用于口腔癌前病变风险预测的微生物菌群及应用制造技术

本发明专利技术公开了用于口腔癌前病变风险预测的微生物群及应用，发明专利技术人基于测定的总计127个健康对照、124个口腔癌前病变粪便样本测序数据的分析，鉴别出其中的菌群分类标记物。基于本发明专利技术的微生物群，可以有效预测口腔癌前病变风险。基于本发明专利技术微生物群开发的诊断试剂，可以有效预测口腔癌前病变风险，检测过程无创，安全性高。同时因为菌群样本可以常温运输，大大提高了检测的方便性。

【技术实现步骤摘要】
用于口腔癌前病变风险预测的微生物菌群及应用
本专利技术涉及用于口腔癌前病变风险预测的微生物菌群及应用。
技术介绍
口腔癌是最常见的头颈部恶性肿瘤，近年来，口腔癌的发病率在许多国家有上升趋势。口腔癌可由口腔白斑等口腔癌前病变发展而来，口腔癌前病变是一种是以口腔黏膜下纤维化及口腔扁平苔藓等口腔黏膜改变为特点的癌前病变，癌前病变有很大癌变的可能性，因为缺少早期筛查及检测的肿瘤生物标记物，50％以上的口腔癌患者在晚期阶段才能得到确诊，发现可用于口腔癌早期诊断的肿瘤标志物正成为研究热点。江锦岗,严振球.口腔癌前病变标志物的研究现状[J].临床军医杂志,2006,34(2):224-227.中指出研究口腔癌前病变的标志物对口腔肿瘤的化学预防具有重要意义，但目前还没有单一的指标能获得满意效果，人们还在不断寻找既和癌症发生有密切关系，又在癌变早期出现的特异性强、灵敏度高的生物指标作为癌变生物标志物。目前研究和应用的指标有：(1)与细胞增殖相关的标志物，如增殖细胞核抗原、核仁组成区嗜银蛋白、Ki67/Mib-1、端粒酶等。(2)与细胞凋亡相关的标志物，如Bcl-2/Bax，Survivin，环氧化物酶2。(3)特异性基因，如p53基因及其表达产物。(4)染色体畸变，如微卫星标志及杂合性缺失、DNA含量等。于雪迪,孙红英.代谢组学在口腔癌及口腔癌前病变标志物研究中的应用[J].口腔医学,2017,37(04):369-372.中指出基于代谢组学技术的分析方法具有发现肿瘤相关标志物的潜能，越来越多的用于重大疾病的风险预评估及早期诊断等方面的研究。近年来国内外许多学者应用代谢组学技术探索口腔癌及口腔癌前疾病的异常代谢改变，对患者的唾液、血液、尿液、组织等的代谢产物进行了研究，以期找到疾病相关生物标志物，为临床早期诊断及治疗提供客观证据。但是，基于组学技术的代谢物研究仍然存在问题，每种实验样本，每种分析技术都有相应的局限性。目前的研究主要集中在癌症领域，口腔癌前病变领域研究还不够深入，口腔癌前病变发展至口腔癌这一过程的代谢改变研究甚少。此外，口腔癌及癌前病变的发生发展是多事件共同作用的结果，仅依靠单一层面的代谢物研究并不足以进行全面的分析。大量研究已经得到与疾病生理病理变化相关的潜在标志物，但各标志物之间关联性不强。而且目前寻找新的肿瘤相关标志物的研究较多，很少有相关的临床验证报道。这些问题还需要我们注重运用整合思想，进行进一步的研究及验证。MagerDL,HaffajeeAD,DevlinPM,etal.Thesalivarymicrobiotaasadiagnosticindicatoroforalcancer:adescriptive,non-randomizedstudyofcancer-freeandoralsquamouscellcarcinomasubjects[J].Journaloftranslationalmedicine,2005,3(1):27.中采用DNA杂交技术检测了口腔癌患者唾液中40种常见细菌，发现牙龈卟啉单胞菌、产黑色素普氏菌和轻链球菌水平显著上调，对口腔癌的早期筛查有一定帮助。现有技术并未明确如何通过微生物菌群的情况来预测口腔癌前病变风险。
技术实现思路
本专利技术的目的在于克服现有技术的不足，提供一组可以高效预测口腔癌前病变风险的微生物群。本专利技术的另一个目的在于提供定量微生物群丰度的试剂在制备口腔癌前病变风险预测试剂中的应用。本专利技术所采取的技术方案是：一种用于口腔癌前病变风险预测的微生物菌群，包括健康人富集菌群和口腔癌前病变病人富集菌群，健康人富集菌群至少含有：p__Firmicutes|c__Bacilli|o__Lactobacillales、f__Prevotellaceae|g__Prevotella|s__nanceiensis、f__Veillonellaceae|g__Megasphaera、c__TM7-3|o__CW040、o__Clostridiales|f__Peptostreptococcaceae、o__Rickettsiales|f__mitochondria、f__Tissierellaceae|g__WAL_1855D、f__Staphylococcaceae|g__Staphylococcus、f__Tissierellaceae|g__ph2、o__Campylobacterales|f__Helicobacteraceae、g__Paenibacillus|s__lautus；口腔癌前病变病人富集菌群至少含有：f__Micrococcaceae|g__Rothia|s__dentocariosa、f__Enterococcaceae|g__Vagococcus、f__Porphyromonadaceae|g__Paludibacter、f__Flavobacteriaceae|g__Capnocytophaga|s__ochracea、f__Prevotellaceae|g__Prevotella|s__stercorea、f__Halomonadaceae|g__Halomonas、c__Bacilli|o__Gemellales、f__Veillonellaceae|g__Acidaminococcus、f__Bacteroidaceae|g__Bacteroides|s__coprophilus、o__Aeromonadales|f__Aeromonadaceae、f__Clostridiaceae|g__Clostridium、f__Micrococcaceae|g__Micrococcus、f__Erysipelotrichaceae|g__Bulleidia|s__moorei、f__Helicobacteraceae|g__Helicobacter|s__pylori、f__Erysipelotrichaceae|g__Holdemania、f__Enterobacteriaceae|g__Serratia、c__Clostridia|o__SHA-98、f__Pasteurellaceae|g__Actinobacillus、f__Pseudomonadaceae|g__Azomonas、g__Ruminococcus|s__torques、o__Oceanospirillales|f__Halomonadaceae、f__Erysipelotrichaceae|g__Coprobacillus。作为上述微生物群的进一步改进，口腔癌前病变风险通过菌群丰度计算得到，计算公式如下：式中，Ij为风险指数，Aij是样品j中菌种i的相对丰度，N是所在选择在健康人菌群中富集菌群的子集，M是与口腔癌前病变相关富集菌群的子集，|N|与|M|分别是第一子集与第二子集所述菌种的个数。一种用于口腔癌前病变风险预测的试剂盒，其含有定量上述微生物群的试剂。作为上述试剂盒的进一步改进，口腔癌前病变风险通过菌群丰度计算得到，计算公式如下：式中，Ij为风险指数，Aij是样品j中菌种i的相对丰度，N是所在选择在健康人菌群中富集菌群的子集，M是与口腔癌前病变相关富集菌群本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种用于口腔癌前病变风险预测的微生物菌群，包括健康人富集菌群和口腔癌前病变病人富集菌群，其特征在于：健康人富集菌群至少含有：p__Firmicutes|c__Bacilli|o__Lactobacillales、f__Prevotellaceae|g__Prevotella|s__nanceiensis、f__Veillonellaceae|g__Megasphaera、c__TM7‑3|o__CW040、o__Clostridiales|f__Peptostreptococcaceae、o__Rickettsiales|f__mitochondria、f__Tissierellaceae|g__WAL_1855D、f__Staphylococcaceae|g__Staphylococcus、f__Tissierellaceae|g__ph2、o__Campylobacterales|f__Helicobacteraceae、g__Paenibacillus|s__lautus；口腔癌前病变病人富集菌群至少含有：f__Micrococcaceae|g__Rothia|s__dentocariosa、f__Enterococcaceae|g__Vagococcus、f__Porphyromonadaceae|g__Paludibacter、f__Flavobacteriaceae|g__Capnocytophaga|s__ochracea、f__Prevotellaceae|g__Prevotella|s__stercorea、f__Halomonadaceae|g__Halomonas、c__Bacilli|o__Gemellales、f__Veillonellaceae|g__Acidaminococcus、f__Bacteroidaceae|g__Bacteroides|s__coprophilus、o__Aeromonadales|f__Aeromonadaceae、f__Clostridiaceae|g__Clostridium、f__Micrococcaceae|g__Micrococcus、f__Erysipelotrichaceae|g__Bulleidia|s__moorei、f__Helicobacteraceae|g__Helicobacter|s__pylori、f__Erysipelotrichaceae|g__Holdemania、f__Enterobacteriaceae|g__Serratia、c__Clostridia|o__SHA‑98、f__Pasteurellaceae|g__Actinobacillus、f__Pseudomonadaceae|g__Azomonas、g__Ruminococcus|s__torques、o__Oceanospirillales|f__Halomonadaceae、f__Erysipelotrichaceae|g__Coprobacillus。...

