β-地中海贫血IVS-Ⅱ654(C→T)检测试剂盒及ARMS-QPCR检测方法技术

技术编号:9513354 阅读:236 留言:0更新日期:2013-12-27 13:27
本发明专利技术提供一种β-地中海贫血IVS-Ⅱ654(C→T)检测试剂盒,其包括PCR反应液(1)、PCR反应液(2)和混合酶液,所述PCR反应液(1)包括β-地中海贫血IVS-Ⅱ654(C→T)上游引物(1)、探针以及下游引物;所述PCR反应液(2)包括β-地中海贫血IVS-Ⅱ654(C→T)上游引物(2)、所述探针以及下游引物;所述上游引物(1)为:5’-TTGCATATTCATAATCTCCCTAC-3’;所述上游引物(2)为:5’-ACAGTGATAATTTCTGGGTTAAGCT-3’;所述探针为:5’-(FAM)TTTCTGCATATAAATTGTAACTGAT(DABCYL)-3’;所述下游引物为:5’-AGGGCCTAGCTTGGACTCAG-3’。本发明专利技术β-地中海贫血IVS-Ⅱ654(C→T)检测试剂盒检测标本,仅需3小时即可完成检测,同时检测β-地中海贫血IVS-Ⅱ654(C→T)特异性较强,有效克服了β-地中海贫血PCR-反向点杂交法、基因检测技术中存在的周期长、操作繁琐,需要送到专门检测单位的缺点。?

