桑树黑斑病病原菌的核糖体RNA序列及其应用制造技术

本发明专利技术首次公开了一种桑树黑斑病病原菌

Ribosomal RNA sequences of pathogenic bacteria and its application in mulberry leaf spot

For the first time, the invention discloses a mulberry leaf spot pathogen

【技术实现步骤摘要】
桑树黑斑病病原菌的核糖体RNA序列及其应用
本专利技术属于生物
，特别涉及一种桑树黑斑病病原Pseudocercosporamori的核糖体RNA序列及其应用。
技术介绍
现有的真菌研究方法中，常常通过核糖体DNA(ribosomeDNA,rDNA)序列进行测序比对用于真菌的鉴定。核糖体在细胞中具有重要功能，rDNA编码的基因许多都与蛋白质合成的反应过程密切相关，在蛋白质的生物合成中起决定作用。rDNA序列分为转录区和非转录区，转录区由编码核糖体5.8S、18S、28S蛋白结构的基因和基因间的2个转录间隔区(InternalTranscribedSpacer,ITS)ITS1、和ITS2组成，共同组成一个转录单位。rDNA中编码5.8S、18S、28S的rDNA序列较为保守，可以用于分析自然界物种分类的科间或更高级阶元间的血系研究的分子标记。由于5.8SrDNA序列短、且高度保守，难以用于真菌的系统发育和分子鉴定；而18SrDNA的片段较长，片段中存在保守区和可变区，因此，现有研究中，通过选择不同的特异性扩增引物将某一结构域片段扩增后，经过测序以及对测序结果的分析比对，可用于真本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种桑树黑斑病病原菌

【技术特征摘要】
1.一种桑树黑斑病病原菌Pseudocercosporamori核糖体RNA，其特征在于，所述核糖体RNA的全长cDNA序列如SEQ.ID.NO1所示。2.根据权利要求1所述桑树黑斑病病原菌Pseudocercosporamori核糖体RNA，其特征在于，所述核糖体RNA由18SrRNA、ITS1、5.8SrRNA、ITS2、28SrRNA组成；所述18SrRNA的cDNA序列为SEQ.ID.NO1所示序列中第1～1726碱基序列所示；所示ITS1的cDNA序列为SEQ.ID.NO1所示序列中第1727～1876，所述5.8SrRNA的cDNA序列为SEQ.ID.NO1所示序列中第1877～2034，所述ITS2的cDNA序列为SEQ.ID.NO1所示序列中第2035～2183，所述28SrRNA的cDNA序列为SEQ.ID.NO1所示序列中第2184～5469。3.根据权利要求1所述桑树黑斑病病原菌Pseudocercosporamori核糖体RNA，其特征在于，所述核糖体RNA的全长cDNA序列中包含2对引物序列，所述引物序列分别如SEQ.ID.NO2～SEQ.ID.NO5所示。4.根据权利要求1或2所述桑树黑斑病病原菌Pseudocercosporamori的核糖体RNA序列在定量检测桑树黑斑病病原菌Pseudocercosporamori的应用。5.根据权利要求4所述的应用，其特征在于，所述应用的方法包括以下步骤：S1.收集桑树病叶；S2.提取桑树病叶的总DNA；S3.IlluminaDNA文库构建；S4.Illumina高通量测序；S5.去除测序数据中桑树基因组序列；S6.组装微生物基因组序列；S7.组装完整核糖体DNA序列S8.对比分析核糖体DNA序列；步骤S3所述IlluminaDNA文库构建的方法为：依照Illumina文库构建流程，将所述步骤S2中所述总DNA构建为片段大小500bp的双末端高通量测序文库；步骤S9所述对对比分析核糖体DNA序...

【专利技术属性】
技术研发人员：刘吉平，刘希，
申请(专利权)人：华南农业大学，
类型：发明
国别省市：广东,44