使用同种异体T细胞治疗自身免疫疾病的方法技术

本文提供包括表达T细胞受体的同种异体细胞毒性T细胞的组合物以及用该组合物治疗自身免疫疾病的方法，所述T细胞受体与I类MHC上呈递的EB病毒(EBV)肽特异性结合。

Treatment of autoimmune diseases with allogeneic T cells

This article provides a composition comprising allogeneic cytotoxic T cells expressing T cell receptors and a method for treating autoimmune diseases with the composition. The T cell receptors specifically bind to EBV peptide presented on class I MHC.

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】使用同种异体T细胞治疗自身免疫疾病的方法相关申请本申请要求于2016年5月25日提交的美国临时专利申请序列号62/341,360、于2016年7月7日提交的美国临时专利申请序列号62/359,326、以及于2017年4月20日提交的美国临时专利申请序列号62/487,814的优先权的权益，其中的每个通过引用被整体并入。背景自身免疫疾病(如多发性硬化(MS)和系统性自身免疫疾病(SAD)、以及炎性肠病(IBD))是由针对身体自身组织的异常免疫应答引起的病理。MS的特征在于由身体自身的免疫细胞降解髓鞘(一种围绕神经纤维的保护性脂质壳)。SAD是具有多种症状的一组结缔组织疾病，包含类风湿性关节炎(RA)、系统性红斑狼疮(SLE)和斯耶格伦综合征(SS)。IBD是结肠和小肠的一组炎性病况，所述IBD包含克罗恩氏病、乳糜泻和溃疡性结肠炎(ulcerativecolitis)。EB病毒(EBV)(也称为人疱疹病毒4)是一种普遍存在的疱疹病毒。最近，已经表明，暴露于EBV可以在自身免疫疾病(包含MS、SAD和IBD)的发病机理中易感染或以另外的方式发挥作用。例如，最近的研究已经表明，相比于健康个体，被诊断患有MS的个体在神经组织中聚集的B细胞中显示出更高水平的EBV相关蛋白。据推测，EBV感染的B细胞的增加和/或这样的细胞的有缺陷的消除可能使个体易患这样的自身免疫疾病。概述本文提供用于治疗自身免疫疾病(例如，MS、SAD和/或IBD)的方法，所述方法包括向受试者施用表达T细胞受体的同种异体细胞毒性T细胞(CTL)，所述T细胞受体与I类MHC上呈递的EBV肽特异性结合。在一些实施方案中，限制TCR的I类MHC由存在于受试者中的HLA等位基因编码。在一些实施方案中，方法包括从细胞库中选择同种异体CTL。在一些实施方案中，EBV肽包括LMP1肽或LMP1肽的片段、LMP2A肽或LMP2A肽的片段、和/或EBNA1肽或EBNA1肽的片段。在一些实施方案中，EBV肽包括表1中列出的序列。在某些方面，本文提供治疗自身免疫疾病(例如，MS、SAD和/或IBD)的方法，所述方法包括生成表达与I类MHC上呈递的EBV肽特异性结合的T细胞受体的同种异体CTL，以及然后向受试者施用同种异体CTL。在一些实施方案中，在施用至受试者之前，将同种异体CTL储存在细胞库中。在一些实施方案中，限制TCR的I类MHC由存在于受试者中的HLA等位基因编码。在一些实施方案中，通过将包括同种异体CTL的样品(例如，PBMC样品)与呈递I类MHC(例如，由存在于受试者中的HLA等位基因编码的I类MHC)上的EBV肽的抗原呈递细胞(APC)孵育，从而诱导样品中肽特异性CTL的增殖，来生成同种异体CTL。在一些实施方案中，通过将APC与编码EBV肽的核酸构建体(例如，AdE1-LMPpoly)孵育，从而诱导APC呈递EBV肽，来使APC呈递EBV肽。在一些实施方案中，APC可以是B细胞、抗原呈递T细胞、树突状细胞或人工抗原呈递细胞(例如，表达CD80、CD83、41BB-L和/或CD86的细胞系(如aK562细胞))。在一些实施方案中，EBV肽包括LMP1肽或LMP1肽的片段、LMP2A肽或LMP2A肽的片段、和/或EBNA1肽或EBNA1肽的片段。在一些实施方案中，EBV肽包括表1中列出的序列。在一些实施方案中，在施用至受试者之前，针对与受试者的相容性来选择CTL(例如，从细胞库选择)。在一些实施方案中，如果CTL通过与受试者共有的HLA等位基因被限制(即，CLT的TCR受限制于由存在于受试者中的HLA等位基因编码的I类MHC蛋白)，则选择CTL。在一些实施方案中，如果CTL和受试者共有至少2个(例如，至少3个、至少4个、至少5个、至少6个)HLA等位基因，并且CTL通过共有的HLA等位基因被限制，则选择CTL。在一些实施方案中，施用至受试者的CTL选自细胞库(例如，CTL库)。附图的简要说明图1示出，相比于从MS患者获得的CTL产物，从健康(NMDP)供体获得的CTL产物中改进的效应子功能，如通过刺激后CD8+和IFNg+的活淋巴细胞的级分所测量的(曼-惠特尼(MannWhitney)p值＝0.0002)。详细说明综述本文提供使用识别例如本文所描述的EBV表位中的一个或更多个的同种异体CTL，在受试者中治疗自身免疫紊乱(例如，MS、SAD和/或IBD)的方法。在一些实施方案中，方法还包括从细胞库中选择同种异体CTL。在一些实施方案中，方法还包括制造同种异体CTL。定义为了方便起见，此处收集了说明书、实施例和所附权利要求中采用的某些术语。本文中使用冠词“一(a)”和“一(an)”指所述冠词的一个或多于一个(即，至少一个)语法对象。举例来说，“一要素”意指一个要素或多于一个要素。如本文所使用的，术语“施用”意指向受试者提供药剂或药物组合物，并且包含(但不限于)由医疗技术人员施用和自我施用。这样的药剂可以含有例如本文所描述的肽、本文提供的抗原呈递细胞和/或本文提供的CTL。术语“氨基酸”旨在包括包含氨基官能性和酸官能性两者、并且能够被包含在天然存在的氨基酸的聚合物中的全部分子(无论是天然的还是合成的)。示例性氨基酸包含天然存在的氨基酸；其类似物、衍生物和同源物；具有变体侧链的氨基酸类似物；以及前述中任何一种的全部立体异构体。术语“结合”或“相互作用”指由于例如生理条件下的静电相互作用、疏水相互作用、离子相互作用和/或氢键相互作用而在两个分子之间(例如，TCR与肽/MHC之间)的缔合(其可以是稳定的缔合)。术语“生物样品”、“组织样品”或简单地“样品”各自指从受试者的组织获得的细胞的集合。组织样品的来源可以是如来自新鲜、冷冻和/或保存的器官、组织样品、活组织检查、或抽出物的实体组织；血液或任何血液成分、血清、血液；体液，如脑脊液、羊水、腹膜液或间质液、尿液、唾液、粪便、眼泪；或来自受试者的妊娠或发育的任何时间的细胞。如本文所使用的，术语“细胞因子”指影响细胞功能，并且是调控免疫应答、炎症应答或造血反应中细胞之间的相互作用的分子的任何分泌的多肽。细胞因子包含(但不限于)单核因子和淋巴因子，无论哪种细胞产生其。例如，单核因子通常被称为由单核细胞(如巨噬细胞和/或单核细胞)产生和分泌。然而，许多其他细胞也产生单核因子，如天然杀伤细胞、成纤维细胞、嗜碱性粒细胞、嗜中性粒细胞、内皮细胞、脑星形细胞、骨髓基质细胞、表皮角质形成细胞和B淋巴细胞。淋巴因子通常被称为由淋巴细胞产生。细胞因子的实例包含(但不限于)白细胞介素-1(IL-1)、白细胞介素-2(IL-2)、白细胞介素-6(IL-6)、白细胞介素-8(IL-8)、肿瘤坏死因子α(TNFα)和肿瘤坏死因子β(TNFβ)。术语“表位”意为能够与抗体或TCR特异性结合的蛋白决定簇。表位通常由分子的化学活性表面基团(如氨基酸或糖侧链)组成。某些表位可以由抗体能够结合的特定氨基酸序列限定。如本文所使用的，短语“药学上可接受的”指在合理的医学判断范围内适合于与人类和动物的组织接触，而没有过度毒性、刺激、过敏反应或其他问题或并发症，与合理的利益/风险比相称的那些药剂、化合物、材料、组合物和/或剂量。如本文所使用的，短语“本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种在受试者中治疗或预防自身免疫疾病的方法，所述方法包括向所述受试者施用表达T细胞受体的同种异体细胞毒性T细胞(CTL)，所述T细胞受体与I类MHC上呈递的EBV肽特异性结合。

