检测人类免疫缺陷病毒1型的PCR引物组、探针及其试剂盒和检测方法技术

技术编号:11913610 阅读:167 留言:0更新日期:2015-08-20 16:41
本发明专利技术公开了检测人类免疫缺陷病毒1型的PCR引物组、探针及其试剂盒和检测方法,该试剂盒含有高敏感度的引物组和探针,设计多重循环并提到引物退火温度,达到极高的灵敏度和特异性,最低检出限可达每个反应可检测2拷贝HIV-1 DNA/百万细胞,比目前其它检测方法更加灵敏。而且本发明专利技术的检测方法且加入细胞定量体系,可在同一反应中同时对HIV-1 DNA及细胞数进行定量。本发明专利技术的试剂盒中还加入制备简单、稳定,溯源可靠的定量标准品,可解决目前HIV DNA定量溯源性问题。本发明专利技术可应用于HIV感染早期检测,新生儿或高危人群HIV感染筛查,HIV-1病毒储存库检测,抗病毒药物治疗疗效评估,病情复发控制及彻底治愈标准建立等,其方法操作简单,成本低,具有广泛的临床应用作用,有利于推广应用。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于病毒检测领域,涉及一种检测人类免疫缺陷病毒1型的PCR引物组、探 针及其试剂盒和检测方法。
技术介绍
艾滋病即获得性免疫缺陷综合征(acquired immunodeficiency syndrome, AIDS),是一种慢性致死性传染病,由人类免疫缺陷病毒(human immunodeficiency virus, HIV)引起,分为人类免疫缺陷病毒1型(HIV-1)和人类免疫缺陷病毒2型(HIV-2),HIV-1 是目前全球包括中国在内流行的主要毒株,HIV-2型目前只在西非流行。HIV感染后导致 人体免疫机能缺陷,从而发生机会性感染和肿瘤等一系列临床综合征,病死率几乎达100%。 根据2011年数据,艾滋病已经波及全球200多个国家和地区,感染者总数已超过6000万, 2000万人死于艾滋病。由于该病潜伏期长、隐蔽性强、传播途径多样化、病死率高,目前既无 能治愈的药物也无有效的疫苗预防,给防治工作带来了严重困难。 我国目前处于HIV/AIDS广泛流行期,政府采取了一系列坚决的措施,已经有效地 控制了非法采供血行为,用血安全性得到最大限度的保障,但是经静脉注射吸毒和经性传 播HIV的势头并未得到很好的控制,尤其是性传播已成为主要传播方式,而且在一些地区 已出现HIV感染者的第二代传播(母婴传播、家庭内性传播等),对全国HIV/AIDS的流行 蔓延无疑起到推波助澜之作用。按照国家2014年最新颁布的治疗标准,其中超过8成需要 立即开展和持续终生高效抗逆转录病毒治疗(Highly active antiretroviral therapy, HAART),在公卫、临床、立法、治安等多方面均形成严重挑战。扩大HIV检测和抗病毒治疗, 早诊早治,降低新发数和病死率,是我国"十二五"以来艾滋病整体防控的战略目标。 目前国内外HIV检测主要存在以下问题: (1) "窗口期"(指感染后到体内产生抗体、并达到检出水平之间这段时间,期间具有感 染性但抗体检测为阴性,受不同检测方法和个体差异影响)及早期诊断。HIV感染后确定感 染的病毒标志物依次出现的顺序为:病毒核酸(RNA与前病毒DNA)、病毒蛋白(如p 24抗 原)、病毒抗体。目前,国内外HIV常规检测主要还是抗体血清学检测(ELISA、WB)。此技术 已建立20余年,成熟可靠,然而一直受所谓"窗口期"问题的困扰,"窗口期" 一般在40天 以上。核酸检测方面,由于病毒标志物出现更早,在窗口期前移上具有抗体检测技术不可比 拟的优势。但受灵敏度限制,目前外周血血清HIV RNA检测(目前国内外已上市的病毒载量 检测试剂盒检出限在20~200拷贝/mL之间)仍有11天左右窗口期。 虽然HIV-1是逆转录病毒,具有传染力的病毒子是RNA,但是HIV进入人体后,会进 入到CD4+ T细胞,靠自身的逆转录酶逆转录为DNA,也就是通常所说的前病毒,然后整合到 细胞的基因组中,从而感染T细胞。目前国内已上市的HIV-1核酸检测试剂盒是通过检测 血里面的HIV RNA浓度来诊断是否艾滋病感染。在早期感染或正在进行抗艾滋病治疗的患 者中,游离病毒子很少,而且病毒RNA在提取过程中容易降解,这类试剂盒难以检测到。但 是细胞中还是有整合的HIV病毒基因,一旦人的免疫能力下降或者未及时用药,这些整合 的病毒子就会开始复制,使病情发展。 (2)病毒储存库检测。临床对HIV抗病毒治疗的结果评价分为"彻底治愈"和"功 能性治愈"。前者要求实现长期不进行任何抗病毒治疗,体内仍检测不到HIV核酸;后者效 果类似病毒精英控制者,体内仍可检测到低水平的HIV-1 RNA和/或DNA,但长期免于HIV 相关疾患的损害。