用于癌症诊断的CDK6基因外显子基因群及诊断试剂盒制造技术

技术编号:14913151 阅读:176 留言:0更新日期:2017-03-30 02:50
本发明专利技术涉及一组用于癌症诊断的CDK6基因外显子基因群及其引用,以及一种基于所述CDK6基因外显子基因群的癌症诊断试剂盒。本发明专利技术发现了一种癌症新的分子诊断指标CDK6基因外显子扩增,提供了其在制备癌症诊断试剂盒中的应用,以及一种癌症诊断试剂盒,与传统的检测手段相比,分子标志物的诊断更及时、更特异,从而提高癌症患者的5年生存率,降低死亡率,应用前景广阔。

【技术实现步骤摘要】
(一)
本专利技术涉及一组用于癌症诊断的CDK6基因外显子基因群及其引用,以及一种基于所述CDK6基因外显子基因群的癌症诊断试剂盒。(二)
技术介绍
据世界卫生组织统计,目前癌症的死亡率已超过冠状动脉心脏病和脑卒中成为死亡率排名第一的慢性疾病,严重威胁人类健康。世界范围内,2012年全球新发癌症病例1410万,死亡820万,肺癌和乳腺癌分别位居男性和女性恶性肿瘤发病和死亡首位。癌症的发病机制依旧不明确,但与人口增长和老龄化、微生物感染、吸烟、饮食习惯、家族肿瘤史和环境污染等密切相关。我国恶性肿瘤发病率总体呈上升趋势,每年以3%-5%的速度递增。由于恶性肿瘤细胞具有容易侵袭和转移的特点,且临床就诊者多为中晚期患者,延误了早期治疗的最佳时机,导致治疗方法选择有限和治疗效果不理想。未经治疗的癌症患者五年生存率极低,约为0-14%,因此早期诊断、获得根治性切除是患者长期生存的唯一方式。癌症诊断方法包括光学和形态学的检查等,但是由于肿瘤的发生和转移是一个多步骤,涉及到多个基因的过程,即使同一个肿瘤中也存在不同特性的细胞,生长速率,免疫特性和侵袭转移性不同,因此癌症诊断的准确度和灵敏度不高。随着癌症的发病机制的研究越来越广泛,分子生物标记物在其中的重要性越来越明显。这些标记物已成为癌症诊断和治疗的重要靶点。Cyclin-DependentKinase6(CDK6)基因位于7q21-q22,具有丝氨酸/苏氨酸激酶活性,促进细胞周期由G1期向S期转变。CDK6基因核苷酸序列共231707bp。其中包含8个外显子,分别是:Exon1,1-150bp;Exon2,151-750bp;Exon3,751-886bp;Exon4,887-1054bp;Exon5,1055-1164bp;Exon6,1165-1215bp;Exon7,1216-1351bp;Exon81352-11717bp。基因扩增是指细胞内特定基因拷贝数特异性大量增加的现象,按扩增范围的不同进而分为全基因组扩增及特定基因簇的扩增,常见于生物发育及肿瘤发生等过程,是癌基因激活的主要机制。细胞内选择性复制DNA,从而产生大量的拷贝,最终可能导致基因产物的过表达,过表达程度随肿瘤类型的不同而存在差异。专利技术人在癌症患病人群中发现,与癌旁正常组织相比,癌组织中的CDK6基因的一个或多个外显子发生扩增,即外显子不同程度的扩增引起CDK6基因核苷酸序列的改变,进而导致表达产物增加,这将有助于恶性肿瘤的精确诊断。(三)
技术实现思路
本专利技术目的是提供一组用于癌症诊断的CDK6基因外显子基因群及其引用,以及一种基于所述CDK6基因外显子基因群的癌症诊断试剂盒。本专利技术采用的技术方案是:一组用于癌症诊断的CDK6基因外显子基因群,由以下基因序列组成:SEQIDNo.1所示的Exon1片段:gagtgtcagtcggctctccgcacgtgtccgcggcctcgcggagcaggtaatcagactctggggaaggagttaccagcactctctccggSEQIDNo.2所示的Exon2片段:cagaagctggatggagagacctccccgcggggctggcgtaaccctggtgccgccgccgcgaaactccgcctgcagagtcgccgccgccgccgccgccggaggagcgagccgatccctcctcttccctcctcgaagcgaagtcctcaacacSEQIDNo.3所示的Exon3片段:ctttatggtttcagtgggcactccaggctctggaactttatccaagtaagtggtcaagtcttgatcgacatgttcaaacactaaagttagtttggtttctctgtctgttcgtgacactgtgcacacSEQIDNo.4所示的Exon4片段:gccgaagtcagcgagttttatttgtccgctgctggtcaccagaatgttctgtggttttagatcgcgatgcactactcggtgtgaatgaagaaagtccagacctcggagaagctgaaacaSEQIDNo.5所示的Exon5-6片段:gtacagagcacccgaagtcttgctccagtccagctacgccacccccgtggatctctggagtgttggctgcatatttgcagaaatgtttcgtagaaagcctctttttcgtggaagttcagatgttgaSEQIDNo.6所示的Exon7片段:ggtctttgcctagttcatcgatatctgttacaaacttctcaattggttgggcagattttgaatgaaaagcctgcctgggaagggcaacatctctaggccagtcttcttctcctgSEQIDNo.7所示的Exon8片段:acaccaggtagaaggactgcattagagaacatatgtgaccctgttaggtttgcagaatcgaggccataaaccataagctgagactgcgaatttatgaaaggttcattgaaagcaagcaaacaggtggtgcatgggaacagcttaagcaatctgttattagttatacaatggtagcaatatatttcagaagtgccgggagaExon1完整序列如下:Exon2完整序列如下:Exon3完整序列如下:Exon4完整序列如下:Exon5完整序列如下:Exon6完整序列如下:gcctctttttcgtggaagttcagatgttgatcaactaggaaaaatcttggaExon7完整序列如下:Exon8完整序列如下:本专利技术还涉及所述的CDK6基因外显子基因群在制备癌症诊断试剂盒中的应用。具体的,所述应用为:以所述CDK6基因外显子基因群为基因诊断标记物,设计相应扩增引物,添加相应PCR扩增试剂组成癌症诊断试剂盒。本专利技术还涉及基于所述CDK6基因外显子基因群的癌症诊断试剂盒,主要包括PCR特异性扩增引物和PCR反应试剂,其特征在于所述PCR特异性扩增引物序列如下:Exon1:上游引物:5’-CCGGAGAGAGTGCTGGTAAC-3’;下游引物:5’-GAGTGTCAGTCGGCTCTCC-3’;Exon2:上游引物:5’-GTGTTGAGGACTTCGCTTCG-3’;下游引物:5’-CAGAAGCTGGATGGAGAGAC-3’;Exon3:上游引物:5’-GTGTGCACAGTGTCACGAAC-3’;下游引物:5’-CTTTATGGTTTCAGTGGGCAC-3’;Exon4:上游引物:5’-TGTTTCAGCTTCTCCGAGGT-3’;下游引物:5’-GCCGAAGTCAGCGAGTTTTA-3’Exon5-6:上游引物:5’-GTACAGAGCACCCGAAGTCT-3’;下游引物:5’-TCAACATCTGAACTTCCACGA-3’;Exon7:上游引物:5’-CAGGAGAAGAAGACTGGCCT-3’;下游引物:5’-GGTCTTTGCCTAGTTCATCGA-3’;Exon8:上游引物:5’-TCTCCCGGCACTTCTGAAAT本文档来自技高网
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【技术保护点】
一组用于癌症诊断的CDK6基因外显子基因群,由以下基因片段组成:SEQ ID No.1所示的Exon 1片段;SEQ ID No.2所示的Exon 2片段;SEQ ID No.3所示的Exon 3片段;SEQ ID No.4所示的Exon 4片段;SEQ ID No.5所示的Exon 5‑6片段;SEQ ID No.6所示的Exon 7片段;SEQ ID No.7所示的Exon 8片段。