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】2016.05.25 US 62/341,360;2016.07.07 US 62/359,326;1.一种在受试者中治疗或预防自身免疫疾病的方法，所述方法包括向所述受试者施用表达T细胞受体的同种异体细胞毒性T细胞(CTL)，所述T细胞受体与I类MHC上呈递的EBV肽特异性结合。2.如权利要求1所述的方法，其中所述I类MHC由存在于所述受试者中的HLA等位基因编码。3.如权利要求1或2所述的方法，其中所述自身免疫疾病是多发性硬化(MS)。4.如权利要求1或2所述的方法，其中所述自身免疫疾病是类风湿性关节炎(RA)。5.如权利要求1至4中任一项所述的方法，其中所述同种异体CTL从细胞库获得。6.一种在受试者中治疗或预防自身免疫疾病的方法，所述方法包括：a)从细胞库中选择表达T细胞受体的同种异体细胞毒性T细胞(CTL)，所述T细胞受体与I类MHC上呈递的EBV肽特异性结合；b)向所述受试者施用所述同种异体CTL。7.如权利要求6所述的方法，其中所述I类MHC由存在于所述受试者中的HLA等位基因编码。8.如权利要求6或7所述的方法，其中所述自身免疫疾病是多发性硬化(MS)或类风湿性关节炎(RA)。9.一种在受试者中治疗或预防自身免疫疾病的方法，所述方法包括：a)将包括同种异体细胞毒性T细胞(CTL)的样品与呈递EBV肽的抗原呈递细胞(APC)孵育，从而诱导所述样品中肽特异性T细胞的增殖；b)向所述受试者施用肽特异性同种异体CTL。10.如权利要求9所述的方法，其中所述I类MHC由存在于所述受试者中的HLA等位基因编码。11.一种在受试者中治疗或预防自身免疫疾病的方法，所述方法包括：a)将抗原呈递细胞(APC)与编码EBV肽的核酸构建体孵育，从而诱导...

【专利技术属性】
技术研发人员：R·肯纳，
申请(专利权)人：昆士兰医学研究所理事会，
类型：发明
国别省市：澳大利亚,AU