【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】相关申请的交叉引用本申请要求2009年11月13日提交的美国临时申请No. 61/261，064 ;2009年11月30日提交的美国临时申请No. 61/283，150 ;2010年3月12日提交的美国临时申请No. 61/313，364 ;2010年3月12日提交的美国临时申请No. 61/313，594 ;2010年5月20日提交的美国临时申请No. 61/346,873 ;2010年9月13日提交的美国临时申请No. 61/382，447 ；2010年10月5日提交的美国临时申请No. 61/390，136 ;和2010年10月19日提交的美国临时申请No. 61/394，735的权益。前述全部申请的内容在此通过引用的方式完整并入。序列表本申请含有已经以ASCII格式经EFS-Web提交并且在此通过弓I用方式完整并入的序列表。在2010年11月12日创建的所述ASCII副本命名为I20417W0. txt并且大小是249，096 字节。背景技木癌症代表多种遗传性病灶的表型終点，所述遗传性病灶赋予细胞全部肿瘤发生所需要的生物学特性。实际上，许多癌症(包括例如B细...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】2009.11.13 US 61/261,064;2009.11.30 US 61/283,150;1.一种确定肿瘤或癌细胞或受试者对包括HSP90抑制剂的治疗的响应性的方法,所述受试者具有所述肿瘤或癌细胞或处于具有所述肿瘤或癌细胞的风险，所述方法包括 (i)检测所述肿瘤或癌细胞中ALK、MAPK途径和/或EGFR基因或基因产物中的改变；和/或 ( )评价以下一项或多项a)所述肿瘤或癌细胞组织结构，b)所述受试者的吸烟状态，或c)HSP90在所述肿瘤或癌细胞中的水平或表达，从而确定所述肿瘤或癌细胞对包括HSP90抑制剂的治疗的响应性。2.一种鉴定罹患癌症或肿瘤有或处于罹患癌症或肿瘤的风险的受试者具有对包括HSP90抑制剂的治疗响应的可能性的方法，所述方法包括以下一项、两项、三项或四项 (i)检测来自所述受试者的样本中ALK、MAPK途径和/或EGF基因或基因中的改变的存在或不存在； ( )检测来自所述受试者的样本中癌性组织结构的存在或不存在； (iii)确定所述受试者的吸烟状态；或 (iv)确定来自所述受试者的样本中HSP90的水平或表达，从而鉴定所述受试者可能或不可能对包括HSP90抑制剂的治疗响应。3.—种监测或预测包括HSP90抑制剂的治疗在受试者中治疗癌症或肿瘤的功效的方法，所述方法包括 (i)检测从所述受试者获得的样本中ALK、MAPK途径和/或EGFR基因或基因产物中的改变的中存在或不存在；和/或 ( )评价以下一项或多项a)来自所述受试者的样本中癌性组织结构的存在或不存在；b)所述受试者的吸烟状态；或c)HSP90的水平或表达；并且 (iii)将在⑴和/或(ii)中检测到的改变或评价结果与参考样本比较，其中所述样本中检测到的改变或评价结果相对于所述参考样本的差异的程度指示或预示所述治疗的功效。4.如权利要求1-3中任一项所述的方法，其中以下一项或多项指示对包括HSP90抑制剂的治疗响应的可能性增加(i)检测所述组织结构中非小细胞肺癌、鳞状细胞或结直肠癌细胞或组织的存在；(ii)鉴定所述受试者为例如具有至少5、10、15或更长包年吸烟史的吸烟者；或(iii)检测升高的HSP90水平或表达。5.如权利要求1-3中任一项所述的方法，其中检测到或存在ALK基因或基因产物中的改变表明所述肿瘤、所述癌细胞或所述受试者对包括HSP90抑制剂的治疗响应的可能性增加。6.如权利要求1-3中任一项所述的方法，其中所述MAPK途径基因或基因产物选自H-Ras、N-Ras、K-Ras、A-Raf、B-Raf (BRAF)、C-Raf、Mek 或 Erk 中一种或多种。7.如权利要求1-3中任一项所述的方法，还包括检测选自EGFR、PIK3CA、PTEN、AKT、TP53 (p53)、CTNNBl ( β -连环蛋白)、APC、KIT、JAK2、NOTCH、FLT3、RSK、ETS、ELK-1 或 SAP-1的一种或多种基因产物中的改变。8.如权利要求6所述的方法，其中检测到或存在MAPK途径基因或基因产物中的改变表明所述肿瘤或癌细胞对包括HSP90抑制剂作为单一药剂的治疗响应的可能性增加。9.如权利要求6所述的方法，其中检测到或存在MAPK途径基因或基因产物中的改变表明所述肿瘤或癌细胞对包括与第二药剂组合的HSP90抑制剂的治疗响应的可能性增加。