【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及生物信息学，尤其涉及单细胞分类和筛选方法以及用于所述方法的装置。
技术介绍
不同个体之间，个体的不同组织之间，甚至同一组织的不同部位在基因表达、拷贝数变异、表观遗传等方面都存在显著差异。细胞之间也存在异质性，即使是体外培养遗传背景完全相同的细胞群体。对于干细胞或前体细胞，因为任何状态改变都是可遗传的，细胞异质性尤为明显。为了更好地研究细胞生物学，揭示细胞异质性的规律，非常需要开发应用于单个细胞研究的技术方法，因此有学者提出“单细胞分析(SCA) ”概念，从“组学(Omics)I度进行阐述。单细胞分类和筛选为单细胞分析提供了重要基础。·单细胞分类可以有效应用于各种干细胞分化过程的研究中，如肿瘤干细胞、胚胎干细胞的定向分化、造血干细胞的研究中，需要筛选不同分化阶段的干细胞，进行各种干细胞的检测。在耐药性研究中，需要对给药不同时期的细胞进行精确分类，从而进一步分析该细胞亚群的耐药性和耐药基因，例如可进行癌症病人的多药耐药性及多药耐药基因与药物滥用、药物耐受、药物依赖的关系的研究。同样地，在药物靶点基因的筛选中，由于药物与细胞，特别是敏感细胞相互作用，将引...
【技术保护点】
单细胞分类方法，包括以下步骤：将每个单细胞样本经测序得到的reads结果与参考基因组序列进行比对，并将比对结果进行数据过滤；根据过滤后的数据确定每个单细胞样本的一致基因型，并将所有单细胞样本的一致基因型保存为SNP数据集；从已保存的SNP数据集提取与参考基因组SNP数据集位置对应的位点的基因型文件；挑选细胞突变SNP位点，并根据细胞突变SNP位点的基因型文件，对细胞进行分类。
【技术特征摘要】
【专利技术属性】
技术研发人员：徐讯，鲍莉，何伟明，侯勇，陶晔，
申请(专利权)人：深圳华大基因科技有限公司，深圳华大基因研究院，
类型：发明
国别省市：
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