本发明专利技术公开了一种ARID1A基因及其编码蛋白产物的应用，用于制备诊断肿瘤的产品和治疗肿瘤的药物。本发明专利技术的ARID1A基因及其编码的蛋白产物可作为诊断肿瘤的特异性标志基因，使肿瘤的诊断更加快速、准确；本发明专利技术的ARID1A基因及其编码的蛋白产物还可用于制备抑制肿瘤细胞生长、转移的药物，为肿瘤的治疗提供新的途径。
【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及肿瘤的诊断和治疗领域，特别涉及ARIDlA基因及其编码的蛋白产物在肿瘤的诊断和治疗中的应用。
技术介绍
肝癌每年导致60万人死亡，是严重威胁我国人民健康的恶性肿瘤之一。肝癌发病涉及多种因素，包括こ肝病毒、丙肝病毒、酒精、黄曲霉素污染等。在我国肝癌病人中，こ肝病毒感染是主要因素。癌基因的激活、抑癌基因的失活是肝癌发病的分子机制。尽管之前的研究已发现了肝癌中抑癌基因，例如TP53的失活，癌基因的激活，例如P-catenin、gpl30都是体细胞突变所导致的，但肝癌发生发展中的遗传学事件还不是很清楚。已知遗传学改变是肿瘤发生、转移所必须的，但是目前在临床肝癌样本中仅发现少数基因具有相对低频 率的体细胞突变，提示还可能存在其它重要基因的体细胞突变能够导致肝癌发生及转移。人ARIDlA基因定位于人类染色体lp35. 3，编码蛋白为SWI/SNF家族成员之一。SWI/SNF家族成员蛋白具有解螺旋酶和ATP酶活性，能够通过改变特定基因附近染色质结构而调控这些基因的转录。ARIDlA蛋白作为ATP依赖性染色质重塑复合物SWI/SNF中的成员之一，对于正常染色质上处于静止状态的基因转录激活是必须的。ARIDlA蛋白至少具有两个重要的保守功能结构域DNA结合结构域，特异性结合富含AT碱基的DNA序列；ARID1A蛋白C-端结构域，激活糖皮质激素受体依赖的转录活性。普遍认为ARIDlA基因编码的蛋白产物赋予SWI/SNF复合物特异性，通过蛋白DNA或蛋白蛋白相互作用而募集该复合物至染色体靶位置。目前已经发现了 ARIDlA基因的两个转录变异体，编码两个不同的蛋白产物。最近的研究(ARID1Amutations in endometriosis-associated ovariancarcinomas，Wiegand KC et al.，N Engl J Med.，Oct 14,2010 ；Frequent mutations ofchromatin remodeling gene ARIDlAin ovarian clear cell carcinoma,Jones S et al.，Science, Oct 8,2010)发现，ARIDlA基因作为ー个抑癌基因，在半数以上的卵巢癌中频繁发生突变。
技术实现思路
本专利技术要解决的技术问题之ー是提供ー种ARIDlA基因及其编码蛋白产物在制备诊断肿瘤的产品中的应用。本专利技术要解决的技术问题之ニ是提供ー种ARIDlA基因及其编码蛋白产物在制备治疗肿瘤的药物中的应用。本专利技术要解决的技术问题之三是提供一种用于抑制肿瘤细胞的生长和/或转移的药物组合物。本专利技术要解决的技术问题之四是提供ー种包含ARIDlA基因的载体。本专利技术要解决的技术问题之五是提供ー种包含上述载体的遗传工程化的宿主细胞。本专利技术要解决的技术问题之六是提供两对用于制备治疗肿瘤药物的ARIDlA基因的 siRNA。本专利技术要解决的技术问题之七是提供ー对用于特异性扩增ARIDlA基因的引物。为解决上述技术问题，本专利技术采用了如下技术方案在本专利技术的第一方面，提供了 ARIDlA基因及其编码的蛋白产物在制备诊断肿瘤的产品中的应用。所述诊断肿瘤的产品包括用DNA序列分析法诊断肿瘤的产品。所述用DNA序列分析法诊断肿瘤的产品包括特异性扩增ARIDlA基因的引物与测序引物。在本专利技术的第二方面，提供了ー种载体，它包含ARIDlA基因。所述ARIDlA基因包 括与目前国际公共核酸序列数据库GeneBank中ARIDlA基因(NM_006015，NM_139135)DNA序列具有70%以上同源性，且编码相同功能蛋白质的DNA序列。