树鼩MHC-DRB1*1101基因序列及其应用制造技术

技术编号:13929216 阅读:122 留言:0更新日期:2016-10-28 12:25
本发明专利技术公开树鼩MHC‑DRB1*1101基因序列及其应用,其核苷酸基因序列如SEQ ID No.1所示;该树鼩MHC‑DRB1*1101基因序列应用于建立HCV模型,大大提高建立树鼩HCV模型的效率,并且减少资源的损失。结合已经建立成功的HCV树鼩模型,可能为该疾病的治疗找到一个新的靶点,为下一步开展HCV树鼩模型的治疗研究提供一个最基本资料,为开展的树鼩其它等位基因研究提供一个开始。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及生物
,具体涉及树鼩MHC-DRB1*1101基因序列及其应用
技术介绍
丙型肝炎病毒(hepatitis C virus,HCV)感染在中国和世界范围内已成为慢性肝炎、肝硬化和肝细胞癌的主要病因之一。目前全球约有1.7亿HCV感染者,中国有3700~4000万。HCV感染的主要危险因素是静脉注射吸毒和输血。每年新增病例约300~400万,其中80%的感染者会发展为慢性肝炎,30%进展为终末期肝病,包括肝硬化、肝癌等。HCV急性感染后可引起机体一系列固有及适应性免疫反应。15~25%的HCV感染可被宿主免疫反应所自限清除,而大多数则呈慢性持续性感染,发展为慢性活动性肝炎、肝硬化及肝细胞癌。HCV的高度变异性、泛嗜性、免疫耐受、免疫损伤等因素,是导致HCV感染慢性化的重要原因。虽然目前聚乙二醇干扰素和利巴韦林的联合应用明显提高了对慢性丙型肝炎患者的治疗效果,但仍有近50%的患者表现出持续性的病毒反应。这可能与不同个体的遗传学差异有关,此种差异可能是导致机体对HCV感染表现出不同的免疫反应的原因。近年来国内外有关宿主遗传基因与疾病关系的研究表明,人类白细胞抗原(human leucocyte antigen,HLA)在宿主免疫基因系统的免疫应答中起着举足轻重的作用,编码HLA抗原的主要组织相容性复合体(major histo⁃compatibility complex,MHC)是脊椎动物中一个与免疫相关的多基因家族,是生物体重要的免疫遗传系统,也是目前已知的多态性最丰富的一个基因系统,拥有极大数量的等位基因,赋予种群巨大潜力以适应多变的内外环境,其丰富的等位基因水平被认为是生物体识别外来寄生物(细菌、病毒、原生动物及其他寄生虫和噬菌体)能力的重要部分。目前关于HCV感染的宿主遗传背景研究主要有4个方面,即HCV清除、HCV易感性、HCV持续性、HCV进展至肝硬化。就目前而言,HCV感染的宿主遗传背景的研究主要集中在HCV的清除方面。已经有众多的研究结果表明HLA等位基因与HCV清除有关,虽然其它许多等位基因存在争议,但HLA-DQB1*0301、DRB1*1101和DRB1*1301是三个已为不同研究者在多个种族的研究中所证实的慢性丙型肝炎患者中有利于HCV清除的保护性基因位点,其可能的机制是DQB1*0301、DRB1*1101和DRB1*1301基因能有效地将HCV递呈给T淋巴效应细胞,激活或介导细胞免疫反应,从而发挥对HCV感染的保护作用。树鼩(tree shrews, Tupaia belangeri)是一类树栖的攀鼩目(Scandentia)树鼩科(Tupaiinae),外型酷似松鼠的小型哺乳动物,进化上接近灵长类,分布与菲律宾、印度和我国西南部地区,我国主要分布于云南、广西、海南等地。我国有2个种、6个亚种,云南省最丰富。昆明地区主要分布的是滇西亚种(Tupaia Belangeri Chinensis),由于树鼩其特殊的分类地位和体型小,经济易得,易驯养,繁殖能力强,方便实验操作、饲养成本低,新陈代谢等生理特征和解剖结构比犬、鼠等动物更接近于非人灵长类动物,以及存在诸多自发性疾病等特性,自上世纪80年代开始,就相继用于替代或减少一些非人灵长类动物的使用,用以作为某些人类重大疾病研究的动物模型,在医学实验中已被广泛应用。如丙型肝炎动物模型、乙型肝炎模型、手足口病模型、内分泌系统疾病等。近几年对树鼩开发利用已进入了一个新的发展时期,在建立HCV动物模型方面也取得了较好的进展,然而,目前对树鼩的群体遗传结构还知之甚少,特别是关于树鼩MHC方面研究的国内还没有报道,这极大地限制了其在疾病动物模型研究的应用,也是其品系资源创制的瓶颈。故有必要发掘和利用树鼩对HCV易感、抗病的基因,为开展人类HCV模型建立、药物筛选、安全性评价以及滇西亚种树鼩的遗传监测等提供科学依据。
