【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】专利技术背景专利
本专利技术涉及新型的荧光染料，猝灭剂染料和由共轭到它们上的胂酸衍生的具有增强极性的小沟结合体。本专利技术还涉及在自动化合成条件下染色细胞、标记蛋白和制备与极性胂酸酯染料共轭的寡核苷酸探针的方法。相关技术描述多年来将染料-标记的合成寡核苷酸用作互补的DNA和RNA靶用序列-特异性探针。这些方法在法医学、分子生物学和医学诊断中具有广阔的应用，因为它们可以鉴定和定量具体的核酸靶。DNA探针的早期应用依赖于放射性标记(典型地，32P)，而近来的方法使用包括化学发光和荧光基团的报道分子。改进的装备仪器可以使这些光谱方法的灵敏度达到或超过放射标记的方法。量子产额高的荧光染料特别适宜于需要高灵敏检测试剂的生物应用。最近开发的检测方法采用荧光共振能量传递(FRET)处理，用于检测探针杂交，而不是直接检测荧光强度。这类分析中，在猝灭剂分子的吸收光谱与供体荧光团的发射光谱重叠并且两种分子十分靠近时，供体荧光团(报道分子)和受体分子(猝灭剂)之间发生FRET。供体荧光团的激发态能量由共振偶极子-诱导的偶极性相互作用传递给相邻的受体，这导致供体荧光的猝灭。供体和受体分子之间的能量传递效率高度取决于分子之间的距离。还知道其它荧光猝灭机理，例如碰撞和电荷转移猝灭。典型地，以这样的方式设计基于FRET的检测方法，该方式使得供体荧光团和受体分子十分靠近，从而供体荧光的猝灭是有效的。在分析的过程...
【技术保护点】
一种极性荧光染料，其包含被一个或多个胂酸酯基取代的荧光化合物，所述的荧光化合物具有在３４０ｎｍ和１１００ｎｍ之间的激发和在４４０和１１５０ｎｍ之间的荧光发射最大值。
【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】US 2005-3-9 60/661,2221.一种极性荧光染料，其包含被一个或多个胂酸酯基取代的荧光化合
物，所述的荧光化合物具有在340nm和1100nm之间的激发和在440和
1150nm之间的荧光发射最大值。
2.式(I)的化合物：
其中，
R1为氢，烷基，-CHO，-NO2，-CH2R11，-As(＝O)(OR6)(OR7)或
-As(OR6)2(OR7)2或-L-Rx；
R2为氢，-CN，烷基，芳烷基，卤代烷基或-CH2R11；
R3为氢，烷基，卤素，-As(＝O)(OR6)(OR7)或-As(OR6)2(OR7)2；
R4为-NR12R13，其中R12和R13相同或不同，并且独立地为H，烷基，
芳基，烷基羰基，芳基羰基或R12和R13一起形成杂环；
R5为氢，卤素，-As(＝O)(OR6)(OR7)或-As(OR6)2(OR7)2；
R6和R7相同或不同，并且独立地为H，烷基，芳基，或杂芳基；或
R6和R7连接在一起形成5或6-元杂环，所述的杂环包含砷和连接R6和R7的两个氧原子，其中-R6-R7-为-[C(R8)2]w-(w为2或3)，其中每个R8相同或不同，并且独立地为氢，羟基，氰基，-OC(O)-烷基，-OC(O)-芳基，
烷基，芳基，烷基羰基，芳基羰基，-CH2CN，-CH2SO2Me，-CH2SO2Ph，
或相邻碳原子上的两个R8与它们连接的碳原子一起形成芳基或杂芳基，
或同一碳上的两个R8形成氧代；
R11为-COOH，-As(＝O)(OR6)(OR7)或-As(OR6)2(OR7)2；
L为单共价键或具有1-30个选自C、N、O和S中的非氢原子的共价
键，并且由以下中的任何组合组成：单、双、三或芳族碳-碳键，碳-氮键，
氮-氮键，碳-氧键和碳-硫键；以及
Rx为活性基团，
条件是，R1，R3，R5和R11中的至少一个为-As(＝O)(OR6)(OR7)或
-As(OR6)2(OR7)2。
3.式(II)的化合物：
其中，
R15为氢，烷基，芳烷基，卤代烷基或-CN；
R16为-CH2As(＝O)(OR6)(OR7)或-CH2As(OR6)2(OR7)2；
R6和R7相同或不同，并且独立地为H，烷基，芳基，或杂芳基；或
R6和R7连接在一起形成5或6-元杂环，所述的杂环包含砷和连接R6和R7的两个氧原子，其中-R6-R7-为-[C(R8)2]w-(w为2或3)，其中每个R8相同或不同，并且独立地为氢，羟基，氰基，-OC(O)-烷基，-OC(O)-芳基，