在本专利技术的第三方面，提供了ー种含有上述载体的遗传工程化的宿主细胞。在本专利技术的第四方面，提供了一种用于抑制肿瘤细胞生长和/或转移的药物组合物，该药物组合物含有安全有效量的ARIDlA蛋白质及药学上可接受的载体。在本专利技术的第五方面，提供了 ARIDlA基因及其编码的蛋白产物在制备治疗肿瘤的药物中的应用。在本专利技术的第六方面，提供了两对用于制备治疗肝癌药物的ARIDlA基因的siRNA，其中，ー对siRNA的正义链具有如SEQ ID NO :33所示的序列，反义链具有如SEQ IDNO 34所示的序列；另ー对siRNA的正义链具有如SEQ ID NO 35所示的序列，反义链具有如SEQ ID NO 36所示的序列。在本专利技术的第七方面，提供了ー对特异扩增ARIDlA基因的引物，该引物对的上游引物序列具有如SEQ ID NO :1所示序列或其互补序列，下游引物序列具有如SEQ ID NO 2所示序列或其互补序列。本专利技术的ARIDlA蛋白质包括ARIDlA保守性变异蛋白质、其活性片段或其活性衍生物，或其他具有与ARIDlA蛋白质相同功能的变异形式。这些变异形式包括(但并不限于)若干个(通常为I 50个，较佳地I 30个，更佳地I 20个，最佳地I 10个)氨基酸的缺失、插入和/或取代，以及在C末端和/或N末端添加ー个或数个(通常为20个以内，较佳地为10个以内，更佳地为5个以内)氨基酸。例如，在本领域中，用性能相近或相似的氨基酸进行取代时，通常不会改变蛋白质的功能。又比如，在C末端和/或N末端添加一个或数个氨基酸通常也不会改变蛋白质的功能。本专利技术的ARIDlA蛋白质的变异形式包括同源序列、保守性变异体、等位变异体、天然突变体、诱导突变体、在高或低的严紧条件下能与ARIDlA的DNA杂交的DNA所编码的蛋白，以及利用抗ARIDlA蛋白质的抗血清获得的多肽或蛋白。本专利技术还提供了其他蛋白质，如包含ARIDlA蛋白质或其片段的融合蛋白。除了几乎全长的蛋白质外，本专利技术还包括ARIDlA蛋白质的可溶性片段。通常，该片段具有ARIDlA多肽序列的至少约10个连续氨基酸，通常至少约30个连续氨基酸，较佳地至少约50个连续氨基酸，更佳地至少约80个连续氨基酸，最佳地至少约100个连续氨基酸。上述“ ARIDlA保守性变异蛋白质”指与ARIDlA蛋白氨基酸序列相比，有至多10个，较佳地至多8个，更佳地至多5个氨基酸被性质相似或相近的氨基酸所替换而形成蛋白质。本专利技术还包括ARIDlA蛋白或多肽的类似物。这些类似物与天然ARIDlA蛋白质的差别可以是氨基酸序列上的差异，也可以是不影响序列的修饰上的差异，或者兼而有之。这些蛋白质包括天然或诱导的遗传变异体。诱导变异体可以通过各种技术得到，如通过辐射或暴露于诱变剂而产生随机诱变，还可通过定点诱变法或其他已知分子生物学的技木。类似物还包括具有不同于天然L-氨基酸的残基(如D-氨基酸)的类似物，以及具有非天然存在的或合成的氨基酸(如P、￥_氨基酸)的类似物。应理解，本专利技术的蛋白质并不限于上述列举的代表性的蛋白质。修饰(通常不改变一级结构)形式包括体内或体外的蛋白质的化学衍生形式如こ酰化或羧基化。修饰还包括糖基化，如那些在蛋白质的合成和加工中或进ー步加工步骤中进行糖基化修饰而产生的蛋白质。这种修饰可以通过将多肽暴露于进行糖基化的酶(如哺乳动物的糖基化酶或去糖基化酶)而完成。修饰形式还包括具有磷酸化氨基酸残基(如磷酸酪氨酸，磷酸丝氨酸，磷酸苏氨酸)的序列。还包括被修饰从而提高了其抗蛋白水解性能或优化了溶解本文档来自技高网...
【技术保护点】
一种ARID1A基因及其编码蛋白产物的应用，其特征在于：所述ARID1A基因及其编码的蛋白产物在制备诊断肿瘤的产品中的应用。
【技术特征摘要】
【专利技术属性】
技术研发人员：邓庆，韩泽广，王群，李坤雨，
申请(专利权)人：上海人类基因组研究中心，
类型：发明
国别省市：
还没有人留言评论。发表了对其他浏览者有用的留言会获得科技券。