【技术特征摘要】
1.一种用于口腔癌前病变风险预测的微生物菌群，包括健康人富集菌群和口腔癌前病变病人富集菌群，其特征在于：健康人富集菌群至少含有：p__Firmicutes|c__Bacilli|o__Lactobacillales、f__Prevotellaceae|g__Prevotella|s__nanceiensis、f__Veillonellaceae|g__Megasphaera、c__TM7-3|o__CW040、o__Clostridiales|f__Peptostreptococcaceae、o__Rickettsiales|f__mitochondria、f__Tissierellaceae|g__WAL_1855D、f__Staphylococcaceae|g__Staphylococcus、f__Tissierellaceae|g__ph2、o__Campylobacterales|f__Helicobacteraceae、g__Paenibacillus|s__lautus；口腔癌前病变病人富集菌群至少含有：f__Micrococcaceae|g__Rothia|s__dentocariosa、f__Enterococcaceae|g__Vagococcus、f__Porphyromonadaceae|g__Paludibacter、f__Flavobacteriaceae|g__Capnocytophaga|s__ochracea、f__Prevotellaceae|g__Prevotella|s__stercorea、f__Halomonadaceae|g__Halomonas、c__Bacilli|o__Gemellales、f__Veillonellaceae|g__Acidaminococcus、f__Bacteroidaceae|g__Bacteroides|s__coprophilus、o__Aeromonadales|f__Aeromonadaceae、f__Clostridiaceae|g__Clostridium、f__Micrococcaceae|g__Micrococcus、f__Erysipelotrichaceae|g__Bulleidia|s__...

【专利技术属性】
技术研发人员：宋卓，卢秦，孙海鹏，
申请(专利权)人：人和未来生物科技长沙有限公司，
类型：发明
国别省市：湖南,43