一种用于构建枸杞DNA指纹图谱的引物组合以及应用和方法技术

本发明专利技术提供了一种用于构建枸杞DNA指纹图谱的引物组合以及应用和方法，属于DNA指纹图谱技术领域。本发明专利技术在枸杞基因测序结果基础上首次开发筛选出了具有多态性的15个SSR引物对，该15个SSR引物对可用于构建枸杞DNA指纹图谱，并结合毛细管电泳技术构建得到的枸杞DNA指纹图谱，具有电泳分辨率高、灵敏度高、数据分析处理便捷等特点，为DNA指纹图谱的在枸杞上的进一步应用研究提供了坚实的理论支持。

【技术实现步骤摘要】
一种用于构建枸杞DNA指纹图谱的引物组合以及应用和方法
本专利技术涉及DNA指纹图谱
，具体而言，涉及一种用于构建枸杞DNA指纹图谱的引物组合以及应用和方法。
技术介绍
枸杞是我国传统的中药材，在中药材领域具有重要的地位。宁夏作为枸杞地道产区，枸杞种植历史悠久，在枸杞育种、栽培、加工等方面成果颇丰。近年来，随着枸杞育种方法的不断进步，新的枸杞品种也不断涌现，这些枸杞种质资源有许多优异品种未能被合理利用。因此，将这些枸杞种质资源进行有效分类和鉴定，对枸杞种质资源的研究、品种创新尤为重要。DNA指纹图谱技术对植物品种进行分离和鉴定的有效手段。DNA指纹图谱是指DNA样品用特定分子标记技术处理显示出具有特定DNA片段的总称。DNA指纹图谱技术最早用于在刑侦或亲子鉴定上确定人的身份，而后随着生物技术的进步与发展，DNA指纹图谱技术在很多植物上得到广泛的应用。目前，常用于构建DNA指纹图谱的分子标记有SSR、AFLP、SRAP、SCoT、RAPD、SNP以及ISSR。不同分子标记构建的DNA指纹图谱各有其特点。其中，以ISSR、SSR、SRAP应用最广泛。目前，DNA指纹图谱的在枸杞上的应用研究并不多，由其是以SSR分子标记技术来构建枸杞DNA指纹图谱的更未见报道。
技术实现思路
本专利技术的目的在于提供一种用于构建枸杞DNA指纹图谱的引物组合，该引物组合可用于构建出枸杞DNA指纹图谱。本专利技术的另一目的在于提供上述引物组合在构建枸杞DNA指纹图谱中的应用。本专利技术的另一目的在于提供构建枸杞DNA指纹图谱的方法，该方法所构建出的枸杞DNA指纹图谱能够准确反应出枸杞DNA指纹图谱的信息。本专利技术的另一目的在于提供采用上述方法得到的枸杞DNA指纹图谱在鉴定枸杞种质资源中的应用。本专利技术是这样实现的：一种用于构建枸杞DNA指纹图谱的引物组合，其包括第1-15引物对，上述第1-15引物对的碱基序列分别如SEQIDNO.1-2、SEQIDNO.3-4、SEQIDNO.5-6、SEQIDNO.7-8、SEQIDNO.9-10、SEQIDNO.11-12、SEQIDNO.13-14、SEQIDNO.15-16、SEQIDNO.17-18、SEQIDNO.19-20、SEQIDNO.21-22、SEQIDNO.23-24、SEQIDNO.25-26、SEQIDNO.27-28、SEQIDNO.29-30所示。上述的用于构建枸杞DNA指纹图谱的引物组合在构建枸杞DNA指纹图谱中的应用。一种构建枸杞DNA指纹图谱的方法，其包括：用上述的用于构建枸杞DNA指纹图谱的引物组合的第1-15引物对分别对多个枸杞种质的DNA进行PCR扩增，得到扩增产物；将上述扩增产物分别进行电泳，得到扩增带型数；将上述扩增带型数进行编码处理，得到每一种上述枸杞种质的DNA对应上述第1-15引物对的第1-15编号，串联上述第1-15编号形成字符串。