【技术实现步骤摘要】
【专利摘要】本专利技术提供一种β-地中海贫血IVS-Ⅱ654(C→T)检测试剂盒,其包括PCR反应液(1)、PCR反应液(2)和混合酶液,所述PCR反应液(1)包括β-地中海贫血IVS-Ⅱ654(C→T)上游引物(1)、探针以及下游引物;所述PCR反应液(2)包括β-地中海贫血IVS-Ⅱ654(C→T)上游引物(2)、所述探针以及下游引物;所述上游引物(1)为:5’-TTGCATATTCATAATCTCCCTAC-3’;所述上游引物(2)为:5’-ACAGTGATAATTTCTGGGTTAAGCT-3’;所述探针为:5’-(FAM)TTTCTGCATATAAATTGTAACTGAT(DABCYL)-3’;所述下游引物为:5’-AGGGCCTAGCTTGGACTCAG-3’。本专利技术β-地中海贫血IVS-Ⅱ654(C→T)检测试剂盒检测标本,仅需3小时即可完成检测,同时检测β-地中海贫血IVS-Ⅱ654(C→T)特异性较强,有效克服了β-地中海贫血PCR-反向点杂交法、基因检测技术中存在的周期长、操作繁琐,需要送到专门检测单位的缺点。【专利说明】β -地中海贫血IVS-1I 654 (C - T)检测试剂盒及ARMS-QPCR检测方法
本专利技术属于分子生物学和遗传学领域,更具体地,涉及一种β-地中海贫血IVS-1I 654 (C-T)检测试剂盒及β -地中海贫血IVS-1I 654 (C-T)点突变ARMS-QPCR检测方法。
技术介绍
β地中海贫血(β-mediterranean anemia)是指β链的合成受部分或完全抑制的一组血红蛋白病。患儿出生时无症状,多于婴儿期发病,生后3~6个月内发病者占50%,偶有新生儿期发病者。发病年龄愈早,病情愈重。严重的慢性进行性贫血,需依靠输血维持生命,3~4周输血I次,随年龄增长日益明显。因本病的病因多为点突变,故常用PCR加ASO才能明确突变点,我国各民族的β地贫基因突变情况有一定差异,南方汉族的突变基因以⑶41-42(-TCTT)、⑶L7(A — Τ)、IVS-11-654 (C — T)和TATA-box28(A — G)为主,占85%~90%。双重杂合子的突变组合可达近100种,β-地中海贫血IVS-1I 654 (C-T)是众多β -地中海贫血突变位点中的一种。扩增阻滞突变系统(amplificationrefractory mutation system),又名等位基因特异PCR(allele specific PCR,ASPCR)是验证性检测DNA序列变化的经典方法之一,典型的ARMS过程包含两个PCR扩增过程,引物有两对,它们的的区别在于3’端不同,一条引物能与“正常”的靶DNA互补,另一条与“非正常”的靶DNA互补,因此两个扩增反应只能扩增“特定”的DNA模板,因此要求3’末端核苷酸必须等位特异。目前对该β_地中海贫血检测方法一般是采用PCR-反向点杂交法、基因检测技术等明确b珠蛋白基因的异常位点,检测时间长,而且操作繁琐,基因检测技术需要送到专门检验单位去检查,费时费力。
技术实现思路
本专利技术解决了现有技术中的不足,提供一种灵敏度高、误差小、安全快速检测的β -地中海贫血IVS-1I 654 (C — Τ)检测试剂盒及β -地中海贫血IVS-1I 654 (C — Τ)点突变的ARMS-QPCR检测方法。本专利技术的技术方案为:一种β -地中海贫血IVS-1I 654 (C — Τ)检测试剂盒,其包括PCR反应液(I )、PCR反应液(2)和混合酶液,所述PCR反应液(I)包括β -地中海贫血IVS-1I 654 (C-T)上游引物(I)、探针以及下游引物;所述PCR反应液(2)包括β-地中海贫血IVS-1I 654 (C-T)上游引物(2)、所述探针以及下游引物; 所述上游引物(I)为:5,- TTGCATATTCATAATCTCCCTAC -3,; 所述上游引物(2)为:5’ - ACAGTGATAATTTCTGGGTTAAGCT -3’ ;所述探针为:5’ -(FAM) TTTCTGCATATAAATTGTAACTGAT (DABCYL)-3’; 所述下游引物为:5’ - AGGGCCTAGCTTGGACTCAG -3’。在本专利技术的一个较佳实施例中,进一步包括,在对所述上游引物(I )、上游引物(2)、探针以及下游引物进行引物设计时,所述上游引物(I)和上游引物(2)的3’末端与待检位点碱基匹配与错配,共用下游引物和探针;所述上游引物(I)和上游(2)的3’末端倒数第2位碱基错配,共用下游引物和探针。在本专利技术的一个较佳实施例中,进一步包括,所述碱基错配方式为A — T或G — C互换。在本专利技术的一个较佳实施例中,进一步包括,其还包括β-地中海贫血IVS-1I 654(C-T)的阴性对照液和阳性对照品,所述阴性对照液为不含有β-地中海贫血IVS-1I 654(C — Τ)基因的Tris-EDTA缓冲液,其浓度为0.0lM~0.015Μ, pH为8.00~8.02 ;所述阳性对照品为β -地中海贫血IVS-1I 654 (C — Τ)突变型DNA合成阳性模板和β -地中海贫血IVS-1I 654野生型DNA合成阳性模。。在本专利技术的一个较佳实施例中,进一步包括,所述上游引物(I)的浓度为50 μΜ,其体积为0.1~0.2 μ I /管;所述上游引物(2)的浓度为50 μ Μ,其体积为0.1~0.2 μ I/管;所述下游引物的浓度为50 μΜ,其体积为0.1~0.2μ1 /管;所述探针的浓度为50μ Μ,其体积为0.1~0.2 μ I /管。在本专利技术的一个较佳实施例中,进一步包括,所述PCR反应液(I)和PCR反应液(2)均包括灭菌超纯水、IOXBuffer缓冲液、氯化镁和dNTPs,所述灭菌超纯水的体积为4.8~11.4μ I /管,所述IOX Buffer缓冲液中不含镁离子,其体积为2~4 μ I /管;所述氯化镁的浓度为25mM,其体积为2~4 μ I /管;所述dNTPs的浓度为2.5mM,其体积为2~4 μ I /管。在本专利技术的一个较佳实施例中,进一步包括,所述混合酶液包括DNA聚合酶、灭菌超纯水和显色液,所述DNA聚合酶为Taq酶,其浓度为5U/ul,体积为00.15~0.3μ I /管;所述灭菌超纯水的体积为1.84~1.68 μ I /管;所述显色液为溴酹兰,其体积为0.01~0.02 μ I / 管。在本专利技术的一个较佳实施例中,进一步包括,一种使用本专利技术所述的地中海贫血IVS-1I 654 (C — Τ)检测试剂盒的β -地中海贫血IVS-1I 654 (C — Τ)点突变的ARMS-QPCR检测方法,包括如下步骤: (1)提取β-地中海贫血IVS-1I 654 (C — Τ)的DNA样品; (2)将步骤(I)中获得的DNA样品进行荧光定量PCR检测,荧光定量PCR检测步骤中使用该β -地中海贫血IVS-1I 654 (C — Τ)检测试剂盒。在本专利技术的一个较佳实施例中,进一步包括,步骤(2)中所述的荧光定量PCR检测的条件为:50 ~55?:2 ~5min ;94 ~95?:2 ~3min ; 本文档来自技高网
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【技术保护点】
一种β?地中海贫血IVS?Ⅱ654(C→T)检测试剂盒,其包括PCR反应液(1)、PCR反应液(2)和混合酶液,其特征在于,所述PCR反应液(1)包括β?地中海贫血IVS?Ⅱ654(C→T)上游引物(1)、探针以及下游引物;?所述PCR反应液(2)包括β?地中海贫血IVS?Ⅱ654?(C→T)上游引物(2)、所述探针以及下游引物;所述上游引物(1)为:5’??TTGCATATTCATAATCTCCCTAC??3’;所述上游引物(2)为:5’??ACAGTGATAATTTCTGGGTTAAGCT??3’;所述探针为:5’?(FAM)?TTTCTGCATATAAATTGTAACTGAT?(DABCYL)?3’;所述下游引物为:5’??AGGGCCTAGCTTGGACTCAG??3’。

【技术特征摘要】

【专利技术属性】
技术研发人员:龚剑
申请(专利权)人:苏州发士达生物科技有限公司
类型:发明
国别省市:

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