烷基，芳基，烷基羰基，芳基羰基，-CH2CN，-CH2SO2Me，-CH2SO2Ph，
或相邻碳原子上的两个R8与它们连接的碳原子一起形成芳基或杂芳基，
或同一碳上的两个R8形成氧代；
R17和R18相同或不同，并且独立地为氢，烷基或卤代烷基；
R19为氢，任选被羟基、卤素、-COOH或-SO2OH取代的烷基，任选被
羟基、卤素、-COOH或-SO2OH取代的芳基，或-L-Rx；
L为单共价键或具有1-30个选自C、N、O和S中的非氢原子的共价
键，并且由以下中的任何组合组成：单、双、三或芳族碳-碳键，碳-氮键，
氮-氮键，碳-氧键和碳-硫键；以及
Rx为活性基团。
4.式(III)的化合物：
其中，
m为1、2、3、4或5；
R24和R25相同或不同，并且独立地为氢，烷基，卤素，-As(＝O)(OR6)(OR7)
或-As(OR6)2(OR7)2；
R26、R27、R28和R29相同或不同，并且独立地为氢，烷基或任选被
-As(＝O)(OR6)(OR7)或-As(OR6)2(OR7)2取代的芳基；
R31和R32相同或不同，并且独立地为氢，烷基，卤素，-As(＝O)(OR6)(OR7)
或-As(OR6)2(OR7)2；
每个R30独立地为氢，-C(O)R33，卤素，烷基，芳烷基，芳基，烷硫基，
烷基羰基，芳基羰基，-SO2R33，-As(＝O)(OR6)(OR7)，-As(OR6)2(OR7)2或
-L-Rx；
R33为羟基，-NH(CH2)jSO3R34，-NH(CH2)jAs(＝O)(OR34)2，
-NH(CH2)jCOOR34，-NH(CH2)jOR34或-NH(CH2)jN(R34)2(j为2-6之间的整
数)；
每个R34相同或不同，并且独立地为氢，烷基，芳基或杂芳基；
R24和R28可以任选形成5或6-元杂环；
R25和R29可以任选形成5或6-元杂环；
R26和R28可以任选形成任选被-As(＝O)(OR6)(OR7)或-As(OR6)2(OR7)2取代的5-9元杂环；
R27和R29可以任选形成任选被-As(＝O)(OR6)(OR7)或-As(OR6)2(OR7)2取代的5-9元杂环；
R26和R31可以任选形成任选被氢，烷基，-CH2As(＝O)(OR6)(OR7)或
-CH2As(OR6)2(OR7)2取代的5或6-元杂环；
R27和R32可以任选形成任选被氢，烷基，-CH2As(＝O)(OR6)(OR7)或
-CH2As(OR6)2(OR7)2取代的5或6-元杂环；
R6和R7相同或不同，并且独立地为H，烷基，芳基，或杂芳基；或
R6和R7连接在一起形成5或6-元杂环，所述的杂环包含砷和连接R6和R7的两个氧原子，其中-R6-R7-为-[C(R8)2]w-(w为2或3)，其中每个R8相同或不同，并且独立地为氢，羟基，氰基，-OC(O)-烷基，-OC(O)-芳基，
烷基，芳基，烷基羰基，芳基羰基，-CH2CN，-CH2SO2Me，-CH2SO2Ph，
或相邻碳原子上的两个R8与它们连接的碳原子一起形成芳基或杂芳基，
或同一碳上的两个R8形成氧代；以及
L为单共价键或具有1-30个选自C、N、O和S中的非氢原子的共价
键，并且由以下中的任何组合组成：单、双、三或芳族碳-碳键，碳-氮键，
氮-氮键，碳-氧键和碳-硫键；以及
Rx为活性基团，
条件是，R24、R25、R26、R27、R28、R29、R30、R31、R32和R33中的至
少一个为或包含-As(＝O)(OR6)(OR7)或-As(OR6)2(OR7)2。
5.式(IV)的化合物：
其中，
每个R35相同或不同，并且独立地为氢，卤素，-NO2，-CN，-SO3-，
烷氧基，胺，二烷基胺，单烷基胺，-N＝N-R39，-As(＝O)(OR6)(OR7)或
-As(OR6)2(OR7)2；
n为1、2或3；
p为1或2；
每个R36相同或不同，并且独立地为氢，卤素，-NO2，-CN，-SO3-，
烷氧基，胺，二烷基胺，单烷基胺，-N＝N-R39，-As(＝O)(OR6)(OR7)或
-As(OR6)2(OR7)2；
R6和R7相同或不同，并且独立地为H，烷基，芳基，或杂芳基；或
R6和R7连接在一起形成5或6-元杂环，所述的杂环包含砷和连接R6和R7的两个氧原子，其中-R6-R7-为-[C(R8)2]w-(w为2或3)，其中每个R8相同或不同，并且独立地为氢，羟基，氰基，-OC(O)-烷基，-OC(O)-芳基，
