测序对照制造技术
Sequencing comparison
This publication generally involves manual controls for genetic sequencing and quantitative assays, which can be used to calibrate extremely diverse genetic sequencing and quantification methods. For example, the sequencing control disclosed in this paper can be used to calibrate very high throughput sequencing methods (for example, those called next generation sequencing methods). This publication also involves sequencing control in a variety of applications (including calibration in a variety of sequencing methods).
【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】测序对照专利
本公开通常涉及可用于校准极其多种测序方法的测序对照(或“标准品”)。例如，本文公开的测序对照可用于校准极其多种高通量测序方法(例如，那些称为下一代测序方法的)。本公开还通常涉及在极其多种应用中(例如包括在多种测序方法的校准中)使用测序对照。专利技术背景下一代测序(NGS)技术(以如下公司提供的服务和产品为例：Illumina,Nanopore,PacBio,IonTorrent,Roche454Pyrosequencing(参见例如Bentley,D.R.etal.,2008；Clarke,J.etal.,2009；Ronaghi,M.etal.,1998；Eid,J.etal.,2009；Rothberg,J.M.etal.,2011)和其他)实现核酸分子的高通量、大规模平行测序。这些技术有能力确定单个样品中数百万个RNA和DNA分子的核苷酸碱基序列。此外，确定个别RNA或DNA序列的速率与样品中个别RNA或DNA序列的相对丰度成比例。因此，NGS也可用于确定样品中一个或多个核酸序列的量。NGS广泛用于测定核酸的序列和/或测量核酸的量，所述核酸...
【技术保护点】
包含人工多核苷酸序列的人工染色体，其中所述人工多核苷酸序列的任何片段与任何已知的天然存在的基因组序列是能区分的。
【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】2014.12.16 AU 2014905092;2015.09.24 AU 20159038921.包含人工多核苷酸序列的人工染色体，其中所述人工多核苷酸序列的任何片段与任何已知的天然存在的基因组序列是能区分的。2.权利要求1的人工染色体，其中所述人工多核苷酸序列的任何1,000个连续的核苷酸与相同长度的任何已知天然存在的基因组序列具有小于100％的序列同一性。3.权利要求1的人工染色体，其中所述人工多核苷酸序列的任何100个连续的核苷酸与相同长度的任何已知天然存在的基因组序列具有小于100％的序列同一性。4.权利要求1的人工染色体，其中所述人工多核苷酸序列的任何21个连续的核苷酸与相同长度的任何已知天然存在的基因组序列具有小于100％的序列同一性。5.前述权利要求中任一项的人工染色体，其中所述人工多核苷酸序列包含选自下组的天然存在的真核染色体的任何一个或多个特征：基因座、CpG岛、移动元件(mobileelements)、重复多核苷酸特征(repetitivepolynucleotidefeatures)、小规模遗传变异和大规模遗传变异。6.权利要求5的人工染色体，其中：i)所述人工多核苷酸序列包含多个基因座(multiplegeneloci)；ii)所述重复多核苷酸特征包含下列任何一个或多个：末端重复、串联重复、反向重复和散在重复(interspersedrepeats)；iii)所述基因座包含免疫受体基因座；iv)所述小规模遗传变异包含一个或多个SNP、一个或多个插入、一个或多个缺失、一个或多个微卫星和/或多个核苷酸多态性；和/或v)所述大规模遗传变异包含一个或多个缺失、一个或多个重复、一个或多个拷贝数变体、一个或多个插入、一个或多个倒位和/或一个或多个易位。7.权利要求1至4中任一项的人工染色体，其包含天然存在的原核染色体的一个或多个特征。8.前述权利要求中任一项的人工染色体的片段，其包含所述人工多核苷酸序列的20至10,000,000个连续的核苷酸。9.权利要求8的片段，其是RNA片段或DNA片段。10.人工多核苷酸序列，其包含连结的(conjoined)权利要求8的两个或更多个片段以形成连续的多核苷酸序列。11.权利要求10的人工多核苷酸序列，其是RNA或DNA多核苷酸序列。12.载体，其包含权利要求1至7中任一项的人工染色体的DNA片段，所述片段包含所述人工多核苷酸序列的20至10,000,000个连续的核苷酸。13.载体，其包含权利要求10的人...
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