【技术特征摘要】
1.一组用于癌症诊断的CDK6基因外显子基因群,由以下基因片段组成:SEQIDNo.1所示的Exon1片段;SEQIDNo.2所示的Exon2片段;SEQIDNo.3所示的Exon3片段;SEQIDNo.4所示的Exon4片段;SEQIDNo.5所示的Exon5-6片段;SEQIDNo.6所示的Exon7片段;SEQIDNo.7所示的Exon8片段。2.权利要求1所述的CDK6基因外显子基因群在制备癌症诊断试剂盒中的应用。3.如权利要求2所述的应用其特征在于,所述应用为:以所述CDK6基因外显子基因群为基因诊断标记物,设计相应扩增引物,添加相应PCR扩增试剂组成癌症诊断试剂盒。4.基于权利要求1所述CDK6基因外显子基因群的癌症诊断试剂盒,主要包括PCR特异性扩增引物和PCR反应试剂,其特征在于所述PCR特异性扩增引物序列如下:Exon1:上游引物:5’-CCGGAGAGAGTGCTGGTAAC-3’;下游引物:5’-GAGTGTCAGTCGGCTCTCC-3’;Exon2:上游引物:5’-GTGTTGAGGACTTCGCTTCG-3’;下游引物:5’-CAGAAGCTGGATGGAGAGAC-3’;Exon3:上游引物:5’-GTGTGCACAGTGTCACGAAC-3’;下游引物:5’-CTTTATGGTTTCAGTGGGCAC-3’;Exon4:上游引物:5’-TGTTTCAGCTTC...

【专利技术属性】
技术研发人员:安汉祥张云周丹汤玮玮
申请(专利权)人:厦门大学附属第一医院厦门稀土材料研究所
类型:发明
国别省市:福建;35

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