【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】
本专利技术主要涉及以减少和/或治愈临床或工业细菌生物膜的方法和组合物。
技术介绍
哺乳动物体内生物膜中存在的细菌引发了约三分之二的慢性/复发性疾病。这些生物膜由被外部“粘液”保护的细菌组成，所述粘液通常主要由DNA组成，其阻碍天然免疫及获得性免疫系统、抗生素和其它抗菌剂从获取入口到达所述生物膜内细菌，使得从机体清除所述感染十分困难。此外，所述生物膜可作为未来的通常具有致死后果的急性感染的储存器。已发现DNABII家族蛋白中的至少一种蛋白在所有已知真细菌中存在，并被发现自然存在于所述细菌细胞的外部。当它们引起强烈的天然免疫反应时，其感染结果是宿主个体不能自然产生针对家族成员的特异性抗体。细菌生物膜带来的主要问题是宿主免疫系统和/或抗生素及其它抗菌剂无法获得接近所述生物膜内受保护的细菌的途径。生物膜也存在于工业环境中。例如，生物膜广泛影响了从生产领域到加油站储罐的石油处理问题。在该领域，硫酸盐还原生物膜细菌产生硫化氢(酸性油)。在生产管道中，生物膜活性产生了阻塞滤器及管口的粘液。生物膜及生物膜有机体也引起了管道及石油处理设备的腐蚀。这些问题可出现于整个石油或天然气生产设备，直至在终产物储存罐表面也发现污染和腐蚀性生物膜有机体的地步。在家庭中，生物膜被发现存在于支持微生物生长的物体内或任意表面上，如谷物内、食品表面、卫生间内以及游泳池和温泉中。生物膜广泛影响了家庭以及工业的水处理。它们能够生长在处理设备表面并妨碍该设备的性能，如热传导的降低或堵塞过滤器和膜。生长在冷却塔填料上的生物膜可以增加足够的重量以引起所述填料的塌陷。生物膜甚至引起高度专化不锈钢的腐蚀。水...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】2010.03.29 US 61/318,743;2010.05.21 US 61/347,362;1.种用于抑制、竞争或中和DNABII多肽或蛋白质与微生物DNA结合的方法，包含所述DNABII多肽或蛋白质或所述微生物DNA与干扰剂的接触，从而抑制、竞争或中和所述DNABII蛋白质或多肽结合所述微生物DNA。2.种用于抑制、预防或分解微生物生物膜的方法，包括所述生物膜与干扰剂的接触，从而抑制、预防或分解所述微生物生物膜。3.利要求1或2的方法，其中所述接触是在体外或体内。4.种用于抑制、预防或分解受试者中生物膜的方法，包括给所述受试者施用有效量的干扰剂，从而抑制、预防或分解所述微生物生物膜。5.种用于抑制、预防或治疗在受试者中产生生物膜的微生物感染，包含给所述受试者施用有效量的干扰剂，从而抑制、预防或治疗在受试者中产生生物膜的微生物感染。6.利要求1-5任一项的方法，其中所述干扰剂是下述组的: (a)分离或重组的整合宿主因子(IHF)多肽或其片段或等价物； (b)分离或重组的来源于E.coli株系U93的组蛋白样蛋白(HU)多肽或其片段或等价物； (c)分离或重组的表8、表9A、表9B、表10所确定的蛋白或多肽或图6所确定的DNA结合肽，或其片段或等价物； (d)分离或重组的SEQID N0.1至340的多肽，或其片段或等价物； (e)分离或重组的SEQID N0.6_11、28、29、42_100、表8的C末端多肽或表10所确定的那些C末端多肽或其片段或等价物； (f)与整合宿主因子竞争性结合微生物DNA的多肽或多核苷酸； (g)类似Holliday交叉的四路交叉多核苷酸，类似复制叉的三路交叉多核苷酸，具有固有柔性的多核苷酸或弯曲的多核苷酸； (h)编码(a)至(f)中任意一种的分离或重组的多核苷酸，或SEQID N0.36的分离或重组的多核苷酸或其等价物，或在严格条件下与所述多核苷酸杂交的多核苷酸、其等价物或互补分子； (i)特异性识别或结合(a)至(f)中任一项的抗体或抗原结合片段，或其每种抗体或抗原结合片段的等价物或片段； U)编码(i)中所述抗体或抗原结合片段的分离或重组的多核苷酸或其互补链；或 (k)与DNABII蛋白或多肽竞争性结合微生物DNA的小分子。7.利要求1-6任一项的方法，其中所述干扰剂是分离或重组的DNABII多肽或其片段或等价物。8.利要求7的方法，其中所述DNABII多肽是IHF多肽或其片段、IHF多肽的C末端片段、或其等价物。