重组核酸片段RecCR010113及其检测方法技术

本申请提供了重组核酸片段及其检测方法。本申请还提供了含有重组核酸片段的水稻植株的选育方法，利用分子标记对重组植株进行前景选择和背景选择，获得了含有重组核酸片段的水稻植株。

【技术实现步骤摘要】

本申请涉及全基因组选择育种技术。具体而言，本申请涉及利用全基因组选择育种技术选育含有重组核酸片段的水稻植株，以及由此而获得的重组核酸片段及其检测方法。
技术介绍
长期以来，传统育种的选择方法主要依赖于田间表现型的评价，根据育种家个人经验进行取舍，其最大的缺点在于耗时长，效率较低。要提高选择的效率，最理想的方法应是能够直接对基因型进行选择。随着分子生物技术的发展，分子标记为实现对基因型的直接选择提供了可能。近年来，已开始应用分子标记辅助选择方法来改良个别目标性状，能够显著的缩短育种年限。稻瘟病是水稻最严重的病害之一，全球每年由稻瘟病引起的水稻产量损失占11％～30％，因此稻瘟病及其抗性的研究显得尤为重要。随着对稻瘟病研究的逐步深入，许多水稻抗稻瘟病基因DNA片段相继被定位和克隆。其中，水稻第6染色体的Pi2区间被定位和克隆了很多稻瘟病抗性基因，如Pi2、Piz-t、Pi9、Pigm、Pi50，该区间包含一个稻瘟病抗性基因的基因簇(Qu等，Genetics.2006,172:1901-1914；Wang等，Phytopathology.2012,102:779-786；Xiao等，Mo本文档来自技高网...

【技术保护点】
重组核酸片段，其选自：i)包含SEQ ID NO:1所示序列180‑377位核苷酸的序列或其片段或其变体或其互补序列；ii)包含SEQ ID NO:1所示序列的序列或其片段或其变体或其互补序列；iii)包含SEQ ID NO:2所示序列528‑774位核苷酸的序列或其片段或其变体或其互补序列；iv)包含SEQ ID NO:2所示序列的序列或其片段或其变体或其互补序列；以及以上片段的组合。

【技术特征摘要】
1.重组核酸片段，其选自：i)包含SEQIDNO:1所示序列180-377位核苷酸的序列或其片段或其变体或其互补序列；ii)包含SEQIDNO:1所示序列的序列或其片段或其变体或其互补序列；iii)包含SEQIDNO:2所示序列528-774位核苷酸的序列或其片段或其变体或其互补序列；iv)包含SEQIDNO:2所示序列的序列或其片段或其变体或其互补序列；以及以上片段的组合。2.检测权利要求1所述片段的引物，其中所述引物选自：(I)特异性识别SEQIDNO:1所示序列1-180位核苷酸的序列的正向引物和特异性识别SEQIDNO:1所示序列377-782位核苷酸的序列的反向引物；(II)以下第一组引物对与第二组引物对的组合，其包含(a)第一组引物对：特异性识别SEQIDNO:1所示序列第1-180位核苷酸的序列的正向引物和特异性识别SEQIDNO:1所示序列第181-376位核苷酸的序列的反向引物；和(b)第二组引物对：特异性识别SEQIDNO:1所示序列第181-376位核苷酸的序列的正向引物和特异性识别SEQIDNO:1所示序列第377-782位核苷酸的序列的反向引物；(III)特异性识别包含SEQIDNO:1所示序列第180-181位核苷酸的序列的正向引物和特异性识别包含SEQIDNO:1所示序列第376-377位核苷酸的序列的反向引物；(IV)特异性识别包含SEQIDNO:1所示序列第180-181位核苷酸的序列的正向引物和特异性识别SEQIDNO:1所示序列第377-782位核苷酸的序列的反向引物；(V)特异性识别SEQIDNO:1所示序列第1-180位核苷酸的序列的正向引物和特异性识别包含SEQIDNO:1所示序列第376-377位核苷酸的序列的反向引物；和/或任选地，(VI)特异性识别SEQIDNO:2所示序列1-528位核苷酸的序列的正向引物和特异性识别SEQIDNO:2所示序列774-1363位核苷酸的序列的反向引物；(VII)以下第三组引物对与第四组引物对的组合，其包含(c)第三组引物对：特异性识别SEQIDNO:2所示序列第1-528位核苷酸的序列的正向引物和特异性识别SEQIDNO:2所示序列第529-773位核苷酸的序列的反向引物；和(d)第四组引物对：特异性识别SEQIDNO:2所示序列第529-773位核苷酸的序列的正向引物和特异性识别SEQIDNO:2所示序列第774-1363位核苷酸的序列的反向引物；(VIII)特异性识别包含SEQIDNO:2所示序列第528-529位核苷酸的序列的正向引物和特异性识别包含SEQIDNO:2所示序列第773-774位核苷酸的序列的反向引物；(IX)特异性识别包含SEQIDNO:2所示序列第528-529位核苷酸的序列的正向引物和特异性识别SEQIDNO:2所示序列第774-1363位核苷酸的序列的反向引物；(X)特异性识别SEQIDNO:2所示序列第1-528位核苷酸的序列的正向引物和特异性识别包含SEQIDNO:2所示序列第773-774位核苷酸的序列的反向引物。3.检测权利要求1所述片段的引物，其中所述引物选自：(I)用于扩增和测序SEQIDNO:1所示序列的引物5’-CCAGCTTCTAGTTTGTTCCCTGTA-3’，5’-TGCTTAGTTAG...

【专利技术属性】
技术研发人员：周发松，喻辉辉，张学堂，邱树青，孔会利，雷昉，律文堂，姚玥，潘丽，李旭，李菁，韦懿，陈光，何予卿，李传国，田冰川，张启发，
申请(专利权)人：中国种子集团有限公司，
类型：发明
国别省市：北京;11