上述的构建枸杞DNA指纹图谱的方法所得到的枸杞DNA指纹图谱在鉴定枸杞种质资源中的应用。与现有技术相比，本专利技术的有益效果是：本专利技术的通过SSR分子标记技术对枸杞基因组序列进行分析筛选，得到可用于构建枸杞DNA指纹图谱的引物组合，该引物组合包括SEQIDNO.1-2、SEQIDNO.3-4、SEQIDNO.5-6、SEQIDNO.7-8、SEQIDNO.9-10、SEQIDNO.11-12、SEQIDNO.13-14、SEQIDNO.15-16、SEQIDNO.17-18、SEQIDNO.19-20、SEQIDNO.21-22、SEQIDNO.23-24、SEQIDNO.25-26、SEQIDNO.27-28、SEQIDNO.29-30所示的15个引物对，该15个引物对可用于构建枸杞品种或枸杞种质的DNA指纹图谱，所得到的枸杞DNA指纹图谱可以是以电泳图谱表示的或者是以字符串表示的，其反应的指纹信息准确可靠，该枸杞DNA指纹图谱作为枸杞种质资源鉴定的参考依据，为枸杞的市场流通、栽培管理等领域得到进一步的推广利用提供支持。同时也为为DNA指纹图谱的在枸杞上的进一步应用研究提供了坚实的理论支持。附图说明为了更清楚地说明本专利技术实施例的技术方案，下面将对实施例中所需要使用的附图作简单地介绍，应当理解，以下附图仅示出了本专利技术的某些实施例，因此不应被看作是对范围的限定，对于本领域普通技术人员来讲，在不付出创造性劳动的前提下，还可以根据这些附图获得其他相关的附图。图1为本专利技术用第3引物对对宁杞1号扩增后的毛细管电泳图谱；图2为本专利技术用第5引物对对宁杞1号扩增后的毛细管电泳图谱；图3为本专利技术用第7引物对对宁杞1号扩增后的毛细管电泳图谱；图4为本专利技术用第11引物对对宁杞1号扩增后的毛细管电泳图谱；图5为本专利技术用第13引物对对宁杞1号扩增后的毛细管电泳图谱；图6为本专利技术用第8引物对对宁杞1号扩增后的毛细管电泳图谱；图7为本专利技术用第10引物对对宁杞1号扩增后的毛细管电泳图谱；图8为本专利技术用第14引物对对宁杞1号扩增后的毛细管电泳图谱；图9为本专利技术用第1引物对对宁杞1号扩增后的毛细管电泳图谱；图10为本专利技术用第15引物对对宁杞1号扩增后的毛细管电泳图谱；图11为本专利技术用第12引物对对宁杞1号扩增后的毛细管电泳图谱；图12为本专利技术用第4引物对对宁杞1号扩增后的毛细管电泳图谱；图13为本专利技术用第2引物对对宁杞1号扩增后的毛细管电泳图谱；图14为本专利技术用第9引物对对宁杞1号扩增后的毛细管电泳图谱；图15为本专利技术用第6引物对对宁杞1号扩增后的毛细管电泳图谱；图16为本专利技术用第10引物对对宁杞5号扩增后的毛细管电泳图谱；图17为本专利技术用第10引物对对宁杞7号扩增后的毛细管电泳图谱；图18为本专利技术用第10引物对对宁农杞9号扩增后的毛细管电泳图谱；图19为本专利技术用第10引物对对蒙杞1号扩增后的毛细管电泳图谱；图20为本专利技术用第10引物对对宁夏黄果扩增后的毛细管电泳图谱；图21为本专利技术用第10引物对对宁杞菜1号扩增后的毛细管电泳图谱；图22为本专利技术用第10引物对对黑果扩增后的毛细管电泳图谱；图23为本专利技术用第10引物对对中国扩增后的毛细管电泳图谱；图24为本专利技术用第10引物对对北方扩增后的毛细管电泳图谱；图25为本专利技术用第10引物对对云南扩增后的毛细管电泳图谱；图26为本专利技术用第10引物对对蔓生扩增后的毛细管电泳