用于监测对抗SMAD7疗法的反应性的方法技术

公开了用于监测患者对使用抗SMAD7疗法的治疗敏感还是有抗性的方法。所述方法是基于来自于所述患者的样本中CCR9+FOXP3+T细胞、CCR9+IFN-γ+T细胞、CCR9+IL17A+T细胞、FOXP3+T细胞、IFN-γ+T细胞和/或IL17A+T细胞的量的测定。T细胞群体的测量可以通过流式细胞术、免疫组织化学和/或ELISA来测定。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】用于监测对抗SMAD7疗法的反应性的方法对相关申请的参考本申请要求2011年9月15日提交的欧洲申请EP11425234.9的利益和2011年12月16日提交的美国申请61/576,556的利益，所述申请的全部公开内容在此通过引用并入本申请用于所有目的。
技术介绍
炎症性肠病(IBD)是胃肠道的慢性炎性障碍，在美国有大约一百万人患有此病。IBD的两种最常见形式是克罗恩病(CD)和溃疡性结肠炎(UC)。尽管CD能够影响整个胃肠道，但它主要影响回肠(小肠的远端或下部)和大肠。UC主要影响结肠和直肠。当前用于CD和UC两者的治疗包括氨基水杨酸酯类(例如5-氨基水杨酸、柳氮磺胺吡啶和美沙拉嗪)、抗生素(例如环丙沙星和甲硝唑)、皮质类固醇(例如布地奈德或泼尼松)、免疫抑制剂(例如硫唑嘌呤或甲氨喋呤)和肿瘤坏死因子(TNF)拮抗剂(例如英夫利昔单抗)。患者对这些疗法的反应随疾病严重性而变，并且它可以随活动性炎症和缓解的循环而变。此外，目前用于IBD的许多疗法伴有不良的副作用。尽管CD和UC的病因未知，但两者都被认为是肠粘膜的炎性疾病。最近的研究证实，TGF-β1起到能够控制粘膜性肠炎的强力免疫调节剂的作用。TGF-β1结合含有两个亚基TGF-β1R1和TGF-β1R2的跨膜丝氨酸/苏氨酸激酶受体异源二聚体。在配体结合后，TGF-β1R1受体被组成性活化的TGF-β1R2受体磷酸化，并通过属于SMAD家族的蛋白将信号传导到细胞核。激活的TGF-β1R1直接磷酸化SMAD2和SMAD3蛋白，然后它们与SMAD4相互作用。SMAD2/SMAD3/SMAD4复合体易位到细胞核，并调节某些基因的转录。其他研究证实，另一种SMAD蛋白SMAD7也在炎症中发挥作用。SMAD7这种细胞内蛋白已被证明干扰SMAD2/SMAD3与TGF-β1R1的结合，阻止这些蛋白的磷酸化和活化。此外，SMAD7蛋白的表达增加与TGF-β1介导的信号传导的抑制相关。来自于IBD患者的粘膜样本具有高水平的SMAD7和低水平的磷酸化SMAD3的特征，表明在这些患者中TGF-β1介导的信号传导受损。最近的研究聚焦于将SMAD7作为治疗患有IBD的患者的靶点。这样的疗法包括抗SMAD7反义疗法。就此而言，需求一种基于预测性生物标志物的方法，能用于鉴定患者可能(或不可能)对使用抗SMAD7疗法产生反应(respond)。
技术实现思路
本专利技术部分地基于下述发现：在来自于患有炎症性肠病(IBD)(例如克罗恩病或溃疡性结肠炎)的患者(例如人类患者)的生物(例如血液或组织)样本中，某些T细胞群体的调节(例如CCR9+FoxP3+T细胞增加，CCR9+IFN-gamma阳性(IFN-γ+)T细胞减少，CCR9+IL17A+T细胞减少，FoxP3+T细胞减少，IFN-γ+T细胞减少和/或IL17A+T细胞减少)与对使用抗SMAD7疗法的治疗的敏感性相关。应该认识到，能够事先或在开始治疗后不久预测IBD患者是否可能对使用抗SMAD7疗法的治疗具有反应性(responsive)是有益的。本文中所描述的细胞群体的调节，能预测抗SMAD7疗法对患有IBD的患者的治疗效果。有益的是，本专利技术的方法将最终帮助医生选择有效的疗法，并改善患者疾病状态、更好的医疗护理和患者总成本的降低。