The invention discloses a composite detection system and detection method of genomic simplification and two generation sequencing SNP, which includes the following steps: adding a substrate to the formed amplification product, which can synthesize the first base, remove all free bases, select the PTP plate when sequencing, and contain 1 million 600 thousand optical fibers on the PTP flat surface. In the hole, a variety of enzymes and substrates needed for chemiluminescence reaction are contained in the optical fiber hole, then the bases are circulated in order of T, A, C, and G into PTP plate in order. If base pairs occur, pyrophosphoric acid will be released and pyrophosphoric acid forms oxidizing fluorescein under the action of enzyme, and the high sensitivity C is used in real time. CD is captured, the base is paired with the PTP plate, and then the light signal of a molecule is captured, thus the corresponding sequence can accurately and quickly determine the base sequence of the template to be tested. The invention can accurately sequence the genome.
【技术实现步骤摘要】
一种基因组简化与二代测序SNP复合检测体系和检测方法
本专利技术涉及基因组测序
,尤其涉及一种基因组简化与二代测序SNP复合检测体系和检测方法。
技术介绍
DNA测序作为一种重要的实验技术,在生物学研究中有着广泛的应用。早在DNA双螺旋结构(WatsonandCrick,1953)被发现后不久就有人报道过DNA测序技术,但是当时的操作流程复杂,没能形成规模。Sanger法因为既简便又快速,并经过后续的不断改良,成为了迄今为止DNA测序的主流。然而随着科学的发展,传统的Sanger测序已经不能完全满足研究的需要,对模式生物进行基因组重测序以及对一些非模式生物的基因组测序,都需要费用更低、通量更高、速度更快的测序技术,第二代测序技术(Next-generationsequencing)应运而生。这三个技术平台各有优点,454FLX的测序片段比较长,高质量的读长(read)能达到400bp;Solexa测序性价比最高,不仅机器的售价比其他两种低,而且运行成本也低,在数据量相同的情况下,成本只有454测序的1/10;SOLID测序的准确度高,原始碱基数据的准确度大于 ...
【技术保护点】
一种基因组简化与二代测序SNP复合检测体系和检测方法,其特征在于,包括以下步骤:S1:选取目标DNA,并利用内切酶对目标DNA进行酶切,以便获得目标DNA片段,完成后,将其置于零下10‑零下2摄氏度的无菌储存箱内,备用;S2:再次选取DNA模板,并在DNA模板表面涂抹DNA模板制备液,且DNA模板制备液需均匀涂抹,以保证反应的准确度;S3:向S1中处理的目标DNA片段内添加DNA修复酶,并在15‑25摄氏度的环境下,能够将目标DNA片段末端进行修复,然后再次向其中添加碱基,并将其储存3‑6h,然后备用;S4:将S3中储存后的目标DNA片段取出,并在放置在15‑25摄氏度的反 ...
【技术特征摘要】
1.一种基因组简化与二代测序SNP复合检测体系和检测方法,其特征在于,包括以下步骤:S1:选取目标DNA,并利用内切酶对目标DNA进行酶切,以便获得目标DNA片段,完成后,将其置于零下10-零下2摄氏度的无菌储存箱内,备用;S2:再次选取DNA模板,并在DNA模板表面涂抹DNA模板制备液,且DNA模板制备液需均匀涂抹,以保证反应的准确度;S3:向S1中处理的目标DNA片段内添加DNA修复酶,并在15-25摄氏度的环境下,能够将目标DNA片段末端进行修复,然后再次向其中添加碱基,并将其储存3-6h,然后备用;S4:将S3中储存后的目标DNA片段取出,并在放置在15-25摄氏度的反应器皿内,并将目标DNA片段分别与甲基化引物相连接,从而获取的连接产物;S5:将S4中产生的连接产物置于S2中的DNA模板内,并将目标DNA片段结合到扩增引物表面,然后将目标DNA片段进行扩增,从而能够形成扩增产物;S6:将形成的扩增产物内添加底物,从而能够合成第一个碱基,并清除所有游离的碱基,在测序时,选取PTP平板,且PTP平板表面含有160万个光纤孔,光纤孔内载有化学发光反应所需的各种酶以及底物,然后将碱基依照T、A、C、G的顺序依次循环进入PTP平板,假如发生碱基配对,会释放焦磷酸,焦磷酸在酶的作用下,形成氧化荧光素,同时释放光信号,以获取信号;S7:将S6中释放的光信号,实时利用高灵敏度CCD捕获,...
【专利技术属性】
技术研发人员:李泽卿,
申请(专利权)人:武汉爱基百客生物科技有限公司,
类型:发明
国别省市:湖北,42
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