9.利要求7的方法，其中所述DNABII多肽是HU多肽或其片段、HU多肽的C末端片段、或其等价物。10.利要求4-9任一项的方法，进一步包含给所述受试者施用有效量的一种或多种抗菌剂、DNA酶、抗体、抗原肽或佐剂。11.利要求4-10任一项的方法，其中所述受试者是非人类动物或人类患者。12.利要求1-11任一项的方法，其中所述微生物DNA来自表8所确定的微生物。13.利要求4-12任一项的方法，其中所述试剂通过包括外敷、透皮、经皮、舌下、直肠、阴道、眼、皮下、肌肉内、腹膜内、尿道、鼻内、通过吸入或口服的方法给药。14.利要求4-12任一项的方法，其中所述受试者是儿科患者并且所述试剂以用于儿科患者的配方给药。15.有此需要的受试者体内诱导免疫应答或赋予被动免疫的方法,包括给所述受试者施用有效量的一种或多种下述组的试剂: (a)分离或重组的整合宿主因子(IHF)多肽，或其片段或等价物； (b)分离或重组的来源于E.coli株系U93的组蛋白样蛋白(HU)多肽或其片段或等价物； (c)分离或重组的表8、表9A、表9B、表10所确定的蛋白或多肽或图6所确定的DNA结合肽，或其片段或等价物； (d)分离或重组的SEQID N0.1至340的多肽，或其片段或等价物； (e)分离或重组的SEQID N0.6-11、28、29、42-100、表8的C末端多肽或表10所确定的那些C末端多肽或其片段或等价物； (f)编码(a)-(e)中任一项的分离或重组的多核苷酸或SEQID N0.36的分离或重组的多核苷酸或其等价物，或在严格条件下与所述多核苷酸杂交的多核苷酸、其等价物或其互补分子； (g)特异性识别或结合(a)-(e)中任一项的抗体或抗原结合片段，或其等价物或片段； (h)编码(g)中的所述抗体或抗原结合片段的分离或重组的多核苷酸； (i)以(a)-(e)中任一项冲击的抗原呈递细胞；以及 (i)以一种或多种编码(a)-(e)中任一项的多核苷酸转染的抗原呈递细胞。16.利要求15的方法，其中所述试剂包含分离或重组的DNABII多肽或者其片段或等价物。17.利要求16的方法，其中所述DNABII多肽是IHF多肽或其片段、IHF多肽的C末端片段、或其等价物。18.利要求16的方法，其中所述DNABII多肽是HU多肽或其片段、HU多肽的C末端片段、或其等价物。19.利要求15-18任一项的方法，进一步包含给所述受试者施用有效量的一种或多种抗菌剂、DNA酶、抗体、抗原肽或佐剂。20.利要求15-19任一项的方法，其中所述受试者是非人类动物或人类患者。21.利要求15-20任一项的方法，其中所述分离或重组的多核苷酸来自表8所确定的微生物。22.利要求15-21任一项的方法，其中所述试剂通过包括外敷、透皮、经皮、舌下、直肠、阴道、眼、皮下、肌肉内、腹膜内、尿道、鼻内、通过吸入或口服的方法给药。23.利要求15-22任一项的方法，其中所述受试者是儿科患者并且所述试剂以用于儿科患者的配方给药。24.本由选自SEQID N0.1_5、或12_27、30_35、101-340的氨基酸序列或图6所确定的DNA结合肽或者其片段或等价物组成的分离或重组的多肽。25.含SEQID N0.1或2的分离或重组的多肽，条件是所述多肽不是SEQ IDNOS.6-ll、28、29 或 42-100。26.含SEQID N0.3、4或5的分离或重组的多肽，条件是所述多肽不是SEQ IDNOS.6-11、28、29 或 42-100。27.含SEQID N0.12、14、16、18、20、22、24、26、30或32的分离或重组的多肽，条件是所述多肽不是 SEQ ID N0S.6-11、28、29 或 42-100。28.含SEQID N0.13、15、17、19、21、23、25、27、31或33的分离或重组的多肽，条件是所述多肽不是 SEQ ID N0S.6-11、28、29 或 42-100。29.述组的分离或重组的多肽: 具有SEQ ID N0.12和13的多肽； 具有SEQ ID N0.14和15的多肽； 具有SEQ ID N0.16和17的多肽； 具有SEQ ID N0.18和19的多肽； 具有SEQ ID N0.20和21的多肽； 具有SEQ ID N0.23和24的多肽； 具有SEQ ID N0.25和26的多肽； 具有SEQ ID N0.30和31的多肽； 具有SEQ ID N0.32和33的 多肽； 具有SEQ ID N0.34和35的多肽； 具有SEQ ID N0.337和338的多肽；或 具有SEQ ID N0.339和340的多肽； 条件是所述多肽不是IHFa、IHF β或SEQ ID N0.6至11、28、29，或42至100中任意一个的野生型。