青光眼恶化风险的判定方法技术

是否存在青光眼风险的判定方法，该方法包括以下步骤：在体外检测在来自受检者的样品中存在于如下各核苷酸序列的第３１位的单核苷酸多态性的等位基因和／或基因型的步骤，所述核苷酸序列为选自ＳＥＱ　ＩＤ　ＮＯ：２０３～７５２所示的核苷酸序列的至少一个核苷酸序列或其互补序列（步骤Ａ）；以及将上述步骤Ａ中检测到的等位基因和／或基因型与ＳＥＱ　ＩＤ　ＮＯ：２０３～７５２所示的核苷酸序列中包含高风险等位基因的至少一个等位基因和／或基因型进行比较的步骤（步骤Ｂ）。根据本发明专利技术的方法，通过分析样品中的本发明专利技术的单核苷酸多态性的等位基因或基因型，可判定样品提供者的青光眼恶化风险的高低，根据该风险，样品提供者可以采取青光眼的预防措施或者接受适当的治疗。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】
本专利技术涉及检测与青光眼的恶化有关的单核苦酸多态性或青光 眼恶化风险高的单核苷酸多态性的存在的方法、以及用于该检测方 法的试剂盒。
技术介绍
青光眼是由于视网膜神经节细胞死亡而导致特征性视神经乳头 凹陷和视野缺损的疾病。眼压升高被认为是青光眼中乳头凹陷和视野 缺损的主要原因。另一方面，还存在眼压在经统计地计算得到的正常 范围内的青光眼，但这种情况下，对其个体而言该眼压也是足以产生 视野缺损的高眼压，所以也认为是发生了青光眼。治疗青光眼的基本原则是保持低眼压，为了保持低眼压，就必需 要考虑导致高眼压的原因。因此，在青光眼的诊断中，重要的是根据 眼压的高低及其原因对青光眼进行分类。作为导致眼压升高的原因， 充满眼内的房水的主要排出经f隅角是否存在闭塞是重要的。从上 述观点考虑，原发性青光眼大致分为伴有隅角闭塞的隅角闭塞型青光 眼和不伴有隅角闭塞的隅角开放型青光眼。其中，隅角开放型青光眼又分为伴有眼压升高的狭义的隅角开放型青光眼、即原发性隅角开 放型青光眼和眼压在正常范围内的正常眼压青光眼。很久以来就已知青光眼与遗传有关，有"^艮道称在隅角开放型青 光眼中，有5~50%具有家族史，通常有20 25%是遗传性的。根据上 述报道，正在进行探索青光眼的致病基因的研究，作为研究的成果， 有人报道了肌球蛋白样蛋白(Myocilin， MYOC)基因的突变与隅角开放型青光眼有关(参照专利文献1)、而视神经蛋白基因(optineurin, OPTN) 的突变与正常眼压青光眼有关(参照非专利文献1)。但仅凭这些基因还 无法说明所有的青光眼遗传因素，于是设想还存在未知的青光目M目关 基因。另 一方面，单核苷酸多态性是指在个体基因组的核苷,列中， 发现一个碱基变成其它碱基的置换突变，该突变在其生物种的种群中 以某种程度的频率、通常约1%以上的频率存在。单核苷酸多态性存 在于基因上的内含子、外显子或除此以外的基因组的所有区域。 专利文献l:日本特开2000-306165号公报非专利文献1: Rezaie T，其他作者11名,Science, 2002年，第295 巻,No.5557,第1077-1079页.
技术实现思路
专利技术所要解决的课题通常，将眼压或眼底照片用作青光眼的简单检查，但通过这些检 查未必能确诊青光眼。除此之外，通常还进行视野检查，但却存在以 下问题检查时间长，患者负担大；以及患者必需适应检查，所以初 次检查结果的可靠性低等。另一方面，如上所述，强烈怀疑在青光眼的发病中有遗传因素的 参与，但决定性的致病基因还未确定。另一方面，即使根据单一基因 突变或多态性还无法说明对疾病的参与，但却认为可如下说明遗传因 素参与青光眼的发病存在多个与青光眼有关的比较稳定的基因的突变或多态性，各个突变或多态性结合起来发挥作用。本专利技术人等为了找出与青光眼有关的基因，着眼于基因组上的多态性、特别是单核苷酸多态性。青光眼虽然是长期緩慢恶化的疾病，但根据经验已知其中有恶化迅速的患者。存在这种青光眼恶化迅速的患者的理由尚不明确，怀疑 有遗传因素的参与。可将以下用于治疗计划的设立通过找出参与青光眼恶化的多态性，预知具有该多态性中在青光眼恶化迅速的患者中 出现频率高的多态性的人青光眼的恶化风险高，进行更慎重的治疗和 高频率的经过观察，用于管理青光眼的恶化等。并且，用于研究青光 眼治疗药的候选物质实际上是否可用于青光眼治疗药的临床试验需 要进行长期的试验，但通过将具有本专利技术的参与青光眼恶化的多态性 的患者集中起来进行临床试验，可以缩短青光眼治疗药的候选物质的 临床试验期间。另外，通过上述临床试验选择的青光眼治疗药有可能 对治疗恶化迅速的青光眼特别有效。本专利技术的课题在于提供通过检测参与青光眼恶化的单核苷酸多 态性来预测青光眼的恶化风险的方法、和用于该^r测方法的试剂盒。解决课题的方法本专利技术人等对青光眼患者中恶化迅速的患者和恶化緩慢的患者 的基因组上存在的公知多态性部位进^f亍整合分析，发现了与青光眼恶 化有关的单核苷酸多态性，并且，在该单核苷酸多态性中发现了在青 光眼恶化迅速的患者中高频率地确认到的等位基因及其对立等位基 因、以及各等位基因的组合、即在青光眼恶化迅速的患者中高频率地 确认到的基因型。进一步发现通过将上述与青光眼恶化有关的多个 单核普酸多态性组合以进行判定，可以精度更高地判定样品提供者是 否为容易发生青光眼恶化者，从而完成了本专利技术。即，本专利技术涉及下述 。是否存在青光眼风险的判定方法，该方法包括以下步骤在体 外检测在来自受检者的样品中存在于如下各核苷酸序列的第31位的 单核苷酸多态性的等位基因和/或基因型的步骤(步骤A)，所述核苷酸 序列为选自SEQIDNO: 203-752所示的核苷酸序列的至少一个核苷 酸序列或其互补序列；以及将上述步骤A中检测到的等位基因和/或基因型与SEQ ID NO: 203-752所示的核苷酸序列中包含高风险等位基因的至少一个等位基位基因时，判 定存在青光眼风险；或者，当上述高风险等位基因符合显性遗传模型、 且上述步骤A中检测到的基因型为包含上述高风险等位基因的基因 型的纯合子或杂合子时，判定存在青光眼风险；当上述高风险等位基 因符合隐性遗传模型、且上述步骤A中检测到的基因型为包含上述高 风险等位基因的基因型的纯合子时，判定存在青光眼风险。是否存在青光眼风险的判定方法，该方法包括以下步骤在体 外检测在来自受检者的样品中存在于如下核酸分子中的各核苷酸序 列的第31位的单核香酸多态性的等位基因和/或基因型的步骤，上述 核酸分子包含选自SEQIDNO: 203~752所示的核苷酸序列的至少一 个核苷酸序列或其互补序列(步骤Cl);或使用包含如下核苷酸序列的 核酸分子，在体外检测上述单核苷酸多态性的等位基因和/或基因型的 步骤(步骤C2)，所述核普酸序列包含选自SEQ ID NO: 753 1061所 示的核苷酸序列的至少一个核苷酸序列或其互补序列；以及将上述步骤Cl或C2中检测到的等位基因和/或基因型与至少一 个如下核酸分子进行比较的步骤(步骤D)，所述核酸分子含有SEQID NO: 203 752所示的核苷酸序列中包含高风险等位基因的等位基因和 /或基因型，上述步骤Cl或C2中检测到的等位基因为上述高风险等位基因 时，判定存在青光眼风险；或者，当上述高风险等位基因符合显性遗 传模型、且上述步骤Cl或C2中检测到的基因型为包含上述高风险等 位基因的基因型的纯合子或杂合子时，判定存在青光眼风险；当上述 高风险等位基因符合隐性遗传模型、且上述步骤Cl或C2中检测到的 基因型为包含上述高风险等位基因的基因型的纯合子时，判定存在青 光眼风险。判定是否存在青光眼风险的试剂盒，该试剂盒含有下述核酸分 子包含选自SEQIDNO: 203~752所示的核苷酸序列的至少一个核包含如下核苷g拼 列的核酸分子，所述核苷酸序列包含选自SEQIDNO: 753 1061所示 的核苦酸序列的至少 一个核苷酸序列或其互补序列；该试剂盒用于在体外检测在来自受检者的样品中上述单核苷酸 多态性的等位基因和/或基因型。是否存在青光眼风险的判定方法，该方法包括以下步骤步骤(i):从来自受检者的样品中提取核酸分子的步骤；步骤(ii):对于上述步骤(i本文档来自技高网...