技术实现思路
本专利技术目的在于提供树鼩MHC-DRB1*1101基因序列及其应用,为高效建立理想的HCV树鼩模型提供保障。本专利技术通过下列技术方案实现:树鼩MHC-DRB1*1101基因序列,其核苷酸基因序列如SEQ ID No.1所示。所述树鼩MHC-DRB1*1101基因序列,其引物序列为:引物序列上:5'-GTT TCT TGG AGT ACT CTA CGT C-3'引物序列下:5'-CTG CAC TGT GAA GCT CTC AC-3'。本专利技术的另一个目的在于提供所述树鼩MHC-DRB1*1101基因序列在HCV模型建立上的应用。本专利技术的核苷酸序列能用多种方法获得。例如,用本领域熟知的杂交技术分离核苷酸序列。这些技术包括但不局限于:(1)用探针与基因组或cDNA文库杂交以检出同源的核苷酸序列;和(2)表达文库的抗性筛选以检出具有共同结构特征的克隆的核苷酸序列片段。本专利技术具备的优点及效果:人HLA-DRB1*1101基因与HCV病毒清除感染有关,即携带HLA-DRB1*1101等位基因的人群不容易感染HCV病毒;而现在用树鼩建立HCV模型效率仍很低,一些树鼩不容易感染HCV病毒,鉴于此,发掘树鼩体内与HCV病毒清除有关的DRB1*1101基因,在建模之前对树鼩DRB1*1101基因进行检测,如果结果为阳性,则不用来感染HCV病毒,而筛选DRB1*1101基因呈阴性的树鼩来感染HCV,这样将会大大提高建立树鼩HCV模型的效率,并且减少资源的损失。另外,本专利技术提供基因序列是与HCV清除有关的有效基因,序列大小为267bp,在本物种是第一次被检测发现,本序列对这个群体的遗传背景提供了很重要的信息,为开展其他疾病动物模型研究提供一个最基本资料,并且为大量高效建立HCV动物模型提供最首要信息。另外HCV急性感染后可引起机体一系列固有及适应性免疫反应。15~25%的HCV感染可被宿主免疫反应所自限清除,而大多数则呈慢性持续性感染,发展为慢性活动性肝炎、肝硬化及肝细胞癌。其中被宿主自限清除的原因和机制迄今尚不完全清楚,特别DRB1*1101对HCV的清除的调控机制知之甚少,用现代分子遗传学,寻找这些疾病相关的具体基因或相关DNA序列,是病因学研究的切入点之一。本基因序列的发现就起到了这样一个作用。本专利技术提供的基因序列在人类已被明确证实是HCV有效清除的一个基因,即也是一个抗病的基因,以该基因入手,结合已经建立成功的HCV树鼩模型,可能为该疾病的治疗找到一个新的靶点,为下一步开展HCV树鼩模型的治疗研究提供一个最基本资料,为开展的树鼩其它等位基因研究提供一个开始。附图说明图1为本专利技术所得树鼩MHC-DRB1*1101基因序列与genebank中最相似的序列(AC234247.1)的比对图。具体实施方式下面结合附图和实施例对本专利技术作进一步详细说明,但本专利技术保护范围不局限于所述内容,实施例中使用的试剂和方法,如无特殊说明,均采用常规试剂和使用常规方法。实施例1实验动物:滇西亚种树鼩(Tupaia belangeri chinensis),由中国医学科学院医学生物学研究所树鼩种质资源中心提供。主要试剂:SanPrep柱式DNA提取试剂盒(购自生工生物工程有限公司);SanPrep柱式DNA胶回收试剂盒(购自生工生物工程有本文档来自技高网
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【技术保护点】
树鼩MHC‑DRB1*1101基因序列,其核苷酸基因序列如SEQ ID No.1所示。

【技术特征摘要】
1.树鼩MHC-DRB1*1101基因序列,其核苷酸基因序列如SEQ ID No.1所示。2.根据权利要求1所述的树鼩MHC-DRB1*1101基因序列,其特征在于:所述树鼩MHC-DRB1*1101基因序列的引物序列为:引物序列上:...

【专利技术属性】
技术研发人员:马开利黄璋琼鲁帅尧吴正存江勤芳高家红李云李聪杜廷福
申请(专利权)人:中国医学科学院医学生物学研究所
类型:发明
国别省市:云南;53

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