30.述组的分离或重组的多肽: 基本由SEQ ID N0.12和13组成的多肽； 基本由SEQ ID N0.14和15组成的多肽； 基本由SEQ ID N0.16和17组成的多肽； 基本由SEQ ID N0.18和19组成的多肽； 基本由SEQ ID N0.20和21组成的多肽； 基本由SEQ ID N0.23和24组成的多肽； 基本由SEQ ID N0.25和26组成的多肽； 基本由SEQ ID N0.30和31组成的多肽； 基本由SEQ ID N0.32和33组成的多肽； 基本由SEQ ID N0.34和35组成的多肽； 基本由SEQ ID N0.337和338组成的多肽；或 基本由SEQ ID N0.339和340组成的多肽； 条件是所述多肽不是IHFa、IHF β或SEQ ID N0.6至11、28、29，或42至100中任意一个的野生型。31.利要求24-30中任一项的分离或重组多肽的片段或等价物。32.含两种或多种的权利要求22-31中任一项的分离或重组多肽的分离或重组多肽。33.码权利要求24-32中任一项的多肽的分离或重组的多核苷酸或其互补分子。34.含权利要求33所述分离或重组的多核苷酸的载体。35.含权利要求24-32中任一项的分离或重组多肽、权利要求33的分离或重组多核苷酸或权利要求34的载体的分离的宿主细胞。36.含权利要求24-32中任一项分离或重组多肽的分离的抗原呈递细胞，其中所述多肽存在于所述细胞的表面。37.利要求36的分离的抗原呈递细胞，其中所述抗原呈递细胞是树突状细胞。38.异性识别或结合权利要求24-32中任一项的分离或重组多肽的抗体或抗原结合片段，或编码所述抗体或抗原结合片段的分离或重组的多核苷酸。39.利要求34的抗体，其中所述抗体选自多克隆抗体、单克隆抗体、人源化抗体、人类抗体、抗体衍生物、镶嵌抗体、双抗体、抗体衍生物、重组人类抗体、嵌合抗体或抗体片段。40.利要求39所述的抗体，其中所述抗体是单克隆抗体。41.产权利要求40所述抗体的杂交瘤细胞系。42.种组合物，包含运载体以及一种或多种的: (a)权利要求24-32中任一项 的分离或重组的多肽； (b)权利要求33所述的分离或重组的多核苷酸； (c)权利要求34所述的载体； (d)权利要求35-37中任一项的分离的宿主细胞；或 (e)权利要求38-40中任一项的抗体。43.利要求42所述的组合物，进一步包含一种或多种佐剂、抗原肽或抗菌剂。44.利要求42或43所述的组合物，其中所述运载体选自液体载体、药学上可接受的载体、固相载体、药学上可接受的多聚物、脂质体、胶束、植入物、支架、糊剂、凝胶剂、牙科植入物或医用植入物。45.利要求42-44中任一项的组合物，配制用于给药人类患者或非人类动物。46.利要求42-44中任一项的组合物，配制用于通过包括外敷、透皮、经皮、舌下、直肠、阴道、眼、皮下、肌肉内、腹膜内、尿道、鼻内、通过吸入或口服的方法给药。47.利要求42-46中任一项的组合物，配置用于儿童患者。48.含下述组中任一种或多种试剂的试剂盒: (a)权利要求24-32中任一项的分离或重组的多肽； (b)权利要求33所述的分离或重组的多核苷酸； (c)权利要求34所述的载体； (d)权利要求35-37中任一项的分离的宿主细胞； (e)权利要求38-40中任一项的抗体； (f)权利要求42所述的组合物； (g)分离或重组的整合宿主因子(IHF)多肽或者其片段或等价物； (h)分离或重组的来源于E.coli株系U93的组蛋白样蛋白(HU)多肽或其片段或等价物； (i)分离或重组的表8、表9A、表9B、表10所确定的蛋白或多肽或图6所确定的DNA结合肽，或其片段或等价物； (j)分离或重组的SEQ ID N0.1至340的多肽，或其片段或等价物； (k)分离或重组的SEQ ID N0.6-11、28、29、42-100、表8的C末端多肽或表10所确定的那些C末端多肽或其片段或等价物； (I)与整合宿主因子竞争性结合微生物DNA的多肽； (m)类似Holliday交叉的四路交叉多核苷酸，类似复制叉的三路交叉多核苷酸，具有固有柔性的多核苷酸或弯曲的多核苷酸； (η)编码(g)-(l)中任一项的分离或重组的多核苷酸； (ο)特异性识别或结合(g)-(l)中任一项的抗体或抗原结合片段，或者其等价物或片段； (P)编码(ο)中所述抗体或抗原结合片段的分离或重组的多核苷酸；以及 (q)与DNABII蛋白或多肽竞争结合微生物DNA的小分子，及使用说明。