乙型肝炎病毒八种基因分型的荧光PCR试剂盒及检测方法技术

技术编号:12740556 阅读:116 留言:0更新日期:2016-01-21 02:13
本发明专利技术提供一种乙型肝炎病毒八种基因分型的荧光PCR试剂盒及检测方法,属于生物检验技术领域。采用的技术方案是:设计合成特异性针对乙型肝炎病毒八种基因亚型的引物和探针,并分别对探针进行荧光标记,运用荧光PCR方法进行特异性检测。本发明专利技术的有益效果为:(1)本品采用聚合酶链式反应(PCR)结合荧光探针技术,检测样品中A-H型乙型肝炎病毒分型,所设计的探针和引物特异性型及灵敏度高,准确性好。(2)成本经济,操作方法快速简便,适宜广泛推广应用。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于生物检验
,具体设及一种乙型肝炎病毒八种基因分型的巧光 PCR试剂盒及检测方法。
技术介绍
乙型病毒性肝炎是长期困扰全球医学界的难题,是急慢性肝炎、肝硬化、肝癌的重 要致病因子之一,也是全世界最严重的公共卫生问题之一。据WT0报告,全球60多亿人 口中,有大约30亿人口生活在乙型肝炎病毒(皿V)高流行地区,超过20亿人感染过皿V,其 中慢性感染者超过3.5亿。我国每年的乙肝发病率在6 000万人次W上,是一个乙型病 毒性肝炎发病大国。在中国、东南亚和非洲等国家和地区,有约50%的肝硬化和70 - 90% 的肝癌,是由慢性皿V感染引起,而感染了皿V变异体的皿V携带者有7 - 30%。[000引 目前根据基因序列的核巧酸差异将皿V分为A~Η8种基因型别,按照全基因序 列核巧酸差异> 8%或其S基因序列核巧酸差异> 4%的差异度判定为不同型别,同一基因 型满足序列差异《5. 6%。皿V基因型别存在较明显的地域性分布特点,A型在欧洲和中部非 洲多见巧型、C型主要分布于亚洲;D型分布区域最广,流行于地中海、中东等地区;E型W 非洲为主;G型仅见于美国和欧洲;F、Η型分布在美国。我国WB型和C型分布为主,为优 势型,且存在南北差异,北方WC型为优势型,南方WΒ型为优势型;D型多分布于如新疆、 西藏、宁夏等少数民族地区,偶有A、E、F型报道,尚未见G、H型。有研究表明,皿V存在不同 基因型别的混合感染。 目前乙型肝炎病毒基因分型的检测方法包括基因序列测定、聚合酶链反应-限制 性片段长度多态性分析(PCR-RFLP)、基因型特异性多引物对PCR分型(即巢式PCR法)、特 异性线性探针检测法(INNO-LiPA)INN〇-LiPA、PCR微板核酸分子杂交化ISA法、单克隆抗体 ELISA法W及基因忍片。但运些方法或多或少存在一些缺陷:如基因测序分型方法结果准 确可靠,但过程繁琐、费时、成本高、难W推广,不适合大样本的检测,且缺乏敏感性,不能发 现同一个体中两种或两种W上的皿V基因型的混合感染。PCR-RFLP对于单个核巧酸位点的 多态性所导致的限制性内切酶酶切位点改变有碍内切酶消化,酶切不完全会出现复杂的条 带,酶切图谱识别复杂,因而影响基因分型的可信度,且该法同样不能发现几种基因型的混 合感染。巢式PCR法方法需要合成多条引物,需经两轮PCR过程,较RFLP法历时长,污染机 会较大,且无法完全避免出现非特异性扩增条带而妨碍观察分型结果。INNO-LiPA存在价格 昂贵、特异性稍低的不足。单克隆抗体ELISA法不能对血清皿sAg阴性的皿V感染进行基 因分型,W及少数皿sAg无法分型。基因忍片存在成本较高、假阳性率高、不同忍片的集成 度不足等缺点,PCR微板核酸分子杂交化ISA法适用于自动化程度高较高的实验室。 对于分子实验室中大量样本的常规检测,急需准确度高、特异性好、价格经济、快 速的检测方法。
