SLC24A5基因突变体及其应用制造技术

本发明专利技术涉及分离的编码SLC24A5突变体的核酸、分离的多肽、筛选易感眼皮肤白化病的生物样品的方法、筛选易感眼皮肤白化病的生物样品的系统以及用于筛选易感眼皮肤白化病的生物样品的试剂盒。其中，分离的编码SLC24A5突变体的核酸，与SEQ ID NO：1相比，具有选自下列的至少一种突变：c.591G>A和c.1361insT。通过检测这些突变体在生物样品中是否存在，可以有效地检测生物样品是否易感眼皮肤白化病。

【技术实现步骤摘要】
SLC24A5基因突变体及其应用
本专利技术涉及SLC24A5基因突变体及其应用。具体地，本专利技术涉及分离的编码SLC24A5突变体的核酸、分离的多肽、筛选易感眼皮肤白化病的生物样品的方法、筛选易感眼皮肤白化病的生物样品的系统以及用于筛选易感眼皮肤白化病的生物样品的试剂盒。
技术介绍
眼皮肤白化病（OCA）是一种异质的常染色体隐性遗传病，在全世界的流行率约为1:17000。此病表现为皮肤、头发和眼的黑色素减少或完全丧失，通常伴随着畏光、斜视、中毒或严重的视觉缺陷、眼球震颤等眼科症状。目前，已知的人类OCA的致病基因有非综合征型OCA基因（TYR,OCA2,TYRP1和SLC45A2）和综合征型OCA基因（HPS1,AP3B1,HPS3,HPS4,HPS5,HPS6,DTNBP1,BLOC1S3,PLDN,LYST,MYO5A,RAB27A和MLPH），但仍有多个眼皮肤白化病患者可能由其他的未知基因致病。因而，目前对眼皮肤白化病的研究仍有待深入。
技术实现思路
本专利技术旨在至少解决现有技术中存在的技术问题之一。为此，本专利技术的一个目的在于提出人类眼皮肤白化病的新的致病基因及其突变。本专利技术是基于专利技术人的下列工作而完成的：专利技术人通过全外显子组测序结合Sanger验证的方法确定了眼皮肤白化病的新的致病基因及致病突变。根据本专利技术的第一方面，本专利技术提出了一种分离的编码SLC24A5突变体的核酸。根据本专利技术的实施例，与SEQIDNO：1相比，该核酸具有选自下列的至少一种突变：c.591G>A和c.1361insT。根据本专利技术的实施例，专利技术人确定了多个SLC24A5基因的突变体，这些突变体与眼皮肤白化病的发病密切相关，从而通过检测这些突变体在生物样品中是否存在，可以有效地检测生物样品是否易感眼皮肤白化病。根据本专利技术的第二方面，本专利技术提出了一种分离的多肽。根据本专利技术的实施例，与SEQIDNO：2相比，该分离的多肽具有选自下列的至少一种突变：p.W197X和p.L454Ffs31X。根据本专利技术的一些具体示例，该多肽是由前述分离的编码SLC24A5突变体的核酸编码的。通过检测生物样品中是否表达该多肽，可以有效地检测生物样品是否易感眼皮肤白化病。根据本专利技术的第三方面，本专利技术提出了一种筛选易感眼皮肤白化病的生物样品的方法。根据本专利技术的实施例，该筛选易感眼皮肤白化病的生物样品的方法包括以下步骤：从生物样品提取核酸样本；确定核酸样本的核酸序列；该核酸样本的核酸序列或其互补序列与SEQIDNO：1相比，具有选自c.591G>A和c.1361insT的至少一种突变是生物样品易感眼皮肤白化病的指示。通过根据本专利技术实施例的筛选易感眼皮肤白化病的生物样品的方法，可以有效地筛选易感眼皮肤白化病的生物样品。根据本专利技术的第四方面，本专利技术提出了一种筛选易感眼皮肤白化病的生物样品的系统。根据本专利技术的实施例，该筛选易感眼皮肤白化病的生物样品的系统包括：核酸提取装置，该核酸提取装置用于从生物样品提取核酸样本；核酸序列确定装置，该核酸序列确定装置与核酸提取装置相连，用于对核酸样本进行分析，以便确定核酸样本的核酸序列；判断装置，该判断装置与核酸序列确定装置相连，以便基于核酸样本的核酸序列或其互补序列与SEQIDNO：1相比，是否具有选自c.591G>A和c.1361insT的至少一种突变，判断生物样品是否易感眼皮肤白化病。利用该系统，能够有效地实施前述筛选易感眼皮肤白化病的生物样品的方法，从而可以有效地筛选易感眼皮肤白化病的生物样品。根据本专利技术的第五方面，本专利技术提出了一种用于筛选易感眼皮肤白化病的生物样品的试剂盒。根据本专利技术的实施例，该用于筛选易感眼皮肤白化病的生物样品的试剂盒包括：适于检测SLC24A5基因突变体的试剂，其中与SEQIDNO：1相比，SLC24A5基因突变体具有选自c.591G>A和c.1361insT的至少一种突变。利用根据本专利技术的实施例的试剂盒，能够有效地筛选易感眼皮肤白化病的生物样品。本专利技术的附加方面和优点将在下面的描述中部分给出，部分将从下面的描述中变得明显，或通过本专利技术的实践了解到。附图说明本专利技术的上述和/或附加的方面和优点从结合下面附图对实施例的描述中将变得明显和容易理解，其中：图1：显示了根据本专利技术实施例的筛选易感眼皮肤白化病的生物样品的系统及其组成部分的示意图，其中，A为根据本专利技术实施例的筛选易感眼皮肤白化病的生物样品的系统的示意图，B为根据本专利技术实施例的核酸提取装置的示意图，C为根据本专利技术实施例的核酸序列确定装置的示意图；图2：显示了根据本专利技术实施例的一个非综合征型OCA（OCA6）患者家系的家系图谱；图3：显示了图2所示的非综合征型OCA（OCA6）患者家系中先证者及其哥哥的临床诊断结果图；图4：显示了根据本专利技术一个实施例，对图2所示的非综合征型OCA（OCA6）患者家系中先证者及其父母和哥哥的SLC24A5基因突变位点c.1361insT和c.591G>A的Sanger测序验证峰图；图5：显示了根据本专利技术一个实施例，图2所示的非综合征型OCA（OCA6）患者家系中先证者及其父母和哥哥，以及家系外正常人的头发真黑素测定结果；图6：显示了免疫印迹法测定的HPS突变体小鼠模型pa、ru、ep和pe，以及野生对照B6的SLC24A5蛋白稳态水平结果；图7：显示了根据本专利技术一个实施例，图2所示的非综合征型OCA（OCA6）患者家系中先证者及其哥哥的皮肤组织病理学检验结果。具体实施方式下面详细描述本专利技术的实施例，所述实施例的示例在附图中示出，其中自始至终相同或类似的标号表示相同或类似的元件或具有相同或类似功能的元件。下面通过参考附图描述的实施例是示例性的，仅用于解释本专利技术，而不能理解为对本专利技术的限制。SLC24A5基因突变体根据本专利技术的第一方面，本专利技术提出了一种分离的编码SLC24A5突变体的核酸。根据本专利技术的实施例，与SEQIDNO：1相比，该核酸具有选自下列的至少一种突变：c.591G>A和c.1361insT，优选地，该核酸同时具有c.591G>A和c.1361insT突变。在本文中所使用的表达方式“编码SLC24A5突变体的核酸”，是指与编码SLC24A5突变体的基因相对应的核酸物质，即核酸的类型不受特别限制，可以是任何包含与SLC24A5突变体的编码基因相对应的脱氧核糖核苷酸和/或核糖核苷酸的聚合物，包括但不限于DNA、RNA或cDNA。此外，需要说明的是，“c.591G>A”表示cDNA序列的第591位碱基由G突变为A；“c.1361insT”表示在cDNA序列的第1361位碱基后插入T，而cDNA序列的第1354位碱基至第1361位碱基均为T，因此该突变也可以被表示为c.1354insT、c.1355insT…..或c.1360insT，由此，在本文中，c.1361insT突变可以表示c.1354insT、c.1355insT…..或c.1361insT突变。根据本专利技术的一个具体示例，前面所述的编码SLC24A5突变体的核酸为DNA。根据本专利技术的实施例，专利技术人确了多个SLC24A5基因的突变体，这些突变体与眼皮肤白化病的发病密切相关，从而通过检测这些突变体在生物样品中是本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种分离的编码SLC24A5突变体的核酸，其特征在于，与SEQ ID NO：1相比，所述核酸具有选自下列的至少一种突变：c.591G>A和c.1361insT，优选地，所述核酸同时具有c.591G>A和c.1361insT突变，任选地，所述核酸为DNA。