【技术保护点】
是否存在青光眼风险的判定方法，该方法包括以下步骤：　步骤Ａ：在来自受检者的样品中，在体外检测存在于如下各核苷酸序列的第３１位的单核苷酸多态性的等位基因和／或基因型的步骤，所述核苷酸序列为：选自ＳＥＱ　ＩＤ　ＮＯ：２０３～７５２所示的核 苷酸序列的至少一个核苷酸序列或其互补序列；以及　步骤Ｂ：将上述步骤Ａ中检测到的等位基因和／或基因型与ＳＥＱ　ＩＤＮＯ：２０３～７５２所示的核苷酸序列中包含高风险等位基因的至少一个等位基因和／或基因型进行比较的步骤；　当上述步骤Ａ 中检测到的等位基因为上述高风险等位基因时，判定存在青光眼风险；或者，当上述高风险等位基因符合显性遗传模型、且上述步骤Ａ中检测到的基因型为包含上述高风险等位基因的基因型的纯合子或杂合子时，判定存在青光眼风险；当上述高风险等位基因符合隐性遗传模型、且上述步骤Ａ中检测到的基因型为包含上述高风险等位基因的基因型的纯合子时，判定存在青光眼风险。

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】...

【专利技术属性】
技术研发人员：木下茂，田代启，中野正和，八木知人，森和彦，池田阳子，谷口孝纯，景山正明，
申请(专利权)人：参天制药株式会社，木下茂，田代启，
类型：发明
国别省市：JP[日本]