技术实现思路
为解决上述技术问题,本专利技术提供一种乙型肝炎病毒八种基因分型的巧光PCR试 剂盒及检测方法,通过设计合成特异性针对乙型肝炎病毒八种基因亚型的引物和探针,并 结合PCR检测方法的技术方案,实现了快速、准确测定乙型肝炎病毒分型,测定成本降低。 本专利技术采用的技术方案是:乙型肝炎病毒八种基因分型的巧光PCR试剂盒,其特 征在于,所述试剂盒中包括如下三.、至⑨中的至少一个PCR反应液体系: ① 针对乙型肝炎病毒A型基因型的PCR反应液体系,包括如下引物和探针 皿V-A-FACCTGGGTGGGTAATAATTTGGA 皿V-A-RGAAACCACAATAGTTGCCTGATCTT HBV-A-PAATTGACTACTAGATCCCTG ② 针对乙型肝炎病毒B型基因型的PCR反应液体系,包括如下引物和探针 HBV-B-FCTCGTGGTGGACTTCTCTCAATT 皿V-B-RATCCAGCGATAACCAGGACAAAT皿V-B-PCAAATCTCCAGTCACTCAC ③ 针对乙型肝炎病毒C型基因型的PCR反应液体系,包括如下引物和探针 皿V-C-FGAGCCAACTCAAACAATCCAGAT HBV-C-RGAATGCTCCCGCTCCTACCT HBV-C-PCCCCAACAAGGATC ④ 针对乙型肝炎病毒D型基因型的PCR反应液体系,包括如下引物和探针 皿V-D-FGGGAACTTTACTGGGCTTTATTCTT 皿V-D-RGGGCCTACAAACTGTTCACATTT HBV-D-PCTCATTGGAAAACACC ⑥ 针对乙型肝炎病毒E型基因型的PCR反应液体系,包括如下引物和探针 HBV-E-FAGTGAACCCTGTTCCGACTACTG HBV-E-RGGTCCCCAATCCTCGAGAA HBV-E-PCTCACTCATCTCGTCAAT ⑧ 针对乙型肝炎病毒F型基因型的PCR反应液体系,包括如下引物和探针 HBV-F-FGAGTCCCTTTATACCGCTGTTACC 皿V-F-RGTAATGATCCCCAACTGCCAAT 皿V-F-PATGGATACCCACAGATAA ⑦ 针对乙型肝炎病毒G型基因型的PCR反应液体系,包括如下引物和探针 皿V-G-FTGGAAAGTCTGTCAACGAATAACTG 皿V-G-RAAGGCAGGGTAACCACATTGG HBV-G-PTTTCGCTGCTCCTTTT ⑨ 针对乙型肝炎病毒Η型基因型的PCR反应液体系,包括如下引物和探针 HBV-H-FCCCGTGTGTCCTCTACTTCCA 皿V-H-RAAGAGTGGTGCAGGTTTTGCA皿V-H-PATCTACAACCACCAGCACG。 优选的,所述每种探针一端标记有巧光报告基团FAM、ΤΕΤ、肥X、R0X、JOE、CY3、 CY5、TAMRA或TexasRed,另一端标记有巧光泽灭基团MGB、B册-1、B册-2、LowaBlackRQ、 LowaBlack?FQ或D油巧 1。 更优选的,所述针对乙型肝炎病毒A-D型基因型的PCR反应液体系组成第一反应 体系,其中皿V-A-P的5'端标记FAM,3'端标记MGB,皿V-B-P的5'端标记肥X,3'端标记 MGB,皿V-C-P的5'端标记R0X,3'端标记MGB,皿V-D-P的5'端标记CY5, 3'端标记MGB; 针对乙型肝炎病毒E-H型基因型的PCR反应液体系组成第二反应体系,其中皿V-E-P的5'端标记FAM,3'端标记MGB,皿V-F-P的5'端标记肥X,3'端标记MGB,皿V-G-P的5' 端标记R0X,3'端标记MGB,皿V-H-P的5'端标记CY5, 3'端标记MGB。 