【技术特征摘要】
1.一种分离的编码SLC24A5突变体的核酸，其特征在于，与SEQIDNO：1相比，所述核酸发生选自下列的至少一种突变：c.591G>A和c.1361insT。2.根据权利要求1所述的分离的编码SLC24A5突变体的核酸，其特征在于，所述核酸同时发生c.591G>A和c.1361insT突变。3.根据权利要求1所述的分离的编码SLC24A5突变体的核酸，其特征在于，所述核酸为DNA。4.一种分离的多肽，其特征在于，与SEQIDNO：2相比，所述分离的多肽发生选自下列的至少一种突变：p.W197X和p.L454Ffs31X。5.根据权利要求4所述的分离的多肽，其特征在于，所述多肽同时发生p.W197X和p.L454Ffs31X突变。6.根据权利要求4所述的分离的多肽，其特征在于，所述多肽是由权利要求1-3任一项所述的核酸编码的。7.一种筛选易感眼皮肤白化病的生物样品的系统，其特征在于，包括：核酸提取装置，所述核酸提取装置用于从所述生物样品提取核酸样本；核酸序列确定装置，所述核酸序列确定装置与所述核酸提取装置相连，用于对所述核酸样本进行分析，以便确定所述核酸样本的核酸序列；判断装置，所述判断装置与所述核酸序列确定装置相连，以便基于所述核酸样本的核酸序列或其互补序列与SEQIDNO：1相比，是否发生选自c.591G>A和c.1361insT的至少一种突变，判断所述生物样品是否易感眼皮肤白化病。8.根据权利要求7所述的系统，其特征在于，所述核酸提取装置进一步包括：RNA提取单元，所述RNA提取单元用于从所...

【专利技术属性】
技术研发人员：戴兰兰，刘轩竹，李巍，魏爱华，
申请(专利权)人：深圳华大基因研究院，
类型：发明
国别省市：广东;44