49.利要求48所述的试剂盒，进一步包含一种或多种佐剂、抗原肽、DN酶、抗体或抗菌剂。50.利要求48或49的试剂盒，进一步包含选自液体载体、药学上可接受的载体、固相载体、药学上可接受的多聚物、脂质体、胶束、植入物、支架、糊剂、凝胶剂、牙科植入物或医用植入物的运载体。51.定调节DNABII蛋白质或多肽与含有相同微生物DNA样品中的微生物DNA相结合的试剂的方法，包括候选试剂与所述样品的接触并测试所述蛋白质或多肽与所述DNA的结八口 ο52.利要求51所述的方法，其中所述试剂通过抑制、预防或中和DNABII蛋白质或多肽与微生物DNA的结合调节所述结合。53.种选自下组的试剂的应用: (a)权利要求24-32中任一项的分离或重组的多肽； (b)权利要求33所述的分离或重组的多核苷酸； (c)权利要求34所述的载体； (d)权利要求35-37中任一项的分离的宿主细胞； (e)权利要求38-40中任一项的抗体； (f)权利要求42所述的组合物； (g)分离或重组的整合宿主因子(IHF)多肽或者其片段或等价物； (h)分离或重组的来源于E.coli株系U93的组蛋白样蛋白(HU)多肽或其片段或等价物； (i)分离或重组的表8、表9A、表9B、表10所确定的蛋白或多肽或图6所确定的DNA结合肽，或其片段或等价物； (j)分离或重组的SEQ ID N0.1至340的多肽，或其片段或等价物； (k)分离或重组的SEQ ID N0.6-11、28、29、42-100、表8的C末端多肽或表10所确定的那些C末端多肽或其片段或等价物； (I)与整合宿主因子竞争性结合微生物DNA的多肽； (m)类似Holliday交叉的四路交叉多核苷酸，类似复制叉的三路交叉多核苷酸，具有固有柔性的多核苷酸或弯曲的多核苷酸； (η)编码(g)-(l)中任一项的分离或重组的多核苷酸； (ο)特异性识别或结合(g)-(l)中任一项的抗体或抗原结合片段，或者其等价物或片段； (P)编码(ο)中所述抗体或抗原结合片段的分离或重组的多核苷酸；以及 (q)与DNABII蛋白或多肽竞争结合微生物DNA的小分子。54.利要求6或15的方法，其中所述抗体是单克隆抗体或其片段。55.利要求54所述的方法，其中所述单克隆抗体或其片段是人类抗体、人源化抗体、重组抗体、嵌合抗体、镶嵌抗体、修饰的抗体或抗体衍生物。56.利要求55所述的方法，其中所述抗体是通过VH和/或VL⑶R1、⑶1 2和/或CDR3区域内保守氨基酸突变修饰的。57.利要求55所述的方法，其中所述抗体是通过改变Fe铰链区域的半胱氨酸残基数量或通过Fe铰链区域的保守氨基酸突变修饰的。58.利要求55所述的方法，其中所述单克隆抗体或其片段是化学修饰的。59.利要求58所述的方法，其中所述单克隆抗体或其片段是聚乙二醇化的。60.利要求58所述的方法，其中所述单克隆抗体或其片段偶联血清蛋白。61.利要求60所述的方法，其中所述血清蛋白是人血清白蛋白。62.利要求55所述的方法，其中所述单克隆抗体或其片段偶联诊断试剂。63.利要求62所述的方法，其中所述诊断试剂选自酶、辅基复合物、荧光材料、发光材料、生物发光材料、放射性材料、正电子发射金属以及非放射性的顺磁金属离子。64.利要求63所述的方法，其中所述酶选自辣根过氧化物酶、碱性磷酸酶、β半乳糖苷酶以及乙酰胆碱酯酶。65.利要求63所述的方法，其中所述辅基复合物选自链霉亲和素/生物素以及亲和素/生物素。66.利要求63所述的方法,其中所述突光材料选自伞形酮、突光素、异硫氰酸突光素、罗丹明、二氯三唑嗪基胺荧光素、丹磺酰...
【专利技术属性】
技术研发人员：史蒂文·D·古德曼，劳伦·O·巴凯勒特兹，
申请(专利权)人：南加利福尼亚大学，全国儿童医院有限公司，
类型：
国别省市：
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