所述试剂盒中还包括乙型肝炎病毒A-H型基因型的标准品。 本专利技术还提供乙型肝炎病毒八种基因分型的非诊断性检测方法,其特征在于,所 述方法包括W下步骤: (1) 合成权利要求1所述的引物和探针; (2) 根据仪器对各探针两端分别标记权利要求2中所述的巧光报告基团和相应的巧光 泽灭基团; (3)制备阳性标准品; (4) 提取待测样品DNA; (5) 准备PCR反应体系; (6) 运行PCR; (7) 数据分析。本文档来自技高网
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【技术保护点】
乙型肝炎病毒八种基因分型的荧光PCR试剂盒,其特征在于,所述试剂盒中包括如下至⑧ 中的至少一个PCR反应液体系:①针对乙型肝炎病毒A型基因型的PCR反应液体系,包括如下引物和探针HBV‑A‑F    ACCTGGGTGGGTAATAATTTGGAHBV‑A‑R    GAAACCACAATAGTTGCCTGATCTTHBV‑A‑P    AATTGACTACTAGATCCCTG②针对乙型肝炎病毒B型基因型的PCR反应液体系,包括如下引物和探针HBV‑B‑F    CTCGTGGTGGACTTCTCTCAATTHBV‑B‑R    ATCCAGCGATAACCAGGACAAATHBV‑B‑P    CAAATCTCCAGTCACTCAC③针对乙型肝炎病毒C型基因型的PCR反应液体系,包括如下引物和探针HBV‑C‑F    GAGCCAACTCAAACAATCCAGATHBV‑C‑R    GAATGCTCCCGCTCCTACCTHBV‑C‑P    CCCCAACAAGGATC④针对乙型肝炎病毒D型基因型的PCR反应液体系,包括如下引物和探针HBV‑D‑F    GGGAACTTTACTGGGCTTTATTCTTHBV‑D‑R    GGGCCTACAAACTGTTCACATTTHBV‑D‑P    CTCATTGGAAAACACC⑤针对乙型肝炎病毒E型基因型的PCR反应液体系,包括如下引物和探针HBV‑E‑F    AGTGAACCCTGTTCCGACTACTGHBV‑E‑R    GGTCCCCAATCCTCGAGAAHBV‑E‑P    CTCACTCATCTCGTCAAT⑥针对乙型肝炎病毒F型基因型的PCR反应液体系,包括如下引物和探针HBV‑F‑F    GAGTCCCTTTATACCGCTGTTACCHBV‑F‑R    GTAATGATCCCCAACTGCCAATHBV‑F‑P    ATGGATACCCACAGATAA⑦针对乙型肝炎病毒G型基因型的PCR反应液体系,包括如下引物和探针HBV‑G‑F    TGGAAAGTCTGTCAACGAATAACTGHBV‑G‑R    AAGGCAGGGTAACCACATTGGHBV‑G‑P    TTTCGCTGCTCCTTTT⑧针对乙型肝炎病毒H型基因型的PCR反应液体系,包括如下引物和探针HBV‑H‑F    CCCGTGTGTCCTCTACTTCCAHBV‑H‑R    AAGAGTGGTGCAGGTTTTGCAHBV‑H‑P    ATCTACAACCACCAGCACG。...

【技术特征摘要】

【专利技术属性】
技术研发人员:李云张明史玲莉曹彦强闫冀焕沈军李薇兰景付晓昀林玉楼
申请(专利权)人:河北国际旅行卫生保健中心
类型:发明
国别省市:河北;13

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