后续的研宄发现,接受HAART治疗患者体内其实一直存在着另一种潜伏 形式的HIV-1,即所谓病毒储存库。chun等1997年首次发现了整合在静止的记忆性⑶4+T 淋巴细胞中的病毒储存库,其中小部分含有整合的HIV DNA,可以在某种刺激下重新开始复 制-组装病毒。这些潜伏的感染细胞十分稳定,因此病毒储存库已被广泛认为是HAART无 法从患者体内清除HIV的主要原因和艾滋病治愈的最大障碍。 近年来病毒储存库相关主要检测技术包括:①QVOA (Quantitative viral outgrowth assay),又名 IUPM (Infectious Units Per Million)分析,由 Siliciano 和Siliciano 2005年建立。该方法对人员和设备要求较高,价格昂贵,样本需求量大 (120-180mL血液),费时费力,且结果准确性影响因素众多,检出率偏低,也不适用于组织活 检。②⑶4+T淋巴细胞计数,多采用⑶4/8/3流式仪检测,但没有证据表明能直接反映HIV 病毒储存库的变化,有无一定相关性尚待进一步求证。③RNA检测。如上述,由于HAART能 够非常有效地控制患者血浆HIV-1 RNA含量,甚至将其降低至临床常规检测的低限(20-50 拷贝/mL)以下,而且RNA检测对设备、人员及标本提取要求较高,因此其无法应用于病毒储 存库检测。 (3)新生儿HIV感染的诊断。HIV感染的母亲其婴儿由于母体抗体的存在,用抗体 检测法通常为阳性。但实际上只有20%~60%的婴儿可在母亲的子宫里、在分娩和引产或 通过产后哺乳时从其母体感染HIV。新生儿血清阳性者并不能说明是HIV感染。因为母体 HIV抗体可持续大约15个月之久,在一般情况下,婴儿并不表现出HIV感染的任何症状。病 毒细胞培养法对婴儿并不是一种可靠实用的方法;HIV特异IgM抗体的检测在母体抗体存 在下也是不可能的,在过量血清抗体存在下检出血清中的HIV抗原也十分困难。对这些婴 儿用可靠的核酸方法进行HIV感染的早期诊断是十分重要的。另外,婴幼儿被HIV感染后 病情发展较快,早期诊断对及时采取治疗措施,延缓阻止病情发展极为重要。 综上所述,传统的HIV检测方法,受限于"窗口期"、耗时、花费及标本要求高以及 检测灵敏度低等特点,亟需开发一种高敏感的HIV DNA检测方法。目前国内外鲜见有HIV DNA检测试剂盒,有文章报道的HIV DNA PCR检测方法灵敏度均在每百万细胞检测到10拷 贝HIV DNA或以上。
技术实现思路
为了解决上述问题,本专利技术通过大量实验研宄筛选出高灵敏和高特异性的引物序 列和检测探针,及特定的PCR反应程序和条件,构建了高敏感HIV-1 DNA PCR检测试剂盒及 检测方法,最低检测限可达每个反应可检测2拷贝HIV-1 DNA/百万细胞。 本专利技术的目的在于提供检测人类免疫缺陷病毒1型的PCR引物。 本专利技术的另一目的在于提供一种检测人类免疫缺陷病毒1型的PCR检测试剂盒。 本专利技术的再一目的在于提供一种检测检测人类免疫缺陷病毒1型的PCR检测方 法。 本专利技术所采取的技术方案是: 检测人类免疫缺陷病毒1型的PCR引物组,该引物组为引物组1或引物组2或引物组 3,其中, 引物组 1 由 SEQ ID N0:1、SEQ ID N0:2、SEQ ID N0:3、SEQ ID N0:4、SEQ ID N0:5 和 SEQ ID N0:6 组成; 引物组 2 由 SEQ本文档来自技高网
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【技术保护点】
检测人类免疫缺陷病毒1型的PCR引物组,该引物组为引物组1或引物组2或引物组3,其中,引物组1由SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:5和SEQ ID NO:6组成;引物组2由SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:9、SEQ ID NO:10和SEQ ID NO:11组成;引物组3由SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:13和SEQ ID NO:14组成。

【技术特征摘要】

【专利技术属性】
技术研发人员:朱托夫
申请(专利权)人:广州海力特生物科技有限公司
类型:发明
国别省市:广东;44

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