再测序病原菌微阵列制造技术

技术编号:9001212 阅读:193 留言:0更新日期:2013-08-02 21:20
本发明专利技术是关于通过采用DNA再测序微阵列进行病原菌探测和鉴别的方法。本发明专利技术也提供了再测序微阵列芯片,用于生物样本中存在的病原菌的区分诊断和血清类型分类。本发明专利技术进一步提供了探测生物样本中存在病原菌和鉴别病原菌的方法。本发明专利技术也提供了计算机实施生物序列辨识器(CIBSI)系统和依据至少一种筛选参数从生物序列数据中筛选子序列的方法。至少一种筛选参数对应从类似的筛选中获得有意义结果的一种可能性。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术提供了采用DNA再测序微阵列进行病原菌检测。优选,本专利技术提供了多个病原菌的同时测定方法。本专利技术也提供了再测序微阵列和区分诊断用的微阵列芯片和生物样本中紧密相关病原菌间的细微区别。本专利技术进一步提供了检测生物样本中病原菌的存在和识别的方法。本专利技术能够诊断和监视已知病原菌序列和由于未预期序列突变而被确定的病原菌,以及这种病原菌的混合物。联合一些扩增策略,再测序允许同时临床诊断和血清类型分类的传统监测试验、抗生素耐药性、遗传漂变/遗传漂移分析、法医、和生物恐怖事件的快速探测。本专利技术也是关于多种自动筛选体系,该体系包括采用可供选择的生成核酸或蛋白序列的任意方法自动子序列筛选体系。该系统适用于自动筛选由再测序DNA微阵列获得的不完全核苷酸序列数据的子序列,依据系统预先确定的参数或使用者确定的参数,采用一种或一种以上相似性搜索算法来筛选最适于对比预先确定数据库序列收集的序列子集。本专利技术的实施方案也能够进一步分析和表达由一种或一种以上子序列提交的相似搜索得到的相关结果。这里描述的本专利技术的主题分辨序列标记的组合,该序列标记组合源于多个序列靶点(例如,微生物)本文档来自技高网...

【技术保护点】
腺病毒株的基因组序列,选自由Ad3、Ad3FS_navy、Ad4、Ad4vaccine、Ad4FS_navy、Ad4FS_AF、Ad5FS、Ad7、Ad7FS_navy、Ad7vaccine、Ad16、Ad1、和Ad21和其片段组成的组。

【技术特征摘要】
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【专利技术属性】
技术研发人员:布赖恩·艾格埃里克·H·汉森拉塞尔·P·克鲁泽洛克林宝钏罗伯·罗利司徒登大卫·斯坦杰詹尼弗·约翰逊克拉克·蒂贝特斯德宗·撒奇加里·沃拉伊丽莎白·沃特王征
申请(专利权)人:海军秘书处代表的美国政府
类型:发明
国别省市:

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