The invention discloses a primer pair for detecting gyrA gene and parC gene polymorphism of Pseudomonas aeruginosa by pyrophosphatic acid sequencing method, and a detection kit containing the primer pair. Through the primer design of gyrA gene and parC gene of Pseudomonas aeruginosa, the polymorphism of Thr_83 and ASP_of gyrA gene and Ser_and Ala_of parC gene were analyzed. The kit can realize accurate, rapid and high throughput detection of gyrA gene and parC gene polymorphism of Pseudomonas aeruginosa.
【技术实现步骤摘要】
焦磷酸测序法检测绿脓杆菌gyrA基因和parC基因多态性的引物对及试剂盒
本专利技术属于分子生物学领域，具体涉及焦磷酸测序法检测绿脓杆菌中gyrA基因和parC基因多态性的引物对及试剂盒。
技术介绍
绿脓杆菌（也称铜绿假单胞菌）是一种非常重要的机会感染菌，可以占到所有医院感染的10%。而且对免疫功能低下的患者，例如严重烧伤、癌症、艾滋、移植手术患者、介入治疗患者等，危害尤其巨大，高达28%的这类患者可能感染绿脓杆菌[1-2]。不仅如此，绿脓杆菌因其内在的机制，或者通过获得性的方式，极易产生广谱耐药性。目前氟喹诺酮类药物是唯一有效的口服治疗药物[3]。在氟喹诺酮类药物中，环丙沙星和左氧氟沙星是应用最为广泛的治疗绿脓杆菌感染的药物。氟喹诺酮类药物是通过抑制两类重要的酶活性，DNA螺旋酶（DNAgyrase）和拓扑异构酶IV（topoisomeraseIV）来实现细菌的增殖作用的，而这两类酶均是DNA复制过程中的关键酶。基因分析发现，这两个酶是有异四聚体机构蛋白，由两个亚单位构成。这两个亚单位又分别由四个基因编码，分别是gyrA，gyrB，parC和parE[4]。其中...
【技术保护点】
1.一种焦磷酸测序法检测绿脓杆菌gyrA基因和parC基因多态性的引物对，其特征在于，所述引物对包括：（1）扩增引物gyrA上游引物：5`‑CGCCGTGTGCTTTATGC‑3`（SEQ ID 1）gyrA下游引物：5`‑CAGCAGTTCGTGGGCAGC‑3`（SEQ ID 2）parC上游引物：5`‑GTGCAGCGACGCATCGTCTACG‑3`（SEQ ID 3）parC下游引物：5`‑AAGGACTTGGGATCGTCC‑3`（SEQ ID 4）其中，两组引物的下游引物（SEQ ID 2和SEQ ID4）均进行生物素标记；（2）测序引物gyrA基因测序引物5...
【技术特征摘要】
1.一种焦磷酸测序法检测绿脓杆菌gyrA基因和parC基因多态性的引物对，其特征在于，所述引物对包括：（1）扩增引物gyrA上游引物：5`-CGCCGTGTGCTTTATGC-3`（SEQID1）gyrA下游引物：5`-CAGCAGTTCGTGGGCAGC-3`（SEQID2）parC上游引物：5`-GTGCAGCGACGCATCGTCTACG-3`（SEQID3）parC下游引物：5`-AAGGACTTGGGATCGTCC-3`（SEQID4）其中，两组引物的下游引物（SEQID2和SEQID4）均进行生物素标记；（2）测序引物gyrA基因测序引物5`-CATGCGCACGATGGTGT-3`（SEQID5）parC基因测序引物5`-CATGGCCTCGTAGCAGG-3`（SEQID6）。2.一种焦磷酸测序法检测绿脓杆菌gyrA基因和pa...
【专利技术属性】
技术研发人员：彭夫望，吕明，张海倩，
申请(专利权)人：河南昂睿生物科技有限公司，
类型：发明
国别省市：河南,41
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