因此，第一方面，本专利技术提供了一种用于确定患有炎症性肠病(IBD)的患者对使用至少一种抗SMAD7疗法的治疗的反应性的方法，所述方法包括：在从所述患者获得的至少一个样本中，测定选自由CCR9+FoxP3+T细胞，CCR9+IFN-γ+T细胞，CCR9+IL17A+T细胞，FoxP3+T细胞，IFN-γ+T细胞和IL17A+T细胞所组成的组的至少一种细胞群体的量，其中在所述至少一个样本中，相对于所述至少一个细胞群体的已知对照水平，细胞群体CCR9+FoxP3+T细胞的量的增加和/或细胞群体CCR9+IFN-γ+T细胞、CCR9+IL17A+T细胞、FoxP3+T细胞、IFN-γ+T细胞和IL17A+T细胞中至少一个细胞群体的量的减少，预测所述患有IBD的患者对所述抗SMAD7疗法的反应性。应该认识到，“确定患者的反应性”包括：预测或监测患有IBD的患者对使用至少一种抗SMAD7疗法的治疗的有效性或反应性。适合情况下，所述样本是生物样本。在本专利技术方法的优选实施方式中，鉴定两种或更多种下列调节，以帮助确定所述患者对所述疗法的反应性：CCR9+FoxP3+T细胞的量的增加，表明所述患者可能对所述抗SMAD7疗法产生反应或具有反应性；CCR9+IFN-γ+T细胞的量的减少，表明所述患者可能对所述抗SMAD7疗法产生反应或具有反应性；CCR9+IL17A+T细胞的量的减少，表明所述患者可能对所述抗SMAD7疗法产生反应或具有反应性；FoxP3+T细胞的量的减少，表明所述患者可能对所述抗SMAD7疗法产生反应或具有反应性；IFN-γ+T细胞的量的减少表明所述患者可能对所述抗SMAD7疗法产生反应或具有反应性；IL17A+T细胞的量的减少表明所述患者可能对所述抗SMAD7疗法产生反应或具有反应性。在第一优选实施方式中，所述细胞群体是CCR9+FoxP3+T细胞。在第二优选实施方式中，所述细胞群体是CCR9+IFN-γ+T细胞。在第三优选实施方式中，所述细胞群体是CCR9+IL17A+T细胞。在第四优选实施方式中，所述优选的细胞群体是FoxP3+T细胞。在第五优选实施方式中，所述细胞群体是IFN-γ+T细胞。在第六优选实施方式中，所述细胞群体是IL17A+T细胞。其他优选的细胞群体是FoxP3+CD103+T细胞、CD103+T细胞或整合素α4β7+T细胞中的任一种。适合情况下，本专利技术的方法可以在体外进行。优选地，在本专利技术的方法中，在量测定步骤之前，可以进行从患有IBD的患者获得所述样本的步骤。所述样本可以通过抽血或进行组织活检来获取。适合情况下，在从所述患者获得所述至少一个样本时，所述患者可以正接受至少一种抗SMAD7疗法。优选地，在本专利技术的方法中，CCR9+FoxP3+T细胞的量增加、CCR9+IFN-γ+T细胞的量减少、CCR9+IL17A+T细胞的量减少、FoxP3+T细胞的量减少、IFN-γ+T细胞的量减少或IL17A+T细胞的量减少的鉴定，表明所述患者可能进入缓解。适合情况下，所述至少一种细胞群体的量可以使用本领域技术人员已知的试剂/方法，通过流式细胞术、免疫组织化学(例如ELISA)和/或RNA/DNA分析来确定。应该认识到，可以使用选自由抗CCR9抗体，抗FoxP3抗体，抗IFN-γ抗体和抗IL17A抗体所组成的组来进行所述流式细胞术和/或免疫组织化学。或者，细胞的量可以通过测量编码选自由CCR9、FoxP3、IFN-γ和IL17A所组成的组的至少一种标志物的RNA的量来确定。优选地，对照是指对照水平，其为在施用至少一种抗SMAD7疗法之前从所述患者(患有IBD)获得、或在施用至少一种抗SMAD7疗法后立即获得的至少一种细胞群体的量的基线水平。“施用后立即”是指在治疗开始的第一天/当天。