烷基，芳基，烷基羰基，芳基羰基，-CH2CN，-CH2SO2Me，-CH2SO2Ph，
或相邻碳原子上的两个R8与它们连接的碳原子一起形成芳基或杂芳基，
或同一碳上的两个R8形成氧代；
R37和R38相同或不同，并且独立地为氢，烷基，芳烷基，芳基或-L-Rx；
R39为任选被一个或多个-As(＝O)(OR6)(OR7)或-As(OR6)2(OR7)2取代的
芳基或杂芳基；
L为单共价键或具有1-30个选自C、N、O和S中的非氢原子的共价
键，并且由以下中的任何组合组成：单、双、三或芳族碳-碳键，碳-氮键，
氮-氮键，碳-氧键和碳-硫键；以及
Rx为活性基团，
条件是，R35和R36中的至少一个为-As(＝O)(OR6)(OR7)或
-As(OR6)2(OR7)2。
6.式(V)的化合物：
其中，
v为0、1、2、3、4、5或6；
Y表示形成每个环中具有6个原子的一个或两个稠合芳族环所需要的
原子，每个环原子相同或不同，并且独立地为＝CR46-，＝N+R47-或＝N-；
W表示形成每个环中具有6个原子的一个或两个稠合芳族环所需要的
原子，每个环原子相同或不同，并且独立地为＝CR46-，＝N+R47-或＝N-；
Z为-O-，-S-，-Se-，-C(R48)2或-NR49-；
R20和R23相同或不同，并且独立地为烷基，芳烷基或被以下基团取代
的取代烷基：羟基、氰基、硝基、氨基、磺酰基、磷酰基、-As(＝O)(OR6)(OR7)、
-As(OR6)2(OR7)2、-COOH、烷氧基、单烷基氨基、二烷基氨基或三烷基铵，
或L-Rx；
R52和R53相同或不同，并且独立地为氢，烷基，被以下基团取代的烷
基：羟基、-COOH、卤素、氰基、硝基、胺、烷基氨基、二烷基氨基、磺
酰基、磷酰基、-As(＝O)(OR6)(OR7)或As(OR6)2(OR7)2，或L-Rx；
R21和每个R22相同或不同，并且独立地为氢，卤素，烷氧基，羟基，
巯基，芳氧基，杂环，亚胺离子，L-Rx，或两个相邻的R21和R22或任何
两个相邻的R22形成4、5或6元碳环，任选被烷基，卤素或氧代取代；或
彼此相距一个碳的两个R22与它们连接的碳一起形成4、5或6元碳环，任
选被以下基团取代：烷基，卤素，烷硫基，芳硫基，烷氧基，芳氧基，氧
代(＝O)，＝S或＝C(R50)2；
每个R46和R47相同或不同，并且独立地为氢，烷基，芳基，卤素，氰
基，硝基，胺，烷基氨基，二烷基氨基，磺酰基，磷酰基，-As(＝O)(OR6)(OR7)，
As(OR6)2(OR7)2或L-Rx；
每个R48和R49相同或不同，并且独立地为氢或任选被以下基团取代的
烷基：羟基、-COOH、卤素、氰基、硝基、胺、烷基氨基、二烷基氨基、
磺酰基、磷酰基、-As(＝O)(OR6)(OR7)或-As(OR6)2(OR7)2，或L-Rx；
每个R50相同或不同，并且独立地为氢，烷基，氰基，-C(O)NHR48；
R6和R7相同或不同，并且独立地为H，烷基，芳基，或杂芳基；或
R6和R7连接在一起形成5或6-元杂环，所述的杂环包含砷和连接R6和R7的两个氧原子，其中-R6-R7-为-[C(R8)2]w-(w为2或3)，其中每个R8相同或不同，并且独立地为氢，羟基，氰基，-OC(O)-烷基，-OC(O)-芳基，
烷基，芳基，烷基羰基，芳基羰基，-CH2CN，-CH2SO2Me，-CH2SO2Ph，
或相邻碳原子上的两个R8与它们连接的碳原子一起形成芳基或杂芳基，
或同一碳上的两个R8形成氧代；
L为单共价键或具有1-30个选自C、N、O和S中的非氢原子的共价
键，并且由以下中的任何组合组成：单、双、三或芳族碳-碳键，碳-氮键，
氮-氮键，碳-氧键和碳-硫键；以及
Rx为活性基团，
条件是，R20，R23，R46，R47，R48，R49，R52和R53中的至少一个为
-As(＝O)(OR6)(OR7)或-As(OR6)2(OR7)2。
7.式(VI)的化合物：
其中，
y为1、2或3；
x为0、1、2或3；
每个R56相同或不同，并且独立地为氢，卤素，羟基，-As(＝O)(OR6)(OR7)
或-As(OR6)2(OR7)2；
R6和R7相同或不同，并且独立地为H，烷基，芳基，或杂芳基；或
R6和R7连接在一起形成5或6-元杂环，所述的杂环包含砷和连接R6和R7的两个氧原子，其中-R6...
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