10.如权利要求5所述的方法，其中检测到或存在ALK基因或基因产物中的改变表明对包括HSP90抑制剂作为单一药剂或组合以抑制、减少或治疗NSCLC肿瘤或癌细胞的治疗响应的可能性增加。11.如权利要求6所述的方法，其中检测到或存在K-Ras基因或基因产物中的改变表明对包括HSP90抑制剂作为单一药剂或组合以抑制、减少或治疗结直肠肿瘤或癌细胞的疗法响应的可能性增加。12.如权利要求6所述的方法，其中检测到或存在B-Raf基因或基因产物中的改变表明对包括HSP90抑制剂作为单一药剂或组合以抑制、减少或治疗结直肠肿瘤或癌细胞的疗法响应的可能性增加。13.如权利要求6所述的方法，其中检测到或存在K-Ras基因或基因产物中的改变任选地与检测到P53基因或基因产物中的改变组合，表明对包括HSP90抑制剂和mTOR抑制剂以抑制、减少或治疗NSCLC肿瘤或癌细胞的治疗响应的可能性增加。14.如权利要求1-3中任一项所述的方法，还包括治疗或预防携带ALK和/或MAPK途径基因或基因产物中的改变的癌症或肿瘤，所述治疗包括将HSP90抑制剂作为单一药剂或组合施用至需要HSP90治疗的受试者。15.一种治疗罹患癌症或肿瘤或处于罹患所述癌症或肿瘤的风险的受试者的方法，所述癌症或肿瘤携带ALK或MAPK途径改变，所述方法包括将HSP90抑制剂作为单一药剂或组合以下述量施用至鉴定为可能从HSP90抑制剂治疗中获益或针对HSP90抑制剂治疗所考查或评价的受试者，所述的量足以在所述受试者中减少或抑制所述肿瘤细胞生长和/或治疗或预防所述癌症。16.如权利要求15所述的方法，其中所述受试者被鉴定为具有以下一项或多项吸烟史；升高的HSP90水平或表达；NSCLC (例如，复发和/或难治性NSCLC) ；NSCLC或SCC细胞或肿瘤；或在接受至少一个先前化疗方案期间或之后正在经历病情进展；是在接受至少一个先前含钼化疗方案期间或之后经历病情进展的NSCLC患者。17.如权利要求15所述的方法，其中通过评价从所述受试者获得的样本以检测ALK、MAPK途径和/或EGFR基因或基因产物的存在，选出所述受试者以用包括HSP90抑制剂的疗法治疗。18.如权利要求3所述的方法，还包括对应于检测到的差异改变单独或组合的HSP90抑制剂的剂量或剂量方案。19.如权利要求18所述的方法，其中，在用所述HSP90抑制剂治疗期间或在治疗已经中止后，从所述受试者获得的样本中存在ALK、MAPK途径和/或EGFR基因或基因产物中的改变或存在癌细胞或组织，表明需要增加作为单一药剂或组合的所述HSP90抑制剂的施用剂量或频率。20.如权利要求2-3所述的方法，其中所述样本从所述受试者收集或获得。21.如权利要求1-3中任一项所述的方法，其中所述基因或基因产物的改变包括以下至少一种细胞遗传异常、非相互易位、重排、染色体内倒位、点突变、缺失、基因拷贝数的变化、基因或基因产物表达的变化。22.如权利要求1-3中任一项所述的方法，其中所述基因或基因产物中的改变包括一种或多种致瘤多肽的表达水平或结构或活性变化中的至少一种。23.如权利要求1-3中任一项所述的方法，其中所述基因或基因产物的改变包括突变致瘤亚型的表达水平、结构或活性的变化，所述突变致瘤亚型因可变剪接事件、移码事件、翻译事件或翻译后事件中一种或多种产生。24.如权利要求5所述的方法，其中所述ALK基因或基因产物中的所述改变选自表I中所列的一种或多种突变ALK多核苷酸分子或多肽。25.如权利要求5所述的方法，其中所述ALK基因或基因产物中的所述改变包括EML4-ALK融合物、KIF5B-ALK融合物、TGF-ALK融合物、NPM-ALK融合物或ALK点突变，所述ALK 点突变包括 F1245I/L、L1204F、A1200V、L1196M、I1170S、T1151M、R1275Q、Fl 174V/C/L、T1087I或K1062M中的一种或多种。26.如权利要求5所述的方法，其中所述一种或多种改变是ALK基因重排。27.如权利要求6所述的方法，其中所述MAPK途径基因或基因产物中的所述改变选自表5中所列的一种或多种突变K-Ras或B-Raf多核苷酸分子或所述多肽。28.如权利要求6所述的方法，其中所述MAPK途径基因或基因产物中的所述改变选自在密码子12、13和/或61中的一种或多种K-Ras突变。29.如权利...
【专利技术属性】
技术研发人员：C·福里茨，E·Y·诺曼特，J·G·派兹，K·A·维斯特，
申请(专利权)人：无限制药股份有限公司，
类型：发明
国别省市：
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