抗体蛋白的分子改造辅助预测方法技术

本发明专利技术涉及一种抗体蛋白的分子改造辅助预测方法，包括以下步骤：(1)扫描抗体与抗原相互作用界面的氨基酸残基；(2)对抗体与抗原相互作用界面上的氨基酸残基进行微环境判断；(3)确定候选改造位点，进行虚拟突变获得抗原与突变抗体复合物体系，计算结合自由能以及突变所造成的结合自由能改变；(4)根据步骤(3)的计算结果，按需求挑选可能对亲和力及特异性有较大影响的作为改造候选位点的氨基酸残基给出结果，从而指导实验。本发明专利技术设计巧妙独特，结合了抗体分子作用界面统计规律，能定性并定量的预测突变后抗体对抗原亲和力的改变，大大提高了预测准确度，适于大规模推广应用。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及抗体蛋白
，特别涉及抗体蛋白的分子改造
，具体是指一种。
技术介绍
单克隆抗体分子因为其分子结构和功能的特点，能够对特定抗原实现特异性，高亲和力的结合，从而在分子免疫、实验室检测、临床诊断以及肿瘤靶向治疗上有着巨大的需求。因此，目的为提高或者降低亲和力的抗体蛋白改造有着巨大的市场需求。但是， 针对抗体分子的改造工作很大程度上受到实验方法的限制，随机性比较大。而应用计算辅助模拟预测方法可以对要改造的抗体分子作用界面氨基酸残基逐一进行计算机上的理论模拟突变，并预测亲和力改变的大小，从而对实验有着直接的指导作用，节约大量时间和成本。目前因为并没有专门为抗体抗原复合物设计的预测模型，大家只能使用常规蛋白相互作用的普适模型。而抗体是一类特殊的蛋白质，其与抗原的结合在亲和力，特异性上有异于普通的蛋白相互作用，所以普适模型的预测准确度远远达不到大家的期望。更为突出的是，抗体结合界面上一般聚集有大量芳香族氨基酸，大量试验证明，这些在抗体蛋白作用界面上富集的芳香族氨基酸残基对于抗原-抗体相互作用有重要的能量贡献。当突变涉及到它们时，亲和力的改变往往差距十几倍，甚至上百倍，普本文档来自技高网...

【技术保护点】
１．一种抗体蛋白的分子改造辅助预测方法，其特征在于，所述的方法包括以下步骤：（１）扫描抗体与抗原相互作用界面的氨基酸残基；（２）对抗体与抗原相互作用界面上的氨基酸残基进行微环境判断；（３）确定候选改造位点，进行虚拟突变获得抗原与突变抗体复合物体系，计算结合自由能以及突变所造成的结合自由能改变；（４）根据步骤（３）的计算结果，按需求挑选可能对亲和力及特异性有较大影响的作为改造候选位点的氨基酸残基给出结果，从而指导实验。

【技术特征摘要】

【专利技术属性】
技术研发人员：曹志伟，吴迪，李亦学，
申请(专利权)人：上海生物信息技术研究中心，
类型：发明
国别省市：31