用于检测肝肿瘤良恶性的基因标志物、试剂盒及检测方法技术

本发明专利技术涉及用于检测肝肿瘤良恶性的基因标志物、试剂盒及检测方法。基因标志物包括一个或两个以上以下基因：FAT非典型钙粘蛋白1、雌激素相关受体γ、性别决定基因y染色体区域盒家族成员9、纤毛状络合物子单元1、1号染色体开放阅读框125抗体、络丝蛋白、转铁蛋白、TNF受体超家族成员、胰腺和十二指肠同圆框1、α‑酸性糖蛋白2；通过高通量测序检测肝肿瘤基因标志物中5‑羟甲基胞嘧啶的含量，从而判定肝肿瘤良恶性。本发明专利技术检测肝肿瘤良恶性具有安全无创、DNA来源广泛、准确性高、操作方便、用户体验好优点。本发明专利技术可与其他临床指标相结合，为肝肿瘤后续筛查、诊断、治疗与预后提供更准确的判断。

Gene markers, kits and detection methods for detecting benign and malignant liver tumors

The present invention relates to gene markers, kits and detection methods for detecting benign and malignant liver tumors. Genetic markers including one or more than two genes: FAT following the atypical cadherin 1, estrogen related receptor gamma, sex determining gene chromosome Y box family member 9, ciliated complex sub unit of chromosomes 1, 1 open reading frame 125 antibody, reelin, transferrin, TNF receptor superfamily, the duodenum and pancreas with box 1, alpha acid glycoprotein 2; the content of high-throughput sequencing to detect liver cancer genetic markers in 5 hydroxymethylcytosine, to determine Liver Benign and malignant tumors. The invention has the advantages of safety, non-invasive, wide DNA source, high accuracy, convenient operation and good user experience for detecting benign and malignant hepatic tumors. The present invention can be combined with other clinical indicators to provide more accurate judgment for subsequent screening, diagnosis, treatment and prognosis of liver tumors.

【技术实现步骤摘要】
用于检测肝肿瘤良恶性的基因标志物、试剂盒及检测方法
本专利技术涉及肝肿瘤良恶性的临床分子诊断
具体的，本专利技术涉及用于检测肝肿瘤良恶性的基因标志物、试剂盒及肝肿瘤良恶性的检测方法。
技术介绍
肿瘤分良性肿瘤和恶性肿瘤两大类。良性肿瘤生长缓慢，除在要害部位占位有影响外，一般对健康和生命没有危害。恶性肿瘤生长迅速，与人体争夺营养，产生有害代谢产物，破坏人体正常器官组织结构，对人体健康极为有害，如不及时进行有效治疗将会夺人生命。常见的肝良性肿瘤有肝细胞腺瘤、肝管细胞腺瘤、肾上腺残余瘤、血管瘤、错构瘤等。肝恶性肿瘤就是指肝细胞肝癌，即我们通常讲的肝癌。肝癌是最常见的全球恶性肿瘤之一。据世界卫生组织2008年统计，全球每年新发病748300例，死亡695900例，其中50%以上发生在中国。良性肿瘤与恶性肿瘤二者在细胞形态、组织结构、生长方式、增长速度和对人体影响等方面均有本质的不同，所以治疗方式上也不一样。把恶性肿瘤当作良性肿瘤治疗就会贻误病人。反之，若把良性肿瘤当作恶性肿瘤治疗，不仅造成病人精神上负担，而且由于采取许多不必要的治疗手段，致使病人遭受痛苦和损失。但某些良性肿瘤和恶性肿本文档来自技高网...

【技术保护点】
基因标志物用于检测肝肿瘤良恶性的用途，通过高通量测序检测肝肿瘤基因标志物中5‑羟甲基胞嘧啶的含量，从而判定肝肿瘤良恶性，包括一个或两个以上以下基因：FAT非典型钙粘蛋白1 (FAT1)、雌激素相关受体γ（ESRRG）、性别决定基因y染色体区域盒家族成员9（SOX9）、纤毛状络合物子单元1（EVC）、1号染色体开放阅读框125抗体（AXDND1）、络丝蛋白（RELN）、转铁蛋白（TF）、TNF受体超家族成员（TNFRSF11B）、胰腺和十二指肠同圆框1（PDX1）、α‑酸性糖蛋白2（ORM2）。

【技术特征摘要】
1.基因标志物用于检测肝肿瘤良恶性的用途，通过高通量测序检测肝肿瘤基因标志物中5-羟甲基胞嘧啶的含量，从而判定肝肿瘤良恶性，包括一个或两个以上以下基因：FAT非典型钙粘蛋白1(FAT1)、雌激素相关受体γ（ESRRG）、性别决定基因y染色体区域盒家族成员9（SOX9）、纤毛状络合物子单元1（EVC）、1号染色体开放阅读框125抗体（AXDND1）、络丝蛋白（RELN）、转铁蛋白（TF）、TNF受体超家族成员（TNFRSF11B）、胰腺和十二指肠同圆框1（PDX1）、α-酸性糖蛋白2（ORM2）。2.根据权利要求1所述的用途，其特征在于：所述基因标志物包括包括FAT1、ESRRG、SOX9、EVC、AXDND1、RELN、TF、TNFRSF11B、PDX1和ORM2。3.一种用于检测肝肿瘤良恶性的方法，包括以下步骤：a）测定良性肝肿瘤样品和肝癌受试者样品中权利要求1和2所述的基因标志物的5-羟甲基胞嘧啶的含量；b）用良性肝肿瘤样品中所述基因标志物的5-羟甲基胞嘧啶含量作为参照，将肝癌受试者样品中对应的基因标志物的5-羟甲基胞嘧啶含量标准化，良性肝肿瘤样品和肝癌受试者样品中同一基因标志物的5-羟甲基胞嘧啶含量分别为X和Y，则肝癌受试者样品中该基因标志物的标准化5-羟甲基胞嘧啶含量为Y/X；c）对步骤b）中经标准化的所述基因标志物的5-羟甲基胞嘧啶含量进行数学关联，并获得评分P；d）根据所述评分P大小得到肝肿瘤良恶性的检测结果。4.根据权利要求3所述的方法，其特征在于步骤a）包括如下步骤：将来自肝癌患者和良性肝肿瘤患者的DNA片段化；将所述片段化的DNA末端修复并末端补齐；将末端补齐的...

【专利技术属性】
技术研发人员：陆星宇，宋艳群，彭莱，张子谋，
申请(专利权)人：上海易毕恩生物技术有限公司，上海易毕恩基因科技有限公司，
类型：发明
国别省市：上海,31