图谱；图27为本专利技术用第10引物对对新疆扩增后的毛细管电泳图谱；图28为本专利技术用第10引物对对红枝扩增后的毛细管电泳图谱；图29为本专利技术用第10引物对对柱筒扩增后的毛细管电泳图谱；图30为本专利技术用第10引物对对截萼扩增后的毛细管电泳图谱；图31为本专利技术用第10引物对对CJ扩增后的毛细管电泳图谱；图32为本专利技术用第10引物对对HB扩增后的毛细管电泳图谱；图33为本专利技术用第10引物对对SC扩增后的毛细管电泳图谱；图34为本专利技术用第10引物对对AN扩增后的毛细管电泳图谱；图35为本专利技术用第10引物对对W30扩增后的毛细管电泳图谱；图36为本专利技术用第10引物对对HZ01扩增后的毛细管电泳图谱；图37为本专利技术用第10引物对对ZH08扩增后的毛细管电泳图谱；图38为本专利技术用第10引物对对W27扩增后的毛细管电泳图谱；图39为本专利技术用第10引物对对W15扩增后的本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种用于构建枸杞DNA指纹图谱的引物组合，其特征在于，其包括第1‑15引物对，所述第1‑15引物对的碱基序列分别如SEQ ID NO.1‑2、SEQ ID NO.3‑4、SEQ ID NO.5‑6、SEQ ID NO.7‑8、SEQ ID NO.9‑10、SEQ ID NO.11‑12、SEQ ID NO.13‑14、SEQ ID NO.15‑16、SEQ ID NO.17‑18、SEQ ID NO.19‑20、SEQ ID NO.21‑22、SEQ ID NO.23‑24、SEQ ID NO.25‑26、SEQ ID NO.27‑28、SEQ ID NO.29‑30所示。

【技术特征摘要】
1.一种用于构建枸杞DNA指纹图谱的引物组合，其特征在于，其包括第1-15引物对，所述第1-15引物对的碱基序列分别如SEQIDNO.1-2、SEQIDNO.3-4、SEQIDNO.5-6、SEQIDNO.7-8、SEQIDNO.9-10、SEQIDNO.11-12、SEQIDNO.13-14、SEQIDNO.15-16、SEQIDNO.17-18、SEQIDNO.19-20、SEQIDNO.21-22、SEQIDNO.23-24、SEQIDNO.25-26、SEQIDNO.27-28、SEQIDNO.29-30所示。2.根据权利要求1所述的用于构建枸杞DNA指纹图谱的引物组合，其特征在于，所述第1-15引物对中每个引物对的上游引物的5’端标记有荧光基因；或者所述第1-15引物对中每个引物对的下游引物的5’端标记有所述荧光基因。3.根据权利要求2所述的用于构建枸杞DNA指纹图谱的引物组合，其特征在于，所述荧光基因为选自FAM、TAMRA、HEX和ROX中的任意一种。4.权利要求1-3中任一项所述的用于构建枸杞DNA指纹图谱的引物组合在构建枸杞DNA指纹图谱中的应用。5.一种构建枸杞DNA指纹图谱的方法，其特征在于，其包括：用权利要求1-3中任一项所述的用于构建枸杞DNA指纹图谱的引物组合的第1-15引物对分别对多个枸杞种质的DNA进行PCR扩增，得到扩增产物；将所述扩增产物分别进行电泳，得到扩增带型数；将所述扩增带型数进行编码处理，得到每一种...

【专利技术属性】
技术研发人员：曹有龙，尹跃，赵建华，安巍，
申请(专利权)人：宁夏农林科学院枸杞工程技术研究所，
类型：发明
国别省市：宁夏,64