDopplerflowimaging，CDFI)及外科手术确诊。病例与对照组均获得研究对象或亲属的知情同意。对病例及对照组采集静脉全血5mL，EDTA-K2抗凝，-20℃保存。1.2主要试剂和仪器ABI2400型PCR仪、血液基因组DNA快速抽提试剂盒(中国生工生物工程股份有限公司)、LowMWDNAMarker-A(中国生工生物工程股份有限公司)、4SGreenNucleicAcidStain核酸染色剂、琼脂糖H等。引物由上海生工生物工程股份有限公司设计合成。1.3方法1.3.1基因组DNA提取及检测取冰冻静脉血于37℃水浴箱溶解，按血液基因组DNA快速抽提试剂盒步骤提取基因组DNA。采用微量分光光度计测定DNA浓度及纯度，用OD本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种与小儿先天性心脏病相关的SNP分子标记，其特征在于，所述分子标记选自

【技术特征摘要】
1.一种与小儿先天性心脏病相关的SNP分子标记，其特征在于，所述分子标记选自MTHFR基因rs1801131和rs1801133中的至少一种，其中rs1801131为A或C，rs1801133为C或T。2.根据权利要求1所述的SNP分子标记，其特征在于，rs1801131AC基因型或CC基因型患小儿先天性心脏病的风险高于rs1801131AA基因型。3.根据权利要求1所述的SNP分子标记，其特征在于，rs1801133CT基因型或TT基因型患小儿先天性心脏病的风险高于rs1801131CC基因型。4.根据权利要求1所述的SNP分子标记，其特征在于rs1801131AC基因型或CC基因型，并且rs1801133CT基因型或TT基因型患小儿先天性心脏病的风险高于其他基因型。5.用于检测权利要求1所述SNP分子标记的试剂在制备用于预测和诊断小儿先天性心脏病的试剂盒中的应用。6.根据权利要求5所述的应用，其特征在于，...

【专利技术属性】
技术研发人员：冯勤颖，黄山，孙建超，
申请(专利权)人：贵州省临床检验中心，
类型：发明
国别省市：贵州,52