在相关方面中，本文公开了一种用于监测患有IBD并正经历使用抗SMAD7疗法的治疗的患者，以确定所述患者是否对所述疗法具有本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种用于确定患有炎症性肠病的患者对使用至少一种抗SMAD7疗法的治疗的反应性的方法，该方法包括：在从所述患者获得的至少一个样本中，测定选自由下列细胞群体所组成的细胞群体组中的至少一种细胞群体的量：CCR9+FoxP3+T细胞，CCR9+IFN‑γ+T细胞，CCR9+IL17A+T细胞，FoxP3+T细胞，IFN‑γ+T细胞和IL17A+T细胞，其中，在所述至少一个样本中，相对于所述至少一个细胞群体的已知对照水平，细胞群体CCR9+FoxP3+T细胞的量的增加和/或细胞群体CCR9+IFN‑γ+T细胞、CCR9+IL17A+T细胞、FoxP3+T细胞、IFN‑γ+T细胞和IL17A+T细胞中至少一个细胞群体的量的减少，预测所述患有炎症性肠病的患者对所述抗SMAD7疗法的反应性。

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】2011.09.15 EP 11425234.9;2011.12.16 US 61/576,5561.一种试剂在制备用于确定患有克罗恩病(CD)的患者对使用至少一种抗SMAD7疗法的治疗的反应性的产品中的应用，其中使用该产品的方法包括以下步骤：在从所述患者获得的至少一个样本中，测定选自由下列细胞群体所组成的细胞群体组中的至少一种细胞群体的量：CCR9+FoxP3+T细胞，CCR9+IFN-γ+T细胞，CCR9+IL17A+T细胞，FoxP3+T细胞，IFN-γ+T细胞和IL17A+T细胞，其中，在所述至少一个样本中，相对于所述至少一个细胞群体的已知对照水平，细胞群体CCR9+FoxP3+T细胞的量的增加和/或细胞群体CCR9+IFN-γ+T细胞、CCR9+IL17A+T细胞、FoxP3+T细胞、IFN-γ+T细胞和IL17A+T细胞中至少一个细胞群体的量的减少，预测所述患有克罗恩病(CD)的患者对所述抗SMAD7疗法的反应性。2.如权利要求1所述的应用，其中，两种或更多种下列调节被鉴定以帮助确定所述患者的反应性：CCR9+FoxP3+T细胞的量的增加，表明所述患者对所述抗SMAD7疗法具有反应性或将产生反应；CCR9+IFN-γ+T细胞的量的减少，表明所述患者对所述抗SMAD7疗法具有反应性或将产生反应；CCR9+IL17A+T细胞的量的减少，表明所述患者对所述抗SMAD7疗法具有反应性或将产生反应；FoxP3+T细胞的量的减少，表明所述患者对所述抗SMAD7疗法具有反应性或将产生反应；IFN-γ+T细胞的量的减少，表明所述患者对所述抗SMAD7疗法具有反应性或将产生反应；IL17A+T细胞的量的减少，表明所述患者对所述抗SMAD7疗法具有反应性或将产生反应。3.如权利要求1或2所述的应用，其在离体的情况下进行。4.如权利要求1或2所述的应用，其中，在获得所述至少一个生物样本时，所述患者正接受至少一种抗SMAD7疗法。5.如权利要求1或2所述的应用，其中，下列至少一项表明所述患者进入或将进入缓解：CCR9+FoxP3+T细胞的量增加、CCR9+IFN-γ+T细胞的量减少、CCR9+IL17A+T细胞的量减少、FoxP3+T细胞的量减少、IFN-γ+T细胞的量减少或IL17A+T细胞的量减少。6.如权利要求1或2所述的应用，其中，所述至少一个样本是血液样本或组织样本。7.如权利要求6所述的应用，其中，所述组织样本来自于所述患者的胃肠道。8.如权利要求1或2所述的应用，其中，所述至少一种细胞群体的量通过流式细胞术、免疫组织化学和/或RNA/DNA分析来确定。9.如权利要求8所述的应用，其中，使用选自由下列的抗体所组成的抗体组来进行所述流式细胞术和/或免疫组织...

【专利技术属性】
技术研发人员：乔瓦尼·蒙泰莱奥内，弗朗西斯卡·维蒂，塞尔瓦托·贝利尼亚，
申请(专利权)人：诺格尔制药有限公司，
类型：发明
国别省市：爱尔兰;IE